WEBVTT 00:00:00.347 --> 00:00:03.075 Beszélgessünk még egy kicsit arról, 00:00:03.075 --> 00:00:05.805 hogy a DNS hogyan másolja magát, 00:00:05.805 --> 00:00:06.845 miként replikálódik, 00:00:06.845 --> 00:00:09.381 és hogy mik azok a szereplők, 00:00:09.381 --> 00:00:11.120 amelyek közreműködnek e folyamatban. 00:00:11.120 --> 00:00:13.426 Eközben sokszor említjük majd 00:00:13.426 --> 00:00:17.514 a DNS molekula 3' és 5' (3 vessző és 5 vessző) végeit. 00:00:17.514 --> 00:00:19.823 Ha még sosem hallottál erről, 00:00:19.823 --> 00:00:21.944 akkor nézd meg a videót 00:00:21.944 --> 00:00:26.041 a DNS antiparallel szerkezetéről. 00:00:26.041 --> 00:00:28.163 Ismételjük át egy kicsit, 00:00:28.163 --> 00:00:31.177 ha esetleg régen láttad utoljára. 00:00:31.177 --> 00:00:33.042 Itt a DNS részletes ábrája 00:00:33.042 --> 00:00:35.394 az előbb említett videóból. 00:00:35.394 --> 00:00:37.694 Az 5' és 3' elnevezés 00:00:37.694 --> 00:00:40.762 arra utal, hogy mi zajlik azokon a ribózmolekulákon, 00:00:40.762 --> 00:00:44.840 amelyek ennek a foszfát-cukor gerincnek az alkotórészei. 00:00:44.840 --> 00:00:46.941 Itt egy ribóz, 00:00:46.941 --> 00:00:48.459 ami egy öt szénatomos cukor. 00:00:48.459 --> 00:00:50.630 Megszámozhatjuk a szénatomokat: 00:00:50.630 --> 00:00:54.716 ez az 1' helyzetű szénatom, ez a 2', 00:00:54.716 --> 00:00:58.326 ez a 3', ez a 4', 00:00:58.326 --> 00:01:00.551 ez pedig az 5' helyzetű szénatom. 00:01:00.551 --> 00:01:04.563 A létrának ezen az oldalán 00:01:04.563 --> 00:01:08.107 az úgynevezett haladási (lefutási) irány... 00:01:08.107 --> 00:01:10.216 (iderajzolok egy vonalat) 00:01:10.216 --> 00:01:15.098 Ez 3'-5' irányban halad. 00:01:15.098 --> 00:01:19.308 Ez vég a 3' vég, ez pedig az 5' vég. 00:01:19.308 --> 00:01:20.546 A lefutási iránya 3'-5'. 00:01:20.546 --> 00:01:23.550 Ez a foszfátcsoport az egyik gyűrű 3' atomjához csatlakozik. 00:01:23.550 --> 00:01:25.934 Ennek a gyűrűnek az 5' atomja egy foszfátcsoporthoz, 00:01:25.934 --> 00:01:27.358 az pedig a következő gyűrű 3' atomjához, 00:01:27.358 --> 00:01:28.464 az pedig... 00:01:28.464 --> 00:01:31.260 az 5' atomján át egy foszfátcsoporthoz kapcsolódik. 00:01:31.260 --> 00:01:34.003 A másik vég, mint mondtuk, antiparallel szál 00:01:34.003 --> 00:01:36.676 Párhuzamos az előbbivel, de fordított irányban fut. 00:01:36.676 --> 00:01:39.509 Tehát ez a 3' atom, ez az 5', 00:01:40.379 --> 00:01:43.515 ez 3', ez 5', 00:01:43.515 --> 00:01:44.979 Ezt jelenti tehát 00:01:44.979 --> 00:01:47.563 az antiparallel szerkezet. 00:01:47.563 --> 00:01:49.418 A molekula két gerince 00:01:49.418 --> 00:01:51.449 ez a két szál egymással párhuzamos, 00:01:51.449 --> 00:01:54.661 de ellentétes irányban futnak. 