WEBVTT 00:00:00.982 --> 00:00:05.071 Je vais vous parler des machines les plus incroyables au monde 00:00:05.071 --> 00:00:07.396 et de ce que nous pouvons en faire. 00:00:07.396 --> 00:00:08.579 Les protéines, 00:00:08.579 --> 00:00:10.693 que vous voyez dans cette cellule, 00:00:10.863 --> 00:00:14.963 remplissent l'essentiel des fonctions majeures de notre organisme. 00:00:14.973 --> 00:00:16.851 Elles assimilent notre nourriture, 00:00:16.875 --> 00:00:18.581 elles contractent nos muscles 00:00:18.605 --> 00:00:20.182 elles font marcher nos neurones 00:00:20.206 --> 00:00:22.402 et alimentent notre système immunitaire. 00:00:22.402 --> 00:00:24.376 Tous les phénomènes biologiques – 00:00:24.400 --> 00:00:25.551 presque tous – 00:00:25.575 --> 00:00:27.237 sont créés par les protéines. NOTE Paragraph 00:00:27.698 --> 00:00:32.326 Les protéines sont des chaînes linéaires de composants appelés acides aminés. 00:00:32.366 --> 00:00:35.599 La nature utilise un alphabet de 20 acides aminés, 00:00:35.623 --> 00:00:38.078 dont certains noms vous sont peut-être familiers. 00:00:38.921 --> 00:00:42.463 Sur cette image à l'échelle, chaque boule est un atome. 00:00:43.351 --> 00:00:47.949 Les forces chimiques entre acides aminées créent ces longues molécules filiformes 00:00:48.019 --> 00:00:51.480 qui se replient en des structures tridimensionnelles sans pareil. 00:00:51.937 --> 00:00:53.277 Le phénomène de repliement, 00:00:53.301 --> 00:00:54.735 qui peut sembler aléatoire, 00:00:54.759 --> 00:00:56.722 est en fait très précis. 00:00:56.746 --> 00:01:01.143 Chaque protéine se replie à chaque fois dans sa forme caractéristique 00:01:01.167 --> 00:01:04.665 et le phénomène de repliement prend tout juste une fraction de seconde. 00:01:06.029 --> 00:01:07.873 C'est la forme des protéines 00:01:07.897 --> 00:01:12.077 qui leur permet de développer leurs remarquables fonctions biologiques. 00:01:12.520 --> 00:01:13.671 Par exemple, 00:01:13.695 --> 00:01:17.203 l'hémoglobine a une forme idéalement adaptée aux poumons 00:01:17.227 --> 00:01:19.214 pour transporter une molécule d'oxygène. 00:01:19.499 --> 00:01:21.651 Quand l'hémoglobine se déplace vers le muscle, 00:01:21.675 --> 00:01:23.607 sa forme change légèrement 00:01:23.631 --> 00:01:25.822 et l'oxygène ressort. NOTE Paragraph 00:01:27.494 --> 00:01:28.860 Les formes des protéines 00:01:28.884 --> 00:01:31.097 et donc leurs remarquables fonctions, 00:01:31.121 --> 00:01:37.051 sont entièrement décrites dans la séquence d'acides aminés de la chaîne de protéines. 00:01:37.331 --> 00:01:41.272 Sur cette image, les lettres du dessus représentent chacune un acide aminé. 00:01:42.860 --> 00:01:44.697 D'où viennent ces séquences ? 00:01:45.586 --> 00:01:50.410 Les gènes dans votre génome déterminent les séquences d'acides aminés 00:01:50.434 --> 00:01:51.832 de vos protéines. 00:01:51.856 --> 00:01:55.594 Chaque gène code la séquence d'acides aminés d'une seule protéine. 00:01:57.515 --> 00:02:01.317 La traduction entre ces séquences d'acides aminés 00:02:01.341 --> 00:02:03.799 et les structures et fonctions des protéines 00:02:03.823 --> 00:02:06.400 est appelé le problème de repliement des protéines. 00:02:06.439 --> 00:02:07.984 C'est un problème très complexe 00:02:08.008 --> 00:02:11.188 car une protéine peut adopter tellement de formes différentes. 00:02:12.073 --> 00:02:13.718 En raison de cette complexité, 00:02:13.742 --> 00:02:17.119 les humains n'ont pu exploiter le potentiel des protéines 00:02:17.119 --> 00:02:20.265 qu'en apportant d'infimes changements aux séquences d'acides aminés 00:02:20.265 --> 00:02:22.366 des protéines à l'état naturel. NOTE Paragraph 00:02:22.835 --> 00:02:26.637 C'est similaire au procédé utilisé par nos ancêtres de l'âge de pierre 00:02:26.717 --> 00:02:30.020 pour fabriquer les outils en bois et en pierre 00:02:30.100 --> 00:02:32.333 que nous avons trouvés dans le monde entier. 