1 00:00:00,917 --> 00:00:03,825 我们要如何击败新型冠状病毒? 2 00:00:04,317 --> 00:00:06,948 通过使用我们最好的工具: 3 00:00:06,972 --> 00:00:09,011 我们的科学和技术。 4 00:00:09,594 --> 00:00:12,726 在我的实验室中, 我们正在使用人工智能 5 00:00:12,750 --> 00:00:14,329 和合成生物学的工具, 6 00:00:14,353 --> 00:00:17,413 加快与这场疫情的战斗。 7 00:00:18,078 --> 00:00:19,941 我们工作的初衷 8 00:00:19,965 --> 00:00:22,818 是想解决抗生素耐药性的危机。 9 00:00:22,842 --> 00:00:27,531 我们的项目试图利用 机器学习的力量 10 00:00:27,555 --> 00:00:29,401 补充我们的抗生素“弹药库”, 11 00:00:29,425 --> 00:00:33,263 并避免会造成全球性危害的 后抗生素时代。 12 00:00:33,685 --> 00:00:37,099 重要的是,同样的技术能用来寻找 13 00:00:37,099 --> 00:00:39,236 可以帮助我们应对当前疫情的 14 00:00:39,236 --> 00:00:41,373 抗病毒化合物。 15 00:00:42,080 --> 00:00:44,422 机器学习正在颠覆 16 00:00:44,422 --> 00:00:46,940 传统的药物开发模型。 17 00:00:47,434 --> 00:00:48,683 通过这种方法, 18 00:00:48,683 --> 00:00:52,675 我们不再需要在实验室里 一个接一个费力地测试 19 00:00:52,675 --> 00:00:53,793 成千上万 20 00:00:53,793 --> 00:00:55,681 现有分子的效力, 21 00:00:55,856 --> 00:01:00,513 而是可以训练电脑探索更大的、 22 00:01:00,537 --> 00:01:04,121 基本上涵盖了所有 可能合成的分子的空间。 23 00:01:04,145 --> 00:01:09,759 因此,相比在“海底捞针”, 24 00:01:09,783 --> 00:01:13,543 我们可以使用计算能力 这块“巨型磁铁”, 25 00:01:13,567 --> 00:01:17,482 同时在几个“海”底 捞很多很多根“针”。 26 00:01:18,423 --> 00:01:21,010 我们的早期尝试 已经取得了一些成功。 27 00:01:21,010 --> 00:01:26,475 最近,我们使用机器学习 发现了新的抗生素, 28 00:01:26,475 --> 00:01:28,099 可以帮助我们抵御 29 00:01:28,099 --> 00:01:32,694 可能伴随 SARS-CoV-2 冠状病毒感染 发生的细菌感染。 30 00:01:33,181 --> 00:01:37,261 两个月前,TED 的“大胆计划” (Audacious Project) 31 00:01:37,261 --> 00:01:39,562 批准了我们的资金申请, 32 00:01:39,586 --> 00:01:44,124 这将大规模扩展我们的工作, 目标是在未来的七年里, 33 00:01:44,124 --> 00:01:45,491 发现七类新型抗生素, 34 00:01:45,491 --> 00:01:49,710 以对抗世界上七种 致命的病原体细菌。 35 00:01:50,206 --> 00:01:51,939 在此说明一下: 36 00:01:51,963 --> 00:01:54,435 在过去三十年内,人类发现的 37 00:01:54,435 --> 00:01:57,150 新型抗生素的数量为零。 38 00:01:58,030 --> 00:02:01,625 虽说寻找新的抗生素 是为了我们的中期未来, 39 00:02:01,625 --> 00:02:06,277 新型冠状病毒构成了 迫在眉睫的致命威胁, 40 00:02:06,301 --> 00:02:10,094 我很高兴能跟大家宣布, 我们认为可以使用相同的技术 41 00:02:10,118 --> 00:02:12,927 寻找对抗这种病毒的治疗手段。 42 00:02:13,486 --> 00:02:15,205 那么我们该怎么做呢? 43 00:02:15,229 --> 00:02:18,177 我们正在创建一个 化合物训练库, 44 00:02:18,201 --> 00:02:23,743 并与合作者一起,用这些分子处理 被 SARS-CoV-2 感染的细胞, 45 00:02:23,743 --> 00:02:27,718 看看哪个分子表现出了有效的活性。 