00:01:54.661 --> 00:01:58.833 Tehát ez a 3' vég, ez pedig az 5' vég. 00:01:58.833 --> 00:02:00.402 Ezt nagyon fontos tudni ahhoz 00:02:00.402 --> 00:02:02.070 hogy értsük a replikációt, 00:02:02.070 --> 00:02:04.030 mivel a DNS-polimeráz, 00:02:04.030 --> 00:02:06.767 ami beépíti az új nukleotidokat, 00:02:06.767 --> 00:02:09.327 a növekvő DNS-szálba, 00:02:09.327 --> 00:02:12.827 csak a 3' véghez tudja kapcsolni a nukleotidokat. 00:02:13.872 --> 00:02:16.828 Itt például 00:02:16.828 --> 00:02:18.456 a hosszbbítás csak... 00:02:18.456 --> 00:02:21.741 csak ebben az irányban végezhető. 00:02:21.741 --> 00:02:24.250 A másik irányban nem. 00:02:24.250 --> 00:02:27.000 v 00:02:27.000 --> 00:02:29.386 Úgy is mondhatjuk, hogy az új nukleotidokat 00:02:29.386 --> 00:02:33.074 csak a 3' véghez kapcsolhatjuk, 00:02:33.074 --> 00:02:36.741 vagyis a DNS hosszabbítása csak 5'- 3' irányban történhet. 00:02:38.793 --> 00:02:40.978 Ha csak a 3' véget hosszabbítjuk, 00:02:40.978 --> 00:02:45.038 akkor az 5' irányból a 3' irányba haladunk. 00:02:45.038 --> 00:02:47.733 Nem haladhatunk 3' - 5' irányba. 00:02:47.733 --> 00:02:52.410 A hosszabbítás az 5' végen polimerázzal nem lehetséges. 00:02:52.410 --> 00:02:55.146 Miről szól a polimeráz... 00:02:55.146 --> 00:02:57.046 Vizsgáljuk meg a fenti ábrát, 00:02:57.046 --> 00:02:58.985 ahol együtt látható 00:02:58.985 --> 00:03:01.023 a folyamat összes szereplője. 00:03:01.023 --> 00:03:03.512 Itt a DNS-szál, 00:03:03.512 --> 00:03:07.270 az eredeti formájában 00:03:07.270 --> 00:03:09.769 a megkettőződés előtti alakjában. 00:03:09.769 --> 00:03:13.591 Megjelöltük a 3' és az 5' végeket, 00:03:13.591 --> 00:03:15.436 és követhető a szálak iránya. 00:03:15.436 --> 00:03:19.204 Ez a 3', kövessük végig 00:03:19.204 --> 00:03:22.914 ez a hozzá tartozó 5' vég. 00:03:22.914 --> 00:03:26.741 Ezek tehát ugyanazon szál végei 00:03:26.741 --> 00:03:30.402 Ez pedig, ha égig követjük, 00:03:30.402 --> 00:03:32.409 ugyanaz a szál 00:03:32.409 --> 00:03:33.654 Ez a 3' vége 00:03:33.654 --> 00:03:37.821 ez pedig az 5' vége. 00:03:38.954 --> 00:03:40.118 Elsőként... 00:03:40.118 --> 00:03:41.795 amint elhangzott a korábbi videókban 00:03:41.795 --> 00:03:44.154 amelyekben áttekintettük a replikációt 00:03:44.154 --> 00:03:48.321 a hélixet alkotó két szál 00:03:49.992 --> 00:03:54.031 a két DNS-szálnak szét kell válnia, 00:03:54.031 --> 00:03:56.271 hogy felépülhessen a másik 00:03:56.271 --> 00:03:58.757 a létra másik oldala 00:03:58.757 --> 00:04:01.076 a szétvált szálak mentén. 