WEBVTT

00:00:00.710 --> 00:00:02.578
Bekijk deze tekening eens.

00:00:02.578 --> 00:00:04.183
Weet je wat ze voorstelt?

00:00:04.183 --> 00:00:06.930
Ik ben moleculair bioloog

00:00:06.930 --> 00:00:09.533
en ik ben dit soort tekeningen
vaak tegengekomen.

00:00:09.533 --> 00:00:12.105
Meestal noemen we ze een model,

00:00:12.105 --> 00:00:14.359
een tekening die laat zien
hoe we denken

00:00:14.359 --> 00:00:17.023
dat een cellulair
of moleculair proces plaatsvindt.

00:00:17.023 --> 00:00:19.522
Deze bijzondere tekening

00:00:19.522 --> 00:00:23.845
stelt clathrin-afhankelijke 
endocytose voor.

00:00:23.845 --> 00:00:26.455
Het is een proces waarbij een molecuul

00:00:26.455 --> 00:00:28.693
van buiten de cel naar binnen geraakt

00:00:28.693 --> 00:00:31.230
door ingevangen te worden
in een blaasje, of vesikel,

00:00:31.230 --> 00:00:34.050
dat vervolgens door de cel
wordt opgenomen.

00:00:34.050 --> 00:00:35.885
Maar er is een probleem 
met deze tekening,

00:00:35.885 --> 00:00:38.517
vooral dan door wat ze niet laat zien.

00:00:38.517 --> 00:00:39.982
Door een heleboel experimenten

00:00:39.982 --> 00:00:41.817
van vele wetenschappers

00:00:41.817 --> 00:00:44.813
weten we veel
over hoe moleculen eruit zien,

00:00:44.813 --> 00:00:46.495
hoe ze in de cel bewegen,

00:00:46.495 --> 00:00:48.320
en dat dit allemaal plaatsvindt

00:00:48.320 --> 00:00:51.310
in een ongelooflijk dynamische omgeving.

00:00:51.310 --> 00:00:54.783
We besloten om samen
met clathrine-expert Tomas Kirchhausen,

00:00:54.783 --> 00:00:57.102
een nieuw soort model te ontwerpen

00:00:57.102 --> 00:00:59.126
dat dat allemaal liet zien.

00:00:59.126 --> 00:01:00.862
We beginnen buiten de cel.

00:01:00.862 --> 00:01:02.510
Nu kijken we naar binnen.

00:01:02.510 --> 00:01:04.590
Clathrines zijn die driepotige moleculen,

00:01:04.590 --> 00:01:07.878
die zichzelf kunnen samenvoegen
tot voetbalachtige vormen.

00:01:07.878 --> 00:01:09.825
Door zich te binden aan een membraan

00:01:09.825 --> 00:01:11.742
kan clathrine het membraan vervormen

00:01:11.742 --> 00:01:13.155
en een soort kopje vormen

00:01:13.155 --> 00:01:15.462
waaruit een blaasje,
een vesikel, ontstaat.

00:01:15.462 --> 00:01:17.246
Hierin worden wat proteïnen

00:01:17.246 --> 00:01:18.900
van buiten de cel opgenomen.

00:01:18.900 --> 00:01:22.198
Proteïnen zorgen er nu voor
dat dit blaasje wordt afgeknepen,

00:01:22.198 --> 00:01:25.082
waardoor het zich afscheidt 
van de rest van het membraan.

00:01:25.082 --> 00:01:27.504
Dan is clathrine in principe
klaar met zijn werk,

00:01:27.504 --> 00:01:28.612
en nu gaan proteïnen -

00:01:28.612 --> 00:01:30.558
die gele en oranje dingen hier -

00:01:30.558 --> 00:01:33.100
die clathrinekooi weer uit elkaar halen.

00:01:33.100 --> 00:01:36.382
Al deze proteïnen kunnen
in principe gerecycleerd

00:01:36.382 --> 00:01:37.918
en opnieuw gebruikt worden.

00:01:37.918 --> 00:01:41.327
Deze processen zijn te klein
om rechtstreeks waarneembaar te zijn,

00:01:41.327 --> 00:01:43.159
zelfs niet met de beste microscopen.

00:01:43.159 --> 00:01:45.790
Animaties als deze zorgen
voor een echt krachtige manier

00:01:45.790 --> 00:01:48.808
om een hypothese te visualiseren.

00:01:48.808 --> 00:01:50.654
Hier nog een ander voorbeeld.

00:01:50.654 --> 00:01:53.390
Deze tekening geeft weer
hoe een onderzoeker denkt

00:01:53.390 --> 00:01:56.895
dat het HIV-virus
in en uit cellen geraakt.

00:01:56.895 --> 00:01:59.414
Ook dit is een enorme simplificatie

00:01:59.414 --> 00:02:01.158
die helemaal niet laat zien

00:02:01.158 --> 00:02:03.640
wat we eigenlijk weten
over deze processen.

00:02:03.640 --> 00:02:05.855
Misschien verbaast het je te weten

00:02:05.855 --> 00:02:08.622
dat deze eenvoudige tekeningen
de enige manier zijn

00:02:08.622 --> 00:02:12.454
waarop de meeste biologen
hun moleculaire hypotheses visualiseren.

00:02:12.454 --> 00:02:13.482
Waarom?

00:02:13.482 --> 00:02:15.472
Omdat films maken van processen

00:02:15.472 --> 00:02:18.326
zoals we denken dat ze echt gebeuren,
enorm moeilijk is.

00:02:18.326 --> 00:02:22.469
Ik ben in Hollywood maanden bezig geweest
met het aanleren van 3D-animatiesoftware.

