WEBVTT 00:00:00.000 --> 00:00:01.884 Néhány korábbi videóban 00:00:01.884 --> 00:00:03.858 már foglalkoztunk enzimekkel. 00:00:03.858 --> 00:00:06.736 Most egy kicsit jobban elmélyedünk a témában, 00:00:06.736 --> 00:00:09.949 hogy megismerjük az enzimek segítőtársait. 00:00:09.949 --> 00:00:11.567 Mire is jók az enzimek? 00:00:11.567 --> 00:00:14.493 A kémiai reakciókat segítik elő 00:00:14.493 --> 00:00:18.486 az aktiválási energia csökkentésével, 00:00:18.486 --> 00:00:21.574 hogy a reakciók könnyebben, illetve gyorsabban menjenek végbe. 00:00:21.574 --> 00:00:24.198 Néhány enzimmel már találkoztunk. 00:00:24.198 --> 00:00:26.776 Először tisztázzunk néhány dolgot. 00:00:26.776 --> 00:00:29.283 A tankönyvek néha így ábrázolják az enzimeket, 00:00:29.283 --> 00:00:31.070 ilyesféle rajzokkal találkozhatunk. 00:00:31.070 --> 00:00:34.461 Ez volna itt az enzim, 00:00:34.461 --> 00:00:36.441 x 00:00:36.441 --> 00:00:39.759 itt pedig... 00:00:39.759 --> 00:00:41.812 itt köt meg valamilyen szubsztrátot, 00:00:41.812 --> 00:00:43.879 X 00:00:43.879 --> 00:00:45.435 amit majd valahogy átalakít. 00:00:45.435 --> 00:00:48.986 Az elvont, tankönyvízű magyarázat szerint 00:00:48.986 --> 00:00:52.331 a szubsztrát pontosan így illeszkedik az enzimhez, 00:00:52.331 --> 00:00:53.863 ám ez valójában nem egészen így működik 00:00:53.863 --> 00:00:55.605 a biológiai rendszerekben. 00:00:55.605 --> 00:00:58.485 Ne feledjük, hogy az enzimekről beszélve 00:00:58.485 --> 00:01:00.180 fehérjékről beszélünk. 00:01:00.180 --> 00:01:03.918 Vannak persze RNS-enzimek (ribozimek) is, 00:01:03.918 --> 00:01:06.588 de az enzimek nagy többsége 00:01:06.588 --> 00:01:08.864 mégiscsak fehérje. 00:01:08.864 --> 00:01:11.440 Arról is sokat beszéltünk, 00:01:11.440 --> 00:01:13.808 hogy ezek a polipeptid szerkezetek, 00:01:13.808 --> 00:01:16.503 és a sokféle oldalláncot hordozó aminosavak 00:01:16.503 --> 00:01:19.400 hogyan hajtogatódnak össze változatos szerkezetekké. 00:01:19.400 --> 00:01:22.377 Egy pontosabb rajz így ábrázolná 00:01:22.377 --> 00:01:26.325 a tekervényes szerkezetű fehérjét. 00:01:26.325 --> 00:01:28.623 x 00:01:28.623 --> 00:01:30.782 Itt egy pár alfa hélix, ott néhány béta-redő, 00:01:30.782 --> 00:01:33.754 egy halom gubanc egymás hegyén-hátán. 00:01:33.754 --> 00:01:35.891 A szubsztrát pedig valamiféle molekula, 00:01:35.891 --> 00:01:40.837 amely beleágyazódik a fehérje szerkezetébe. 00:01:40.837 --> 00:01:43.784 Itt van néhány példa. 00:01:43.784 --> 00:01:46.781 Ez a hexokináz modellje. 00:01:46.781 --> 00:01:49.613 Ez a kis pötty az ATP, 00:01:49.613 --> 00:01:51.912 ez a kis valami pedig a glükóz, 00:01:51.912 --> 00:01:54.722 amely éppen foszforilálódik. 