1
00:00:00,710 --> 00:00:02,579
Şu çizime bir bakın.

2
00:00:02,579 --> 00:00:04,183
Ne olduğunu söyleyebilir misiniz?

3
00:00:04,183 --> 00:00:06,930
Moleküler biyoloji eğitimi aldım

4
00:00:06,930 --> 00:00:09,533
ve bunun gibi birçok çizim gördüm.

5
00:00:09,533 --> 00:00:12,475
Bunlar genellikle örnek
çizim diye tabir edilir,

6
00:00:12,475 --> 00:00:14,491
bir hücresel ya da moleküler işlemin

7
00:00:14,491 --> 00:00:16,988
nasıl olduğunu düşündüğümüzü
gösteren bir çizim.

8
00:00:17,023 --> 00:00:20,672
Bu çizim Klatrin bağımlı endositoz

9
00:00:20,672 --> 00:00:23,845
denilen bir işlemi
ayrıntılı olarak gösteriyor.

10
00:00:23,845 --> 00:00:26,455
Bu daha sonra hücre tarafından özümsenen

11
00:00:26,455 --> 00:00:29,443
bir kese ya da kabarcık
vasıtasıyla bir molekülün

12
00:00:29,443 --> 00:00:32,120
hücre dışından hücre içine

13
00:00:32,120 --> 00:00:34,050
alınabildiği bir işlemdir.

14
00:00:34,050 --> 00:00:35,885
Yine de, bu çizimde bir hata var,

15
00:00:35,885 --> 00:00:38,517
ve esas olarak neyi
göstermediği ile ilgili.

16
00:00:38,517 --> 00:00:39,982
Çok sayıda deneyden,

17
00:00:39,982 --> 00:00:41,817
çok sayıda farklı bilim adamından,

18
00:00:41,817 --> 00:00:44,813
bu moleküllerin nasıl göründüğü
ile ilgili bir çok şey biliyoruz.

19
00:00:44,813 --> 00:00:46,495
Hücre içerisinde hareket edişlerini

20
00:00:46,495 --> 00:00:48,320
ve tüm bunların

21
00:00:48,320 --> 00:00:50,870
inanılmaz hareketli
bir ortamda meydana geldiğini.

22
00:00:51,310 --> 00:00:54,783
Klathrin uzmanı
Tomas Kirchhausen'in işbirliği ile,

23
00:00:54,783 --> 00:00:57,102
olayın tamamını gösteren
yeni bir örnek çizim çeşidi

24
00:00:57,102 --> 00:00:59,126
yaratmaya karar verdik.

25
00:00:59,126 --> 00:01:00,862
Böylece, hücre dışından başladık.

26
00:01:00,862 --> 00:01:02,510
Şimdi içine bakıyoruz.

27
00:01:02,510 --> 00:01:04,590
Klathrin şu üç bacaklı moleküldür

28
00:01:04,590 --> 00:01:07,878
ki kendi kendini futbol topuna
benzer şekilde monte edebilir.

29
00:01:07,878 --> 00:01:09,575
Bir zar ile birleşmesi sayesinde,

30
00:01:09,575 --> 00:01:11,742
klathrin zarın şeklini bozabilir

31
00:01:11,742 --> 00:01:13,155
ve bir balon ya da
kabarcık şeklini alarak

32
00:01:13,155 --> 00:01:15,462
fincana benzer bir form oluşturur,

33
00:01:15,462 --> 00:01:17,246
bu oluşum hücrenin dışındaki bazı

34
00:01:17,246 --> 00:01:18,900
proteinleri hapsetmeye başlar.

35
00:01:18,900 --> 00:01:22,398
Proteinler şimdi içeriden
kabarcığa çimdik atar

36
00:01:22,398 --> 00:01:24,982
ve onu zarın kalanından ayırır.

37
00:01:24,982 --> 00:01:27,374
Şimdi klathrin görevini
yerine getirmiş oldu

38
00:01:27,374 --> 00:01:28,612
ve proteinler içeri gelmeye başladı.

39
00:01:28,612 --> 00:01:30,558
Onları sarı ve turuncu ile belirttik.

40
00:01:30,558 --> 00:01:33,100
Bunlar klathrin kafesini
ayrıştırmakla yükümlü.

