WEBVTT

00:00:02.417 --> 00:00:03.684
Asun Utahissa,

00:00:03.714 --> 00:00:08.625
joka tunnetaan eräistä maailman
hienoimmista luonnonmaisemista.

00:00:09.023 --> 00:00:12.774
Nämä maisemat voivat olla
todella vaikuttavia ja kiehtovia,

00:00:12.808 --> 00:00:16.427
aivan kuin ne olisivat
toiselta planeetalta.

00:00:16.522 --> 00:00:20.164
Tutkijana rakastan
luonnollisen maailman havainnointia.

00:00:20.208 --> 00:00:21.976
Mutta solubiologina

00:00:22.000 --> 00:00:24.809
olen kiinnostuneempi
ymmärtämään luontoa

00:00:24.833 --> 00:00:27.042
paljon pienemmässä mittakaavassa.

NOTE Paragraph

00:00:27.917 --> 00:00:30.726
Animoin molekyylejä yhdessä
muiden tutkijoiden kanssa.

00:00:30.750 --> 00:00:33.420
Teemme videoita molekyyleistä,
jotka ovat niin pieniä,

00:00:33.457 --> 00:00:35.268
että ne ovat käytännössä näkymättömiä.

00:00:35.292 --> 00:00:38.143
Molekyylit ovat pienempiä kuin
valon aallonpituus,

00:00:38.167 --> 00:00:40.406
joten niitä ei voi nähdä suoraan

00:00:40.430 --> 00:00:42.476
edes parhaimmilla valomikroskoopeilla.

00:00:42.500 --> 00:00:44.643
Miten voin siis
havainnollistaa asioita,

00:00:44.667 --> 00:00:46.643
jotka ovat näkymättömän pieniä?

NOTE Paragraph

00:00:46.667 --> 00:00:48.809
Tutkijat, kuten kollegani,

00:00:48.833 --> 00:00:50.934
saattavat käyttää koko uransa

00:00:50.958 --> 00:00:53.518
yrittäessään ymmärtää yhtä
molekyylitason toimintoa.

00:00:53.542 --> 00:00:56.018
He tekevät sen sarjalla kokeita,

00:00:56.042 --> 00:00:59.143
joista jokainen paljastaa
yhden palapelin palan.

00:00:59.167 --> 00:01:01.934
Yksi koe voi kertoa proteiinin muodosta,

00:01:01.958 --> 00:01:03.226
kun taas toinen kertoo

00:01:03.250 --> 00:01:05.586
minkä muiden proteiinien
kanssa se on tekemisissä,

00:01:05.600 --> 00:01:08.465
ja kolmas kertoo
mistä osasta solua sen löytää.

00:01:08.489 --> 00:01:12.476
Kaikista näistä tiedon rippeistä
voidaan muodostaa hypoteesi,

00:01:12.500 --> 00:01:15.583
eli siis tarina siitä,
miten molekyyli saattaisi toimia.

NOTE Paragraph

00:01:17.000 --> 00:01:20.934
Minun työni on tehdä
näistä ideoista animaatio.

00:01:20.958 --> 00:01:22.226
Se voi olla konstikasta,

00:01:22.250 --> 00:01:25.476
sillä molekyylit voivat tehdä
aika hulluja juttuja.

00:01:25.500 --> 00:01:28.851
Mutta nämä animaatiot
voivat todella auttaa tutkijoita

00:01:28.875 --> 00:01:31.976
kommunikoimaan ideoitaan siitä,
miten molekyylit toimivat.

00:01:32.000 --> 00:01:34.768
Samalla voimme nähdä
molekyylien maailman

00:01:34.792 --> 00:01:36.351
tutkijoiden silmin.

NOTE Paragraph

00:01:36.375 --> 00:01:38.309
Näytän joitain animaatioita,

00:01:38.333 --> 00:01:41.091
lyhyen kiertoajelun asioista,
jotka ovat mielestäni

00:01:41.115 --> 00:01:43.549
molekyylien maailman ihmeitä.

00:01:43.583 --> 00:01:45.559
Tässä on immuunisolu.

00:01:45.583 --> 00:01:48.476
Nämä solut ryömivät ympäriinsä kehoissamme

00:01:48.500 --> 00:01:51.518
etsien tunkeilijoita,
kuten sairauksia tartuttavia bakteereja.

00:01:51.542 --> 00:01:54.643
Tämä liike on 
yhdestä lempiproteiineistani,

00:01:54.667 --> 00:01:55.934
aktiinista,

00:01:55.958 --> 00:01:58.434
joka on osa sytoskeletonia
eli solun tukirankaa.

