WEBVTT 00:00:00.000 --> 00:00:01.724 Néhány korábbi videóban 00:00:01.724 --> 00:00:03.254 már foglalkoztunk az enzimekkel. 00:00:03.254 --> 00:00:06.276 Most egy kicsit jobban elmélyedünk a témában, 00:00:06.276 --> 00:00:09.993 hogy megismerjük az enzimek segítőtársait. 00:00:09.993 --> 00:00:11.567 Mire is jók az enzimek? 00:00:11.567 --> 00:00:14.713 A kémiai reakciókat segítik elő 00:00:14.713 --> 00:00:16.966 az aktiválási energia csökkentésével, 00:00:16.966 --> 00:00:22.114 hogy a reakciók könnyebben, illetve gyorsabban menjenek végbe. 00:00:22.114 --> 00:00:24.398 Néhány enzimmel már találkoztunk. 00:00:24.398 --> 00:00:26.727 Először is tisztázzunk néhány dolgot! 00:00:26.727 --> 00:00:29.632 A tankönyvekben néha így láthatók az enzimek, 00:00:29.632 --> 00:00:31.070 ilyen rajzokkal találkozhatunk. 00:00:31.070 --> 00:00:36.171 Ez volna itt az enzim, 00:00:36.171 --> 00:00:39.759 ez itt pedig... 00:00:39.759 --> 00:00:43.919 mondjuk itt köt meg valamilyen szubsztrátot, 00:00:43.919 --> 00:00:45.515 amit majd valahogy átalakít. 00:00:45.515 --> 00:00:50.023 Az elvont, tankönyvízű magyarázat szerint 00:00:50.023 --> 00:00:52.781 a szubsztrát pontosan így illeszkedik az enzimhez, 00:00:52.781 --> 00:00:55.405 ám ez nem egészen így működik a biológiai rendszerekben. 00:00:55.405 --> 00:00:58.565 Ne feledjük, hogy az enzimeken 00:00:58.565 --> 00:00:59.980 fehérjéket értünk. 00:00:59.980 --> 00:01:04.308 Vannak persze RNS-enzimek (ribozimek) is, 00:01:04.308 --> 00:01:06.798 de az enzimek nagy többsége 00:01:06.798 --> 00:01:08.734 mégiscsak fehérje. 00:01:08.734 --> 00:01:10.780 Azt is hosszan részleteztük, 00:01:10.780 --> 00:01:13.728 hogy a fehérjék, ezek a polipeptidek 00:01:13.728 --> 00:01:16.670 és az aminosavak sokféle oldallánca 00:01:16.670 --> 00:01:19.680 milyen sokféleképpen hajtogatódnak össze. 00:01:19.680 --> 00:01:23.761 Egy pontosabb rajz tehát így ábrázolná 00:01:23.761 --> 00:01:26.543 a tekervényes szerkezetű fehérjét. 00:01:26.543 --> 00:01:30.932 Itt van pár alfa-hélix, ott néhány béta-redő, 00:01:30.932 --> 00:01:34.274 egy halom gubanc egymás hegyén-hátán. 00:01:34.274 --> 00:01:36.991 A szubsztrát pedig valamiféle molekula, 00:01:36.991 --> 00:01:41.337 ami beleágyazódik a fehérje szerkezetébe. 00:01:41.337 --> 00:01:43.945 Lássunk néhány példát! 00:01:43.945 --> 00:01:46.241 Ez a hexokináz modellje. 00:01:46.241 --> 00:01:50.663 Ez a kis pötty az ATP, 00:01:50.663 --> 00:01:52.962 ez a kis valami pedig a glükóz, 00:01:52.962 --> 00:01:54.882 amely éppen foszforilálódik. 00:01:54.882 --> 00:01:58.286 A reakciót ez a nagy fehérjemolekula segíti, 00:01:58.286 --> 00:01:59.884 a hexokináz. 00:01:59.884 --> 00:02:02.902 Ennek a videónak az a lényege, 00:02:02.902 --> 00:02:05.372 hogy bár az enzimek kapcsán fehérjékre, 00:02:05.372 --> 00:02:07.513 azaz valamilyen aminosav-láncra gondolunk, 00:02:07.513 --> 00:02:09.767 az enzimeknek gyakran vannak olyan részei, 00:02:09.767 --> 00:02:11.848 amelyek szerkezetileg nem fehérjék. 00:02:11.848 --> 00:02:14.338 Ezt a hexokinázok esetében is láttuk, 00:02:14.338 --> 00:02:16.832 a glükóz foszforilációja kapcsán. 00:02:16.832 --> 00:02:20.347 Említettük, hogy az aktiválási energia csökkentésében 00:02:20.347 --> 00:02:25.957 kulcsszerepet játszanak ezek a pozitív magnéziumionok. 