この新型コロナウイルスに どうやって打ち勝てるのでしょう？
私たちの持つ最良の道具
科学とテクノロジーを使います
私の研究室では人工知能（AI）と
合成生物学を使って
今回のパンデミックと戦う スピードを上げています
この技術の本来の用途は
抗生物質への耐性という 危機的状況への対策でした
このプロジェクトで探っているのは 機械学習の力を使って
抗生物質という武器を補強し
世界にとって壊滅的な 抗生物質時代後の世界を回避することです
ここで重要なのは 同じテクノロジーを使って
抗ウイルス化合物を探し
今のパンデミックとの戦いに 役立てられることです
機械学習により
従来の治療薬発見モデルが 完全な様変わりを遂げようとしています
このアプローチでは
苦労して何千もの既存の分子について
一つひとつ 研究室で
その効用を検査せずに
コンピューターに学習させることで はるかに大きな規模での探索をして
合成可能なすべての分子を あたることができます
したがって 干し草の山の中にある １本の針を探すのではなく
計算能力という巨大な磁石を使って
複数の干し草の山で 同時に たくさんの針を見つけられるのです
すでに初期的な成功がいくつか出ています
最近 機械学習を使ってコロナ感染と 同時に発生する可能性がある
細菌感染症に効果が期待される
新しい抗生物質を発見しました
２か月前に TEDの 「Audacious Project」の助成で
私たちの研究を大幅に スケー ルアップでき
７つの新しいクラスの 抗生物質の発見を目的として
世界中の７つの致死率の高い 細菌病原体との戦いを
今後７年かけて行うことになりました
この背景として
新しいクラスの抗生物質が
過去30年以上の間に １つも発見されていません
新しい抗生物質を探す旅は 中期的な未来のためのものですが
新型コロナウイルスは 差し迫った 死の脅威をもたらします
喜ばしいことに 同じテクノロジーを使って
このウイルスと闘う治療薬を 探せそうなのです
どのようにするのでしょうか？
まず 化合物トレーニング ライブラリを作って
共同研究者とともに これらの分子を コロナに感染した細胞の培養に加えて
どれが効果的に働くかを 確認します
これらのデータは機械学習モデルの 精度を向上するのに用いられ
10億を超える分子からなる コンピュータライブラリに適用され
可能性のある 新しい 抗ウイルス化合物を探し出します
上位の予測を統合して検証し
最も有望な候補に臨床試験を行います
話がうますぎますか？
いや そんなことはありません
抗生物質AIプロジェクトは 概念実証研究に基づいており
新しい広域抗生物質の 発見につながりました
ハロシンと呼ばれるものです
ハロシンは強力な 抗菌活性を持っていて
ほとんどすべての抗生物質耐性のある 細菌性病原体に対抗できます
治療不可能な汎耐性感染症も 含めてです
重要なのは 現在の抗生物質とは対照的に
細菌がハロシンに対して 耐性を生じる頻度は
顕著に低いのです
細菌が耐性をつくる能力が あるかどうかを ハロシンと
シプロに対して 研究室で検証しました
シプロの場合は
たった一日で 耐性が見られました
ハロシンの場合は
一日たった後では 耐性は全く見られませんでした
驚くべきことに 30日後でも
ハロシンに対する耐性は 全く見られなかったのです
予備プロジェクトでは まずO-157に 対する約2,500の化合物を検証しました
このトレーニングセットには 良く知られた抗生物質
つまりシプロやペニシリン
さらに抗生物質以外の 多くの薬物が含まれていました
これらのデータで モデルをトレーニングし
抗菌作用に関連する 分子の特徴を学ばせました
そして このモデルを 数千の分子から構成された
薬物再利用ライブラリに適用し
抗菌作用をもつと予測されるが
既存の抗生物質とは似ていない分子を
見つけるよう そのモデルに指示しました
面白いのは そのライブラリの中で この基準に当てはまった唯一の
分子がハロシンだったのです
ハロシンは既存の抗生物質とは 全く似ていないため
抗生物質の専門家であっても 人間には この方法でハロシンを
見つけるのは不可能だったでしょう
この技術によって コロナウイルスに対して 何ができるか想像してください
それだけではありません
合成生物学の手法を使って
DNAや細胞内分子を模倣して いろいろな分子を合成し
コロナウイルスとの戦いのような 人類の目的に貢献します
さらに注目すべきは 迅速な診断検査にも役立てられる
保護マスクを開発していることです
どのように機能するのでしょう？
最近 私たちは
生きている細胞から 細胞内容物を取り出し
紙の上にRNAのセンサーと ともに凍結乾燥し
低コストでエボラやジカの 診断キットを作れることを証明しました
センサーが 患者のサンプル 例えば 血液や唾液などで
湿潤されると活性化されます
実は このテクノロジーは 紙に限らず
布を含む別の素材にも 応用可能なのです
コロナウイルス・パンデミックに対しては
ウイルス検出を目的として RNAセンサーをデザインし
必要な細胞内容物とともに 凍結乾燥して
マスクの布地に組み込みます
そうすると呼吸するだけで
呼吸に伴って生じる水分で
RNAセンサーを活性化できます
したがって 患者が コロナウイルスに感染していると
マスクが蛍光シグナルを生成し
単純で安価な手持ち機器で 検出できるようになります
このようにして １～２時間のうちに患者は
安全に 離れた場所で そして正確に診断されます
また 私たちは合成生物学を使って
コロナウイルスのワクチン候補の デザインもしています
私たちは結核の予防に 百年近く使われていた
BCGワクチンを再利用しています
これは弱毒生ワクチンで
コロナウイルス抗原を 発現するようにデザインし
免疫機能による防御抗体の生産を
誘発します
重要なのは BCGが非常に大量生産しやすく
報告されているワクチンの中で 最良の安全性を持つことです
合成生物学とAIという手法を用いて
新型コロナウイルスとの戦いに 勝つことができるのです
この研究はごく初期の段階ですが 実に将来性があります
科学技術は我々に 重要なアドバンテージを与え
人知と超耐性菌の遺伝子との 戦いにおいて
勝利をもたらしてくれます
ありがとうございました