00:01:54.722 --> 00:01:57.276 A reakciót ez a nagy fehérjemolekula segíti,, 00:01:57.276 --> 00:01:59.784 a hexokináz. 00:01:59.784 --> 00:02:01.814 Ennek a videónak az a lényege, 00:02:02.424 --> 00:02:04.362 hogy bár az enzimfehérjék kapcsán 00:02:04.362 --> 00:02:07.023 valamilyen aminosav-láncra gondolunk, 00:02:07.023 --> 00:02:09.717 az enzimeknek gyakran vannak olyan részei, 00:02:09.717 --> 00:02:11.668 amelyek valójában nem fehérjék. 00:02:11.668 --> 00:02:14.338 Ezt a hexokinázok kapcsán is láttuk, 00:02:14.338 --> 00:02:16.962 amikor a glükóz foszforilációját tárgyaltuk. 00:02:16.962 --> 00:02:19.887 Említettük, hogy az aktiválási energia csökkentésében 00:02:19.887 --> 00:02:23.629 kulcsszerepet játszanak ezek a pozitív magnéziumionok. 00:02:23.629 --> 00:02:26.187 x 00:02:26.187 --> 00:02:28.825 Ezek kissé lefoglalják 00:02:28.825 --> 00:02:32.192 a foszfátcsoportok elektronjait, 00:02:32.192 --> 00:02:35.930 félrehúzzák őket, hogy ez a hidroxilcsoport 00:02:35.930 --> 00:02:37.625 hozzákötődhessen a foszfátcsoporthoz 00:02:37.625 --> 00:02:38.995 és ne zavarják az elektronok. 00:02:38.995 --> 00:02:42.153 Nos, ezek a magnéziumionok 00:02:42.153 --> 00:02:45.288 szigorú értelemben véve nem részei a fehérje alapszerkezetének. 00:02:45.288 --> 00:02:48.190 Ezt takarja kofaktor név. 00:02:48.190 --> 00:02:51.836 Tehát ez itt egy kofaktor, 00:02:51.836 --> 00:02:55.969 amely hozzákapcsolódik a tulajdonképpeni fehérjéhez, 00:02:55.969 --> 00:02:58.244 így az enzim részévé válik, 00:02:58.244 --> 00:03:00.775 sőt nélküle nem is menne végbe a reakció. 00:03:00.775 --> 00:03:03.978 Ezt valahogy így jelölnék a tankönyvekben: 00:03:03.978 --> 00:03:06.673 c 00:03:06.673 --> 00:03:09.204 a reakció végbemeneteléhez 00:03:09.204 --> 00:03:11.943 a szubsztrát mellett kofaktor is szükséges. 00:03:11.943 --> 00:03:14.080 Tehát kofaktor. 00:03:14.080 --> 00:03:17.121 A furcsa név tehát annyit jelent, 00:03:17.121 --> 00:03:20.790 hogy ez az enzimnek egy nemfehérje jellegű része. 00:03:20.790 --> 00:03:25.248 Egy másféle molekula, ion, vagy atom, 00:03:25.248 --> 00:03:27.779 amely az enzim működéséhez szükséges, 00:03:27.779 --> 00:03:31.123 amely nem aminosav, 00:03:31.123 --> 00:03:34.373 nem oldallánc, nem a fehérje része. 00:03:34.373 --> 00:03:35.604 hanem valami másféle dolog, 00:03:35.604 --> 00:03:37.925 aminek jelen kell lenni a reakció katalíziséhez. 00:03:37.925 --> 00:03:39.835 A hexokináz kapcsán láthattuk 00:03:39.835 --> 00:03:44.656 a szerkezetében lévő magnéziumionokat. 00:03:44.656 --> 00:03:47.607 Ezért hangsúlyozzuk annyiszor 00:03:47.607 --> 00:03:49.766 a vitaminok és az ásványi anyagok fontosságát, 00:03:49.766 --> 00:03:54.526 hiszen ezek közül sokan szerepelnek az ezimek kofaktoraiként. 