WEBVTT

00:00:00.627 --> 00:00:03.326
בואו נדבר
קצת יותר לעומק

00:00:03.326 --> 00:00:05.805
על איך DNA בעצם מעתיק את עצמו,

00:00:05.805 --> 00:00:06.845
איך הוא בעצם משוכפל,

00:00:06.845 --> 00:00:08.123
ואנחנו נדבר על

00:00:08.123 --> 00:00:11.150
השחקנים בפועל בתהליך.

00:00:11.150 --> 00:00:13.166
עכשיו, כמו שאני מדבר על
זה, אני הולך לדבר הרבה

00:00:13.166 --> 00:00:17.704
על קצוות 3' ו 5'
של מולקולת הדנ"א,

00:00:17.704 --> 00:00:20.013
ואם לגמרי לא
מוכר לך,

00:00:20.013 --> 00:00:22.163
אני ממליץ לך לצפות בסרטון

00:00:22.163 --> 00:00:26.041
על המבנה האנטי-מקביל של ה- DNA.

00:00:26.041 --> 00:00:28.163
ואני אתן קצת סקירה מהירה כאן,

00:00:28.163 --> 00:00:31.355
למקרה שראית את אבל
זה היה לפני זמן מה.

00:00:31.355 --> 00:00:33.042
זוהי התקרבות ל- DNA,

00:00:33.042 --> 00:00:35.497
זה בעצם-תקריב מהווידאו הזה,

00:00:35.497 --> 00:00:37.934
וכאשר אנחנו מדברים על קצוות 5' ו 3',

00:00:37.934 --> 00:00:40.848
אנחנו מתכוונים למה
שקורה על הריבוזים

00:00:40.848 --> 00:00:44.930
שנוצרו בחלקם על 
עמוד השדרה הסוכרי פוספטי.

00:00:44.930 --> 00:00:47.051
אז יש לנו כאן ריבוז,

00:00:47.051 --> 00:00:48.639
חמש-סוכר חמצני,

00:00:48.639 --> 00:00:50.900
ואנחנו יכולים למנות את הפחמנים;

00:00:50.900 --> 00:00:54.876
זהו פחמן 1' ,
זה פחמן 2' ,

00:00:54.876 --> 00:00:58.516
זה פחמן 3' ,
זה פחמן 4' ,

00:00:58.516 --> 00:01:00.641
וזה פחמן 5' .

00:01:00.641 --> 00:01:02.891
אז הצד הזה של הסולם,

00:01:04.641 --> 00:01:05.693
אתה יכול לומר,

00:01:05.693 --> 00:01:07.642
זה הולך ב ...

00:01:07.642 --> 00:01:10.526
זה הולך, תן לי
למתוח קו קטן כאן,

00:01:10.526 --> 00:01:13.859
זה קורה בכיוון מ- 3' ל 5' .

00:01:15.308 --> 00:01:19.498
אז בסופו של דבר זה הוא 3' ואז בסוף זה 5' .

00:01:19.498 --> 00:01:20.886
זה הולך מ- 3' ל- 5' .

00:01:20.886 --> 00:01:23.550
שימו לב שלוש, הפוספט הזה
מתחבר ל- 3' ,

00:01:23.550 --> 00:01:25.934
אז אנחנו הולכים ל 5'
שמתחבר לפוספט,

00:01:25.934 --> 00:01:27.358
זה מתחבר ל- 3' ,

00:01:27.358 --> 00:01:28.464
אז זה מתחבר--

00:01:28.464 --> 00:01:31.463
אז אנחנו הולכים ל 5'
שמתחבר לפוספט.

00:01:31.463 --> 00:01:34.003
עכשיו בסוף הזה, כפי שאנחנו
אומר זה אנטי-מקביל.

00:01:34.003 --> 00:01:36.676
זה מקביל, אבל 
מכוון לכיוון השני.

00:01:36.676 --> 00:01:39.509
אז זהו ה 3' , זה הוא ה 5' ,

00:01:40.379 --> 00:01:43.515
זה ה- 3' , זה ה- 5' .

