Néhány korábbi videóban már foglalkoztunk enzimekkel. Most egy kicsit jobban elmélyedünk a témában, hogy megismerjük az enzimek segítőtársait. Gyorsan idézzük fel: az enzimek elősegítik a kémiai reakciókat. Csökkentik a reakciók aktiválási energiáját, hogy a reakciók könnyebben, illetve gyorsabban menjenek végbe. Néhány enzimmel már találkoztunk. Csak a tisztánlátás kedvéért jegyezzük meg, a tankönyvek valahogy így ábrázolják az enzimeket, ilyesféle rajzokkal találkozunk. Ez volna itt az enzim, x itt pedig... itt kötődik meg valamilyen szubsztrát, X amivel majd csinál valamit. Egy tankönyvben elmegy egy ilyen elvont ábra, hogy a szubsztrát pont belepasszol az enzim szerkezetébe, de a valóságban nem egészen így működik. egy biológiai rendszerben. Ne feledjük, hogy amikor enzimekről van szó, akkor fehérjékről beszélünk. Persze vannak RNS-enzimek (ribozimek), de az enzimeken a legtöbb esetben mégiscsak fehérjéket értünk. Arról is sokat beszéltünk, hogy ezek a polipeptid szerkezetek, és az őket alkotó aminosavak oldalláncai hogyan hajtogatódnak össze változatos szerkezetekké. Ha szebben tudnék rajzolni, valahogy így rajzolnám le a fehérjét. Mindenféle tekervényes szerkezetbe tekeredve, itt egy pár alfa hélix, ott egy pár béta-redő. mindenféle tekervényes szerkezet. A szubsztrát pedig, valamiféle molekula, beleágyazódik a fehérje szerkezetébe. Itt látható néhány példa. Ez itt egy hexokináz modellje, ez a pötty az ATP, egy kissé nehezen látható a glükóz, amely éppen foszforilálódik. Ez pedig a reakciót elősegító nagy fehérje, a hexokináz. Ennek a videónak az a fő témája, hogy az enzimfehérjékről beszélve aminosav-láncokra gondolunk, ám az enzimekben gyakran vannak olyan részek, amelyek valójában nem fehérjék. A hexokinázokról szólva is láttuk ezt, amikor a glükóz foszforilációjáról beszéltünk. Említettük, hogy az aktiválási energia csökkentésében ezek a pozitív magnéziumionok játszanak szerepet. x Ezek kissé lefoglalják a foszfátcsoportok elektronjait, félrehúzzák őket, hogy ez a hidroxilcsoport hozzákötődhessen a foszfátcsoporthoz és ne zavarják az elektronok. Ezek a magnéziumionok hivatalosan nem részei a fehérjének. Ez az, amit kofaktornak nevezünk. Lehet például itt egy kofaktor, amely hozzákapcsolódik a fő fehérjéhez így az enzim részévé válik, sőt nélküle nem is megy végbe a reakció. A tankönyvekben ezt így jelölnék: c a reakció végbemeneteléhez szükséges a szubsztrát, de emellett a kofaktor is. c A furcsa név tehát annyit jelent, hogy ez az enzimnek egy nemfehérje természetű része. Egy másik molekula, ion, vagy atom, amely az enzim működéséhez szükséges, amely nem aminosav, nem oldallánc, nem a fehérje része. hanem valami másféle dolog, aminek ott kell lenni a reakció katalíziséhez. A hexokináz kapcsán láttunk erre példát, a szerkezetben voltak magnéziumionok. Ezért hangsúlyozzuk annyit az ásványi anyagok és a vitaminok fontosságát, hiszen ezek közül sokan enzimek kofaktoraiként működnek. Ezen a rajzon is látható, amennyire én tudom, ezek a zöldek itt magnéziumionok, és ezek kofaktorok. Kofaktorok, tehát az enzim nemfehérje jellegű részei. A kofaktorok további csoportokra oszthatók. Vannak szerves kofaktorok és szervetlen kofaktorok. Tehát a kofaktorok közül megismertünk egy szervetlen kofaktort. Sokféle ion, magnézium-, nátrium- és kalciumionok x ezek közül sok lehet kofaktor. Sokszor az elektronokat tolják odébb, vagy... hogy.... Vannak szerves kofaktorok is, szerves molekulák. Emlékezz rá, hogy a szerves molekulák szénvegyületek, szénláncokat tartalmaznak. x A szerves kofakorokat koenzimeknek nevezzük. x Tehát koenzimek. Rengeteg példát említhetünk a koenzimekre. Ez itt például a laktát-dehidrogenáz enzim. Ehhez tartozik egy koenzim, amelyikkel sokszor találkoznak a biológiások. Ez a NAD. Mint látható, ez nem csak egy ion, hanem egy egész molekula.