0:00:00.627,0:00:03.326
בואו נדבר[br]קצת יותר לעומק

0:00:03.326,0:00:05.805
על איך DNA בעצם מעתיק את עצמו,

0:00:05.805,0:00:06.845
איך הוא בעצם משוכפל,

0:00:06.845,0:00:08.123
ואנחנו נדבר על

0:00:08.123,0:00:11.150
השחקנים בפועל בתהליך.

0:00:11.150,0:00:13.166
עכשיו, כמו שאני מדבר על[br]זה, אני הולך לדבר הרבה

0:00:13.166,0:00:17.704
על קצוות 3' ו 5'[br]של מולקולת הדנ"א,

0:00:17.704,0:00:20.013
ואם לגמרי לא[br]מוכר לך,

0:00:20.013,0:00:22.163
אני ממליץ לך לצפות בסרטון

0:00:22.163,0:00:26.041
על המבנה האנטי-מקביל של ה- DNA.

0:00:26.041,0:00:28.163
ואני אתן קצת סקירה מהירה כאן,

0:00:28.163,0:00:31.355
למקרה שראית את אבל[br]זה היה לפני זמן מה.

0:00:31.355,0:00:33.042
זוהי התקרבות ל- DNA,

0:00:33.042,0:00:35.497
זה בעצם-תקריב מהווידאו הזה,

0:00:35.497,0:00:37.934
וכאשר אנחנו מדברים על קצוות 5' ו 3',

0:00:37.934,0:00:40.848
אנחנו מתכוונים למה[br]שקורה על הריבוזים

0:00:40.848,0:00:44.930
שנוצרו בחלקם על [br]עמוד השדרה הסוכרי פוספטי.

0:00:44.930,0:00:47.051
אז יש לנו כאן ריבוז,

0:00:47.051,0:00:48.639
חמש-סוכר חמצני,

0:00:48.639,0:00:50.900
ואנחנו יכולים למנות את הפחמנים;

0:00:50.900,0:00:54.876
זהו פחמן 1' ,[br]זה פחמן 2' ,

0:00:54.876,0:00:58.516
זה פחמן 3' ,[br]זה פחמן 4' ,

0:00:58.516,0:01:00.641
וזה פחמן 5' .

0:01:00.641,0:01:02.891
אז הצד הזה של הסולם,

0:01:04.641,0:01:05.693
אתה יכול לומר,

0:01:05.693,0:01:07.642
זה הולך ב ...

0:01:07.642,0:01:10.526
זה הולך, תן לי[br]למתוח קו קטן כאן,

0:01:10.526,0:01:13.859
זה קורה בכיוון מ- 3' ל 5' .

0:01:15.308,0:01:19.498
אז בסופו של דבר זה הוא 3' ואז בסוף זה 5' .

0:01:19.498,0:01:20.886
זה הולך מ- 3' ל- 5' .

0:01:20.886,0:01:23.550
שימו לב שלוש, הפוספט הזה[br]מתחבר ל- 3' ,

0:01:23.550,0:01:25.934
אז אנחנו הולכים ל 5'[br]שמתחבר לפוספט,

0:01:25.934,0:01:27.358
זה מתחבר ל- 3' ,

0:01:27.358,0:01:28.464
אז זה מתחבר--

0:01:28.464,0:01:31.463
אז אנחנו הולכים ל 5'[br]שמתחבר לפוספט.

0:01:31.463,0:01:34.003
עכשיו בסוף הזה, כפי שאנחנו[br]אומר זה אנטי-מקביל.

0:01:34.003,0:01:36.676
זה מקביל, אבל [br]מכוון לכיוון השני.

0:01:36.676,0:01:39.509
אז זהו ה 3' , זה הוא ה 5' ,

0:01:40.379,0:01:43.515
זה ה- 3' , זה ה- 5' .

0:01:43.515,0:01:44.979
ולכן זה פשוט[br]מה שאנחנו מדברים עליו

0:01:44.979,0:01:47.563
כאשר אנו מדברים על[br]המבנה האנטי-מקביל.

0:01:47.563,0:01:49.418
שני עמודי השדרה האלו,

0:01:49.418,0:01:51.449
שני הגדילים האלה[br]מקבילים זה לזה,

0:01:51.449,0:01:54.661
אבל הם מכוונים[br]בכיוונים מנוגדים.

0:01:54.661,0:01:58.833
אז זה הסוף ה- 3'[br]וזה הסוף ה- 5' .