41
00:01:33,100 --> 00:01:36,382
Neticede bütün bu proteinler geri dönüşmüş

42
00:01:36,382 --> 00:01:37,918
ve yeniden kullanılmış oldu.

43
00:01:37,918 --> 00:01:41,327
Bu işlemler en iyi
mikroskoplarla bile direkt

44
00:01:41,327 --> 00:01:43,159
olarak görülemeyecek kadar küçükler,

45
00:01:43,159 --> 00:01:45,790
yani bu gibi animasyonlar bir hipotezi

46
00:01:45,790 --> 00:01:48,808
görselleştirmeyi güçlü
bir şekilde sağlıyor.

47
00:01:48,808 --> 00:01:50,654
İşte başka bir çizim

48
00:01:50,654 --> 00:01:53,390
ve bu da bir araştırmacının
HIV virüsünün hücreye

49
00:01:53,390 --> 00:01:56,895
nasıl girip çıktığını düşündüğünün çizimi.

50
00:01:56,895 --> 00:01:59,414
Ve yine, bu çok büyük bir basitleştirme

51
00:01:59,414 --> 00:02:01,158
ve bu işlemler hakkında gerçekten

52
00:02:01,158 --> 00:02:03,640
bildiklerimizi göstermeye başlamyor.

53
00:02:03,640 --> 00:02:05,855
Bu çizimlerin çoğu biyoloğun moleküler

54
00:02:05,855 --> 00:02:08,622
hipotezlerini görselleştirmek
için kullandığı

55
00:02:08,622 --> 00:02:12,454
tek yol olduğuna şaşırıyor olabilirsiniz.

56
00:02:12,454 --> 00:02:13,482
Niçin?

57
00:02:13,482 --> 00:02:15,472
Çünkü işlemlerin oluş
şekillerini düşündüğümüze

58
00:02:15,472 --> 00:02:18,486
en yakın haliyle gösteren filmler
yaratmak gerçekten çok zor.

59
00:02:18,486 --> 00:02:22,119
Hollywood'da 3D animasyon yazılımı
öğrenmek için aylar geçirdim

60
00:02:22,119 --> 00:02:24,400
ve her bir animasyon
için de aylar harcadım

61
00:02:24,400 --> 00:02:27,750
ve bu çoğu araştırmacının
karşılayamayacağı bir zaman.

62
00:02:27,750 --> 00:02:29,950
Gerçi bedeli muazzam olabiliyor.

63
00:02:29,950 --> 00:02:32,334
Moleküler animasyonlar geniş kitlelere

64
00:02:32,334 --> 00:02:35,775
üstün kesinlikte bilgiyi yayma

65
00:02:35,775 --> 00:02:39,367
becerileriyle benzersizdir.

66
00:02:39,367 --> 00:02:40,870
Şu anda "HIV'nin Bilimi" adlı

67
00:02:40,870 --> 00:02:42,308
bir proje üzerine çalışıyorum.

68
00:02:42,308 --> 00:02:44,670
Burada HIV virüsünün tüm yaşam döngüsünü

69
00:02:44,670 --> 00:02:47,774
olabilecek en kati şekilde ve tüm

70
00:02:47,774 --> 00:02:49,735
moleküler detaylarıyla canlandıracağım.

71
00:02:49,735 --> 00:02:51,886
Bu animasyon binlerce araştırmacının

72
00:02:51,886 --> 00:02:54,862
yüzyıllar boyunca
biriktirdiği verileri içerecek.

73
00:02:54,862 --> 00:02:57,942
Bunlar virüsün neye benzediğini,


74
00:02:57,942 --> 00:03:01,030
vücudumuzdaki hücrelere
nasıl bulaşabildiğini

75
00:03:01,030 --> 00:03:04,622
ve iyileştiricilerin enfeksiyonla nasıl
mücadele ettiğini gösteren veriler.

76
00:03:05,002 --> 00:03:07,331
Yıllar boyunca, gördüm ki animasyonlar

77
00:03:07,331 --> 00:03:10,150
sadece bir fikri anlatmakta değil

78
00:03:10,150 --> 00:03:11,646
aynı zamanda bir hipotezi

79
00:03:11,646 --> 00:03:13,958
keşfetmek için de gerçekten faydalı.

