1 00:00:01,611 --> 00:00:04,451 Регулацията на генната експресия може да бъде моделирана 2 00:00:04,451 --> 00:00:06,969 на всяка стъпка от процеса, 3 00:00:06,969 --> 00:00:09,927 от инициацията на транскрипцията 4 00:00:09,927 --> 00:00:13,078 чак до следтранслационната модификация на един протеин 5 00:00:13,078 --> 00:00:15,895 и всяка стъпка между тях. 6 00:00:15,895 --> 00:00:19,454 Способността да се регулират всички тези различни стъпки 7 00:00:19,454 --> 00:00:21,604 помага на клетките да имат 8 00:00:21,604 --> 00:00:25,078 разнообразието и адаптивността 9 00:00:25,078 --> 00:00:28,429 на ефикасна нинджа, така че да харчат енергия, 10 00:00:28,429 --> 00:00:31,581 за да експресират подходящите протеини, само когато е необходимо. 11 00:00:31,581 --> 00:00:33,612 Или можеш да си представиш клетката 12 00:00:33,612 --> 00:00:35,395 като мързеливец, който иска да изразходва 13 00:00:35,395 --> 00:00:37,877 възможно най-малко енергия. 14 00:00:37,877 --> 00:00:40,304 Като започнем от началото на генната експресия, 15 00:00:40,304 --> 00:00:42,512 да разгледаме генната регулация 16 00:00:42,512 --> 00:00:47,105 що се отнася до регулация на ДНК и хроматин. 17 00:00:47,536 --> 00:00:49,611 Да разгледаме структурата на ДНК. 18 00:00:49,611 --> 00:00:52,742 ДНК е пакетирана в хромозомите под формата на хроматин, 19 00:00:52,742 --> 00:00:57,596 също познат като свръхнавита ДНК. 20 00:00:57,596 --> 00:01:00,395 И хроматинът е изграден от ДНК, 21 00:01:00,395 --> 00:01:03,835 хистонови протеини и не-хистонови протеини. 22 00:01:03,835 --> 00:01:06,504 Има повтарящи се единици в хроматина, 23 00:01:06,504 --> 00:01:09,844 наречени нуклеозоми, които са изградени от 24 00:01:09,844 --> 00:01:14,661 146 двойки бази двойноверижна ДНК, 25 00:01:14,661 --> 00:01:18,827 която е увита около ядро от осем хистона. 26 00:01:18,827 --> 00:01:21,753 И има четири различни вида хистони 27 00:01:21,753 --> 00:01:25,170 в тази структура от осем, които трябва да познаваш. 28 00:01:25,170 --> 00:01:31,545 И те са наречени Н2А, Н2В, Н3 и Н4, 29 00:01:31,545 --> 00:01:34,012 това са просто номенклатурните названия, които са им били дадени. 30 00:01:34,012 --> 00:01:37,969 В крайните амино опашки протича ацетилиране 31 00:01:37,969 --> 00:01:40,961 на тези хистонови протеини от ензим, 32 00:01:40,961 --> 00:01:43,174 наречен хистон ацетилтрансфераза, 33 00:01:43,174 --> 00:01:46,495 което просто ще съкратя на НАТ. 34 00:01:46,495 --> 00:01:49,754 И това е обратима модификация. 35 00:01:49,754 --> 00:01:52,836 Ацетилирането на хистоните се поддържа в равновесие 36 00:01:52,836 --> 00:01:56,128 от друг ензим, който премахва тези ацетилови групи, 37 00:01:56,128 --> 00:02:01,690 който се нарича хистон деацетилаза, или HDAC. 38 00:02:01,690 --> 00:02:04,611 Ацетилирането на хистоните води до 39 00:02:04,611 --> 00:02:07,739 развиване на тази хроматинова структура 40 00:02:07,739 --> 00:02:10,928 и това позволява тя да стане достъпна за транскрипционната "апаратура" 41 00:02:10,928 --> 00:02:13,345 за експресията на гените. 42 00:02:13,345 --> 00:02:17,309 В обратната посока, хистоновото деацетилиране води до получаване 43 00:02:17,309 --> 00:02:20,544 на кондензирана, или затворена, структура на хроматина 44 00:02:20,544 --> 00:02:23,262 и по-слаба транскрипция на тези гени. 45 00:02:23,262 --> 00:02:25,015 Когато тези модификации, които регулират 46 00:02:25,015 --> 00:02:27,077 генната експресия, са унаследяеми, 47 00:02:27,077 --> 00:02:30,900 те се наричат епигенетична регулация. 48 00:02:30,900 --> 00:02:33,656 Когато става въпрос за генна експресия и ДНК, 49 00:02:33,656 --> 00:02:35,388 може да си представиш, че ДНК 50 00:02:35,388 --> 00:02:37,983 бива два основни вида – 51 00:02:37,983 --> 00:02:41,994 плътно пакетирана и транскрипционно неактивна ДНК, 52 00:02:41,994 --> 00:02:44,837 която се нарича хетерохроматин, 53 00:02:44,837 --> 00:02:49,637 и по-малко плътна, транскрипционно активна ДНК, която е еухроматин. 