0:01:58.833,0:02:00.402
וזה הולך להיות ממש חשוב

0:02:00.402,0:02:02.070
להבנה של שכפול,

0:02:02.070,0:02:04.030
משום שה- DNA פולימרז,

0:02:04.030,0:02:06.767
הדברים שמוסיפים עוד ועוד[br]נוקלאוטידים

0:02:06.767,0:02:09.327
כדי להגדיל את גדיל ה- DNA;

0:02:09.327,0:02:12.827
זה יכול להוסיף נוקלאוטידים רק בקצה ה- 3' .

0:02:13.872,0:02:16.828
אז אם דיברנו[br]על זה כאן,

0:02:16.828,0:02:18.456
נוכל רק להוסיף ...

0:02:18.456,0:02:21.741
היינו רק מסוגלים להוסיף הולך בכיוון הזה.

0:02:21.741,0:02:24.250
אנחנו לא יוכלים להוסיף כשאנחנו הולכים ...

0:02:24.250,0:02:27.000
אנחנו לא יוכלים להוסיף כשנלך ככה.

0:02:27.000,0:02:29.386
אז דרך אחת לחשוב על זה[br]היא שתוכל להוסיף רק נוקלאוטידים

0:02:29.386,0:02:33.074
על הקצה 3' או שאתה יכול להאריך רק ...

0:02:33.074,0:02:36.741
אתה יכול להאריך רק DNA[br]שהולך מ 5' ל 3' .

0:02:38.793,0:02:40.978
אם אתה רק מוסיף על קצה 3' ,

0:02:40.978,0:02:45.038
אז אתה הולך בכיוון [br]מ- 5' ל 3'.

0:02:45.038,0:02:47.733
אתה לא יכול ללכת מהכיוון[br]3' ל 5' .

0:02:47.733,0:02:52.410
אתה לא יכול להמשיך להוסיף[br]בצד של 5' באמצעות הפולימראז.

0:02:52.410,0:02:55.146
אז מה שאני מדבר עליו[br]עם פולימראז.

0:02:55.146,0:02:57.046
ובכן בואו נסתכל על הדיאגרמה שכאן

0:02:57.046,0:02:58.985
כי היא באמת נותנת לנו סקירה

0:02:58.985,0:03:01.023
על כל השחקנים השונים.

0:03:01.023,0:03:03.512
אז הנה רק שלנו של גדיל ה DNA שלנו,

0:03:03.512,0:03:07.270
וזה, אתה יכול לדמיין[br]זה קצת טבעי,

0:03:07.270,0:03:09.769
בזה שזה בצורה טבעית שלא ניתנת לשכפול,

0:03:09.769,0:03:13.591
ואתה יכול לראות שסיווגנו[br]כאןאת הקצוות של 3' ו 5' ,

0:03:13.591,0:03:15.436
ואתה יכול לעקוב אחרי[br]אחד מעמודי השדרה הללו.

0:03:15.436,0:03:19.204
ה 3' הזה, אם אתה עוקב אחרי זה[br]כל הדרך לכאן,

0:03:19.204,0:03:22.914
זה הולך, זה מתאים לקווה 5'.

0:03:22.914,0:03:26.741
אז זה וזה הם אותם הגדילים,

0:03:26.741,0:03:30.402
וזה אחד, אם אתה עוקב אחרי זה,

0:03:30.402,0:03:32.409
אם אתה הולך כל הדרך לכאן[br], זה אותו הגדיל.

0:03:32.409,0:03:33.654
אז זה הקצווה 3' ,

0:03:33.654,0:03:37.821
והקצווה 3' ולאחר מכן[br]זה הסוף 5' שלו.

0:03:38.954,0:03:40.118
עכשיו הדבר הראשון,

0:03:40.118,0:03:41.795
דיברנו על זה בסרטונים קודמים

0:03:41.795,0:03:44.154
כשאנחנו נותנים סקירה של שכפול,

0:03:44.154,0:03:48.321
הרעיון הכללי הוא זה[br]ששני הצדדים של הסליל שלנו,

0:03:49.992,0:03:54.031
שני ה- DNA, הסליל הכפול[br]צריך להתפצל,

0:03:54.031,0:03:56.271
ואז נוכל לבנות עוד,

0:03:56.271,0:03:58.757
נוכל לבנות את הצד האחר של הסולם

0:03:58.757,0:04:01.076
על כל אחד משני הקצוות המפוצלים.

0:04:01.076,0:04:04.092
אתה באמת יכול להסתכל על זה[br]כרוכסן,

0:04:04.092,0:04:08.299
אתה פותח אותו ולאחר מכן אתה מכניס[br]רוכסנים חדשים באחד הקצוות.

