WEBVTT 00:00:00.347 --> 00:00:02.913 Beszélgessünk kicsit bővebben arról, 00:00:02.913 --> 00:00:05.805 hogyan másolja önmagát a DNS, 00:00:05.805 --> 00:00:06.845 miként replikálódik, 00:00:06.845 --> 00:00:09.381 és hogy milyen szereplők 00:00:09.381 --> 00:00:11.120 vesznek részt ebben a folyamatban. 00:00:11.120 --> 00:00:13.426 Eközben sokszor emlegetjük majd 00:00:13.426 --> 00:00:17.514 a DNS molekula 3' és 5' végeit. 00:00:17.514 --> 00:00:19.823 Ha még sohasem hallottál erről, 00:00:19.823 --> 00:00:21.944 akkor nézd meg a videót 00:00:21.944 --> 00:00:26.041 a DNS antiparallel szerkezetéről. 00:00:26.041 --> 00:00:28.163 Ismételjük át egy kicsit, 00:00:28.163 --> 00:00:31.177 ha már régen láttad utoljára. 00:00:31.177 --> 00:00:33.042 Ez itt a DNS részletes ábrája 00:00:33.042 --> 00:00:35.394 az előbb említett videóból. 00:00:35.394 --> 00:00:37.694 Az 5' és a 3' jelölés 00:00:37.694 --> 00:00:40.762 a szénatomok helyzetét jelöli azokban a ribózmolekulákban, 00:00:40.762 --> 00:00:44.840 amik a molekula foszfát-cukor gerincét alkotják. 00:00:44.840 --> 00:00:46.941 Ez itt egy ribózmolekula, 00:00:46.941 --> 00:00:48.459 ami egy öt szénatomos cukor. 00:00:48.459 --> 00:00:50.630 Számozzuk meg benne a szénatomokat! 00:00:50.630 --> 00:00:54.716 Ez a szénatom 1' helyzetű, ez 2' helyzetű, 00:00:54.716 --> 00:00:58.326 ez a 3', ez a 4', 00:00:58.326 --> 00:01:00.441 ez pedig az 5' helyzetű szénatomja. 00:01:00.441 --> 00:01:05.593 E létraszerű molekula mellé 00:01:05.593 --> 00:01:10.216 ebben az irányban húzok egy nyilat. 00:01:10.216 --> 00:01:15.098 Ez a nyíl a 3'-5' irányt jelöli. 00:01:15.098 --> 00:01:19.308 Ez a 3' vége, ez pedig az 5' vége. 00:01:19.308 --> 00:01:20.546 A nyíl iránya 3'-5'. 00:01:20.546 --> 00:01:23.449 Figyeld: ez a foszfátcsoport egy 3' helyzetű atomhoz kötődik, 00:01:23.449 --> 00:01:25.470 a következő 5' atom egy foszfátcsoporthoz, 00:01:25.470 --> 00:01:27.358 az egy 3' helyzetű atomhoz, 00:01:27.358 --> 00:01:28.874 az pedig... 00:01:28.874 --> 00:01:31.260 egy 5' atomon át egy újabb foszfátcsoporthoz. 00:01:31.260 --> 00:01:34.003 A másik szál, mint mondtuk, antiparallel helyzetű. 00:01:34.003 --> 00:01:36.536 Párhuzamos az előbbivel, de fordított lefutású. 00:01:36.536 --> 00:01:38.459 Tehát ez az atom 3' helyzetű, 00:01:38.459 --> 00:01:40.179 ez 5' helyzetű, 00:01:40.179 --> 00:01:43.272 ez 3', ez pedig 5' helyzetű. 00:01:43.272 --> 00:01:44.979 Ezt jelenti tehát 00:01:44.979 --> 00:01:47.281 az antiparallel szerkezet. 00:01:47.281 --> 00:01:49.204 A molekula két gerince, 00:01:49.204 --> 00:01:51.329 a két szála párhuzamos, 00:01:51.329 --> 00:01:54.461 de ellentétes lefutásúak. 00:01:54.461 --> 00:01:56.243 Tehát erre van a 3' vég, 00:01:56.243 --> 00:01:58.673 erre pedig az 5' vég. 00:01:58.673 --> 00:02:00.062 Ez nagyon fontos lesz ahhoz, 00:02:00.062 --> 00:02:01.810 hogy megértsük a replikációt, 00:02:01.810 --> 00:02:03.846 mivel a DNS-polimeráz, 00:02:03.846 --> 00:02:06.767 amely a soron következő nukleotidokat építi be 00:02:06.767 --> 00:02:09.327 az újonnan készülő DNS-szálba, 00:02:09.327 --> 00:02:13.872 csak a 3' véghez tud újabb nukleotidokat kapcsolni. 