54 00:02:49,637 --> 00:02:52,228 Аз си представям хетерохроматина 55 00:02:52,228 --> 00:02:56,062 като плътно пакетиран и "спящ" или "хиберниращ", 56 00:02:56,062 --> 00:02:58,978 тъй като хетерохроматин и хиберниращ са с Х, 57 00:02:58,978 --> 00:03:00,595 един вид като плътно натъпкани мечки, 58 00:03:00,595 --> 00:03:02,716 които са затворени в пещерата си за зимата, 59 00:03:02,716 --> 00:03:04,661 докато еухроматинът стои там 60 00:03:04,661 --> 00:03:06,518 с широко отворени ръце, приветстващ 61 00:03:06,518 --> 00:03:09,428 транскрипционната "апаратура", която го транскрибира на воля. 62 00:03:09,428 --> 00:03:12,817 Често ще видиш, че хистоновото деацетилиране 63 00:03:12,817 --> 00:03:16,145 е комбинирано с друг вид 64 00:03:16,145 --> 00:03:18,038 ДНК регулаторен механизъм 65 00:03:18,038 --> 00:03:20,533 и това е ДНК метилиране, 66 00:03:20,533 --> 00:03:24,645 и това протича в процес, наречен генно заглушаване. 67 00:03:24,645 --> 00:03:27,428 И това е по-постоянен метод за 68 00:03:27,428 --> 00:03:30,512 даун регулиране (регулиране надолу) на транскрипцията на гените. 69 00:03:30,512 --> 00:03:32,953 И ДНК метилирането включва добавянето на 70 00:03:32,953 --> 00:03:36,695 метилова група, която е въглерод с три водорода, 71 00:03:36,695 --> 00:03:39,928 към ДНК нуклеотида цитозин, 72 00:03:39,928 --> 00:03:44,544 от ензим, подходящо наречен метилтрансфераза. 73 00:03:44,544 --> 00:03:46,027 И това обикновено протича в 74 00:03:46,027 --> 00:03:49,991 богати на цитозин последователности, наречени CpG острови. 75 00:03:49,991 --> 00:03:53,428 Не забравяй, че цитозинът се свързва с гуанин, 76 00:03:53,428 --> 00:03:56,512 затова те се наричат CG острови. 77 00:03:56,512 --> 00:03:58,534 ДНК метилацията стабилно променя 78 00:03:58,534 --> 00:04:00,355 експресията на гените 79 00:04:00,355 --> 00:04:03,178 и това се случва, когато клетките се делят и диференцират 80 00:04:03,178 --> 00:04:07,544 от ембрионални стволови клетки в специфични тъкани. 81 00:04:07,544 --> 00:04:10,661 Това е жизненоважно за нормалното развитие 82 00:04:10,661 --> 00:04:13,911 и е свързано с други процеси, 83 00:04:13,911 --> 00:04:17,395 като генен импринтинг и инактивация на Х-хромозомата, 84 00:04:17,395 --> 00:04:19,428 които ще обсъдим в друго видео. 85 00:04:19,428 --> 00:04:25,072 Неправилното ДНК метилиране се счита за причина на карциногенезата, 86 00:04:25,077 --> 00:04:28,044 или развитието на рак, така че можеш да видиш как 87 00:04:28,044 --> 00:04:30,968 нормалното функциониране на ДНК метилирането 88 00:04:30,968 --> 00:04:35,691 е важен регулаторен механизъм за клетките ни. 89 00:04:36,062 --> 00:04:37,848 ДНК метилирането може да засегне 90 00:04:37,848 --> 00:04:40,461 транскрипцията на гените по два начина. 91 00:04:40,461 --> 00:04:42,646 Първо, метилирането на ДНК само по себе си 92 00:04:42,646 --> 00:04:44,524 може физически да възпре свързването 93 00:04:44,524 --> 00:04:47,895 на транскрипционни протеини към гена. 94 00:04:47,895 --> 00:04:50,552 И, второ и вероятно по-важно, 95 00:04:50,552 --> 00:04:53,794 метилираната ДНК може да е свързана с протеини, 96 00:04:53,794 --> 00:04:56,513 познати като метил CPG-свързващи домейн протеини, 97 00:04:56,513 --> 00:04:59,032 или MBD накратко. 98 00:04:59,032 --> 00:05:01,952 MBD протеините после могат да повикат допълнителни протеини 99 00:05:01,952 --> 00:05:05,589 към локуса, или определено местоположение в хромозома, 100 00:05:05,589 --> 00:05:08,689 определени гени, като хистон деацетилази 101 00:05:08,689 --> 00:05:11,189 и други хроматин-ремоделиращи протеини, което води до 102 00:05:11,189 --> 00:05:14,203 модифициране на хистоните и оформяне на кондензиран, 103 00:05:14,203 --> 00:05:17,178 неактивен хетерохроматин, който е 104 00:05:17,178 --> 00:05:20,203 транскрипционно заглушен.