46 00:02:28,007 --> 00:02:31,231 这些数据将用于训练 一个机器学习模型, 47 00:02:31,231 --> 00:02:35,178 这个模型将被应用于包含 超过十亿个分子的计算机模拟数据库, 48 00:02:35,178 --> 00:02:39,620 以寻找潜在的新型抗病毒化合物。 49 00:02:40,320 --> 00:02:43,200 我们将合成并测试 算法预测出的最优分子, 50 00:02:43,200 --> 00:02:45,974 并让最有潜力的备选分子 进入临床实验。 51 00:02:46,239 --> 00:02:48,276 听起来是不是过于美好了? 52 00:02:48,276 --> 00:02:49,745 并非如此。 53 00:02:49,745 --> 00:02:52,984 抗生素人工智能项目的设立 是基于我们的概念验证研究, 54 00:02:52,984 --> 00:02:56,254 这项研究最终发现了 一种新型广谱抗生素, 55 00:02:56,254 --> 00:02:57,649 叫做 Halocin。 56 00:02:58,363 --> 00:03:01,364 Halocin 具有强大的抗菌活性, 57 00:03:01,388 --> 00:03:04,903 能杀死几乎所有 对抗生素耐药的病原体细菌, 58 00:03:04,903 --> 00:03:08,780 包括无法治疗的多重耐药感染。 59 00:03:09,999 --> 00:03:11,892 重要的是,与目前的抗生素相比, 60 00:03:11,892 --> 00:03:14,478 细菌对 Halocin 产生耐药性的频率 61 00:03:14,478 --> 00:03:17,064 非常低。 62 00:03:18,226 --> 00:03:21,177 我们在实验室里测试了 细菌对 Halocin 63 00:03:21,177 --> 00:03:25,018 以及环丙沙星(Cipro) 产生耐药性的能力。 64 00:03:25,513 --> 00:03:26,783 结果发现, 65 00:03:26,783 --> 00:03:30,125 仅仅一天后,细菌就对 环丙沙星产生了耐药性。 66 00:03:30,299 --> 00:03:31,841 而对于 Halocin, 67 00:03:31,865 --> 00:03:34,270 经过一天后, 细菌没有产生任何耐药性。 68 00:03:34,503 --> 00:03:37,605 不可思议的是, 甚至在 30 天后, 69 00:03:37,605 --> 00:03:40,675 我们也没有发现细菌 对 Halocin 产生任何耐药性。 70 00:03:40,875 --> 00:03:47,097 在这个试点项目中,我们首先对大肠杆菌 测试了大约 2500 种化合物。 71 00:03:47,097 --> 00:03:49,928 这个训练集包括了已知的抗生素, 72 00:03:49,928 --> 00:03:51,814 例如环丙沙星和青霉素, 73 00:03:51,814 --> 00:03:54,384 以及许多不是抗生素的药物。 74 00:03:55,063 --> 00:03:57,433 我们用这些数据来训练模型, 75 00:03:57,433 --> 00:04:01,447 让它学习与抗菌活性 有关的分子特征。 76 00:04:01,889 --> 00:04:05,311 然后我们把这个模型 应用到由数千个分子组成的 77 00:04:05,311 --> 00:04:07,269 药物再定位数据库上, 78 00:04:07,269 --> 00:04:09,610 并要求模型识别 79 00:04:09,610 --> 00:04:12,472 被预测具有抗菌性能 80 00:04:12,472 --> 00:04:15,114 但长得不像现有抗生素的分子。 81 00:04:16,458 --> 00:04:21,296 有趣的是,数据库里 只有一个分子符合这些条件, 82 00:04:21,296 --> 00:04:23,589 那个分子就是 Halocin。 83 00:04:24,517 --> 00:04:27,788 由于 Halocin 看起来 不像任何现有的抗生素, 84 00:04:27,788 --> 00:04:31,388 人类,包括抗生素专家, 85 00:04:31,388 --> 00:04:33,906 都不可能以这种方式 发现 Halocin 的。 86 00:04:34,516 --> 00:04:37,031 想象一下,我们能如何使用这项技术 87 00:04:37,031 --> 00:04:38,918 对抗 SARS-CoV-2。 