00:02:13.872 --> 00:02:16.828 Ezt a szálat például 00:02:16.828 --> 00:02:21.741 csak ebbe az irányba lehetne hosszabbítani, 00:02:21.741 --> 00:02:26.760 fordított irányban nem. 00:02:26.760 --> 00:02:29.386 Úgy is mondhatjuk, hogy az új nukleotidok 00:02:29.386 --> 00:02:30.783 csak 3' véghez kapcsolhatók, 00:02:30.783 --> 00:02:34.811 vagyis a DNS hosszabbítása 00:02:34.811 --> 00:02:38.553 csak 5'-3' irányban történhet. 00:02:38.553 --> 00:02:40.756 Ha csak a 3' véget hosszabbítjuk, 00:02:40.756 --> 00:02:44.838 akkor 5'-3' irányban haladunk. 00:02:44.838 --> 00:02:47.584 Nem haladhatunk 3'-5' irányba. 00:02:47.584 --> 00:02:52.076 Az 5' vég nem hosszabbítható polimeráz enzimmel. 00:02:52.076 --> 00:02:54.802 Mit jelent ez? 00:02:54.802 --> 00:02:56.869 Vizsgáljuk meg a fenti ábrát, 00:02:56.869 --> 00:02:58.787 ahol egyben látható 00:02:58.787 --> 00:03:00.843 a folyamat összes szereplője. 00:03:00.843 --> 00:03:03.277 Itt látható a DNS-szál, 00:03:03.277 --> 00:03:09.539 a kiindulási formájában, a megkettőződés előtt. 00:03:09.539 --> 00:03:13.441 Megjelöltük a 3' és az 5' végeit. 00:03:13.441 --> 00:03:15.302 Kövessük végig az egyik gerincét! 00:03:15.302 --> 00:03:16.674 Ez a 3' vég, 00:03:16.674 --> 00:03:19.044 innen kiindulva 00:03:19.044 --> 00:03:22.763 eljutunk a hozzá tartozó 5' véghez. 00:03:22.763 --> 00:03:26.509 Ez a kettő tehát egyazon szálnak a két vége. 00:03:26.509 --> 00:03:32.220 Ezt a szálat követve pedig ide jutunk. 00:03:32.220 --> 00:03:35.677 Ez a lánc 3' vége, 00:03:35.677 --> 00:03:38.874 ez pedig az 5' vége. 00:03:38.874 --> 00:03:41.841 Elsőként, ahogy a korábbi videókban említettük, 00:03:41.841 --> 00:03:44.074 ahol áttekintettük a replikációt, 00:03:44.074 --> 00:03:49.813 a hélix két felének 00:03:49.813 --> 00:03:52.550 a kettős hélix két DNS-szálának 00:03:52.550 --> 00:03:53.821 szét kell válnia, 00:03:53.821 --> 00:03:56.085 hogy újraépíthessük 00:03:56.085 --> 00:03:58.597 a létra másik oldalát 00:03:58.597 --> 00:04:01.076 a különvált szálak mellé. 00:04:01.076 --> 00:04:03.902 Olyan ez, mint egy cipzár. 00:04:03.902 --> 00:04:06.342 Szétnyitjuk, és kiegészítjük 00:04:06.342 --> 00:04:08.299 mindkét fél cipzárt. 00:04:08.299 --> 00:04:12.039 A valóságban mindez jóval bonyolultabb, 00:04:12.039 --> 00:04:13.426 mint egy szétnyitott cipzár, 00:04:13.426 --> 00:04:15.306 amiből két újat csinálunk. 00:04:15.306 --> 00:04:18.100 Kell egy rakás enzim, és más egyebek. 00:04:18.100 --> 00:04:20.571 Még ezen az ábrán sem látható 00:04:20.571 --> 00:04:21.579 az összes résztvevő, 00:04:21.579 --> 00:04:23.690 csak a legfontosabbak, 00:04:23.690 --> 00:04:26.459 amik szóba kerülnek 00:04:26.459 --> 00:04:30.069 a DNS-replikáció kapcsán. 00:04:30.069 --> 00:04:32.466 Először is, ez a rész 00:04:32.466 --> 00:04:35.484 szorosan fel van tekeredve. 00:04:35.484 --> 00:04:36.445 Ezt ide is írom. 00:04:36.445 --> 00:04:40.062 Szorosan fel van tekeredve. 00:04:40.062 --> 00:04:41.443 Ha belegondolunk, 00:04:41.443 --> 00:04:44.052 minél jobban széttekeredik az egyik oldalon, 00:04:44.052 --> 00:04:46.311 annál szorosabban tekeredik össze a másikon. 00:04:46.311 --> 00:04:48.815 A cipzár felnyitásához 00:04:48.815 --> 00:04:50.494 kell egy enzim, 00:04:50.494 --> 00:04:52.153 ami széttekeri 00:04:52.153 --> 00:04:54.701 ezt a szorosan összetekert hélixet. 00:04:54.701 --> 00:04:58.476 Ez az enzim a topoizomeráz. 