00:02:25.957 --> 00:02:30.376 Ezek kissé lefoglalják a foszfátcsoportok elektronjait, 00:02:30.376 --> 00:02:33.346 félrehúzzák őket, 00:02:33.346 --> 00:02:35.436 hogy ez a hidroxilcsoport 00:02:35.436 --> 00:02:36.982 a foszfátcsoporthoz kötődhessen, 00:02:36.982 --> 00:02:39.155 és ne zavarják az elektronok. 00:02:39.155 --> 00:02:42.583 Nos, ezek a magnéziumionok 00:02:42.583 --> 00:02:45.988 szigorú értelemben véve nem részei a fehérje alapszerkezetének. 00:02:45.988 --> 00:02:48.830 Ezt takarja a kofaktor név. 00:02:48.830 --> 00:02:52.136 Tehát ez itt egy kofaktor, 00:02:52.136 --> 00:02:55.804 amely hozzákapcsolódik a tulajdonképpeni fehérjéhez, 00:02:55.804 --> 00:02:57.134 így az enzim részévé válik, 00:02:57.134 --> 00:03:01.663 sőt nélküle nem is menne végbe a reakció. 00:03:01.663 --> 00:03:07.463 Ezt valahogy így jelölnék a tankönyvekben: 00:03:07.463 --> 00:03:09.314 a reakció végbemeneteléhez 00:03:09.314 --> 00:03:13.283 a szubsztrát mellett a kofaktor is szükséges. 00:03:13.283 --> 00:03:14.760 Tehát kofaktor. 00:03:14.760 --> 00:03:17.471 A furcsa név tehát annyit jelent, 00:03:17.471 --> 00:03:20.720 hogy ez az enzimnek egy nemfehérje jellegű része. 00:03:20.720 --> 00:03:24.828 Egy másféle molekula, ion, vagy atom, 00:03:24.828 --> 00:03:27.719 amely szükséges az enzim működéséhez, 00:03:27.719 --> 00:03:31.327 és szerkezetileg nem aminosav, 00:03:31.327 --> 00:03:34.463 nem is oldallánc, nem a fehérje része, 00:03:34.463 --> 00:03:36.174 hanem valami másféle dolog, 00:03:36.174 --> 00:03:37.925 ami szükséges a reakció katalíziséhez. 00:03:37.925 --> 00:03:39.345 A hexokináz kapcsán láttuk 00:03:39.345 --> 00:03:45.118 a szerkezetében lévő magnéziumionokat. 00:03:45.118 --> 00:03:46.847 Ezért hangsúlyozzuk annyiszor 00:03:46.847 --> 00:03:48.329 a vitaminok és ásványi sók fontosságát, 00:03:48.329 --> 00:03:51.182 hiszen ezek közül sokan működnek 00:03:51.182 --> 00:03:55.142 enzimek kofaktoraiként. 00:03:55.142 --> 00:03:56.987 Ezen a rajzon is láthatók. 00:03:56.987 --> 00:03:58.949 Legalábbis úgy tudom, 00:03:58.949 --> 00:04:03.300 hogy ezek a zöldek itt a magnéziumionok, 00:04:03.300 --> 00:04:08.059 azaz a kofaktorok. 00:04:08.059 --> 00:04:12.717 Kofaktorok, tehát a tuladonképpeni enzim nemfehérje jellegű részei. 00:04:12.717 --> 00:04:15.372 A kofaktorok tovább is csoportosíthatók, 00:04:15.372 --> 00:04:20.272 szerves, illetve szervetlen kofaktorokra. 00:04:20.272 --> 00:04:25.405 Most tehát egy szervetlen kofaktort ismertünk meg. 00:04:25.405 --> 00:04:32.164 Sokféle ion lehet kofaktor: magnézium-, nátrium- kalciumionok és egyebek. 00:04:32.164 --> 00:04:35.937 Gyakran az az feladatuk, hogy az elekronokat odébb taszítva 00:04:35.937 --> 00:04:37.668 előmozdítsák a reakciót. 00:04:37.668 --> 00:04:42.106 Léteznek szerves kofaktorok is, azaz szerves molekulák. 00:04:42.106 --> 00:04:45.110 Emlékezz rá, hogy a szerves molekulák szénvegyületek, 00:04:45.110 --> 00:04:47.675 főleg szénláncokból állnak. 00:04:47.675 --> 00:04:53.054 A szerves kofakorokat koenzimeknek nevezzük. 00:04:53.054 --> 00:04:55.516 Tehát koenzimek. 00:04:55.516 --> 00:04:58.134 Rengeteg koenzimet ismerünk. 