00:04:01.076 --> 00:04:04.092 Akárcsak egy cipzár, 00:04:04.092 --> 00:04:08.299 amit szétnyitunk, majd mindkét feléhez egy új cipzárat erősítünk 00:04:08.299 --> 00:04:10.041 x 00:04:10.041 --> 00:04:12.419 A valóságban viszont sokkal bonyolultabb, 00:04:12.419 --> 00:04:15.300 mintha csak szétnyitnánk egy cipzárat, aztán újat teszünk rá. 00:04:15.300 --> 00:04:18.296 Kell hozzá egy rakás enzim, és egyebek, 00:04:18.296 --> 00:04:20.151 még ezen az ábrán sem látható 00:04:20.151 --> 00:04:21.845 az összes közreműködő. 00:04:21.845 --> 00:04:24.000 De a legfontosabb résztvevők igen 00:04:24.000 --> 00:04:26.459 legalábbis azok, amiket megemlítünk 00:04:26.459 --> 00:04:30.249 amikor a DNS-replikációró beszélünk. 00:04:30.249 --> 00:04:31.576 Először is az történik, 00:04:31.576 --> 00:04:35.484 ez itt szorosan fel van tekeredve. 00:04:35.484 --> 00:04:36.445 Ezt ide is írom. 00:04:36.445 --> 00:04:38.862 Szorosan fel van tekeredve. 00:04:40.302 --> 00:04:41.443 Ha belegondolunk, ez úgy működik, 00:04:41.443 --> 00:04:44.052 hogy minél jobban széttekerjük az egyik oldalon, 00:04:44.052 --> 00:04:46.421 annál szorosabban tekeredik a másik oldalon. 00:04:46.421 --> 00:04:48.903 A cipzár felnyitásához tehát 00:04:48.903 --> 00:04:50.584 szükséges egy enzim, 00:04:50.584 --> 00:04:54.861 ami segít széttekerni ezt a szorosan feltekert hélixet. 00:04:54.861 --> 00:04:58.676 Ez az enzim a topoizomeráz. 00:04:58.676 --> 00:05:00.993 Úgy működik, 00:05:00.993 --> 00:05:04.776 hogy időlegesen felhasítja a gerincek egyes pontjait, 00:05:04.776 --> 00:05:07.982 hogy szétttekeredjen, aztán újra összekapcsolódnak, 00:05:07.982 --> 00:05:11.097 De a lényeg, hogy széttekeri, 00:05:11.097 --> 00:05:12.762 hogy aztán a helikáz enzim... 00:05:12.762 --> 00:05:14.044 A helikáz persze nem úgy néz ki, 00:05:14.044 --> 00:05:16.351 mint ez a kis háromszög, ami épp hasítja a .. 00:05:16.351 --> 00:05:18.057 A valóságban ezek sokkal .... 00:05:18.057 --> 00:05:19.427 ha a valóságban látnánk 00:05:19.427 --> 00:05:21.659 a helikáz molekuláris szerkezetét. 00:05:21.659 --> 00:05:23.437 A helikáz feladata az, 00:05:23.437 --> 00:05:26.874 hogy felszakítsa a hidrogénkötéseket 00:05:26.874 --> 00:05:29.156 a nitrogéntartalmú bázisok között. 00:05:29.156 --> 00:05:31.550 Itt épp egy adenin és egy timin közt 00:05:31.550 --> 00:05:35.514 szakítja fel a hidrogénkötéseket. 00:05:35.514 --> 00:05:37.514 Első tehát a széttekeredés 00:05:39.511 --> 00:05:40.841 aztán a hlkáz. 00:05:40.841 --> 00:05:42.831 A topoizomeráz széttekeri 00:05:42.831 --> 00:05:45.555 aztán a helikáz felszakítja a kötéseket. 00:05:45.555 --> 00:05:47.504 Innentől kezdve 00:05:47.504 --> 00:05:49.744 külön tárgyaljuk a két szálat, 00:05:49.744 --> 00:05:51.109 mivel, mint említettem, 00:05:51.109 --> 00:05:53.633 az új nukleotidokat 00:05:53.633 --> 00:05:56.466 csak 5'-3' irányban kapcsolhatjuk hozzá. 