00:04:58.476 --> 00:05:01.076 Ennek hatására 00:05:01.076 --> 00:05:04.706 ideiglenesen felhasadnak a szerkezet egyes kötései, 00:05:04.706 --> 00:05:05.896 így az széttekeredik. 00:05:05.896 --> 00:05:07.822 Később ezek a kötések újra kialakulnak, 00:05:07.822 --> 00:05:10.812 de a lényeg az, hogy széttekeri őket, 00:05:10.812 --> 00:05:12.484 hogy aztán a helikáz enzim... 00:05:12.484 --> 00:05:13.850 A helikáz persze nem olyan, 00:05:13.850 --> 00:05:16.181 mint ez a kis háromszög, ami itt vagdossa a kötéseket. 00:05:16.181 --> 00:05:19.057 A valóságban elképesztő látványt nyújtana 00:05:19.057 --> 00:05:21.469 a helikáz molekuláris szerkezete. 00:05:21.469 --> 00:05:23.257 A helikáznak az a feladata, 00:05:23.257 --> 00:05:25.334 hogy felszakítsa a hidrogénkötéseket 00:05:25.334 --> 00:05:28.850 a nitrogéntartalmú bázisok között. 00:05:28.850 --> 00:05:31.550 Itt épp egy adenin és egy timin közt 00:05:31.550 --> 00:05:35.344 szakítja fel a hidrogénkötéseket. 00:05:35.344 --> 00:05:39.301 Első tehát a széttekeredés, 00:05:39.301 --> 00:05:40.841 mielőtt a helikáz... 00:05:40.841 --> 00:05:42.831 tehát a topoizomeráz széttekeri a molekulát, 00:05:42.831 --> 00:05:45.353 aztán a helikáz felszakítja a kötéseket. 00:05:45.353 --> 00:05:49.514 Innentől kezdve a két szálon másféleképpen zajlik a folyamat, 00:05:49.514 --> 00:05:50.769 mivel, mint említettem, 00:05:50.769 --> 00:05:53.488 az új nukleotidok beépítése 00:05:53.488 --> 00:05:57.526 csak 5'-3' irányban lehetséges. 00:05:57.526 --> 00:06:02.279 Az alsó szálon, az ún. vezető szálon 00:06:02.279 --> 00:06:04.136 minden nagyon egyszerű. 00:06:04.136 --> 00:06:06.428 Emlékezz, ez itt az 5' vég, 00:06:06.428 --> 00:06:08.169 a lánc hosszabbítása tehát 00:06:08.169 --> 00:06:13.527 ebben az irányban történik. 00:06:13.527 --> 00:06:16.356 Ez az 5'-3' irány. 00:06:16.356 --> 00:06:19.886 Az itteni események elindításához 00:06:19.886 --> 00:06:22.588 kell egy RNS-primer. 00:06:22.588 --> 00:06:27.934 Az RNS-primert a DNS-primáz építi be. 00:06:27.934 --> 00:06:30.030 Erről még beszélünk 00:06:30.030 --> 00:06:31.772 a követő szál kapcsán. 00:06:31.772 --> 00:06:33.328 Ez beépít egy RNS-t 00:06:33.328 --> 00:06:35.650 (ezt más színnel jelölöm) 00:06:35.650 --> 00:06:37.529 ide épít be egy RNS-primert. 00:06:37.529 --> 00:06:39.470 Amint beépült a primer, 00:06:39.470 --> 00:06:42.516 a DNS-polimeráz elkezdheti 00:06:42.516 --> 00:06:46.939 a nukleotidok hozzáadását a 3' véghez. 00:06:46.939 --> 00:06:49.751 A vezető szál hosszabbítása azért egyszerű, 00:06:49.751 --> 00:06:55.162 mert a DNS-polimeráz... 00:06:55.162 --> 00:06:58.747 Ezek persze nem olyan háromszögek, mint ezen a képen, 00:06:58.747 --> 00:07:01.076 a valóságban ennél sokkal látványosabbak. 00:07:01.076 --> 00:07:04.010 Fent látható az egyik DNS-polimeráz, a másik lent. 00:07:04.010 --> 00:07:07.730 Ez a polimeráz 00:07:07.730 --> 00:07:11.303 a cipzár szétnyílását követve 00:07:11.303 --> 00:07:17.011 újabb és újabb nukleotidokat épít be a 3' végen. 00:07:17.011 --> 00:07:20.655 Ez tehát elég egyértelmű. 