00:02:22.469 --> 00:02:24.400
Elke animatie kost me maanden werk.

00:02:24.400 --> 00:02:27.750
Zoveel tijd kunnen de meeste
onderzoekers zich niet veroorloven.

00:02:27.750 --> 00:02:29.950
Maar de winst kan enorm zijn, dat wel.

00:02:29.950 --> 00:02:32.334
Moleculaire animaties zijn ongeëvenaard

00:02:32.334 --> 00:02:35.775
in hun vermogen
om een grote hoeveelheid informatie

00:02:35.775 --> 00:02:39.097
met uiterste nauwkeurigheid
naar een breed publiek over te brengen.

00:02:39.097 --> 00:02:40.870
Ik ben nu bezig met een nieuw project,

00:02:40.870 --> 00:02:42.448
'De wetenschap van HIV' genaamd,

00:02:42.448 --> 00:02:45.000
waar ik de gehele levenscyclus
van het HIV-virus

00:02:45.000 --> 00:02:47.774
zo nauwkeurig mogelijk zal animeren

00:02:47.774 --> 00:02:49.735
met alle moleculaire details.

00:02:49.735 --> 00:02:51.886
De animatie zal beschikken over gegevens

00:02:51.886 --> 00:02:54.862
die duizenden onderzoekers
in decennia hebben verzameld.

00:02:54.862 --> 00:02:57.942
Gegevens over hoe dit virus eruit ziet,

00:02:57.942 --> 00:03:01.030
hoe het in staat is om cellen
in ons lichaam te infecteren,

00:03:01.030 --> 00:03:05.002
en hoe therapieën helpen
om de infectie te bestrijden.

00:03:05.002 --> 00:03:07.331
In de loop der jaren
ontdekte ik dat animaties

00:03:07.331 --> 00:03:10.150
niet alleen bruikbaar zijn
om een idee te communiceren,

00:03:10.150 --> 00:03:11.646
maar ook erg handig zijn

00:03:11.646 --> 00:03:13.958
om een hypothese te verkennen.

00:03:13.958 --> 00:03:16.872
Biologen visualiseren de processen
die ze bestuderen

00:03:16.872 --> 00:03:19.374
meestal nog steeds
met behulp van pen en papier.

00:03:19.374 --> 00:03:22.854
Met de gegevens die we nu hebben,
is dat gewoon niet goed genoeg meer.

00:03:22.854 --> 00:03:25.090
Het proces van het creëren
van een animatie

00:03:25.090 --> 00:03:28.187
kan fungeren als een katalysator
die de onderzoekers toelaat

00:03:28.187 --> 00:03:30.758
om hun ideeën te laten kristalliseren
en verfijnen.

00:03:30.758 --> 00:03:32.702
Een onderzoekster met wie ik werkte

00:03:32.702 --> 00:03:34.598
en die werkt op moleculaire mechanismen

00:03:34.598 --> 00:03:36.222
van neurodegeneratieve ziekten,

00:03:36.222 --> 00:03:38.850
stelde experimenten op
die direct gerelateerd waren

00:03:38.850 --> 00:03:41.183
aan de animatie waar
zij en ik samen aan werkten.

00:03:41.183 --> 00:03:45.304
Zo kan animatie behulpzaam zijn
bij het onderzoeksproces.

00:03:45.304 --> 00:03:47.767
Ik geloof dat animatie
de biologie kan veranderen.

00:03:47.767 --> 00:03:50.725
Het kan impact hebben op hoe we
met elkaar communiceren,

00:03:50.725 --> 00:03:52.348
hoe we onze gegevens onderzoeken

00:03:52.348 --> 00:03:54.315
en hoe we onze studenten onderwijzen.

00:03:54.329 --> 00:03:58.286
Maar daarvoor moeten meer 
onderzoekers animaties gaan maken.

00:03:58.286 --> 00:04:03.664
Daarvoor bracht ik een team van biologen,
animatoren en programmeurs samen

00:04:03.664 --> 00:04:06.725
om nieuwe, gratis
open-source software te creëren.

00:04:06.725 --> 00:04:08.629
Het heet 'Molecular Flipbook'.

00:04:08.629 --> 00:04:10.525
Het dient om biologen

00:04:10.525 --> 00:04:14.070
moleculaire animaties te laten maken.

00:04:14.070 --> 00:04:17.781
Uit onze tests bleek
dat het maar een kwartier duurt

00:04:17.781 --> 00:04:21.050
voordat een bioloog die nooit eerder
met animatiesoftware werkte,

00:04:21.050 --> 00:04:25.326
een eerste moleculaire animatie
van haar eigen hypothese kon maken.

00:04:25.326 --> 00:04:27.458
Wij bouwen ook een online database op,

00:04:27.458 --> 00:04:31.833
waar iedereen eigen animaties
kan bekijken, downloaden en bijdragen.

00:04:31.849 --> 00:04:33.650
We zijn erg blij om aan te kondigen

00:04:33.650 --> 00:04:37.342
dat de beta-versie van de 
software-toolkit voor moleculaire animatie

00:04:37.342 --> 00:04:40.490
vanaf vandaag voor download
beschikbaar zal zijn.

00:04:40.490 --> 00:04:43.403
We kijken enthousiast uit
naar wat biologen ermee gaan maken

00:04:43.403 --> 00:04:45.529
en welke nieuwe inzichten 
ze gaan verkrijgen

00:04:45.529 --> 00:04:48.669
door hun eigen modellen te animeren.

00:04:48.669 --> 00:04:50.713
Dank je wel.

00:04:50.713 --> 00:04:53.871
(Applaus)