00:03:54.526 --> 00:03:56.987 Ezen a rajzon is látható, 00:03:56.987 --> 00:04:00.469 Úgy tudom, 00:04:00.469 --> 00:04:04.720 ezek a zöldek itt magnéziumionok, 00:04:04.720 --> 00:04:07.459 azaz kofaktorok. 00:04:07.459 --> 00:04:12.057 Kofaktorok, tehát a tuladonképpeni enzim nemfehérje jellegű részei. 00:04:12.057 --> 00:04:14.890 A kofaktorok további csoportokra oszthatók, 00:04:14.890 --> 00:04:17.653 szerves, illetve szervetlen kofaktorokra. 00:04:17.653 --> 00:04:20.142 x 00:04:20.142 --> 00:04:25.035 Most tehát egy szervetlen kofaktort ismertünk meg. 00:04:25.035 --> 00:04:27.822 Sokféle ionból lehet kofaktor, pléldául magnézium-, nátrium- és kalciumionok 00:04:27.822 --> 00:04:29.913 x 00:04:29.913 --> 00:04:32.164 x 00:04:32.164 --> 00:04:35.717 Gyakran az az feladatuk, hogy az elekronokat odébb taszítva 00:04:35.717 --> 00:04:37.668 előmozdítják a reakciót. 00:04:37.668 --> 00:04:39.107 Léteznek szerves kofaktorok is, 00:04:39.107 --> 00:04:41.986 azaz szerves molekulák. 00:04:41.986 --> 00:04:44.054 Emlékezz rá, hogy a szerves molekulák szénvegyületek, 00:04:44.054 --> 00:04:45.540 x 00:04:45.540 --> 00:04:47.328 főleg szénláncokból állnak. 00:04:47.328 --> 00:04:50.741 A szerves kofakorokat koenzimeknek nevezzük. 00:04:50.741 --> 00:04:53.054 x 00:04:53.054 --> 00:04:54.771 Tehát koenzimek. 00:04:54.771 --> 00:04:58.134 Rengeteg koenzimet ismerünk. 00:04:58.134 --> 00:05:00.787 Ez itt például 00:05:00.797 --> 00:05:03.967 a laktát-dehidrogenáz enzim. 00:05:04.517 --> 00:05:06.206 Van egy koenzime, 00:05:06.206 --> 00:05:09.294 amivel a biológiai tanulmányok során sokszor találkozhatunk. 00:05:09.294 --> 00:05:12.359 Ez a NAD. 00:05:12.359 --> 00:05:15.841 Mint látható, ez nem csak egy ion, hanem egy egész molekula. 00:05:15.841 --> 00:05:18.348 Szénatomokat tartalmaz, ezért nevezzük szerves anyagnak. 00:05:18.348 --> 00:05:22.550 Szerkezetileg nem fehérje, 00:05:22.550 --> 00:05:25.341 nem a fehérjét felépítő aminosavakból áll, 00:05:25.341 --> 00:05:27.015 ezért kofaktornak tekintjük, 00:05:27.015 --> 00:05:29.661 és mivel ez egy teljes szerves molekula, 00:05:29.661 --> 00:05:31.495 koenzimnek nevezzük. 00:05:31.495 --> 00:05:34.956 x 00:05:34.956 --> 00:05:37.905 Mint minden kofaktornak, az a szerepe, 00:05:37.905 --> 00:05:39.762 hogy segítsen az enzimnek ellátni a feladatát, 00:05:39.762 --> 00:05:41.991 elősegíteni a reakciót. 00:05:41.991 --> 00:05:45.103 A NAD koenzim, 00:05:45.103 --> 00:05:46.518 amellyel sokat fogunk találkozni, 00:05:46.518 --> 00:05:49.885 a hidridionok átadásában segít. 00:05:49.885 --> 00:05:53.044 A hidridion, amely önmagában szinte sohasem létezik, 00:05:53.044 --> 00:05:55.203 egy olyan hidrogénatom, amelynek a szokásosnál eggyel több elektronja van, 00:05:55.203 --> 00:05:58.918 így negatív töltéssel rendelkezik. 