88 00:04:39,854 --> 00:04:41,114 还不止这些。 89 00:04:41,218 --> 00:04:43,999 我们也在使用合成生物学的工具 90 00:04:43,999 --> 00:04:46,552 修补 DNA 和其他细胞成分, 91 00:04:46,552 --> 00:04:50,182 为人类服务,比如对抗 COVID-19。 92 00:04:50,566 --> 00:04:54,441 值得一提的是,我们正在努力开发 93 00:04:54,441 --> 00:04:57,995 可作为快速诊断测试的防护口罩。 94 00:04:58,215 --> 00:04:59,452 它的原理是什么? 95 00:04:59,570 --> 00:05:00,690 我们最近发现 96 00:05:00,690 --> 00:05:03,444 你可以从活细胞中 提取出细胞成分, 97 00:05:03,444 --> 00:05:08,117 然后把它连同 RNA 检测器 在试纸上进行冷冻干燥, 98 00:05:08,117 --> 00:05:13,350 从而制作出廉价的 埃博拉和寨卡病毒诊断测试工具。 99 00:05:13,414 --> 00:05:18,521 在通过添加患者的样本, 如血液或唾液进行重新溶解后, 100 00:05:18,521 --> 00:05:21,467 RNA 检测器就能被激活。 101 00:05:21,467 --> 00:05:24,954 事实证明,除了纸制品, 102 00:05:24,954 --> 00:05:27,696 这项技术还可以应用于 其他材料,包括布料。 103 00:05:28,730 --> 00:05:30,461 对于 COVID-19 疫情, 104 00:05:30,461 --> 00:05:34,697 我们正在设计 针对病毒的 RNA 检测器, 105 00:05:34,697 --> 00:05:38,127 然后把它们和所需的细胞成分一起 106 00:05:38,127 --> 00:05:40,747 在口罩的面料上进行冷冻干燥, 107 00:05:40,990 --> 00:05:42,887 简单的呼吸行为 108 00:05:43,131 --> 00:05:45,348 连同呼出的水蒸气, 109 00:05:45,348 --> 00:05:47,127 就可以激活测试。 110 00:05:47,945 --> 00:05:51,894 如果患者感染了 SARS-CoV-2, 111 00:05:51,894 --> 00:05:54,464 口罩就会产生荧光信号, 112 00:05:54,464 --> 00:05:58,025 可以通过简单廉价的 手持设备检测出来。 113 00:05:58,588 --> 00:06:02,937 一两个小时内,病人就能得到 114 00:06:02,937 --> 00:06:06,084 安全、准确、无接触的诊断。 115 00:06:06,764 --> 00:06:09,112 我们也在使用合成生物学 116 00:06:09,112 --> 00:06:12,194 设计 COVID-19 的备选疫苗。 117 00:06:13,135 --> 00:06:15,639 我们正在重新利用卡介苗, 118 00:06:15,639 --> 00:06:18,109 这种疫苗在近一个世纪前 就被用来预防结核病。 119 00:06:18,614 --> 00:06:20,245 这是一种减毒活疫苗, 120 00:06:20,245 --> 00:06:24,225 我们通过生物工程 让它表达 SARS-CoV-2 抗原, 121 00:06:24,225 --> 00:06:27,607 以此来触发免疫系统 122 00:06:27,607 --> 00:06:29,287 产生保护性抗体。 123 00:06:29,287 --> 00:06:31,901 重要的是,卡介苗可大规模生产, 124 00:06:31,901 --> 00:06:36,654 并且它的安全性在所有 有记录的疫苗中是最好的。 125 00:06:37,988 --> 00:06:43,042 借助合成生物学与人工智能的工具, 126 00:06:43,042 --> 00:06:46,505 我们可以打赢 和新型冠状病毒的战争。 127 00:06:46,914 --> 00:06:50,076 这项工作尚处于初期阶段, 但它的前景是真实的。 128 00:06:50,824 --> 00:06:54,172 在人类智慧与超级细菌基因的战斗中, 129 00:06:54,172 --> 00:06:57,491 科学和技术能给予我们重要的优势, 130 00:06:57,491 --> 00:06:59,189 帮助我们取得胜利。 131 00:06:59,851 --> 00:07:00,869 谢谢。