0:04:08.299,0:04:10.041
אבל יש הרבה--

0:04:10.041,0:04:12.419
במציאות, זה הרבה יותר[br]מורכב מרק נגיד

0:04:12.419,0:04:15.300
"אה, בוא נפתח את הרוכסן[br]ונשים רוכסנים חדשים על זה."

0:04:15.300,0:04:18.296
זה כרוך בחבורה שלמה של[br]אנזימים וכל מיני דברים

0:04:18.296,0:04:20.151
ואפילו בתרשים הזה,

0:04:20.151,0:04:21.845
אנחנו לא מציגים את כל[br]השחקנים השונים,

0:04:21.845,0:04:24.000
אבל אנחנו מציגים בפניך את השחקנים המרכזיים,

0:04:24.000,0:04:26.459
לפחות אלה שאתה תשמע שמדברים עליהם

0:04:26.459,0:04:30.249
כשאנשים מדברים על שכפול ה- DNA.

0:04:30.249,0:04:31.576
אז הדבר הראשון שצריך לקרות,

0:04:31.576,0:04:35.484
כאן,זה שהכל[br]מלופף בחוזקה, בחוזקה.

0:04:35.484,0:04:36.445
אז תנו לי לכתוב את זה,

0:04:36.445,0:04:38.862
בחוזקה, מלופף בחוזקה.

0:04:40.302,0:04:41.443
וזה בעצם מתברר,

0:04:41.443,0:04:44.052
ככל שאנו מורידים את הליפוף בצד אחד,

0:04:44.052,0:04:46.421
כך יותר בחוזקה הליפוף[br]נעשה בצד השני.

0:04:46.421,0:04:48.903
אז על מנת שתוכל לפתוח את הרוכסן,

0:04:48.903,0:04:50.584
אנחנו צריכים אנזים

0:04:50.584,0:04:54.861
שיעזור לנו להוריד את הליפוף[br]החזק של הסליל.

0:04:54.861,0:04:58.676
והאנזים הזה הוא טופואיזומראז.

0:04:58.676,0:05:00.993
והדרך שהוא באמת עובד היא

0:05:00.993,0:05:04.776
הוא שובר חלקים[br]מעמוד השידרה באופן זמני,

0:05:04.776,0:05:07.982
כך שהם יכולים לא להתלפף[br]ואז הם חוזרים להיות ביחד,

0:05:07.982,0:05:11.097
אבל ברמה הגבוהה הכללית[br]הרעיון הוא שזה נהיה לא מלופף ,

0:05:11.097,0:05:12.762
כך שאז האנזים הליקז,

0:05:12.762,0:05:14.044
וההליקז באמת לא נראה כמו

0:05:14.044,0:05:16.351
המשולש הקטן הזה שחותך דברים.

0:05:16.351,0:05:18.057
הדברים האלה הם למעשה[br]הרבה יותר מרתקים

0:05:18.057,0:05:19.427
אם היית באמת רואה --

0:05:19.427,0:05:21.659
את המבנה המולקולרי של הליקאז.

0:05:21.659,0:05:23.437
אבל מה ההליקאז עושה

0:05:23.437,0:05:26.874
הוא זה ששובר את [br]קשרי מימן האלה בין ...

0:05:26.874,0:05:29.156
בין הבסיסים החנקניים שלנו,

0:05:29.156,0:05:31.550
במקרה הזה זה אדנין[br]כאן, ופה מדובר בתימין

0:05:31.550,0:05:35.514
והוא ישבור את[br]קשר המימן בין שני אלה.

0:05:35.514,0:05:37.514
אז קודם את מוריד את הליפוף,

0:05:39.511,0:05:40.841
אז ההליקאז,

0:05:40.841,0:05:42.831
הטופואיזומראז מוריד את הליפוף הזה,

0:05:42.831,0:05:45.555
אז ההליקאז שובר אותם,

0:05:45.555,0:05:47.504
ואז אנחנו בעצם חושבים על

0:05:47.504,0:05:49.744
שני הגדילים האחרים האלו,

0:05:49.744,0:05:51.109
כפי שציינתי,

0:05:51.109,0:05:53.633
אתה יכול רק להוסיף נוקלאוטידים

0:05:53.633,0:05:56.466
שהולכים מכיוון 5' ל 3' .

0:05:57.693,0:05:59.864
אז הגדיל הזה [br]הימני התחתון כאן

0:05:59.864,0:06:02.399
שנכנה אותו כגדיל המוביל שלנו,

0:06:02.399,0:06:04.236
לאחד הזה יש די פשוט,

0:06:04.236,0:06:06.428
זכור שזוהי קצווה[br]5' כאן,

0:06:06.428,0:06:07.829
אז זה יכול להוסיף,

0:06:07.829,0:06:10.349
זה יכול להוסיף ללכת בכיוון הזה,

0:06:10.349,0:06:13.527
זה יכול להוסיף ללכת[br]בכיוון הזה כאן.