00:01:43.515 --> 00:01:44.979
ולכן זה פשוט
מה שאנחנו מדברים עליו

00:01:44.979 --> 00:01:47.563
כאשר אנו מדברים על
המבנה האנטי-מקביל.

00:01:47.563 --> 00:01:49.418
שני עמודי השדרה האלו,

00:01:49.418 --> 00:01:51.449
שני הגדילים האלה
מקבילים זה לזה,

00:01:51.449 --> 00:01:54.661
אבל הם מכוונים
בכיוונים מנוגדים.

00:01:54.661 --> 00:01:58.833
אז זה הסוף ה- 3'
וזה הסוף ה- 5' .

00:01:58.833 --> 00:02:00.402
וזה הולך להיות ממש חשוב

00:02:00.402 --> 00:02:02.070
להבנה של שכפול,

00:02:02.070 --> 00:02:04.030
משום שה- DNA פולימרז,

00:02:04.030 --> 00:02:06.767
הדברים שמוסיפים עוד ועוד
נוקלאוטידים

00:02:06.767 --> 00:02:09.327
כדי להגדיל את גדיל ה- DNA;

00:02:09.327 --> 00:02:12.827
זה יכול להוסיף נוקלאוטידים רק בקצה ה- 3' .

00:02:13.872 --> 00:02:16.828
אז אם דיברנו
על זה כאן,

00:02:16.828 --> 00:02:18.456
נוכל רק להוסיף ...

00:02:18.456 --> 00:02:21.741
היינו רק מסוגלים להוסיף הולך בכיוון הזה.

00:02:21.741 --> 00:02:24.250
אנחנו לא יוכלים להוסיף כשאנחנו הולכים ...

00:02:24.250 --> 00:02:27.000
אנחנו לא יוכלים להוסיף כשנלך ככה.

00:02:27.000 --> 00:02:29.386
אז דרך אחת לחשוב על זה
היא שתוכל להוסיף רק נוקלאוטידים

00:02:29.386 --> 00:02:33.074
על הקצה 3' או שאתה יכול להאריך רק ...

00:02:33.074 --> 00:02:36.741
אתה יכול להאריך רק DNA
שהולך מ 5' ל 3' .

00:02:38.793 --> 00:02:40.978
אם אתה רק מוסיף על קצה 3' ,

00:02:40.978 --> 00:02:45.038
אז אתה הולך בכיוון 
מ- 5' ל 3'.

00:02:45.038 --> 00:02:47.733
אתה לא יכול ללכת מהכיוון
3' ל 5' .

00:02:47.733 --> 00:02:52.410
אתה לא יכול להמשיך להוסיף
בצד של 5' באמצעות הפולימראז.

00:02:52.410 --> 00:02:55.146
אז מה שאני מדבר עליו
עם פולימראז.

00:02:55.146 --> 00:02:57.046
ובכן בואו נסתכל על הדיאגרמה שכאן

00:02:57.046 --> 00:02:58.985
כי היא באמת נותנת לנו סקירה

00:02:58.985 --> 00:03:01.023
על כל השחקנים השונים.

00:03:01.023 --> 00:03:03.512
אז הנה רק שלנו של גדיל ה DNA שלנו,

00:03:03.512 --> 00:03:07.270
וזה, אתה יכול לדמיין
זה קצת טבעי,

00:03:07.270 --> 00:03:09.769
בזה שזה בצורה טבעית שלא ניתנת לשכפול,

00:03:09.769 --> 00:03:13.591
ואתה יכול לראות שסיווגנו
כאןאת הקצוות של 3' ו 5' ,

00:03:13.591 --> 00:03:15.436
ואתה יכול לעקוב אחרי
אחד מעמודי השדרה הללו.

00:03:15.436 --> 00:03:19.204
ה 3' הזה, אם אתה עוקב אחרי זה
כל הדרך לכאן,

00:03:19.204 --> 00:03:22.914
זה הולך, זה מתאים לקווה 5'.