00:01:58.458 --> 00:02:00.101
Toisin kuin luurankomme,

00:02:00.125 --> 00:02:03.851
aktiinifilamentteja rakennetaan
ja hajotetaan koko ajan.

00:02:03.875 --> 00:02:07.268
Aktiinitukirangalla on
tärkeä rooli soluissamme.

00:02:07.292 --> 00:02:09.059
Niiden avulla solut muuttavat muotoa,

00:02:09.083 --> 00:02:11.476
liikkuvat ympäriinsä, tarttuvat pintoihin,

00:02:11.500 --> 00:02:13.934
ja hotkivat bakteereja.

NOTE Paragraph

00:02:13.958 --> 00:02:16.559
Aktiini liittyy myös
toisenlaiseen liikkeeseen.

00:02:16.583 --> 00:02:19.768
Lihassoluissamme aktiinit muodostavat
säännöllisiä filamentteja,

00:02:19.792 --> 00:02:21.309
jotka näyttävät kankaalta.

00:02:21.333 --> 00:02:24.268
Kun lihas supistuu,
nämä filamentit vetäytyvät yhteen,

00:02:24.292 --> 00:02:26.309
ja ne palaavat alkuasentoonsa

00:02:26.333 --> 00:02:27.809
kun lihas rentoutuu.

NOTE Paragraph

00:02:27.833 --> 00:02:31.059
Solun tukirangan muut osat,
tässä tapauksessa mikrotubulukset,

00:02:31.083 --> 00:02:33.768
vastaavat pitkän matkan kuljetuksista.

00:02:33.792 --> 00:02:36.434
Niitä voisi pitää kuin solujen valtateinä,

00:02:36.458 --> 00:02:39.809
joita käytetään asioiden siirtämiseen
solun laidalta toiselle.

00:02:39.833 --> 00:02:42.601
Toisin kuin tiemme,
mikrotubulukset kasvavat ja kutistuvat,

00:02:42.625 --> 00:02:44.059
ilmestyvät tarvittaessa,

00:02:44.083 --> 00:02:46.434
ja katoavat kun työ on tehty.

NOTE Paragraph

00:02:46.458 --> 00:02:48.893
Molekyyliversioita puoliperävaunuista

00:02:48.917 --> 00:02:51.476
ovat osuvasti nimetyt moottoriproteiinit,

00:02:51.500 --> 00:02:53.976
jotka kävelevät mikrotubuluksilla,

00:02:54.000 --> 00:02:56.684
vetäen joskus valtavia kuormia

00:02:56.708 --> 00:02:58.518
kuten soluelimiä.

00:02:58.542 --> 00:03:01.393
Tämä moottoriproteiini
tunnetaan dyneiininä,

00:03:01.417 --> 00:03:03.851
ja sen tiedetään tekevän töitä ryhmissä,

00:03:03.875 --> 00:03:07.309
jotka näyttävät mielestäni
vähän hevosvankkureilta.

NOTE Paragraph

00:03:07.333 --> 00:03:11.184
Kuten näet, solu on uskomaton,
dynaaminen paikka,

00:03:11.208 --> 00:03:14.643
jossa asioita jatkuvasti
rakennetaan ja puretaan.

00:03:14.667 --> 00:03:16.018
Mutta joitain rakenteita

00:03:16.042 --> 00:03:18.143
on vaikeampi purkaa kuin toisia.

00:03:18.167 --> 00:03:20.101
Paikalle on tuotava erikoisjoukkoja,

00:03:20.125 --> 00:03:23.559
jotta rakenteet puretaan
varmasti aikataulussa.

00:03:23.583 --> 00:03:26.309
Sitä työtä tekevät tällaiset proteiinit.

00:03:26.333 --> 00:03:27.851
Donitsin muotoiset proteiinit,

00:03:27.875 --> 00:03:29.893
joita soluissa on useita eri tyyppejä,

00:03:29.917 --> 00:03:31.976
repivät rakenteita palasiksi

00:03:32.000 --> 00:03:35.393
vetämällä yksittäisiä proteiineja
keskellä olevan reiän läpi.

00:03:35.417 --> 00:03:37.976
Kun tällaiset proteiinit 
eivät toimi kunnolla,

00:03:38.000 --> 00:03:40.726
purettavaksi tarkoitetut proteiinit

00:03:40.750 --> 00:03:43.184
takertuvat joskus toisiinsa kasoiksi,

00:03:43.208 --> 00:03:47.393
ja se voi aiheuttaa kamalia sairauksia,
kuten Alzheimeria.

NOTE Paragraph

00:03:47.417 --> 00:03:49.434
Katsotaanpa seuraavaksi tumaa,

00:03:49.458 --> 00:03:52.393
jossa on genomimme DNA:n muodossa.

