WEBVTT 00:00:00.917 --> 00:00:03.825 Ako zničíme nový koronavírus? 00:00:04.317 --> 00:00:06.948 Našimi najlepšími nástrojmi: 00:00:06.972 --> 00:00:09.011 vedou a technológiou. 00:00:09.594 --> 00:00:12.726 V mojom laboratóriu používame nástroje umelej inteligencie 00:00:12.750 --> 00:00:14.329 a syntetickej biológie, 00:00:14.353 --> 00:00:17.413 aby sme urýchlili boj proti tejto pandémii. 00:00:18.078 --> 00:00:19.941 Pôvodným cieľom nášho tímu 00:00:19.965 --> 00:00:22.818 bolo vyriešiť krízu rezistencie antibiotík. 00:00:22.842 --> 00:00:27.531 Náš projekt sa snaží využiť silu strojového učenia na to, 00:00:27.555 --> 00:00:29.425 aby sme doplnili náš arzenál antibiotík 00:00:29.425 --> 00:00:33.685 a zabránili post-antibiotickej dobe, ktorá by zničila celý svet. 00:00:33.685 --> 00:00:36.505 Podstatné však je, že rovnaká technológia sa môže použiť 00:00:36.529 --> 00:00:38.601 pri hľadaní antivirotík, 00:00:38.625 --> 00:00:41.563 ktoré by nám mohli pomôct v boji proti súčasnej pandémii. NOTE Paragraph 00:00:42.080 --> 00:00:46.592 Strojové učenie zásadne mení tradičný spôsob objavovania liekov. 00:00:47.434 --> 00:00:48.659 Týmto spôsobom, 00:00:48.683 --> 00:00:51.473 namiesto toho, aby sme krkolomne testovali efektivitu 00:00:51.473 --> 00:00:55.311 tisícky existujúcich molekúk v laboratóriu ručne, 00:00:55.856 --> 00:01:00.513 môžeme naučiť počítač preskúmať exponenciálne väčší priestor 00:01:00.537 --> 00:01:04.121 všetkých možných molekúl, ktoré by sme mohli syntetizovať. 00:01:04.145 --> 00:01:09.759 A preto namiesto toho, aby sme hľadali ihlu v kope sena, 00:01:09.783 --> 00:01:13.543 môžeme využiť obrovskú výpočtovú silu, 00:01:13.567 --> 00:01:17.482 a nájsť mnoho ihiel vo viacerých kopách naraz. NOTE Paragraph 00:01:18.423 --> 00:01:20.415 Máme za sebou prvé úspechy. 00:01:21.010 --> 00:01:26.475 Nedávno sme použili strojové učenie pri objave nových antibiotík, 00:01:26.499 --> 00:01:29.353 ktoré nám môžu pomôcť v boji proti bakteriálnym infekciám, 00:01:29.353 --> 00:01:32.694 ktoré sa môžu objaviť súčasne s infekciou SARS-CoV-2. 00:01:33.181 --> 00:01:37.350 Pred dvoma mesiacmi nám TED Audacious Project ponúkol prostriedky, 00:01:37.374 --> 00:01:39.562 aby sme mohli rozšíriť náš záber, 00:01:39.586 --> 00:01:44.214 a objavili sedem nových druhov antibiotík 00:01:44.238 --> 00:01:47.721 účinných proti siedmim najsmrteľnejším patogénom na svete 00:01:47.745 --> 00:01:49.800 v rozmedzí nasledujúcich siedmich rokov. 00:01:50.206 --> 00:01:51.939 Aby som to uviedol do súvislostí: 00:01:51.963 --> 00:01:54.245 Za posledných tridsať rokov nedošlo k objavu 00:01:54.245 --> 00:01:57.150 ani jedného antibiotika novej triedy. NOTE Paragraph 00:01:57.890 --> 00:02:01.601 Zatiaľčo sa pri nových antibiotikách orientujeme na blízku budúcnosť, 00:02:01.625 --> 00:02:06.277 nový koronavírus predstavuje smrteľnú hrozbu práve teraz. 00:02:06.301 --> 00:02:10.094 A som rád, že vám môžem povedať, že rovnakú technológiu môžeme použiť 00:02:10.118 --> 00:02:12.927 pri tvorbe lieku proti tomuto vírusu. 00:02:13.486 --> 00:02:15.205 Ale ako to dosiahneme? 00:02:15.229 --> 00:02:18.177 Vytvárame databázu skúšobných antivirotík 00:02:18.201 --> 00:02:23.743 a s kolegami vkladáme tieto molekuly do buniek infikovaných SARS-CoV-2, 00:02:23.767 --> 00:02:27.661 aby sme videli, ktoré z nich sú v boji efektívne. 