Néhány korábbi videóban
már foglalkoztunk enzimekkel.
Ebben a videóban egy kicsit mélyebbre tekintünk,
hogy lássuk, kik segítik az enzimeket.
Emlékeztetőül:
az enzimek elősegítik a kémiai reakciókat,
csökkentik az aktiválási energiájukat,
hogy a reakciók könnyebben, illetve gyorsabban menjenek végbe.
Néhány enzimmel már találkoztunk.
Csak a tisztánlátás kedvéért jegyezzük meg,
a tankönyvek valahogy így ábrázolják az enzimeket,
ilyesféle rajzokkal találkozunk.
Ez volna itt az enzim,
x
itt pedig...
itt kötődik meg valamilyen szubsztrát,
X
amivel majd csinál valamit.
Egy tankönyvben elmegy egy ilyen elvont ábra,
hogy a szubsztrát pont belepasszol az enzim szerkezetébe,
de a valóságban nem egészen így működik.
egy biológiai rendszerben.
Ne feledjük, hogy amikor enzimekről van szó,
akkor fehérjékről beszélünk.
Persze vannak RNS-enzimek (ribozimek),
de az enzimeken a legtöbb esetben
mégiscsak fehérjéket értünk.
Arról is sokat beszéltünk,
hogy ezek a polipeptid szerkezetek,
és az őket alkotó aminosavak oldalláncai
hogyan hajtogatódnak össze változatos szerkezetekké.
Ha szebben tudnék rajzolni,
valahogy így rajzolnám le a fehérjét.
Mindenféle tekervényes szerkezetbe tekeredve,
itt egy pár alfa hélix, ott egy pár béta-redő.
mindenféle tekervényes szerkezet.
A szubsztrát pedig, valamiféle molekula,
beleágyazódik a fehérje szerkezetébe.
Itt látható néhány példa.
Ez itt egy hexokináz modellje,
ez a pötty az ATP,
egy kissé nehezen látható a glükóz,
amely éppen foszforilálódik.
Ez pedig a reakciót elősegító nagy fehérje,
a hexokináz.
Ennek a videónak az a fő témája,
hogy az enzimfehérjékről beszélve
aminosav-láncokra gondolunk,
ám az enzimekben gyakran vannak olyan részek,
amelyek valójában nem fehérjék.
A hexokinázokról szólva is láttuk ezt,
amikor a glükóz foszforilációjáról beszéltünk.
Említettük, hogy az aktiválási energia csökkentésében
ezek a pozitív magnéziumionok játszanak szerepet.
x
Ezek kissé megbuherálják
a foszfátcsoportok elektronjait,
félrehúzzák őket, hogy ez a hidroxilcsoport
hozzákötődhessen a foszfátcsoporthoz
és ne zavarják az elektronok.
Ezek a magnéziumionok
hivatalosan nem részei a fehérjének.
Ez az, amit kofaktornak nevezünk.