00:03:22.914 --> 00:03:26.741
אז זה וזה הם אותם הגדילים,

00:03:26.741 --> 00:03:30.402
וזה אחד, אם אתה עוקב אחרי זה,

00:03:30.402 --> 00:03:32.409
אם אתה הולך כל הדרך לכאן
, זה אותו הגדיל.

00:03:32.409 --> 00:03:33.654
אז זה הקצווה 3' ,

00:03:33.654 --> 00:03:37.821
והקצווה 3' ולאחר מכן
זה הסוף 5' שלו.

00:03:38.954 --> 00:03:40.118
עכשיו הדבר הראשון,

00:03:40.118 --> 00:03:41.795
דיברנו על זה בסרטונים קודמים

00:03:41.795 --> 00:03:44.154
כשאנחנו נותנים סקירה של שכפול,

00:03:44.154 --> 00:03:48.321
הרעיון הכללי הוא זה
ששני הצדדים של הסליל שלנו,

00:03:49.992 --> 00:03:54.031
שני ה- DNA, הסליל הכפול
צריך להתפצל,

00:03:54.031 --> 00:03:56.271
ואז נוכל לבנות עוד,

00:03:56.271 --> 00:03:58.757
נוכל לבנות את הצד האחר של הסולם

00:03:58.757 --> 00:04:01.076
על כל אחד משני הקצוות המפוצלים.

00:04:01.076 --> 00:04:04.092
אתה באמת יכול להסתכל על זה
כרוכסן,

00:04:04.092 --> 00:04:08.299
אתה פותח אותו ולאחר מכן אתה מכניס
רוכסנים חדשים באחד הקצוות.

00:04:08.299 --> 00:04:10.041
אבל יש הרבה--

00:04:10.041 --> 00:04:12.419
במציאות, זה הרבה יותר
מורכב מרק נגיד

00:04:12.419 --> 00:04:15.300
"אה, בוא נפתח את הרוכסן
ונשים רוכסנים חדשים על זה."

00:04:15.300 --> 00:04:18.296
זה כרוך בחבורה שלמה של
אנזימים וכל מיני דברים

00:04:18.296 --> 00:04:20.151
ואפילו בתרשים הזה,

00:04:20.151 --> 00:04:21.845
אנחנו לא מציגים את כל
השחקנים השונים,

00:04:21.845 --> 00:04:24.000
אבל אנחנו מציגים בפניך את השחקנים המרכזיים,

00:04:24.000 --> 00:04:26.459
לפחות אלה שאתה תשמע שמדברים עליהם

00:04:26.459 --> 00:04:30.249
כשאנשים מדברים על שכפול ה- DNA.

00:04:30.249 --> 00:04:31.576
אז הדבר הראשון שצריך לקרות,

00:04:31.576 --> 00:04:35.484
כאן,זה שהכל
מלופף בחוזקה, בחוזקה.

00:04:35.484 --> 00:04:36.445
אז תנו לי לכתוב את זה,

00:04:36.445 --> 00:04:38.862
בחוזקה, מלופף בחוזקה.

00:04:40.302 --> 00:04:41.443
וזה בעצם מתברר,

00:04:41.443 --> 00:04:44.052
ככל שאנו מורידים את הליפוף בצד אחד,

00:04:44.052 --> 00:04:46.421
כך יותר בחוזקה הליפוף
נעשה בצד השני.

00:04:46.421 --> 00:04:48.903
אז על מנת שתוכל לפתוח את הרוכסן,

00:04:48.903 --> 00:04:50.584
אנחנו צריכים אנזים

00:04:50.584 --> 00:04:54.861
שיעזור לנו להוריד את הליפוף
החזק של הסליל.

00:04:54.861 --> 00:04:58.676
והאנזים הזה הוא טופואיזומראז.

00:04:58.676 --> 00:05:00.993
והדרך שהוא באמת עובד היא

00:05:00.993 --> 00:05:04.776
הוא שובר חלקים
מעמוד השידרה באופן זמני,

00:05:04.776 --> 00:05:07.982
כך שהם יכולים לא להתלפף
ואז הם חוזרים להיות ביחד,

00:05:07.982 --> 00:05:11.097
אבל ברמה הגבוהה הכללית
הרעיון הוא שזה נהיה לא מלופף ,

00:05:11.097 --> 00:05:12.762
כך שאז האנזים הליקז,

00:05:12.762 --> 00:05:14.044
וההליקז באמת לא נראה כמו

00:05:14.044 --> 00:05:16.351
המשולש הקטן הזה שחותך דברים.

