-
researchlabs@ واحد آموزشی شرکت طب یاران سیلک یاخته
-
این ویدیو نشان می دهد که چگونه می توان با استفاده از
-
PCR یک نوکلئیک اسید خاص را در نمونه های بالینی
-
شناسایی کردو مفدار ان را سنجید
-
این موضوع با شناسایی محصول PCR تکثیر شده انجام می شود
-
این فرایند Real time PCRیا RT PCR نامیده می شود
-
برای اینکه بفهمیم محصولات PCR چگونه شناسایی می شوند،
-
در ابتدا باید اتفاقاتی که در یک سیکل PCR می افتد را بررسی کنیم.
-
اولین مرحله در PCR، افزایش دمای واکنش
-
و ذوب کردن dna دورشته ای می باشد.
-
سپس وقتی که دما پایین امد،
-
پرایمرهای اختصاصی به توالی های انتهایی dna می چسبند.
-
حالا DNA جدید می تواند با فعالیت آنزیم پلیمراز
-
در جهت های مخالف ساخته شود.
-
در نتیجه دو کپی از DNA اولیه وجود خواهد داشت.
-
اگر این فرایند را متوجه نشدید
-
، ویدیوهای مربوط به PCRساده را یکبار دیگر مرور کنید.
-
برای شناسایی تولید محصولات جدید در RT PCR،
-
واکنش PCR نیاز به مواد دیگری نیز دارد:
-
یک پروب DNAتک رشته ای.
-
این پروب برای جفت شدن با بخشی از DNA طراحی شده است
-
که در بین دو پرایمر سنتز می شود.
-
به هرحال بر خلاف پرایمرها، این پروب با روش های اختصاصی
-
شناسایی می شود.و حساسیت شناسایی را بالا می برد
-
یکی از این نوکلئوتیدها با یک مولکول فلورسنت
-
و دیگری با مولکول QUENCHER یا خاموش کننده لیبل می شود.
-
مولکول خاموش کننده، به سرعت انرژی نورهای متساعدشده از
-
فلورسنت را جذب می کند.
-
البته تا زمانی که در فاصله نزدیکی از یکدیگر باقی بمانند.
-
حالا بیایید ببینیم وقتی این مواد در واکنش حضور دارند، چه اتفاقی می افتد.
-
پرایمرها به رشته های DNA جدا شده، می چسبد.
-
پروب هم به جایگاه مکمل بین پرایمرها متصل می شود.
-
انزیم، از دو انتهای پرایمرها، DNA جدید را می سازد.
-
هم چنین این انزیم یک فعالیت خارج هسته ای دیگر هم دارد:
-
این انزیم وقتی در مسیر خود به DNAدو رشته ای می رسد،
-
تمامی نوکلئوتیدهای DNA را جدا کرده
-
و ان ها دوباره جایگزین می کند.
-
زمانی که پلیمراز، از پروب عبور می کند،
-
نوکلئوتید دارای مارکر فلورسنت و خاموش کننده را از هم جدا می کند.
-
وقتی این دو مارکر جدا شدند، مولکول فلورسنت در صورت تحریک
-
میتواند نور قابل تشخیصی را تولید کند.
-
هر بار که رشته جدید از DNA ساخته می شود،
-
یک مولکول فلورسنت از خاموش کننده خود جدا می ماند.
-
بنابراین با دوبرابر شدن مقدار DNA در هر سیکل PCR،
-
مقدار انرژی تولیدی توسط فلورسنت نیز بالا می رود.
-
این انرژی زیاد توسط یک فلورمتر در داخل
دستگاه ترموسایکلر اندازه گیری می شود.
-
بنابراین اگر شما فرایند را با نمونه بالینی دارای یک کپی از DNA اغاز کنید،
-
به اندازه 40 سیکل PCR زمان می برد
-
تا این انرژی از طریق فلورمتر دستگاه، شناسایی شود.
-
اگر نمونه شما دارای بیش از 32 کپی از DNA باشد،
-
فرایند شناسایی در طی 5 سیکل کمتر اتفاق می افتد.
-
و اگر 1024 برابر بیشتر از نمونه خود را داشته باشید،
-
فلورسنت در طی 10 سیکل کمتر شناسایی خواهد شد.
-
بنابراین مقدار DNA موجود در نمونه،
با توجه به تعداد سیکل های PCR شناسایی خواهد شد.
-
زیرا مقدار فلورسنت نمونه به پایین ترین حد استانه تشخیص رسبده است
-
RT PCR معمولا برای شناسایی مقدار ویروس در خون بیماران HIV ،
-
هپاتیت B و دیگر ویروس ها به کار می رود
-
اما HIV یک ویروس دارای RNA است و DNA ندارد.
-
RNAتک رشته ای است.
-
بنابراین این فرایند چگونه انجام می شود؟
-
پاسخ این است: RNA بعد از کپی شدن
-
یا تبدیل شدن به DNA دو رشته ای اندازه گیری می شود.
-
این انیمیشن چگونگی این موضوع را نشان می دهد.
-
در ابتدا RNA ویروسی از ویروس ازاد میشود
-
سپس با استفاده از انزیم ریورس ترنس کریپتاز، از RNA ویروسی یک DNA مکمل ساخته می شود.
-
مشابه عمل ترجمه ی طبیعی که اتفاق می افتد
-
در بعضی از پروتوکل ها یک انزیم RNase اختصاصی هم اضافه می شود
-
تا RNA را بسازد و به ان اجازه می دهد تا تجزیه شود.
-
جدا از اینکه این مرحله اتفاق بیوفتد یا نه، مرحله کلیدی بعدی این است
-
که مشابه با واکنش PCR، DNAپلیمراز و پرایمر یک رشته DNA مکمل را می سازد.
-
در انتهای واکنش، RNA تک رشته ای ویروسی
-
به DNA دور شته ای تبدیل شده که همان نوکلئوتیدها را دارد.
-
حالا فرایند PCR می تواند برای این ,DNA همانند قبل انجام شود.
-
researchlabs@ مرجع دانلود ویدئو های آموزشی