1 00:00:00,347 --> 00:00:03,075 Beszélgessünk kicsit bővebben arról, 2 00:00:03,075 --> 00:00:05,805 hogy a DNS hogyan másolja önmagát, 3 00:00:05,805 --> 00:00:06,845 miként replikálódik, 4 00:00:06,845 --> 00:00:09,381 és hogy mely szereplők 5 00:00:09,381 --> 00:00:11,120 vesznek részt ebben a folyamatban. 6 00:00:11,120 --> 00:00:13,426 Eközben sokszor említjük majd 7 00:00:13,426 --> 00:00:17,514 a DNS molekula 3' és 5' végeit (ún. 3 vessző és 5 vessző). 8 00:00:17,514 --> 00:00:19,823 Ha még sohasem hallottál erről, 9 00:00:19,823 --> 00:00:21,944 akkor nézd meg a videót 10 00:00:21,944 --> 00:00:26,041 a DNS antiparallel szerkezetéről. 11 00:00:26,041 --> 00:00:28,163 Ismételjük át egy kicsit, 12 00:00:28,163 --> 00:00:31,177 ha régen láttad utoljára. 13 00:00:31,177 --> 00:00:33,042 Itt van a DNS részletes ábrája 14 00:00:33,042 --> 00:00:35,394 az előbb említett videóból. 15 00:00:35,394 --> 00:00:37,694 Az 5' és a 3' jelölés 16 00:00:37,694 --> 00:00:40,762 az atomok helyzetét jelzi azokban a ribózmolekulákban, 17 00:00:40,762 --> 00:00:44,840 amik a molekula foszfát-cukor gerincét alkotják. 18 00:00:44,840 --> 00:00:46,941 Ez itt egy ribóz, 19 00:00:46,941 --> 00:00:48,459 ami egy öt szénatomos cukor. 20 00:00:48,459 --> 00:00:50,630 Számozzuk meg a szénatomokat: 21 00:00:50,630 --> 00:00:54,716 ez az 1' helyzetű szénatom, ez a 2', 22 00:00:54,716 --> 00:00:58,326 ez a 3', ez a 4', 23 00:00:58,326 --> 00:01:00,551 ez pedig az 5' helyzetű szénatom. 24 00:01:00,551 --> 00:01:04,563 A létrának ezen az oldalán 25 00:01:04,563 --> 00:01:08,107 az úgynevezett haladási irány... 26 00:01:08,107 --> 00:01:10,216 (iderajzolok egy vonalat) 27 00:01:10,216 --> 00:01:15,098 3'-5' irányban fut. 28 00:01:15,098 --> 00:01:19,308 Ez a 3' vég, ez pedig az 5' vég. 29 00:01:19,308 --> 00:01:20,546 A lefutási iránya 3'-5'. 30 00:01:20,546 --> 00:01:23,550 Ez a foszfátcsoport az egyik gyűrű 3' atomjához csatlakozik, 31 00:01:23,550 --> 00:01:25,425 ennek az 5' atomja egy foszfátcsoporthoz, 32 00:01:25,425 --> 00:01:27,358 az pedig a következő gyűrű 3' atomjához, 33 00:01:27,358 --> 00:01:28,874 az pedig... 34 00:01:28,874 --> 00:01:31,260 az 5' atomján át egy újabb foszfátcsoporthoz. 35 00:01:31,260 --> 00:01:34,003 A másik szál, mint mondtuk, antiparallel helyzetű. 36 00:01:34,003 --> 00:01:36,606 Párhuzamos az előbbivel, de fordított irányban fut. 37 00:01:36,606 --> 00:01:40,179 Tehát ez az atom 3' helyzetű, ez 5' helyzetű, 38 00:01:40,179 --> 00:01:43,272 ez 3', ez pedig 5' helyzetű. 39 00:01:43,272 --> 00:01:44,979 Ezt jelenti tehát 40 00:01:44,979 --> 00:01:47,281 az antiparallel szerkezet. 41 00:01:47,281 --> 00:01:49,204 A molekula két gerince, 42 00:01:49,204 --> 00:01:51,329 vagyis ez a két szál egymással párhuzamos, 43 00:01:51,329 --> 00:01:54,461 de ellentétes irányultságú. 