0:06:13.527,0:06:15.277
זה 5' ל 3' ,

0:06:16.496,0:06:20.116
אז מה שצריך לקרות כאן[br]כדי להתחיל בתהליך,

0:06:20.116,0:06:21.949
אתה צריך פריימר RNA

0:06:22.818,0:06:26.234
ואת התו ששם את הפריימר RNA,

0:06:26.234,0:06:28.107
שהו DNA פרימס.

0:06:28.107,0:06:29.684
נדבר קצת יותר על

0:06:29.684,0:06:31.967
הדמויות הללו כאן[br]בגדיל האחורי,

0:06:31.967,0:06:33.328
אבל הם מוסיפים RNA,

0:06:33.328,0:06:35.650
הרשו לי לעשות את זה בצבע שאתה יכול לראות,

0:06:35.650,0:06:37.768
פריימר RNA יתווסף כאן,

0:06:37.768,0:06:39.598
ואז ברגע שיש פריימר,

0:06:39.598,0:06:44.239
אז DNA פולימרז יכול פשוט[br]להתחיל להוסיף נוקלאוטידים,

0:06:44.239,0:06:47.159
הוא יכול להתחיל להוסיף[br]נוקלאוטידים בקצווה 3' .

0:06:47.159,0:06:49.430
והסיבה מדוע לגדיל המוביל די קל לו

0:06:49.430,0:06:52.680
הוא ה DNA פולימראז הוא הזה, כאן,

0:06:53.613,0:06:55.692
הפולימראז הזה, שוב,

0:06:55.692,0:06:59.107
הם לא המלבנים המושלמים[br]האלו כמו בתרשים הזה.

0:06:59.107,0:07:01.326
הם למעשה הרבה יותר[br]מרתק מזה.

0:07:01.326,0:07:02.712
אתה רואה את הפולימראז שם,

0:07:02.712,0:07:07.079
אתה גם רואה שאתה אחד[br]כאן, פולימראז.

0:07:07.079,0:07:08.477
הפולימראז הזה יכול רק,

0:07:08.477,0:07:11.601
אתה יכול לחשוב על זה סוג של[br]כמו לעקוב על רוכסן נפתח

0:07:11.601,0:07:13.473
ואז פשוט להמשיך להוסיף,

0:07:13.473,0:07:17.191
להמשיך להוסיף נוקלאוטידים בקצווה 3'.

0:07:17.191,0:07:20.831
ולכן זה נראה די ישיר.

0:07:20.831,0:07:23.232
עכשיו, אפשר לומר שלא יהיה קל

0:07:23.232,0:07:26.893
אם רק היינו מוסיפים[br]נוקלאוטידים בקצווה 5' ,

0:07:26.893,0:07:28.433
כי אז נוכל לומר

0:07:28.433,0:07:31.128
גם זה קורה מ 3' ל 5' ,

0:07:31.128,0:07:33.399
טוב אולי הפולימראז הזה[br]או פולימראז שונה

0:07:33.399,0:07:35.563
רק יכולו להמשיך ולהוסיף[br]נוקלאוטידים ככה,

0:07:35.563,0:07:37.308
ואז הכל יהיה קל.

0:07:37.308,0:07:40.011
ובכן, מתברר [br]שזה לא המקרה.

0:07:40.011,0:07:43.841
אתה לא יכול להוסיף נוקלאוטידים בסוף 5' ,

0:07:43.841,0:07:46.620
ותן לי להיות ברור,[br]ה 3' הזה, כאן,

0:07:46.620,0:07:48.401
זה, אני מדבר על הגדיל הזה.

0:07:48.401,0:07:50.295
הגדיל הזה כאן,

0:07:50.295,0:07:52.332
זה, הרשו לי לעשות זאת בצבע אחר,

0:07:52.332,0:07:55.454
הגדיל הזה כאן,

0:07:55.454,0:07:58.856
הקצווה ה 3' הזו, זוהי הקצווה 5',

0:07:58.856,0:07:59.689
ולכן אתה לא יכול,

0:07:59.689,0:08:03.343
אתה לא יכול רק להמשיך להוסיף[br]נוקלאוטידים סתם ככה,

0:08:03.343,0:08:06.343
ובכן איך הביולוגיה מתמודדת עם זה?