00:02:28.175 --> 00:02:31.367 Dáta potom použijeme na natrénovanie modelu strojového učenia, 00:02:31.391 --> 00:02:35.461 ktorý nasadíme do databázy viac ako miliardy molekúl vytvorených in silico, 00:02:35.485 --> 00:02:39.689 aby sme našli možné nové antivirotiká. 00:02:40.324 --> 00:02:42.982 Budeme syntetizovať a testovať najlepšie výsledky 00:02:43.006 --> 00:02:45.895 a posunieme ich na klinické testy. NOTE Paragraph 00:02:46.036 --> 00:02:48.813 Znie to neuveriteľne? Nemalo by. 00:02:49.304 --> 00:02:52.083 Projekt tvorby antibiotík umelou inteligenciou je založený 00:02:52.083 --> 00:02:54.243 na výsledkoch nášho konceptuálneho výskumu, 00:02:54.243 --> 00:02:57.600 ktorý viedol k objavu nového širokospektrálneho antibiotika - halicin. 00:02:58.443 --> 00:03:01.256 Halicin je veľmi účinný v boji 00:03:01.256 --> 00:03:05.167 proti takmer všetkým rezistentným bakteriálnym patogénom, 00:03:05.167 --> 00:03:08.772 vrátane nevyliečiteľných infekcií odolným voči všetkým antibiotikám. 00:03:09.502 --> 00:03:12.132 Čo je podstatné, v porovnaní so súčasnými antibiotikami 00:03:12.156 --> 00:03:15.850 je frekvencia, s akou si baktérie budujú rezistenciu voči halicinu, 00:03:15.874 --> 00:03:18.008 pozoruhodne malá. 00:03:18.303 --> 00:03:21.783 Laboratórne sme testovali schopnosť baktérie vybudovať si 00:03:21.783 --> 00:03:24.825 rezistenciu voči halicinu a ciprofloxacínu. 00:03:25.299 --> 00:03:26.841 V prípade ciprofloxacínu 00:03:26.865 --> 00:03:29.690 sme spozorovali rezistenciu už po jednom dni. 00:03:30.213 --> 00:03:31.691 V prípade halicinu 00:03:31.715 --> 00:03:34.130 sme nespozorovali rezistenciu po jednom dni. 00:03:34.479 --> 00:03:37.781 Úžasné je, že ani po 30 dňoch 00:03:37.805 --> 00:03:40.406 sa rezistencia voči halicinu nepotvrdila. NOTE Paragraph 00:03:41.098 --> 00:03:46.694 V tomto pilotnom projekte sme otestovali okolo 2 500 antivirotík proti E.coli. 00:03:47.259 --> 00:03:50.039 Testovaná vzorka obsahovala známe antibiotiká 00:03:50.063 --> 00:03:51.809 ako ciprofloxacín a penicilín, 00:03:51.833 --> 00:03:54.455 ako aj mnoho iných liekov, ktoré nie sú antibiotiká. 00:03:54.984 --> 00:03:57.571 Tieto dáta sme použili na trénovanie modelu, 00:03:57.595 --> 00:04:01.573 aby si osvojil molekulárne vlastnosti potrebné na boj proti baktériám. 00:04:02.269 --> 00:04:04.970 Potom sme ho použili v databáze nových účinkov liekov, 00:04:04.994 --> 00:04:07.052 ktorá obsahuje niekoľko tisíc molekúl, 00:04:07.052 --> 00:04:10.138 a zadali sme mu úlohu, aby identifikoval molekuly 00:04:10.138 --> 00:04:12.922 s možnými antibakteriálnymi účinkami, 00:04:12.946 --> 00:04:15.419 ktoré však nevyzerajú ako existujúce antibiotiká. 00:04:16.427 --> 00:04:21.224 Prekvapujúco, len jedna molekula v databáze splnila tieto podmienky, 00:04:21.248 --> 00:04:23.584 a tou molekulou bol halicin. 00:04:24.214 --> 00:04:27.532 Keďže halicin nevyzerá ako žiadne doposiaľ existujúce antibiotikum, 00:04:27.556 --> 00:04:31.330 bolo by pre človeka, dokonca aj pre odborníka v tejto oblasti, 00:04:31.734 --> 00:04:34.027 nemožné identifikovať halicin týmto spôsobom. 00:04:34.304 --> 00:04:39.128 Predstavte si, ako by sme túto technológiu mohli použiť na boj proti SARS-CoV-2. NOTE Paragraph 00:04:39.783 --> 00:04:41.148 A to nie je všetko. 