00:05:57.693 --> 00:05:59.864 Az alsó szálat tehát 00:05:59.864 --> 00:06:02.399 vezető szálnak nevezzük. 00:06:02.399 --> 00:06:04.236 Ezen tök egyszerűen halad a folyamat 00:06:04.236 --> 00:06:06.428 emlékezz, ez az 5' vége, 00:06:06.428 --> 00:06:07.829 a lánc hosszabbítása tehát 00:06:07.829 --> 00:06:10.349 ebben az irányban folytatódhat. 00:06:10.349 --> 00:06:13.527 c 00:06:13.527 --> 00:06:15.277 Ez az 5'-3' irány. 00:06:16.496 --> 00:06:20.116 Itt a folyamat elindításához 00:06:20.116 --> 00:06:21.949 kell egy RNS-primer 00:06:22.818 --> 00:06:26.234 és az az enzim, amelyik létrehozza az RNS-primert. 00:06:26.234 --> 00:06:28.107 Ez a DNS-primáz. 00:06:28.107 --> 00:06:29.684 Erről még beszélünk 00:06:29.684 --> 00:06:31.967 a követő szál kapcsán 00:06:31.967 --> 00:06:33.328 de a lányeg, hogy RNS-t kapcsolnak 00:06:33.328 --> 00:06:35.650 ezt egy másik színnel jelölöm. 00:06:35.650 --> 00:06:37.768 Ide kapcsolódik egy RNS-primer. 00:06:37.768 --> 00:06:39.598 Miután a primer ide kapcsolódott, 00:06:39.598 --> 00:06:44.239 A DNS-polimeráz megkezdheti a további nukleotidok hozzáadását. 00:06:44.239 --> 00:06:47.159 a 3' véghez. 00:06:47.159 --> 00:06:49.430 Azért olyan egyszerű a vezető szálon, 00:06:49.430 --> 00:06:52.680 mert ez a DNS-polimeráz... 00:06:53.613 --> 00:06:55.692 ismétlem, 00:06:55.692 --> 00:06:59.107 ezek nem olyan háromszögek, mint ezen a képen, 00:06:59.107 --> 00:07:01.326 A valóságban sokkal .............. 00:07:01.326 --> 00:07:02.712 Itt láthatók 00:07:02.712 --> 00:07:07.079 c 00:07:07.079 --> 00:07:08.477 Ez a polimeráz 00:07:08.477 --> 00:07:11.601 csak a cipzár felnyílását követi 00:07:11.601 --> 00:07:13.473 és eközben újabb és újabb 00:07:13.473 --> 00:07:17.191 nukleotidokat kapcsol a 3' véghez. 00:07:17.191 --> 00:07:20.831 Ez elég egyszerű. 00:07:20.831 --> 00:07:23.232 Könnyű lenne, 00:07:23.232 --> 00:07:26.893 ha az 5' véghez is kapcsolhatnánk nukleotidokat, 00:07:26.893 --> 00:07:28.433 hiszen akkor úgy vehetnénk, 00:07:28.433 --> 00:07:31.128 hogy ez a szál 3'-5' irányban halad, 00:07:31.128 --> 00:07:33.399 akkor mondjuk egy másik fajta polimeráz 00:07:33.399 --> 00:07:35.563 hozzákapcsolhatná a nukleotidokat 00:07:35.563 --> 00:07:37.308 és ezzel a dolog el lenne intézve. 00:07:37.308 --> 00:07:40.011 A valóságban ez nem így működik. 00:07:40.011 --> 00:07:43.841 Az 5' véghez nem lehet újabb nukkleotidokat kapcsolni 00:07:43.841 --> 00:07:46.620 Ez pedig láthatóan a 3' vég 00:07:46.620 --> 00:07:48.401 erről a szálról beszélek.c 00:07:48.401 --> 00:07:50.295 Másik színnel rajzolom. 