00:02:33.226 --> 00:02:38.250 Mais les humains n'ont pas appris à voler en modifiant des oiseaux. NOTE Paragraph 00:02:38.790 --> 00:02:40.807 (Rires) NOTE Paragraph 00:02:40.831 --> 00:02:47.075 Grâce aux oiseaux, les scientifiques ont découvert les principes aérodynamiques. 00:02:47.165 --> 00:02:52.135 Les ingénieurs les ont ensuite utilisés pour concevoir des machines volantes. 00:02:52.195 --> 00:02:53.440 De la même manière, 00:02:53.464 --> 00:02:55.406 nous travaillons depuis plusieurs années 00:02:55.426 --> 00:02:58.693 pour découvrir les principes fondamentaux du repliement des protéines 00:02:58.723 --> 00:03:02.782 et intégrer ces principes dans Rosetta, un programme informatique. 00:03:03.742 --> 00:03:06.255 Nous avons beaucoup avancé ces dernières années. 00:03:07.029 --> 00:03:12.356 Nous pouvons désormais concevoir des protéines à partir de zéro sur ordinateur. 00:03:12.396 --> 00:03:15.224 Une fois la nouvelle protéine créée, 00:03:15.224 --> 00:03:19.145 nous codons sa séquence d'acides aminés dans un gène synthétique. 00:03:19.656 --> 00:03:21.504 Nous devons créer un gène synthétique 00:03:21.544 --> 00:03:23.843 car, comme la protéine est complétement nouvelle, 00:03:23.863 --> 00:03:28.605 aucun gène d'un organisme existant ne peut le coder. NOTE Paragraph 00:03:29.697 --> 00:03:33.884 Nos progrès dans la compréhension du repliement des protéines 00:03:33.908 --> 00:03:35.630 et dans la façon de les concevoir, 00:03:35.654 --> 00:03:39.282 associés à la diminution du coût de la synthèse de gènes 00:03:39.306 --> 00:03:42.805 et à l'augmentation de la puissance de calcul selon la loi de Moore, 00:03:42.829 --> 00:03:47.565 nous permettent désormais de concevoir des milliers de nouvelles protéines, 00:03:47.589 --> 00:03:49.928 avec de nouvelles formes, de nouvelles fonctions, 00:03:49.952 --> 00:03:51.465 par ordinateur, 00:03:51.489 --> 00:03:55.404 et de coder chacune d'elles dans un gène synthétique. 00:03:56.248 --> 00:03:58.486 Une fois que nous avons ces gènes synthétiques, 00:03:58.486 --> 00:04:00.205 nous les mettons dans des bactéries 00:04:00.205 --> 00:04:03.684 pour les programmer afin de fabriquer ces toutes nouvelles protéines. 00:04:03.684 --> 00:04:05.270 On extrait ensuite les protéines 00:04:05.294 --> 00:04:08.730 et on voit si elles fonctionnent comme nous les avons conçues 00:04:08.754 --> 00:04:10.405 et si elles sont sûres. NOTE Paragraph 00:04:11.777 --> 00:04:14.392 C'est super de pouvoir produire de nouvelles protéines, 00:04:14.392 --> 00:04:16.852 car malgré la diversité de la nature, 00:04:16.876 --> 00:04:23.240 l'évolution n'a montré qu'une infime part de toutes les protéines possibles. 00:04:23.572 --> 00:04:27.067 Je vous ai dit que la nature utilise un alphabet de 20 acides aminés, 00:04:27.091 --> 00:04:31.560 une protéine type est une chaîne d'une centaine d'acides aminés, 00:04:31.564 --> 00:04:37.116 le nombre total de possibilités est donc 20 fois 20 fois 20, multiplié par 100, 00:04:37.140 --> 00:04:40.957 ce qui est un nombre de l'ordre de 10 à la puissance 130 00:04:40.981 --> 00:04:44.793 C'est énormément plus que le nombre total de protéines 00:04:44.817 --> 00:04:47.773 qui ont existé depuis le début de la vie sur Terre. 00:04:47.990 --> 00:04:50.681 C'est cet espace incroyablement grand 00:04:50.705 --> 00:04:55.521 que nous pouvons désormais explorer grâce à la conception informatique de protéines. NOTE Paragraph 00:04:55.747 --> 00:04:58.136 Les protéines qui existent sur Terre 00:04:58.136 --> 00:05:02.655 ont évolué pour répondre aux problèmes rencontrés par l'évolution naturelle. 