00:03:52.417 --> 00:03:53.851
Kaikissa soluissamme

00:03:53.875 --> 00:03:58.184
DNA:ta hoitaa ja huoltaa
joukko eri proteiineja.

00:03:58.208 --> 00:04:01.018
DNA on kiertynyt
histoni-proteiinien ympärille,

00:04:01.042 --> 00:04:05.351
joten solu saa pakattua
paljon DNA:ta tumaan.

00:04:05.375 --> 00:04:08.434
Näitä koneita kutsutaan
kromatiinin muokkaajiksi,

00:04:08.458 --> 00:04:11.184
ja ne toimivat pyöräyttämällä DNA:n

00:04:11.232 --> 00:04:12.480
histonien ympärille

00:04:12.500 --> 00:04:16.351
paljastaen uusia DNA:n osia.

00:04:16.375 --> 00:04:19.309
Sitten muut koneistot voivat
havaita tämän DNA:n.

00:04:19.333 --> 00:04:21.851
Tässä tapauksessa tämä suuri molekyylikone

00:04:21.875 --> 00:04:23.559
etsii DNA:n osaa,

00:04:23.583 --> 00:04:25.893
joka kertoo sille olevansa geenin alussa.

00:04:25.917 --> 00:04:27.601
Kun kone löytää tämän osan,

00:04:27.625 --> 00:04:30.393
se muuttaa muotoa useita kertoja,

00:04:30.417 --> 00:04:32.518
jolloin muut koneistot saapuvat paikalle,

00:04:32.542 --> 00:04:36.684
mikä taas saa aikaan geenin käynnistyksen
tai uudelleenkirjoituksen.

00:04:36.708 --> 00:04:39.809
Tämä on tarkasti säännelty prosessi,

00:04:39.833 --> 00:04:42.601
koska väärän geenin käynnistys
väärään aikaan

00:04:42.625 --> 00:04:45.268
voi johtaa tuhoisiin seurauksiin.

NOTE Paragraph

00:04:45.292 --> 00:04:48.101
Tutkijat osaavat nykyisin
käyttää proteiinikoneita

00:04:48.125 --> 00:04:49.559
genomien muokkaukseen.

00:04:49.583 --> 00:04:52.018
Olette varmaan kuulleet CRISPR:stä.

00:04:52.042 --> 00:04:54.851
CRISPR hyödyntää 
Cas9-proteiinia,

00:04:54.875 --> 00:04:57.809
joka voidaan ohjelmoida
tunnistamaan ja leikkaamaan

00:04:57.833 --> 00:05:00.226
tietty jakso DNA:sta.

00:05:00.250 --> 00:05:01.518
Tässä esimerkkitapauksessa

00:05:01.542 --> 00:05:05.518
kahta CAs9-proteiinia käytetään
leikkaamaan ongelmallinen osa DNA:ta.

00:05:05.542 --> 00:05:09.018
Esimerkiksi osa geenistä,
joka voisi aiheuttaa sairauden.

00:05:09.042 --> 00:05:10.519
Sitten solukoneistoa käytetään

00:05:10.543 --> 00:05:14.059
liimaamaan DNA:n päät
takaisin yhteen.

NOTE Paragraph

00:05:14.083 --> 00:05:15.351
Molekyylien animoijana

00:05:15.375 --> 00:05:18.684
yksi suurimmista haasteistani
on epävarmuuden havainnollistaminen.

00:05:18.708 --> 00:05:22.018
Kaikki näyttämäni animaatiot
edustavat hypoteesejä,

00:05:22.042 --> 00:05:24.309
kollegoideni arvioita
prosessien kulusta,

00:05:24.333 --> 00:05:26.684
ja perustuvat heidän
parhaisiin tietoihinsa.

00:05:26.708 --> 00:05:28.684
Monien molekyylitason
prosessien kohdalla

00:05:28.708 --> 00:05:31.684
ymmärryksemme on vasta aluillaan,

00:05:31.708 --> 00:05:33.018
ja opittavaa on paljon.

00:05:33.042 --> 00:05:34.309
Totta on se,

00:05:34.333 --> 00:05:38.292
että molekyylien maailmat
ovat valtavia ja paljolti tutkimattomia.

00:05:39.458 --> 00:05:41.518
Minulle näiden molekyylien maisemien

00:05:41.542 --> 00:05:44.934
tutkiminen on ihan yhtä kiinnostavaa
kuin sen luonnollinen maailman,

00:05:44.958 --> 00:05:47.351
jonka näemme ympärillämme.

NOTE Paragraph

00:05:47.375 --> 00:05:48.643
Kiitos.

NOTE Paragraph

00:05:48.667 --> 00:05:51.792
(Suosionosoituksia)