00:07:20.655 --> 00:07:23.010 Nyilván könnyű lenne 00:07:23.010 --> 00:07:24.780 ugyanígy beépíteni a nukleotidokat 00:07:24.780 --> 00:07:26.723 az 5' végen is, 00:07:26.723 --> 00:07:30.888 hiszen akkor 3'-5' irányban haladva 00:07:30.888 --> 00:07:33.270 (mondjuk egy másfajta polimerázzal) 00:07:33.270 --> 00:07:35.212 beépíthetnénk a nukleotidokat, 00:07:35.212 --> 00:07:37.118 és ezzel a dolog el lenne intézve. 00:07:37.118 --> 00:07:40.011 Sajnos ez nem így működik. 00:07:40.011 --> 00:07:43.841 Az 5' véghez nem lehet újabb nukleotidokat kapcsolni. 00:07:43.841 --> 00:07:46.620 Tisztázzuk, ez itt a 3' vég, 00:07:46.620 --> 00:07:48.401 erről a szálról beszélek. 00:07:48.401 --> 00:07:52.332 Ezt a szálat más színnel rajzolom. 00:07:52.332 --> 00:07:55.454 Ennek a szálnak 00:07:55.454 --> 00:07:58.626 ez a 3' vége, és ez az 5' vége, 00:07:58.626 --> 00:08:03.343 ezért nem lehet ebben az irányban hosszabbítani. 00:08:03.343 --> 00:08:07.249 Hogyan oldható meg ez a biológiai feladat? 00:08:07.249 --> 00:08:10.485 A megoldás a primerek beépítése 00:08:10.485 --> 00:08:14.278 a felnyitási hellyel szomszédos szakasz mellé.. 00:08:14.278 --> 00:08:17.197 Ezen a képen a primert csak egyetlen nukleotid képviseli, 00:08:17.197 --> 00:08:19.570 de általában több nukleotidból áll, 00:08:19.570 --> 00:08:21.467 a hosszuk mintegy 10 nukleotid. 00:08:21.467 --> 00:08:27.040 Tehát kb. 10 RNS nukleotidot 00:08:27.040 --> 00:08:29.060 épít be ide a DNS-primáz. 00:08:29.060 --> 00:08:33.256 A DNS-primáz tehát a követő szál mentén haladva, 00:08:33.256 --> 00:08:36.800 ezen az oldalon, a legfelső szálon, 00:08:36.800 --> 00:08:41.050 és beépít egy RNS-primert, 00:08:41.050 --> 00:08:42.773 ami nem csak egyetlen nukleotid, 00:08:42.773 --> 00:08:45.186 hanem jóval több. 00:08:45.186 --> 00:08:47.818 Az elkészült az RNS-primert, 00:08:47.818 --> 00:08:53.159 a polimeráz már képes hosszabbítani 5'-3' irányban, 00:08:53.159 --> 00:08:56.178 mindig a 3' végét. 00:08:56.178 --> 00:09:00.698 Most már elkezdődhet az új DNS-szál beépítése. 00:09:00.698 --> 00:09:02.286 A folyamat menete tehát: 00:09:02.286 --> 00:09:06.766 elsőként a primáz beépíti a primert, 00:09:06.766 --> 00:09:14.414 majd megkezdődik a lánchosszabbítás 5'-3' irányban. 00:09:14.414 --> 00:09:16.658 Aztán ugrás előre, és kezdjük újra. 00:09:16.658 --> 00:09:20.575 Így végül keletkezik egy rakás rövid DNS-szakasz, 00:09:20.575 --> 00:09:24.272 amelyeket Okazaki-fragmenteknek nevezünk. 00:09:24.272 --> 00:09:28.041 Ezek az Okazaki-fragmentek. 00:09:28.041 --> 00:09:31.621 A követő/kullogó szálon folyó munka kicsit bénának tűnik. 00:09:31.621 --> 00:09:32.705 Ezért is hívják követő szálnak 00:09:32.705 --> 00:09:36.555 mintha tökéletlen volna 00:09:36.555 --> 00:09:38.720 ezeket az Okazaki-fragmenteket 00:09:38.720 --> 00:09:41.176 ahogy a felnyílás irányába haladva. 00:09:41.176 --> 00:09:45.600 így kullog, ez a folyamat lassúbb 00:09:45.600 --> 00:09:49.074 de a töredékek végül összekapcsolódnak 00:09:49.074 --> 00:09:51.935 a DNS-ligáz segítségével. 00:09:51.935 --> 00:09:55.727 A DNS-ligáz nem csak összekapcsolja a töredékekeket, 00:09:55.727 --> 00:10:00.197 hanem az RNS-t is kicseréli DNS-re. 00:10:00.197 --> 00:10:05.623 Így mindezek után van egy másolat 00:10:05.623 --> 00:10:08.293 d 00:10:08.293 --> 00:10:10.995 A végére tehát létrejön a két kettős szál. 00:10:10.995 --> 00:10:12.742 Egy itt fent, a követő szálon, 00:10:12.742 --> 00:10:16.321 a másik lent a vezető szálon.