-
Beszéljünk egy kicsit bővebben arról,
-
hogy a DNS hogyan másolja magát,
-
miként replikálódik,
-
és hogy mik azok a szereplők,
-
amelyek közreműködnek e folyamatban.
-
Eközben sokszor említjük majd
-
a DNS molekula 3' és 5'
(3 vessző és 5 vessző) végeit.
-
Ha még sosem hallottál erről,
-
akkor nézd meg a videót
-
a DNS antiparallel szerkezetéről.
-
Ismételjük át egy kicsit,
-
ha esetleg régen láttad utoljára.
-
Itt a DNS részletes ábrája
-
az előbb említett videóból.
-
Az 5' és 3' elnevezés
-
az atomok helyzetére utal
azokban a ribózmolekulákban,
-
amik ezt a foszfát-cukor
gerincet alkotják.
-
Ez Itt egy ribóz,
-
ami egy öt szénatomos cukor.
-
Számozzuk meg a szénatomokat:
-
ez az 1' helyzetű szénatom, ez a 2',
-
ez a 3', ez a 4',
-
ez pedig az 5' helyzetű szénatom.
-
A létrának ezen az oldalán
-
az úgynevezett
haladási (lefutási) irány...
-
(iderajzolok egy vonalat)
-
3'-5' irányú.
-
Ez vég a 3' vég, ez pedig az 5' vég.
-
A lefutási iránya 3'-5'.
-
Ez a foszfátcsoport
az egyik gyűrű 3' atomjához csatlakozik,
-
amely az 5' atomján át
egy foszfátcsoporthoz kapcsolódik,
-
az pedig
a következő gyűrű 3' atomjához,
-
az pedig...
-
az 5' atomján át
egy foszfátcsoporthoz kapcsolódik.
-
A másik szál a már említett
antiparallel szál.
-
Párhuzamos az előbbivel,
de fordított irányban fut.
-
Tehát ez az atom 3' helyzetű,
ez 5' helyzetű,
-
ez 3', ez 5' helyzetű.
-
Tehát ezt jelenti
-
az antiparallel szerkezet.
-
A molekula két gerince
-
ez a két szál egymással párhuzamos,
-
de ellentétes irányban futnak.
-
Tehát ez a 3' vég, ez pedig az 5' vég.
-
Ez nagyon fontos ahhoz,
-
hogy megértsük a replikációt,
-
mivel a DNS-polimeráz,
-
ami beépíti az új nukleotidokat,
-
a készülő új DNS-szálba,
-
csak a 3' véghez tudja kapcsolni a nukleotidokat.
-
Itt például
-
a hosszbbítás csak...
-
csak ebben az irányban végezhető.
-
A másik irányban nem.
-
v
-
Úgy is mondhatjuk, hogy az új nukleotidokat
-
csak a 3' véghez kapcsolhatjuk,
-
vagyis a DNS hosszabbítása csak 5'- 3' irányban történhet.
-
Ha csak a 3' véget hosszabbítjuk,
-
akkor az 5' irányból a 3' irányba haladunk.
-
Nem haladhatunk 3' - 5' irányba.
-
A hosszabbítás az 5' végen
polimerázzal nem lehetséges.
-
Miről szól a polimeráz...
-
Vizsgáljuk meg a fenti ábrát,
-
ahol együtt látható
-
a folyamat összes szereplője.
-
Itt a DNS-szál,
-
az eredeti formájában
-
a megkettőződés előtti alakjában.
-
Megjelöltük a 3' és az 5' végeket,
-
és követhető a szálak iránya.
-
Ez a 3', kövessük végig
-
ez a hozzá tartozó 5' vég.
-
Ezek tehát ugyanazon szál végei
-
Ez pedig, ha égig követjük,
-
ugyanaz a szál
-
Ez a 3' vége
-
ez pedig az 5' vége.
-
Elsőként...
-
amint elhangzott a korábbi videókban
-
amelyekben áttekintettük a replikációt
-
a hélixet alkotó két szál
-
a két DNS-szálnak szét kell válnia,
-
hogy felépülhessen a másik
-
a létra másik oldala
-
a szétvált szálak mentén.
-
Akárcsak egy cipzár,
-
amit szétnyitunk,
majd mindkét feléhez egy új cipzárat erősítünk
-
x
-
A valóságban viszont sokkal bonyolultabb,
-
mintha csak szétnyitnánk egy cipzárat,
aztán újat teszünk rá.
-
Kell hozzá egy rakás enzim, és egyebek,
-
még ezen az ábrán sem látható
-
az összes közreműködő.
-
De a legfontosabb résztvevők igen
-
legalábbis azok, amiket megemlítünk
-
amikor a DNS-replikációró beszélünk.
-
Először is az történik,
-
ez itt szorosan fel van tekeredve.
-
Ezt ide is írom.
-
Szorosan fel van tekeredve.
-
Ha belegondolunk, ez úgy működik,
-
hogy minél jobban széttekerjük az egyik oldalon,
-
annál szorosabban tekeredik a másik oldalon.
-
A cipzár felnyitásához tehát
-
szükséges egy enzim,
-
ami segít széttekerni
ezt a szorosan feltekert hélixet.