00:05:02.705 --> 00:05:05.058 Par exemple, en répliquant le génome. 00:05:06.018 --> 00:05:08.442 Mais nous rencontrons de nouveaux défis aujourd'hui. 00:05:08.442 --> 00:05:11.393 Nous vivons plus vieux, de nouvelles maladies sont importantes. 00:05:11.393 --> 00:05:13.442 Nous réchauffons et polluons la planète, 00:05:13.442 --> 00:05:16.994 nous faisons donc face à une multitude de défis écologiques. 00:05:17.757 --> 00:05:19.805 Si on pouvait attendre un million d'années, 00:05:19.805 --> 00:05:23.507 de nouvelles protéines pourraient évoluer pour répondre à ces défis. 00:05:23.787 --> 00:05:26.416 Mais on ne peut pas attendre des millions d'années. 00:05:26.488 --> 00:05:29.359 A la place, grâce à la conception informatique de protéines, 00:05:29.383 --> 00:05:33.822 on peut concevoir de nouvelles protéines pour relever ces défis dès aujourd'hui. NOTE Paragraph 00:05:35.693 --> 00:05:40.143 Notre idée audacieuse est de faire sortir la biologie de l'âge de pierre 00:05:40.167 --> 00:05:43.402 grâce à la révolution technologique dans la conception des protéines. 00:05:44.023 --> 00:05:46.977 On a déjà montré qu'on pouvait concevoir de nouvelles protéines 00:05:47.001 --> 00:05:49.174 avec de nouvelles formes et fonctions. 00:05:49.174 --> 00:05:53.482 Par exemple, les vaccins agissent en stimulant le système immunitaire 00:05:53.506 --> 00:05:57.008 pour qu'il réagisse fortement contre un agent pathogène. 00:05:57.698 --> 00:05:59.249 Pour créer de meilleurs vaccins, 00:05:59.273 --> 00:06:01.575 nous avons conçu des particules de protéines 00:06:01.599 --> 00:06:05.186 auxquelles nous pouvons fusionner des protéines d'agents pathogènes, 00:06:05.210 --> 00:06:09.544 comme cette protéine bleue ici, du virus respiratoire syncytial ou VRS. 00:06:10.071 --> 00:06:11.861 Pour fabriquer des vaccins potentiels 00:06:11.885 --> 00:06:15.548 qui grouillent littéralement de protéines virales, 00:06:15.572 --> 00:06:18.142 nous constatons que ces vaccins potentiels 00:06:18.166 --> 00:06:21.468 produisent une réponse immunitaire beaucoup plus forte au virus 00:06:21.492 --> 00:06:24.603 que tous les vaccins qui ont été testés jusqu'à présent. 00:06:24.648 --> 00:06:28.722 C'est important car le VRS est actuellement l'une des principales causes 00:06:28.762 --> 00:06:31.461 de la mortalité infantile dans le monde. 00:06:32.414 --> 00:06:36.377 On a aussi conçu de nouvelles protéines pour décomposer le gluten dans l'estomac 00:06:36.401 --> 00:06:37.998 pour la maladie cœliaque 00:06:38.022 --> 00:06:43.268 et d'autres protéines pour stimuler le système immunitaire face au cancer. 00:06:43.338 --> 00:06:47.727 Ces avancées sont le début de la révolution de la conception des protéines. NOTE Paragraph 00:06:48.780 --> 00:06:52.040 Nous avons été inspirés par une précédente révolution technologique : 00:06:52.064 --> 00:06:53.409 la révolution numérique, 00:06:53.433 --> 00:06:58.558 qui a pris place en grande partie grâce aux progrès réalisés au même endroit, 00:06:58.582 --> 00:06:59.854 les laboratoires Bell. 00:07:00.337 --> 00:07:03.661 Les laboratoires Bell avaient un environnement ouvert, collaboratif 00:07:03.661 --> 00:07:06.948 et ont été en mesure d'attirer les meilleurs talents du monde entier. 00:07:07.418 --> 00:07:10.860 Ce qui a conduit à une remarquable série d'innovations – 00:07:10.884 --> 00:07:15.075 le transistor, le laser, la communication par satellite 00:07:15.099 --> 00:07:16.825 et les bases d'Internet. 00:07:17.761 --> 00:07:22.056 Nous voulons bâtir les laboratoires Bell de la conception de protéines. 