44 00:01:54,461 --> 00:01:58,673 Tehát ez a 3' vég, ez pedig az 5' vég. 45 00:01:58,673 --> 00:02:00,062 Ez nagyon fontos ahhoz, 46 00:02:00,062 --> 00:02:01,810 hogy megértsük a replikációt, 47 00:02:01,810 --> 00:02:03,846 mivel a DNS-polimeráz, 48 00:02:03,846 --> 00:02:06,767 amely a soron következő nukleotidokat építi be 49 00:02:06,767 --> 00:02:09,327 az újonnan készülő DNS-szálba, 50 00:02:09,327 --> 00:02:13,872 csak a 3' véghez tudja hozzákapcsolni az újabb nukleotidokat. 51 00:02:13,872 --> 00:02:16,828 Itt például 52 00:02:16,828 --> 00:02:21,741 a hosszabbítás csak ebben az irányban történhet, 53 00:02:21,741 --> 00:02:26,760 a másik irányban nem. 54 00:02:26,760 --> 00:02:29,386 Úgy is mondhatjuk, hogy az új nukleotidok 55 00:02:29,386 --> 00:02:30,783 csak 3' véghez kapcsolhatók, 56 00:02:30,783 --> 00:02:34,811 vagyis a DNS hosszabbítása 57 00:02:34,811 --> 00:02:38,553 csak 5'-3' irányban történhet. 58 00:02:38,553 --> 00:02:40,756 Ha csak a 3' véget hosszabbítjuk, 59 00:02:40,756 --> 00:02:44,838 akkor csak 5'-3' irányban haladhatunk. 60 00:02:44,838 --> 00:02:47,584 Nem haladhatunk 3'-5' irányba. 61 00:02:47,584 --> 00:02:52,191 Nem hosszabbíthatjuk az 5' véget polimeráz közreműködésével. 62 00:02:52,191 --> 00:02:54,882 Mi az, hogy "polimeráz közreműködésével"? 63 00:02:54,882 --> 00:02:56,869 Vizsgáljuk meg a fenti ábrát, 64 00:02:56,869 --> 00:02:58,787 ahol egyben látható 65 00:02:58,787 --> 00:03:00,843 a folyamat összes szereplője. 66 00:03:00,843 --> 00:03:03,277 Itt látható a DNS-szál, 67 00:03:03,277 --> 00:03:09,539 az eredeti formájában, a megkettőződése előtt. 68 00:03:09,539 --> 00:03:13,441 Megjelöltük a 3' és az 5' végeit. 69 00:03:13,441 --> 00:03:15,302 Végigkövethetők az egyes gerincek. 70 00:03:15,302 --> 00:03:19,044 Ez a 3' vég, innen végighaladva 71 00:03:19,044 --> 00:03:22,763 eljutunk a hozzá tartozó 5' véghez. 72 00:03:22,763 --> 00:03:26,509 Ez a kettő tehát egyazon szál két vége. 73 00:03:26,509 --> 00:03:32,220 Ezt a szálat követve pedig ide jutunk. 74 00:03:32,220 --> 00:03:35,677 Ez tehát a lánc 3' vége, 75 00:03:35,677 --> 00:03:38,874 ez pedig az 5' vége. 76 00:03:38,874 --> 00:03:41,841 Elsőként, ahogy a korábbi videókban említettük, 77 00:03:41,841 --> 00:03:44,074 ahol áttekintettük a replikációt, 78 00:03:44,074 --> 00:03:49,813 a hélix két felének 79 00:03:49,813 --> 00:03:52,550 a kettős hélix két DNS-szálának 80 00:03:52,550 --> 00:03:53,821 szét kell válnia, 81 00:03:53,821 --> 00:03:56,085 hogy aztán melléjük épülhesen 82 00:03:56,085 --> 00:03:58,597 a létra másik oldala, 83 00:03:58,597 --> 00:04:01,076 a szétvált szálaknak megfelelően. 84 00:04:01,076 --> 00:04:03,902 Olyan ez, mint egy cipzár. 85 00:04:03,902 --> 00:04:08,299 Szétnyitjuk, és mindkét felét kiegészítjük egy újabb cipzárrá. 