00:05:58.918 --> 00:06:02.603 Tehát egy ilyen részecske átadását segíti 00:06:03.443 --> 00:06:06.435 egyik szubsztrátról a másikra. 00:06:06.435 --> 00:06:09.361 Erre a NAD úgy képes, 00:06:09.361 --> 00:06:14.121 hogy egy hidridion felételével átalakul NADH-vá 00:06:14.121 --> 00:06:16.170 A részeletesebb szerkezete egészen lenyűgöző. 00:06:16.170 --> 00:06:17.656 x 00:06:17.656 --> 00:06:19.304 Valószínűleg készítek egy videót a NAD-ról, 00:06:19.304 --> 00:06:21.162 mivel egy sor tankönyvben láttam 00:06:21.162 --> 00:06:24.157 és fogalmam sem volt róla, mi fán teremnek, 00:06:24.157 --> 00:06:25.876 pedig igazán csodálatos molekula. 00:06:25.876 --> 00:06:27.431 Arra képes, hogy felvegyen egy hidridaniont, 00:06:27.431 --> 00:06:29.938 x 00:06:29.938 --> 00:06:32.006 itt ezen a szénatomon 00:06:32.006 --> 00:06:34.931 kötést alakít ki a hidrogénnel, 00:06:34.931 --> 00:06:36.695 egy későbbi videóban megmutatom, hogyan. 00:06:36.695 --> 00:06:38.228 Nagyon jópofa molekula, 00:06:38.228 --> 00:06:39.459 szeretnék egy kicsit ezzel foglalkozni. 00:06:39.459 --> 00:06:41.363 A fő témánk a koenzimek, 00:06:41.363 --> 00:06:43.824 de ezek a mintázatok általánosak a biológiában, 00:06:43.824 --> 00:06:48.467 A nikotinamid-adenin-dinukleotid név 00:06:48.467 --> 00:06:50.976 pontosan leírja a szerkezetét. 00:06:50.976 --> 00:06:55.976 Ez a rész itt alul a nikotinamid, 00:06:56.027 --> 00:07:01.027 x 00:07:01.076 --> 00:07:03.987 ez képes a hidridion megkötésére illetve leadására, 00:07:03.987 --> 00:07:07.028 mondhatni ez a milekula aktív része. 00:07:07.028 --> 00:07:11.487 Az adenin régi jó ismerősünk a DNS-ből, 00:07:11.487 --> 00:07:15.898 az RNS-ből és az ATP-ből, 00:07:15.898 --> 00:07:18.871 ez tehát itt az adenin. 00:07:18.871 --> 00:07:21.593 A dinukleotid név arra utal, 00:07:21.593 --> 00:07:23.635 hogy ebben a szerkezetben két összekapcsolt nukleotid van 00:07:23.635 --> 00:07:25.494 amelyek a foszfátcsoprtjukon át kapcsolódnak össze. 00:07:25.494 --> 00:07:27.188 Ebben a szerkezetben többféle szerkezet is felismerhető. 00:07:27.188 --> 00:07:28.721 Itt egy adenin, 00:07:28.721 --> 00:07:30.811 itt pedig egy ribóz és egy foszfátcsoport. 00:07:30.811 --> 00:07:35.527 Ez a részlet 00:07:36.420 --> 00:07:39.307 x 00:07:39.307 --> 00:07:41.815 az az építőkő, 00:07:41.815 --> 00:07:46.621 amely az RNS egyik építőköve. 