00:07:22.076 --> 00:07:25.591 Nous cherchons à attirer des scientifiques talentueux du monde entier 00:07:25.615 --> 00:07:28.550 pour accélérer la révolution de la conception de protéines 00:07:28.574 --> 00:07:32.662 et nous nous concentrerons sur cinq grands défis. NOTE Paragraph 00:07:34.136 --> 00:07:39.733 Premièrement, en prenant des souches de grippe du monde entier 00:07:39.757 --> 00:07:43.311 et en les plaçant sur des particules de protéines conçues 00:07:43.335 --> 00:07:45.002 comme je vous ai montré plus tôt, 00:07:45.002 --> 00:07:48.440 nous avons l'intention de fabriquer un vaccin universel contre la grippe, 00:07:48.440 --> 00:07:52.391 dont une injection donne une protection à vie contre la grippe. 00:07:53.356 --> 00:07:54.968 La capacité de concevoir – NOTE Paragraph 00:07:54.992 --> 00:08:00.216 (Applaudissements) NOTE Paragraph 00:08:00.240 --> 00:08:03.308 La capacité de concevoir de nouveaux vaccins par ordinateur 00:08:03.332 --> 00:08:08.640 est importante à la fois pour se protéger des épidémies naturelles de grippe 00:08:08.664 --> 00:08:12.144 et également contre des actes intentionnels de bioterrorisme. NOTE Paragraph 00:08:13.182 --> 00:08:16.562 Deuxièmement, nous allons bien au-delà de l'alphabet limité de la nature 00:08:16.586 --> 00:08:18.297 de seulement 20 acides aminés 00:08:18.321 --> 00:08:23.040 pour concevoir de nouveaux traitements à des maladies comme la douleur chronique, 00:08:23.080 --> 00:08:25.711 en utilisant un alphabet de milliers d'acides aminés. NOTE Paragraph 00:08:26.602 --> 00:08:30.415 Troisièmement, nous construisons des vecteurs avancés d'administration 00:08:30.439 --> 00:08:34.603 pour cibler les médicaments vers leur destination précise dans le corps. 00:08:35.226 --> 00:08:37.875 Par exemple, la chimiothérapie sur une tumeur 00:08:37.899 --> 00:08:42.202 ou les thérapies géniques des tissus là où la réparation de l'ADN doit avoir lieu. NOTE Paragraph 00:08:43.000 --> 00:08:49.536 Quatrièmement, nous créons des thérapies intelligentes s'adaptant dans le corps 00:08:49.556 --> 00:08:51.794 pour aller bien au-delà des traitements actuels, 00:08:51.794 --> 00:08:54.058 qui sont vraiment des outils émoussés. 00:08:54.082 --> 00:08:58.431 Par exemple, pour cibler un petit sous-ensemble de cellules immunitaires 00:08:58.455 --> 00:09:00.536 responsables d'une maladie auto-immune, 00:09:00.560 --> 00:09:04.128 et pour le distinguer de la vaste majorité des cellules immunitaires saines. NOTE Paragraph 00:09:04.899 --> 00:09:08.311 Enfin, inspirés par de remarquables matériaux biologiques 00:09:08.335 --> 00:09:13.443 comme la soie, la coquille d'ormeau, la dent et bien d'autres, 00:09:13.467 --> 00:09:16.351 nous concevons de nouveaux matériaux à base de protéines 00:09:16.375 --> 00:09:20.538 afin de relever les défis énergétiques et écologiques. NOTE Paragraph 00:09:21.558 --> 00:09:24.403 Pour accomplir tout cela, nous développons notre institut. 00:09:24.768 --> 00:09:30.367 Nous souhaitons attirer des scientifiques dynamiques, talentueux et variés 00:09:30.391 --> 00:09:33.471 du monde entier, à toutes les étapes de leur carrière, 00:09:33.495 --> 00:09:35.025 pour qu'ils nous rejoignent. 00:09:35.064 --> 00:09:38.607 Vous pouvez aussi participer à la révolution de la conception des protéines 00:09:38.631 --> 00:09:42.375 grâce à Foldit, notre jeu de pliage et de conception en ligne. 00:09:43.214 --> 00:09:47.065 Ainsi qu'à travers Rosetta@home, notre projet informatique distribué, 00:09:47.089 --> 00:09:50.820 que vous pouvez rejoindre depuis un ordinateur ou un smartphone Android. NOTE Paragraph 00:09:52.547 --> 00:09:56.906 Améliorer le monde grâce à la conception de protéines est l’œuvre de ma vie. 00:09:56.906 --> 00:09:59.664 Je suis si impatient de ce que nous pouvons faire ensemble. 00:09:59.664 --> 00:10:01.523 J'espère que vous vous joindrez à nous 00:10:01.523 --> 00:10:02.715 et je vous remercie. NOTE Paragraph 00:10:02.715 --> 00:10:05.374 (Applaudissements et acclamations)