86 00:04:08,299 --> 00:04:12,039 A valóságban mindez sokkal bonyolultabb, 87 00:04:12,039 --> 00:04:13,426 mint egy szétnyitott cipzár, 88 00:04:13,426 --> 00:04:15,306 amiből két újat csinálunk. 89 00:04:15,306 --> 00:04:18,100 Kell egy rakás enzim, és más egyebek. 90 00:04:18,100 --> 00:04:20,571 Még ezen az ábrán sem látható 91 00:04:20,571 --> 00:04:21,579 az összes résztvevő, 92 00:04:21,579 --> 00:04:23,690 csak a legfontosabbak, 93 00:04:23,690 --> 00:04:26,459 amik szóba kerülnek 94 00:04:26,459 --> 00:04:30,069 a DNS-replikáció kapcsán. 95 00:04:30,069 --> 00:04:32,466 Először is, ez a rész 96 00:04:32,466 --> 00:04:35,484 szorosan fel van tekeredve. 97 00:04:35,484 --> 00:04:36,445 Ezt ide is írom. 98 00:04:36,445 --> 00:04:40,062 Szorosan fel van tekeredve. 99 00:04:40,062 --> 00:04:41,443 Ha belegondolunk, 100 00:04:41,443 --> 00:04:44,052 minél jobban széttekeredik az egyik oldalon, 101 00:04:44,052 --> 00:04:46,311 annál szorosabban tekeredik fel a másik oldalon. 102 00:04:46,311 --> 00:04:48,815 A cipzár felnyitásához tehát 103 00:04:48,815 --> 00:04:50,494 szükséges egy enzim, 104 00:04:50,494 --> 00:04:54,701 ami segít széttekerni ezt a szorosan feltekert hélixet. 105 00:04:54,701 --> 00:04:58,476 Ez az enzim a topoizomeráz. 106 00:04:58,476 --> 00:05:01,076 Úgy működik, 107 00:05:01,076 --> 00:05:04,706 hogy időlegesen felhasítja a gerincek egyes pontjait, 108 00:05:04,706 --> 00:05:07,822 amik így szétttekerednek, majd újra összekapcsolódnak. 109 00:05:07,822 --> 00:05:10,987 A lényeg, hogy széttekeri őket, 110 00:05:10,987 --> 00:05:12,484 hogy aztán a helikáz enzim... 111 00:05:12,484 --> 00:05:13,850 A helikáz persze nem olyan, 112 00:05:13,850 --> 00:05:16,181 mint ez a kis háromszög, ami vagdossa a kötéseket. 113 00:05:16,181 --> 00:05:19,057 A valóságban elképesztő látványt nyújtana 114 00:05:19,057 --> 00:05:21,469 a helikáz molekuláris szerkezete. 115 00:05:21,469 --> 00:05:23,257 A helikáznak az a feladata, 116 00:05:23,257 --> 00:05:25,334 hogy felszakítsa a hidrogénkötéseket 117 00:05:25,334 --> 00:05:28,850 a nitrogéntartalmú bázisok között. 118 00:05:28,850 --> 00:05:31,550 Itt épp egy adenin és egy timin közt 119 00:05:31,550 --> 00:05:35,344 szakítja fel a hidrogénkötéseket. 120 00:05:35,344 --> 00:05:39,301 Első tehát a széttekeredés, 121 00:05:39,301 --> 00:05:40,841 aztán a helikáz... 122 00:05:40,841 --> 00:05:42,831 a topoizomeráz széttekeri, 123 00:05:42,831 --> 00:05:45,353 aztán a helikáz felszakítja a kötéseket. 124 00:05:45,353 --> 00:05:49,514 Innentől kezdve külön tárgyaljuk a két szálat, 125 00:05:49,514 --> 00:05:50,769 mivel, mint említettem, 126 00:05:50,769 --> 00:05:53,383 az új nukleotidok beépülése 127 00:05:53,383 --> 00:05:57,526 csak 5'-3' irányban lehetséges. 128 00:05:57,526 --> 00:05:59,624 Az alsó szálat tehát 129 00:05:59,624 --> 00:06:02,279 vezető szálnak nevezzük. 