00:07:46.621 --> 00:07:48.643 addnin 00:07:48.643 --> 00:07:53.078 ha pedig ezt a részt is hozzávesszük 00:07:53.078 --> 00:07:56.770 ezt az egészet 00:07:56.770 --> 00:07:59.951 akkor ez az ADP. 00:07:59.951 --> 00:08:01.762 Azért hívják dinukleotidnak, 00:08:01.762 --> 00:08:04.479 ez az egyik nukleotid, 00:08:04.479 --> 00:08:08.635 amelyikben a nikotinamid van, 00:08:08.635 --> 00:08:11.722 tehát ez az egyik nukleotid, 00:08:11.722 --> 00:08:14.533 ez pedig a másik, 00:08:14.533 --> 00:08:17.250 amelyikben az adenin van. 00:08:17.250 --> 00:08:19.479 Ezért nevezik dinukleotidnak. 00:08:19.479 --> 00:08:22.659 Remélhetőleg így már kevésbéb rejtélyes a NAD. 00:08:22.659 --> 00:08:25.330 Találkozunk még vele, 00:08:25.330 --> 00:08:27.350 csak ezeket a mintákat akartam megmutatni, 00:08:27.350 --> 00:08:28.998 amelyek újra és újra felbukkannak 00:08:28.998 --> 00:08:30.460 az ATP-ben, az RNS-ben és így tovább. 00:08:30.460 --> 00:08:32.667 x 00:08:32.667 --> 00:08:36.916 Ám nem ez az egyetlen kofaktor illetve koenzim. 00:08:37.896 --> 00:08:39.834 Sok-sok további példát ismerünk. 00:08:39.834 --> 00:08:41.096 A vitaminok és az ásványi anyagok sokat emlegetett fontossága 00:08:41.096 --> 00:08:43.162 azonalapul, hogy ezek többnyire kofaktorok. 00:08:43.162 --> 00:08:45.530 A C vitamin nagyon fontos kofaktor 00:08:45.530 --> 00:08:47.528 azokban az enzimekben, amelyek... 00:08:47.528 --> 00:08:48.619 mindegy, most nem részletezem, 00:08:48.619 --> 00:08:49.919 hogy mi mindenre képes. 00:08:49.919 --> 00:08:51.614 Itt látható a C vitamin két különböző ábrája, 00:08:51.614 --> 00:08:53.797 egy térkitöltéses modell 00:08:53.797 --> 00:08:55.491 és egy pálcikamodell. 00:08:55.491 --> 00:08:58.278 A folsav, úgyszintén kétféle ábrázolásban. 00:08:58.278 --> 00:09:02.532 Ezek tehát mind koenzimek, 00:09:02.532 --> 00:09:05.455 működésük fehérjékhez kötődik 00:09:05.455 --> 00:09:09.006 ezekhez a rendkívül összetett szerkezetekhez 00:09:09.006 --> 00:09:12.444 szubsztrátokat elősegítve 00:09:12.444 --> 00:09:14.905 a szubsztrátot másféle színnel jelölöm. 00:09:16.205 --> 00:09:18.198 Ezek tehát a szubsztrátok, 00:09:18.198 --> 00:09:20.080 Az enzim ezeknek az átalakítását 00:09:20.080 --> 00:09:21.682 igyekszik katalizálni. 00:09:21.682 --> 00:09:23.980 És akkor itt van pár ion, 00:09:23.980 --> 00:09:26.210 x 00:09:26.210 --> 00:09:29.438 amelyek egyfajta kofaktorként működnek, 00:09:29.438 --> 00:09:34.070 A szerves kofaktotrok, 00:09:35.130 --> 00:09:37.503 mint a C vitamin és más említett anyagok, 00:09:37.503 --> 00:09:41.287 szintén részt vesznek a folyamat előmozdításában, 00:09:41.287 --> 00:09:43.516 elősegítik a reakciót. 00:09:43.516 --> 00:09:45.908 Ez tehát néha azzal jár, 00:09:45.908 --> 00:09:48.834 hogy stabilizálni kell bizonyos töltéseket, 00:09:48.834 --> 00:09:51.318 néha elektronokat kell adni-venni 00:09:51.318 --> 00:09:52.897 vagy más efféle dolgokat kell csinálni. 00:09:52.897 --> 00:09:56.473 Voltaképpen a reakciómechanizmus részeként működnek.