0:08:07.439,0:08:10.659
ובכן היא מטפלת בזה על ידי הוספת פריימרים

0:08:10.659,0:08:14.278
כמו איך שהפתיחה [br]קורת, זה יוסיף פריימרים,

0:08:14.278,0:08:17.197
והתרשים הזה מראה את[br]פריימר כאילו הוא רק נוקלאוטיד אחד

0:08:17.197,0:08:19.570
אבל פריימר הוא בדרך כלל[br]מספר נוקלאוטידים,

0:08:19.570,0:08:21.467
בערך 10 נוקלאוטידים.

0:08:21.467,0:08:25.634
אז זה יוסיף בערך 10 RNA[br]נוקלאוטידים כאן,

0:08:27.151,0:08:29.060
וזה נעשה על ידי פרימאז DNA.

0:08:29.060,0:08:32.415
אז ה DNA פרימאז [br]הולך לאורך האחרון,

0:08:32.415,0:08:36.800
הוא הולך לצד הזה,[br]אני יכול לומר הגדיל העליון,

0:08:36.800,0:08:38.382
וזה מוסיף,

0:08:38.382,0:08:41.280
מדובר בהוספת פריימר RNA,

0:08:41.280,0:08:42.773
שלא יהיה רק ​​נוקלאוטיד אחד,

0:08:42.773,0:08:45.186
הוא נוטה להיות כמה מהם,

0:08:45.186,0:08:48.008
ואז ברגע שיש לך כי את הפריימר RNA,

0:08:48.008,0:08:52.175
אז הפולימראז יכול להוסיף[br]בכיוון 5' ל 3' ,

0:08:53.349,0:08:55.432
הוא יכול להוסיף על הקצה 3'.

0:08:56.408,0:08:58.606
אז זה יכול רק להתחיל להוסיף,

0:08:58.606,0:09:00.918
זה יכול רק להתחיל להוסיף DNA ככה.

0:09:00.918,0:09:02.286
וככה אתה יכול לדמיין את התהליך הזה,

0:09:02.286,0:09:06.766
זה סוג של, אתה מוסיף את[br]הפרימאז, שם כמה פריימרים כאן,

0:09:06.766,0:09:10.933
ואז אתה מתחיל לבנות[br]מ 5' לכיוון 3'.

0:09:12.465,0:09:14.684
אתה תתחיל לבנות פשוט ככה,

0:09:14.684,0:09:16.818
ואז אתה מדלג קצת[br]ואז זה קורה שוב.

0:09:16.818,0:09:20.665
אז בסופו של דבר אתה נשאר עם כל[br]מקטעי ה DNA האלו

0:09:20.665,0:09:24.492
והם נקראים מקטעי אוקאזאקי.

0:09:24.492,0:09:26.909
אז,אלו נקראים מקטעי אוקאזאקי,

0:09:28.251,0:09:30.750
אז מה שיש לך קורה[br]כאן על הגדיל האחרון,

0:09:30.750,0:09:31.621
אתה יכול לחשוב על זה כעל,

0:09:31.621,0:09:32.705
למה זה נקרא הגדיל אחרון?

0:09:32.705,0:09:34.996
ובכן מה שאתה צריך לעשות זה סוג כזה של ...

0:09:34.996,0:09:36.555
זה מרגיש כמו הדרך התת-אופטימלית

0:09:36.555,0:09:39.020
שבה אתה צריך להמשיך ליצור[br]את אותם מקטעי אוקזאקי

0:09:39.020,0:09:41.337
כמו שעשית כשהתחלת בזה,

0:09:41.337,0:09:45.600
וכך הוא האחרון, זה הולך[br]להיות תהליך איטי,

0:09:45.600,0:09:49.074
אבל אז כל הגדילים האלה[br]ניתנים להרכבה

0:09:49.074,0:09:50.824
באמצעות DNA ליגאז.

0:09:52.195,0:09:55.927
ה DNA ליגאז; לא רק ירכיב את הגלים יחד

0:09:55.927,0:09:59.148
אבל אז גם יהיה לך [br]RNA שהוחלף בפועל

0:09:59.148,0:10:02.102
עם DNA ולאחר מכן כאשר כל מה שאמרנו נעשה,

0:10:02.102,0:10:05.623
הולך להיות לך גדיל[br]DNA ששוכפל,

0:10:05.623,0:10:08.293
או שנוצר כאן למעלה.

0:10:08.293,0:10:10.995
לכן, כאשר הכל נעשה, אתה[br]הולך לקבל שני גדילים כפולים,

0:10:10.995,0:10:12.904
אחד כאן עבור הגדיל האחרון,

0:10:12.904,0:10:16.321
ואחד כאן למטה, על הגדיל המוביל.