130 00:06:02,279 --> 00:06:04,236 Ezen minden nagyon egyszerűen történik. 131 00:06:04,236 --> 00:06:06,428 Emlékezz, ez az 5' vége, 132 00:06:06,428 --> 00:06:07,829 a lánc hosszabbítása tehát 133 00:06:07,829 --> 00:06:10,349 ebben az irányban folytatódhat. 134 00:06:10,349 --> 00:06:13,527 c 135 00:06:13,527 --> 00:06:15,277 Ez az 5'-3' irány. 136 00:06:16,496 --> 00:06:20,116 Itt a folyamat elindításához 137 00:06:20,116 --> 00:06:21,949 kell egy RNS-primer 138 00:06:22,818 --> 00:06:26,234 és az az enzim, amelyik létrehozza az RNS-primert. 139 00:06:26,234 --> 00:06:28,107 Ez a DNS-primáz. 140 00:06:28,107 --> 00:06:29,684 Erről még beszélünk 141 00:06:29,684 --> 00:06:31,967 a követő szál kapcsán 142 00:06:31,967 --> 00:06:33,328 de a lányeg, hogy RNS-t kapcsolnak 143 00:06:33,328 --> 00:06:35,650 ezt egy másik színnel jelölöm. 144 00:06:35,650 --> 00:06:37,768 Ide kapcsolódik egy RNS-primer. 145 00:06:37,768 --> 00:06:39,598 Miután a primer ide kapcsolódott, 146 00:06:39,598 --> 00:06:44,239 A DNS-polimeráz megkezdheti a további nukleotidok hozzáadását. 147 00:06:44,239 --> 00:06:47,159 a 3' véghez. 148 00:06:47,159 --> 00:06:49,430 Azért olyan egyszerű a vezető szálon, 149 00:06:49,430 --> 00:06:52,680 mert ez a DNS-polimeráz... 150 00:06:53,613 --> 00:06:55,692 ismétlem, 151 00:06:55,692 --> 00:06:59,107 ezek nem olyan háromszögek, mint ezen a képen, 152 00:06:59,107 --> 00:07:01,326 A valóságban sokkal .............. 153 00:07:01,326 --> 00:07:02,712 Itt láthatók 154 00:07:02,712 --> 00:07:07,079 c 155 00:07:07,079 --> 00:07:08,477 Ez a polimeráz 156 00:07:08,477 --> 00:07:11,601 csak a cipzár felnyílását követi 157 00:07:11,601 --> 00:07:13,473 és eközben újabb és újabb 158 00:07:13,473 --> 00:07:17,191 nukleotidokat kapcsol a 3' véghez. 159 00:07:17,191 --> 00:07:20,831 Ez elég egyszerű. 160 00:07:20,831 --> 00:07:23,232 Könnyű lenne, 161 00:07:23,232 --> 00:07:26,893 ha az 5' véghez is kapcsolhatnánk nukleotidokat, 162 00:07:26,893 --> 00:07:28,433 hiszen akkor úgy vehetnénk, 163 00:07:28,433 --> 00:07:31,128 hogy ez a szál 3'-5' irányban halad, 164 00:07:31,128 --> 00:07:33,399 akkor mondjuk egy másik fajta polimeráz 165 00:07:33,399 --> 00:07:35,563 hozzákapcsolhatná a nukleotidokat 166 00:07:35,563 --> 00:07:37,308 és ezzel a dolog el lenne intézve. 167 00:07:37,308 --> 00:07:40,011 A valóságban ez nem így működik. 168 00:07:40,011 --> 00:07:43,841 Az 5' véghez nem lehet újabb nukkleotidokat kapcsolni 169 00:07:43,841 --> 00:07:46,620 Ez pedig láthatóan a 3' vég 170 00:07:46,620 --> 00:07:48,401 erről a szálról beszélek.c 171 00:07:48,401 --> 00:07:50,295 Másik színnel rajzolom. 172 00:07:50,295 --> 00:07:52,332 c 173 00:07:52,332 --> 00:07:55,454 Ezen a szálon 174 00:07:55,454 --> 00:07:58,856 ez a 3' vég, ez pedig az 5' vég, 175 00:07:58,856 --> 00:07:59,689 c 176 00:07:59,689 --> 00:08:03,343 ezért így nem lehet nukleotidokat. 