00:04:41.172 --> 00:04:43.992 Používame nástroje syntetickej biológie, 00:04:44.016 --> 00:04:46.627 zasahujeme do DNA a iných bunkových mechanizmov, 00:04:46.651 --> 00:04:50.561 aby sme tak mohli pomôcť v boji (aj) proti COVID-19. 00:04:50.585 --> 00:04:54.232 A za zmienku stojí, že pracujeme na vývoji rúška, 00:04:54.256 --> 00:04:57.688 ktorý by mohol slúžiť ako rýchly diagnostický test. 00:04:58.192 --> 00:04:59.664 Ako to funguje? 00:04:59.688 --> 00:05:00.893 Dokázali sme, 00:05:00.917 --> 00:05:03.860 že môžeme vybrať bunkový mechanizmus zo živej bunky, 00:05:03.884 --> 00:05:07.976 sublimačne ho vysušiť na kúsku papiera spolu s RNA senzormi, 00:05:08.000 --> 00:05:12.916 a vytvoriť tak lacný diagnostický test na ebolu a ziku. 00:05:13.503 --> 00:05:18.020 Senzori sa aktivujú rehydratáciou 00:05:18.020 --> 00:05:21.576 prostredníctvom napríklad ľudskej krvi alebo slín. 00:05:21.600 --> 00:05:24.861 Zistili sme, že táto technológia nie je obmedzená len na papier, 00:05:24.885 --> 00:05:27.771 ale môže byť použitá na iných materiáloch, vrátane látok. 00:05:28.671 --> 00:05:30.613 V prípade pandémie COVID-19 00:05:30.637 --> 00:05:34.983 vyberáme RNA senzory na identifikáciu vírusu, 00:05:35.007 --> 00:05:38.217 tie spolu s potrebným bunkovým mechanizmom sublimačne vysušíme 00:05:38.241 --> 00:05:40.382 a aplikujeme do látky určenej na rúška. 00:05:40.972 --> 00:05:43.201 Už len samotné dýchanie 00:05:43.225 --> 00:05:45.502 a vodná para, ktorá pritom vzniká, 00:05:45.526 --> 00:05:47.286 dokáže test aktivovať. 00:05:47.804 --> 00:05:52.064 Ak je pacient infikovaný SARS-CoV-2, 00:05:52.088 --> 00:05:54.161 rúško vyšle fluorescenčný signál, 00:05:54.185 --> 00:05:58.015 ktorý môže detekovať aj jednoduché a lacné ručné zariadenie. 00:05:58.534 --> 00:06:03.018 Za hodinu či dve môžeme pacienta diagnostikovať 00:06:03.042 --> 00:06:06.014 bezpečne, presne a na diaľku. NOTE Paragraph 00:06:06.735 --> 00:06:09.255 Syntentickú biológiu používame 00:06:09.279 --> 00:06:11.999 aj na vytvorenie možnej vakcíny na COVID-19. 00:06:13.014 --> 00:06:15.667 Hľadáme nové liečebné účely BCK vakcíny, 00:06:15.691 --> 00:06:18.561 ktorá sa takmer sto rokov používa proti tuberkulóze. 00:06:18.585 --> 00:06:20.126 Je to živá oslabená vakcína, 00:06:20.150 --> 00:06:24.807 ktorú transformujeme tak, aby vytvorila antigény SARS-CoV-2, 00:06:24.831 --> 00:06:27.645 ktoré by mali spustiť produkciu ochranných protilátok 00:06:27.669 --> 00:06:29.304 imunitným systémom. 00:06:29.328 --> 00:06:32.206 Dôležitý je fakt, že BCG vakcína je veľmi dobre škálovateľná 00:06:32.206 --> 00:06:36.659 a je jednou z najbezpečnejších zo všetkých známych vakcín. NOTE Paragraph 00:06:37.881 --> 00:06:42.986 S pomocou syntentickej biológie a umelej inteligencie 00:06:43.010 --> 00:06:46.358 môžeme boj s novým koronavírusom vyhrať. 00:06:46.844 --> 00:06:50.163 Sme vo veľmi počiatočnom štádiu, ale výsledky sú sľubné. 00:06:50.798 --> 00:06:54.243 Veda a technológia nám dávajú veľkú výhodu 00:06:54.267 --> 00:06:57.428 pri boji ľudského rozumu s génmi rezistentných baktérií. 00:06:57.452 --> 00:07:00.260 A tento boj môžeme vyhrať. NOTE Paragraph 00:07:00.260 --> 00:07:01.943 Ďakujem.