00:05:16.351 --> 00:05:18.057
הדברים האלה הם למעשה
הרבה יותר מרתקים

00:05:18.057 --> 00:05:19.427
אם היית באמת רואה --

00:05:19.427 --> 00:05:21.659
את המבנה המולקולרי של הליקאז.

00:05:21.659 --> 00:05:23.437
אבל מה ההליקאז עושה

00:05:23.437 --> 00:05:26.874
הוא זה ששובר את 
קשרי מימן האלה בין ...

00:05:26.874 --> 00:05:29.156
בין הבסיסים החנקניים שלנו,

00:05:29.156 --> 00:05:31.550
במקרה הזה זה אדנין
כאן, ופה מדובר בתימין

00:05:31.550 --> 00:05:35.514
והוא ישבור את
קשר המימן בין שני אלה.

00:05:35.514 --> 00:05:37.514
אז קודם את מוריד את הליפוף,

00:05:39.511 --> 00:05:40.841
אז ההליקאז,

00:05:40.841 --> 00:05:42.831
הטופואיזומראז מוריד את הליפוף הזה,

00:05:42.831 --> 00:05:45.555
אז ההליקאז שובר אותם,

00:05:45.555 --> 00:05:47.504
ואז אנחנו בעצם חושבים על

00:05:47.504 --> 00:05:49.744
שני הגדילים האחרים האלו,

00:05:49.744 --> 00:05:51.109
כפי שציינתי,

00:05:51.109 --> 00:05:53.633
אתה יכול רק להוסיף נוקלאוטידים

00:05:53.633 --> 00:05:56.466
שהולכים מכיוון 5' ל 3' .

00:05:57.693 --> 00:05:59.864
אז הגדיל הזה 
הימני התחתון כאן

00:05:59.864 --> 00:06:02.399
שנכנה אותו כגדיל המוביל שלנו,

00:06:02.399 --> 00:06:04.236
לאחד הזה יש די פשוט,

00:06:04.236 --> 00:06:06.428
זכור שזוהי קצווה
5' כאן,

00:06:06.428 --> 00:06:07.829
אז זה יכול להוסיף,

00:06:07.829 --> 00:06:10.349
זה יכול להוסיף ללכת בכיוון הזה,

00:06:10.349 --> 00:06:13.527
זה יכול להוסיף ללכת
בכיוון הזה כאן.

00:06:13.527 --> 00:06:15.277
זה 5' ל 3' ,

00:06:16.496 --> 00:06:20.116
אז מה שצריך לקרות כאן
כדי להתחיל בתהליך,

00:06:20.116 --> 00:06:21.949
אתה צריך פריימר RNA

00:06:22.818 --> 00:06:26.234
ואת התו ששם את הפריימר RNA,

00:06:26.234 --> 00:06:28.107
שהו DNA פרימס.

00:06:28.107 --> 00:06:29.684
נדבר קצת יותר על

00:06:29.684 --> 00:06:31.967
הדמויות הללו כאן
בגדיל האחורי,

00:06:31.967 --> 00:06:33.328
אבל הם מוסיפים RNA,

00:06:33.328 --> 00:06:35.650
הרשו לי לעשות את זה בצבע שאתה יכול לראות,

00:06:35.650 --> 00:06:37.768
פריימר RNA יתווסף כאן,

00:06:37.768 --> 00:06:39.598
ואז ברגע שיש פריימר,

00:06:39.598 --> 00:06:44.239
אז DNA פולימרז יכול פשוט
להתחיל להוסיף נוקלאוטידים,

00:06:44.239 --> 00:06:47.159
הוא יכול להתחיל להוסיף
נוקלאוטידים בקצווה 3' .