177 00:08:03,343 --> 00:08:06,343 Hogyan oldja meg ezt a dolgot a biológia? 178 00:08:07,439 --> 00:08:10,659 Primereket ad, 179 00:08:10,659 --> 00:08:14,278 ahogy a szétnyílás megtörténik 180 00:08:14,278 --> 00:08:17,197 a képen látható, hogy a primer nem csak egy nukleotid 181 00:08:17,197 --> 00:08:19,570 hanem általában több 182 00:08:19,570 --> 00:08:21,467 mintegy 10 nukleotid 183 00:08:21,467 --> 00:08:25,634 Tehát kb. 10 RNS nukleotidot ad 184 00:08:27,151 --> 00:08:29,060 ezt a DNS primáz végzi. 185 00:08:29,060 --> 00:08:32,415 A DNS-primáz tehát a követő szálon 186 00:08:32,415 --> 00:08:36,800 ezen az oldalon, felül, 187 00:08:36,800 --> 00:08:38,382 és ad. 188 00:08:38,382 --> 00:08:41,280 Bekapcsolja az RNS-primert, 189 00:08:41,280 --> 00:08:42,773 ami nem csak egy nukleotid 190 00:08:42,773 --> 00:08:45,186 hanem sok 191 00:08:45,186 --> 00:08:48,008 Amint megvan az RNS-primer 192 00:08:48,008 --> 00:08:52,175 a polimeráz hozzákapcsolhat 5'-3' irányban 193 00:08:53,349 --> 00:08:55,432 mindig a 3' véghez. 194 00:08:56,408 --> 00:08:58,606 hozzá 195 00:08:58,606 --> 00:09:00,918 így 196 00:09:00,918 --> 00:09:02,286 Úgy képzelhető el a folyamat 197 00:09:02,286 --> 00:09:06,766 jön a promáz, hozzákapcsolja a primert 198 00:09:06,766 --> 00:09:10,933 és megkezdődik a lánchosszabbítás 5'-3' irányban. 199 00:09:12,465 --> 00:09:14,684 így 200 00:09:14,684 --> 00:09:16,818 aztán egy kis ugrás, és ismétlődik. 201 00:09:16,818 --> 00:09:20,665 Keletkezik egy sor kis szakasz 202 00:09:20,665 --> 00:09:24,492 amelyeket Okazaki-fragmenteknek nevezünk. 203 00:09:24,492 --> 00:09:26,909 Okazaki-fragmentek, 204 00:09:28,251 --> 00:09:30,750 a követő szálon 205 00:09:30,750 --> 00:09:31,621 d 206 00:09:31,621 --> 00:09:32,705 miért hívják követő szálnak 207 00:09:32,705 --> 00:09:34,996 s 208 00:09:34,996 --> 00:09:36,555 mintha tökéletlen volna 209 00:09:36,555 --> 00:09:39,020 ezeket az Okazaki-fragmenteket 210 00:09:39,020 --> 00:09:41,337 ahogy a felnyílás irányába haladva. 211 00:09:41,337 --> 00:09:45,600 így kullog, ez a folyamat lassúbb 212 00:09:45,600 --> 00:09:49,074 de a végén minden összekapcsolható 213 00:09:49,074 --> 00:09:50,824 a DNS-ligáz segítségével. 214 00:09:52,195 --> 00:09:55,927 A DNS-ligáz nem csak összekapcsolja a töredékekeket 215 00:09:55,927 --> 00:09:59,148 hanem az RNS-t is 216 00:09:59,148 --> 00:10:02,102 kicseréli DNS-re. 217 00:10:02,102 --> 00:10:05,623 Így mindezek után van egy másolat 218 00:10:05,623 --> 00:10:08,293 d 219 00:10:08,293 --> 00:10:10,995 A végére tehát létrejön a két kettős szál. 220 00:10:10,995 --> 00:10:12,904 Egy itt fent, a követő szálon, 221 00:10:12,904 --> 00:10:16,321 a másik lent a vezető szálon