-
Ez az enzim a topoizomeráz.
-
Úgy működik,
-
hogy időlegesen felhasítja a gerincek egyes pontjait,
-
hogy szétttekeredjen, aztán újra összekapcsolódnak,
-
De a lényeg, hogy széttekeri,
-
hogy aztán a helikáz enzim...
-
A helikáz persze nem úgy néz ki,
-
mint ez a kis háromszög,
ami épp hasítja a ..
-
A valóságban ezek sokkal ....
-
ha a valóságban látnánk
-
a helikáz molekuláris szerkezetét.
-
A helikáz feladata az,
-
hogy felszakítsa a hidrogénkötéseket
-
a nitrogéntartalmú bázisok között.
-
Itt épp egy adenin és egy timin közt
-
szakítja fel a hidrogénkötéseket.
-
Első tehát a széttekeredés
-
aztán a hlkáz.
-
A topoizomeráz széttekeri
-
aztán a helikáz felszakítja a kötéseket.
-
Innentől kezdve
-
külön tárgyaljuk a két szálat,
-
mivel, mint említettem,
-
az új nukleotidokat
-
csak 5'-3' irányban kapcsolhatjuk hozzá.
-
Az alsó szálat tehát
-
vezető szálnak nevezzük.
-
Ezen tök egyszerűen halad a folyamat
-
emlékezz, ez az 5' vége,
-
a lánc hosszabbítása tehát
-
ebben az irányban folytatódhat.
-
c
-
Ez az 5'-3' irány.
-
Itt a folyamat elindításához
-
kell egy RNS-primer
-
és az az enzim, amelyik létrehozza az RNS-primert.
-
Ez a DNS-primáz.
-
Erről még beszélünk
-
a követő szál kapcsán
-
de a lányeg, hogy RNS-t kapcsolnak
-
ezt egy másik színnel jelölöm.
-
Ide kapcsolódik egy RNS-primer.
-
Miután a primer ide kapcsolódott,
-
A DNS-polimeráz megkezdheti a további nukleotidok hozzáadását.
-
a 3' véghez.
-
Azért olyan egyszerű a vezető szálon,
-
mert ez a DNS-polimeráz...
-
ismétlem,
-
ezek nem olyan háromszögek, mint ezen a képen,
-
A valóságban sokkal ..............
-
Itt láthatók
-
c
-
Ez a polimeráz
-
csak a cipzár felnyílását követi
-
és eközben újabb és újabb
-
nukleotidokat kapcsol a 3' véghez.
-
Ez elég egyszerű.
-
Könnyű lenne,
-
ha az 5' véghez is
kapcsolhatnánk nukleotidokat,
-
hiszen akkor úgy vehetnénk,
-
hogy ez a szál 3'-5' irányban halad,
-
akkor mondjuk egy másik fajta polimeráz
-
hozzákapcsolhatná a nukleotidokat
-
és ezzel a dolog el lenne intézve.
-
A valóságban ez nem így működik.
-
Az 5' véghez nem lehet újabb nukkleotidokat kapcsolni
-
Ez pedig láthatóan a 3' vég
-
erről a szálról beszélek.c
-
Másik színnel rajzolom.
-
c
-
Ezen a szálon
-
ez a 3' vég, ez pedig az 5' vég,
-
c
-
ezért így nem lehet nukleotidokat.
-
Hogyan oldja meg ezt a dolgot a biológia?
-
Primereket ad,
-
ahogy a szétnyílás megtörténik
-
a képen látható, hogy a primer nem csak egy nukleotid
-
hanem általában több
-
mintegy 10 nukleotid
-
Tehát kb. 10 RNS nukleotidot ad
-
ezt a DNS primáz végzi.
-
A DNS-primáz tehát a követő szálon
-
ezen az oldalon, felül,
-
és ad.
-
Bekapcsolja az RNS-primert,
-
ami nem csak egy nukleotid
-
hanem sok
-
Amint megvan az RNS-primer
-
a polimeráz hozzákapcsolhat 5'-3' irányban
-
mindig a 3' véghez.
-
hozzá
-
így
-
Úgy képzelhető el a folyamat
-
jön a promáz, hozzákapcsolja a primert
-
és megkezdődik a lánchosszabbítás 5'-3' irányban.
-
így
-
aztán egy kis ugrás, és ismétlődik.
-
Keletkezik egy sor kis szakasz
-
amelyeket Okazaki-fragmenteknek nevezünk.
-
Okazaki-fragmentek,
-
a követő szálon
-
d
-
miért hívják követő szálnak
-
s
-
mintha tökéletlen volna
-
ezeket az Okazaki-fragmenteket
-
ahogy a felnyílás irányába haladva.
-
így kullog, ez a folyamat lassúbb
-
de a végén minden összekapcsolható
-
a DNS-ligáz segítségével.
-
A DNS-ligáz nem csak összekapcsolja a töredékekeket
-
hanem az RNS-t is
-
kicseréli DNS-re.
-
Így mindezek után van egy másolat
-
d
-
A végére tehát létrejön
a két kettős szál.
-
Egy itt fent, a követő szálon,
-
a másik lent a vezető szálon