00:07:50.295 --> 00:07:52.332 c 00:07:52.332 --> 00:07:55.454 Ezen a szálon 00:07:55.454 --> 00:07:58.856 ez a 3' vég, ez pedig az 5' vég, 00:07:58.856 --> 00:07:59.689 c 00:07:59.689 --> 00:08:03.343 ezért így nem lehet nukleotidokat. 00:08:03.343 --> 00:08:06.343 Hogyan oldja meg ezt a dolgot a biológia? 00:08:07.439 --> 00:08:10.659 Primereket ad, 00:08:10.659 --> 00:08:14.278 ahogy a szétnyílás megtörténik 00:08:14.278 --> 00:08:17.197 a képen látható, hogy a primer nem csak egy nukleotid 00:08:17.197 --> 00:08:19.570 hanem általában több 00:08:19.570 --> 00:08:21.467 mintegy 10 nukleotid 00:08:21.467 --> 00:08:25.634 Tehát kb. 10 RNS nukleotidot ad 00:08:27.151 --> 00:08:29.060 ezt a DNS primáz végzi. 00:08:29.060 --> 00:08:32.415 A DNS-primáz tehát a követő szálon 00:08:32.415 --> 00:08:36.800 ezen az oldalon, felül, 00:08:36.800 --> 00:08:38.382 és ad. 00:08:38.382 --> 00:08:41.280 Bekapcsolja az RNS-primert, 00:08:41.280 --> 00:08:42.773 ami nem csak egy nukleotid 00:08:42.773 --> 00:08:45.186 hanem sok 00:08:45.186 --> 00:08:48.008 Amint megvan az RNS-primer 00:08:48.008 --> 00:08:52.175 a polimeráz hozzákapcsolhat 5'-3' irányban 00:08:53.349 --> 00:08:55.432 mindig a 3' véghez. 00:08:56.408 --> 00:08:58.606 hozzá 00:08:58.606 --> 00:09:00.918 így 00:09:00.918 --> 00:09:02.286 Úgy képzelhető el a folyamat 00:09:02.286 --> 00:09:06.766 jön a promáz, hozzákapcsolja a primert 00:09:06.766 --> 00:09:10.933 és megkezdődik a lánchosszabbítás 5'-3' irányban. 00:09:12.465 --> 00:09:14.684 így 00:09:14.684 --> 00:09:16.818 aztán egy kis ugrás, és ismétlődik. 00:09:16.818 --> 00:09:20.665 Keletkezik egy sor kis szakasz 00:09:20.665 --> 00:09:24.492 amelyeket Okazaki-fragmenteknek nevezünk. 00:09:24.492 --> 00:09:26.909 Okazaki-fragmentek, 00:09:28.251 --> 00:09:30.750 a követő szálon 00:09:30.750 --> 00:09:31.621 d 00:09:31.621 --> 00:09:32.705 miért hívják követő szálnak 00:09:32.705 --> 00:09:34.996 s 00:09:34.996 --> 00:09:36.555 mintha tökéletlen volna 00:09:36.555 --> 00:09:39.020 ezeket az Okazaki-fragmenteket 00:09:39.020 --> 00:09:41.337 ahogy a felnyílás irányába haladva. 00:09:41.337 --> 00:09:45.600 így kullog, ez a folyamat lassúbb 00:09:45.600 --> 00:09:49.074 de a végén minden összekapcsolható 00:09:49.074 --> 00:09:50.824 a DNS-ligáz segítségével. 00:09:52.195 --> 00:09:55.927 A DNS-ligáz nem csak összekapcsolja a töredékekeket 00:09:55.927 --> 00:09:59.148 hanem az RNS-t is 00:09:59.148 --> 00:10:02.102 kicseréli DNS-re. 00:10:02.102 --> 00:10:05.623 Így mindezek után van egy másolat 00:10:05.623 --> 00:10:08.293 d 00:10:08.293 --> 00:10:10.995 A végére tehát létrejön a két kettős szál. 00:10:10.995 --> 00:10:12.904 Egy itt fent, a követő szálon, 00:10:12.904 --> 00:10:16.321 a másik lent a vezető szálon