00:04:58.134 --> 00:05:04.517 Ez itt a laktát-dehidrogenáz enzim. 00:05:04.517 --> 00:05:05.457 Van egy koenzime, 00:05:05.457 --> 00:05:09.784 amivel a biológiában sokszor találkozhatunk. 00:05:09.784 --> 00:05:12.539 Ez itt a NAD. 00:05:12.539 --> 00:05:14.237 Figyeld meg, ez nem csak egy ion, 00:05:14.237 --> 00:05:16.031 hanem egy egész molekula. 00:05:16.031 --> 00:05:18.798 Szénatomokat tartalmaz, ezért nevezzük szerves anyagnak. 00:05:18.798 --> 00:05:21.320 Szerkezetileg nem fehérje, 00:05:21.320 --> 00:05:25.551 nem a fehérjét felépítő aminosavakból áll, 00:05:25.551 --> 00:05:27.015 ezért kofaktornak tekintjük, 00:05:27.015 --> 00:05:29.711 és mivel ez egy teljes szerves molekula, 00:05:29.711 --> 00:05:35.776 koenzimnek nevezzük. 00:05:35.776 --> 00:05:38.325 Mint minden kofaktornak, az a szerepe, 00:05:38.325 --> 00:05:40.907 hogy segítse az enzim munkáját, 00:05:40.907 --> 00:05:42.301 elősegíteni a reakciót. 00:05:42.301 --> 00:05:45.103 A NAD koenzim, 00:05:45.103 --> 00:05:46.518 amit sokat fogunk látni, 00:05:46.518 --> 00:05:49.995 a hidridionok átadásában segít. 00:05:49.995 --> 00:05:53.614 A hidridion, mely önmagában szinte sohasem létezik, 00:05:53.614 --> 00:05:55.764 olyan hidrogénatom, amelyben a szokásosnál eggyel több elektron van, 00:05:55.764 --> 00:05:59.508 így negatív töltéssel rendelkezik. 00:05:59.508 --> 00:06:03.453 Tehát egy ilyen részecske átadását segíti 00:06:03.453 --> 00:06:06.465 egyik szubsztrátról a másikra. 00:06:06.465 --> 00:06:09.121 Erre a NAD úgy képes, 00:06:09.121 --> 00:06:14.191 hogy egy hidridion felételével átalakul NADH-vá. 00:06:14.191 --> 00:06:17.064 A részletesebb szerkezete egészen lenyűgöző. 00:06:17.064 --> 00:06:19.014 Valószínűleg készítek egy videót a NAD-ról, 00:06:19.014 --> 00:06:23.280 mivel egy sor tankönyvben láttam 00:06:23.280 --> 00:06:24.157 és fogalmam sem volt róla, mi fán teremnek, 00:06:24.157 --> 00:06:25.876 pedig igazán csodálatos molekula. 00:06:25.876 --> 00:06:29.938 Arra képes, hogy felvegyen egy hidridaniont, 00:06:29.938 --> 00:06:31.016 itt, ezen a szénatomon 00:06:31.016 --> 00:06:33.651 kötést alakít ki a hidrogénnel, 00:06:33.651 --> 00:06:36.815 egy későbbi videóban megmutatom, hogyan. 00:06:36.815 --> 00:06:38.098 Nagyon jópofa molekula, 00:06:38.098 --> 00:06:39.349 szeretnék egy kicsit ezzel foglalkozni. 00:06:39.349 --> 00:06:41.933 A fő témánk a koenzimek, 00:06:41.933 --> 00:06:44.994 de ezek a mintázatok általánosak a biológiában, 00:06:44.994 --> 00:06:49.147 A nikotinamid-adenin-dinukleotid név 00:06:49.147 --> 00:06:51.456 pontosan leírja a szerkezetét. 00:06:51.456 --> 00:07:00.116 Ez a rész itt a nikotinamid, 00:07:00.116 --> 00:07:04.117 ez a rész képes hidridiont megkötni, illetve leadni, 00:07:04.117 --> 00:07:07.828 mondhatni ez a molekula aktív része. 00:07:07.828 --> 00:07:11.891 Az adenin régi jó ismerősünk a DNS-ből, 00:07:11.891 --> 00:07:14.198 az RNS-ből és az ATP-ből, 00:07:14.198 --> 00:07:19.372 ez tehát itt az adenin. 00:07:19.372 --> 00:07:21.133 A dinukleotid név arra utal, 00:07:21.133 --> 00:07:23.589 hogy ebben a szerkezetben két összekapcsolt nukleotid van 00:07:23.589 --> 00:07:25.644 amelyek a foszfátcsoprtjukon át kapcsolódnak össze. 