00:06:47.159 --> 00:06:49.430
והסיבה מדוע לגדיל המוביל די קל לו

00:06:49.430 --> 00:06:52.680
הוא ה DNA פולימראז הוא הזה, כאן,

00:06:53.613 --> 00:06:55.692
הפולימראז הזה, שוב,

00:06:55.692 --> 00:06:59.107
הם לא המלבנים המושלמים
האלו כמו בתרשים הזה.

00:06:59.107 --> 00:07:01.326
הם למעשה הרבה יותר
מרתק מזה.

00:07:01.326 --> 00:07:02.712
אתה רואה את הפולימראז שם,

00:07:02.712 --> 00:07:07.079
אתה גם רואה שאתה אחד
כאן, פולימראז.

00:07:07.079 --> 00:07:08.477
הפולימראז הזה יכול רק,

00:07:08.477 --> 00:07:11.601
אתה יכול לחשוב על זה סוג של
כמו לעקוב על רוכסן נפתח

00:07:11.601 --> 00:07:13.473
ואז פשוט להמשיך להוסיף,

00:07:13.473 --> 00:07:17.191
להמשיך להוסיף נוקלאוטידים בקצווה 3'.

00:07:17.191 --> 00:07:20.831
ולכן זה נראה די ישיר.

00:07:20.831 --> 00:07:23.232
עכשיו, אפשר לומר שלא יהיה קל

00:07:23.232 --> 00:07:26.893
אם רק היינו מוסיפים
נוקלאוטידים בקצווה 5' ,

00:07:26.893 --> 00:07:28.433
כי אז נוכל לומר

00:07:28.433 --> 00:07:31.128
גם זה קורה מ 3' ל 5' ,

00:07:31.128 --> 00:07:33.399
טוב אולי הפולימראז הזה
או פולימראז שונה

00:07:33.399 --> 00:07:35.563
רק יכולו להמשיך ולהוסיף
נוקלאוטידים ככה,

00:07:35.563 --> 00:07:37.308
ואז הכל יהיה קל.

00:07:37.308 --> 00:07:40.011
ובכן, מתברר 
שזה לא המקרה.

00:07:40.011 --> 00:07:43.841
אתה לא יכול להוסיף נוקלאוטידים בסוף 5' ,

00:07:43.841 --> 00:07:46.620
ותן לי להיות ברור,
ה 3' הזה, כאן,

00:07:46.620 --> 00:07:48.401
זה, אני מדבר על הגדיל הזה.

00:07:48.401 --> 00:07:50.295
הגדיל הזה כאן,

00:07:50.295 --> 00:07:52.332
זה, הרשו לי לעשות זאת בצבע אחר,

00:07:52.332 --> 00:07:55.454
הגדיל הזה כאן,

00:07:55.454 --> 00:07:58.856
הקצווה ה 3' הזו, זוהי הקצווה 5',

00:07:58.856 --> 00:07:59.689
ולכן אתה לא יכול,

00:07:59.689 --> 00:08:03.343
אתה לא יכול רק להמשיך להוסיף
נוקלאוטידים סתם ככה,

00:08:03.343 --> 00:08:06.343
ובכן איך הביולוגיה מתמודדת עם זה?

00:08:07.439 --> 00:08:10.659
ובכן היא מטפלת בזה על ידי הוספת פריימרים

00:08:10.659 --> 00:08:14.278
כמו איך שהפתיחה 
קורת, זה יוסיף פריימרים,

00:08:14.278 --> 00:08:17.197
והתרשים הזה מראה את
פריימר כאילו הוא רק נוקלאוטיד אחד

00:08:17.197 --> 00:08:19.570
אבל פריימר הוא בדרך כלל
מספר נוקלאוטידים,

00:08:19.570 --> 00:08:21.467
בערך 10 נוקלאוטידים.

00:08:21.467 --> 00:08:25.634
אז זה יוסיף בערך 10 RNA
נוקלאוטידים כאן,

00:08:27.151 --> 00:08:29.060
וזה נעשה על ידי פרימאז DNA.