80
00:03:13,958 --> 00:03:17,152
Biyologlar hâlâ araştırdıkları
işlemleri görselleştirmek için

81
00:03:17,152 --> 00:03:19,374
çoğunlukla kalem ve kağıt kullanıyorlar

82
00:03:19,374 --> 00:03:22,854
ve şu anda sahip olduğumuz
verilerle bu artık yeterince iyi değil.

83
00:03:22,854 --> 00:03:25,270
Bir animasyon yaratma işlemi,

84
00:03:25,270 --> 00:03:27,927
araştırmacılara kendi
fikirlerini açığa çıkartmaları

85
00:03:27,927 --> 00:03:30,878
ve ayıklamaları için bir
katalizör gibi davranabilir.

86
00:03:30,878 --> 00:03:32,662
Çalıştığım araştırmacılardan birisi

87
00:03:32,662 --> 00:03:34,438
sinir dokusu bozulumunun moleküler

88
00:03:34,438 --> 00:03:36,222
mekanizmaları üzerine çalışıyordu,

89
00:03:36,222 --> 00:03:38,200
birlikte çalıştığımız
animasyonla direkt olarak

90
00:03:38,200 --> 00:03:41,183
alakalı olan deneylerle
çıkageldi ve böylece

91
00:03:41,183 --> 00:03:45,304
animasyon araştırma
sürecine geri besleme yapabildi.

92
00:03:45,304 --> 00:03:48,157
İnanıyorum ki animasyon
biyolojiyi değiştirebilir.

93
00:03:48,157 --> 00:03:50,725
Bu bizim birbirimizle iletişim şeklimizi,

94
00:03:50,725 --> 00:03:52,348
verileri nasıl incelediğimizi
ve öğrencilerimizi

95
00:03:52,348 --> 00:03:53,675
nasıl eğittiğimizi değiştirebilir.

96
00:03:53,675 --> 00:03:55,129
Ama bu değişim için

97
00:03:55,129 --> 00:03:58,286
animasyon yapan daha fazla
araştırmacıya ihtiyacımız var

98
00:03:58,286 --> 00:04:00,541
ve bu doğrultuda yeni, ücretsiz,

99
00:04:00,541 --> 00:04:03,678
açık kaynaklı bir yazılım yaratmak için

100
00:04:03,678 --> 00:04:06,725
animatör ve programcılardan
oluşan bir ekip topladım.

101
00:04:06,725 --> 00:04:08,629
Buna "Moleküler Kitap" dedik

102
00:04:08,629 --> 00:04:10,525
ve bu yalnızca biyologların moleküler

103
00:04:10,525 --> 00:04:13,570
animasyonlar yaratmaları için yapıldı.

104
00:04:14,070 --> 00:04:17,782
Testlerimizde daha önce animasyon deneyimi

105
00:04:17,782 --> 00:04:21,050
olmayan bir biyoloğun
hipotezi için yapacağı

106
00:04:21,050 --> 00:04:23,786
ilk moleküler animasyonunu sadece

107
00:04:23,786 --> 00:04:25,308
15 dakikada bitirdiğini gördük.

108
00:04:25,308 --> 00:04:27,458
Ayrıca herkesin kendi animasyonunu

109
00:04:27,458 --> 00:04:30,233
görüntüleyebileceği, indirebileceği
ve katkıda bulunabileceği

110
00:04:30,233 --> 00:04:31,849
bir veritabanı yapıyoruz.

111
00:04:31,849 --> 00:04:33,820
Bu yazılımın beta versiyonun bugünden

112
00:04:33,820 --> 00:04:36,282
itibaren indirilmeye hazır olduğunu

113
00:04:36,282 --> 00:04:40,490
duyurmaktan büyük mutluluk duyuyoruz.

114
00:04:40,490 --> 00:04:43,233
Biyologların onunla
neler yaratabileceklerini,

115
00:04:43,233 --> 00:04:45,289
kendi animasyonlarını yaratırken

116
00:04:45,289 --> 00:04:46,770
elde edecekleri yeni içgörüleri

117
00:04:46,770 --> 00:04:48,473
görebileceğimiz için heyecanlıyız.

118
00:04:48,473 --> 00:04:50,713
Teşekkürler.

119
00:04:50,713 --> 00:04:53,871
(Alkışlar)