Néhány korábbi videóban már foglalkoztunk enzimekkel. Most egy kicsit jobban elmélyedünk a témában, hogy megismerjük az enzimek segítőtársait. Mire is jók az enzimek? A kémiai reakciókat segítik elő az aktiválási energia csökkentésével, hogy a reakciók könnyebben, illetve gyorsabban menjenek végbe. Néhány enzimmel már találkoztunk. Először tisztázzunk néhány dolgot. A tankönyvek néha így ábrázolják az enzimeket, ilyesféle rajzokkal találkozhatunk. Ez volna itt az enzim, x itt pedig... itt köt meg valamilyen szubsztrátot, X amit majd valahogy átalakít. Az elvont, tankönyvízű magyarázat szerint a szubsztrát pontosan így illeszkedik az enzimhez, ám ez valójában nem egészen így működik a biológiai rendszerekben. Ne feledjük, hogy az enzimekről beszélve fehérjékről beszélünk. Vannak persze RNS-enzimek (ribozimek) is, de az enzimek nagy többsége mégiscsak fehérje. Arról is sokat beszéltünk, hogy ezek a polipeptid szerkezetek, és a sokféle oldalláncot hordozó aminosavak hogyan hajtogatódnak össze változatos szerkezetekké. Egy pontosabb rajz így ábrázolná a tekervényes szerkezetű fehérjét. x Itt egy pár alfa hélix, ott néhány béta-redő, egy halom gubanc egymás hegyén-hátán. A szubsztrát pedig valamiféle molekula, amely beleágyazódik a fehérje szerkezetébe. Itt van néhány példa. Ez a hexokináz modellje. Ez a kis pötty az ATP, ez a kis valami pedig a glükóz, amely éppen foszforilálódik. A reakciót ez a nagy fehérjemolekula segíti,, a hexokináz. Ennek a videónak az a lényege, hogy bár az enzimfehérjék kapcsán valamilyen aminosav-láncra gondolunk, az enzimeknek gyakran vannak olyan részei, amelyek valójában nem fehérjék. Ezt a hexokinázok kapcsán is láttuk, amikor a glükóz foszforilációját tárgyaltuk. Említettük, hogy az aktiválási energia csökkentésében kulcsszerepet játszanak ezek a pozitív magnéziumionok. x Ezek kissé lefoglalják a foszfátcsoportok elektronjait, félrehúzzák őket, hogy ez a hidroxilcsoport hozzákötődhessen a foszfátcsoporthoz és ne zavarják az elektronok. Ezek a magnéziumionok hivatalosan nem részei a fehérjének. Ez az, amit kofaktornak nevezünk. Lehet például itt egy kofaktor, amely hozzákapcsolódik a fő fehérjéhez így az enzim részévé válik, sőt nélküle nem is megy végbe a reakció. A tankönyvekben ezt így jelölnék: c a reakció végbemeneteléhez szükséges a szubsztrát, de emellett a kofaktor is. c A furcsa név tehát annyit jelent, hogy ez az enzimnek egy nemfehérje természetű része. Egy másik molekula, ion, vagy atom, amely az enzim működéséhez szükséges, amely nem aminosav, nem oldallánc, nem a fehérje része. hanem valami másféle dolog, aminek ott kell lenni a reakció katalíziséhez. A hexokináz kapcsán láttunk erre példát, a szerkezetben voltak magnéziumionok. Ezért hangsúlyozzuk annyit az ásványi anyagok és a vitaminok fontosságát, hiszen ezek közül sokan enzimek kofaktoraiként működnek. Ezen a rajzon is látható, amennyire én tudom, ezek a zöldek itt magnéziumionok, és ezek kofaktorok. Kofaktorok, tehát az enzim nemfehérje jellegű részei. A kofaktorok további csoportokra oszthatók. Vannak szerves kofaktorok és szervetlen kofaktorok. Tehát a kofaktorok közül megismertünk egy szervetlen kofaktort. Sokféle ion, magnézium-, nátrium- és kalciumionok x ezek közül sok lehet kofaktor. Sokszor az elektronokat tolják odébb, vagy... hogy.... Vannak szerves kofaktorok is, szerves molekulák. Emlékezz rá, hogy a szerves molekulák szénvegyületek, szénláncokat tartalmaznak. x A szerves kofakorokat koenzimeknek nevezzük. x Tehát koenzimek. Rengeteg példát említhetünk a koenzimekre. Ez itt például a laktát-dehidrogenáz enzim. Ehhez tartozik egy koenzim, amelyikkel sokszor találkoznak a biológiások. Ez a NAD. Mint látható, ez nem csak egy ion, hanem egy egész molekula.