00:08:29.060 --> 00:08:32.415
אז ה DNA פרימאז 
הולך לאורך האחרון,

00:08:32.415 --> 00:08:36.800
הוא הולך לצד הזה,
אני יכול לומר הגדיל העליון,

00:08:36.800 --> 00:08:38.382
וזה מוסיף,

00:08:38.382 --> 00:08:41.280
מדובר בהוספת פריימר RNA,

00:08:41.280 --> 00:08:42.773
שלא יהיה רק ​​נוקלאוטיד אחד,

00:08:42.773 --> 00:08:45.186
הוא נוטה להיות כמה מהם,

00:08:45.186 --> 00:08:48.008
ואז ברגע שיש לך כי את הפריימר RNA,

00:08:48.008 --> 00:08:52.175
אז הפולימראז יכול להוסיף
בכיוון 5' ל 3' ,

00:08:53.349 --> 00:08:55.432
הוא יכול להוסיף על הקצה 3'.

00:08:56.408 --> 00:08:58.606
אז זה יכול רק להתחיל להוסיף,

00:08:58.606 --> 00:09:00.918
זה יכול רק להתחיל להוסיף DNA ככה.

00:09:00.918 --> 00:09:02.286
וככה אתה יכול לדמיין את התהליך הזה,

00:09:02.286 --> 00:09:06.766
זה סוג של, אתה מוסיף את
הפרימאז, שם כמה פריימרים כאן,

00:09:06.766 --> 00:09:10.933
ואז אתה מתחיל לבנות
מ 5' לכיוון 3'.

00:09:12.465 --> 00:09:14.684
אתה תתחיל לבנות פשוט ככה,

00:09:14.684 --> 00:09:16.818
ואז אתה מדלג קצת
ואז זה קורה שוב.

00:09:16.818 --> 00:09:20.665
אז בסופו של דבר אתה נשאר עם כל
מקטעי ה DNA האלו

00:09:20.665 --> 00:09:24.492
והם נקראים מקטעי אוקאזאקי.

00:09:24.492 --> 00:09:26.909
אז,אלו נקראים מקטעי אוקאזאקי,

00:09:28.251 --> 00:09:30.750
אז מה שיש לך קורה
כאן על הגדיל האחרון,

00:09:30.750 --> 00:09:31.621
אתה יכול לחשוב על זה כעל,

00:09:31.621 --> 00:09:32.705
למה זה נקרא הגדיל אחרון?

00:09:32.705 --> 00:09:34.996
ובכן מה שאתה צריך לעשות זה סוג כזה של ...

00:09:34.996 --> 00:09:36.555
זה מרגיש כמו הדרך התת-אופטימלית

00:09:36.555 --> 00:09:39.020
שבה אתה צריך להמשיך ליצור
את אותם מקטעי אוקזאקי

00:09:39.020 --> 00:09:41.337
כמו שעשית כשהתחלת בזה,

00:09:41.337 --> 00:09:45.600
וכך הוא האחרון, זה הולך
להיות תהליך איטי,

00:09:45.600 --> 00:09:49.074
אבל אז כל הגדילים האלה
ניתנים להרכבה

00:09:49.074 --> 00:09:50.824
באמצעות DNA ליגאז.

00:09:52.195 --> 00:09:55.927
ה DNA ליגאז; לא רק ירכיב את הגלים יחד

00:09:55.927 --> 00:09:59.148
אבל אז גם יהיה לך 
RNA שהוחלף בפועל

00:09:59.148 --> 00:10:02.102
עם DNA ולאחר מכן כאשר כל מה שאמרנו נעשה,

00:10:02.102 --> 00:10:05.623
הולך להיות לך גדיל
DNA ששוכפל,

00:10:05.623 --> 00:10:08.293
או שנוצר כאן למעלה.

00:10:08.293 --> 00:10:10.995
לכן, כאשר הכל נעשה, אתה
הולך לקבל שני גדילים כפולים,

00:10:10.995 --> 00:10:12.904
אחד כאן עבור הגדיל האחרון,

00:10:12.904 --> 00:10:16.321
ואחד כאן למטה, על הגדיל המוביל.