00:07:25.644 --> 00:07:27.188 Ebben a szerkezetbentöbbféle szerkezet is felismerhető. 00:07:27.188 --> 00:07:28.601 Itt egy adenin, 00:07:28.601 --> 00:07:31.261 itt pedig egy ribóz és egy foszfátcsoport. 00:07:31.261 --> 00:07:39.937 Ez a részlet 00:07:39.937 --> 00:07:41.775 az az építőkő, 00:07:41.775 --> 00:07:46.919 amely az RNS egyik építőköve. 00:07:46.919 --> 00:07:49.023 addnin 00:07:49.023 --> 00:07:53.078 ha pedig ezt a részt is hozzávesszük 00:07:53.078 --> 00:07:57.270 ezt az egészet 00:07:57.270 --> 00:07:58.721 akkor ez az ADP. 00:07:58.721 --> 00:08:01.862 Azért hívják dinukleotidnak, 00:08:01.862 --> 00:08:04.999 ez az egyik nukleotid, 00:08:04.999 --> 00:08:09.575 amelyikben a nikotinamid van, 00:08:09.575 --> 00:08:12.472 tehát ez az egyik nukleotid, 00:08:12.472 --> 00:08:14.433 ez pedig a másik, 00:08:14.433 --> 00:08:17.315 amelyikben az adenin van. 00:08:17.315 --> 00:08:19.419 Ezért nevezik dinukleotidnak. 00:08:19.419 --> 00:08:22.709 Remélhetőleg így már kevésbé rejtélyes a NAD. 00:08:22.709 --> 00:08:24.190 Találkozunk még vele, 00:08:24.190 --> 00:08:27.350 csak ezeket a mintákat akartam benne megmutatni, 00:08:27.350 --> 00:08:28.998 amelyek újra és újra felbukkannak 00:08:28.998 --> 00:08:33.057 az ATP-ben, az RNS-ben és így tovább. 00:08:33.057 --> 00:08:37.766 Ám nem ez az egyetlen kofaktor, illetve koenzim. 00:08:37.766 --> 00:08:39.294 Sok-sok további példát ismerünk. 00:08:39.294 --> 00:08:41.466 A vitaminok és az ásványi anyagok sokat emlegetett fontossága 00:08:41.466 --> 00:08:43.212 azon alapul, hogy ezek többnyire kofaktorok. 00:08:43.212 --> 00:08:45.830 A C vitamin nagyon fontos kofaktor 00:08:45.830 --> 00:08:47.528 azokban az enzimekben, amelyek... 00:08:47.528 --> 00:08:48.619 mindegy, most nem részletezem, 00:08:48.619 --> 00:08:49.679 hogy mi mindenre képes. 00:08:49.679 --> 00:08:51.499 Itt látható a C vitamin két különböző ábrája, 00:08:51.499 --> 00:08:56.041 egy térkitöltéses modell és egy pálcikamodell. 00:08:56.041 --> 00:08:58.638 A folsav, úgyszintén kétféle ábrázolásban. 00:08:58.638 --> 00:09:00.532 Ezek tehát mind koenzimek, 00:09:00.532 --> 00:09:06.055 működésük fehérjékhez kötődik, 00:09:06.055 --> 00:09:09.283 ezekhez a rendkívül összetett szerkezetekhez 00:09:09.283 --> 00:09:12.629 szubsztrátokat elősegítve 00:09:12.629 --> 00:09:16.125 a szubsztrátot másféle színnel jelölöm. 00:09:16.125 --> 00:09:18.508 Ezek tehát a szubsztrátok, 00:09:18.508 --> 00:09:20.080 Az enzim ezeknek az átalakítását 00:09:20.080 --> 00:09:22.212 igyekszik katalizálni. 00:09:22.212 --> 00:09:25.405 És akkor itt van pár ion, 00:09:25.405 --> 00:09:32.838 amelyek kofaktorként működnek, 00:09:32.838 --> 00:09:34.850 A szerves kofaktorok, 00:09:34.850 --> 00:09:38.206 mint a C vitamin és más említett anyagok, 00:09:38.206 --> 00:09:41.487 szintén részt vesznek a folyamat előmozdításában, 00:09:41.487 --> 00:09:43.735 elősegítik a reakciót. 00:09:43.735 --> 00:09:45.538 Ez tehát néha azzal jár, 00:09:45.538 --> 00:09:48.014 hogy stabilizálni kell bizonyos töltéseket, 00:09:48.014 --> 00:09:51.568 néha elektronokat kell adni-venni, 00:09:51.568 --> 00:09:52.678 vagy más efféle dolgokat kell csinálni. 00:09:52.678 --> 00:09:56.473 Voltaképpen a reakciómechanizmus részeként működnek.