WEBVTT 00:00:00.917 --> 00:00:03.825 Alors, comment allons-nous battre ce nouveau coronavirus ? 00:00:04.317 --> 00:00:06.948 En utilisant nos meilleurs outils : 00:00:06.972 --> 00:00:09.011 notre science et notre technologie. 00:00:09.644 --> 00:00:12.640 Dans mon laboratoire, nous utilisons les outils de l'IA 00:00:12.750 --> 00:00:14.329 et de la biologie synthétique 00:00:14.353 --> 00:00:17.413 pour accélérer la lutte contre cette pandémie. 00:00:18.078 --> 00:00:19.941 Notre travail a été initialement conçu 00:00:19.941 --> 00:00:22.902 pour s'attaquer au problème de la résistance aux antibiotiques. 00:00:22.902 --> 00:00:27.021 Notre projet vise à exploiter le pouvoir de l'apprentissage automatique 00:00:27.021 --> 00:00:29.401 pour réapprovisionner notre arsenal d'antibiotiques 00:00:29.425 --> 00:00:33.263 et éviter la catastrophe planétaire d'une ère post-antibiotique. 00:00:33.415 --> 00:00:36.529 Ce qui est intéressant est qu'on peut utiliser la même technologie 00:00:36.529 --> 00:00:38.601 pour rechercher des composés antiviraux 00:00:38.625 --> 00:00:41.403 qui pourraient nous aider à combattre la pandémie actuelle. NOTE Paragraph 00:00:42.080 --> 00:00:45.432 L'apprentissage automatique va révolutionner le modèle traditionnel 00:00:45.432 --> 00:00:47.410 de découverte de médicaments. 00:00:47.434 --> 00:00:48.659 Avec cette approche, 00:00:48.683 --> 00:00:52.761 au lieu de tester péniblement des milliers de molécules existantes, 00:00:52.785 --> 00:00:54.221 une par une en laboratoire, 00:00:54.245 --> 00:00:55.832 pour vérifier leur efficacité, 00:00:55.856 --> 00:01:00.513 on peut entraîner un ordinateur à explorer l'espace exponentiellement plus large 00:01:00.537 --> 00:01:04.121 de presque toutes les molécules possibles qui pourraient être synthétisées, 00:01:04.145 --> 00:01:09.759 et donc, au lieu de chercher une aiguille dans une botte de foin, 00:01:09.783 --> 00:01:13.543 nous pouvons utiliser l'aimant géant de la puissance de calcul 00:01:13.567 --> 00:01:17.672 pour trouver beaucoup d'aiguilles dans une multitude de bottes de foin simultanément. NOTE Paragraph 00:01:18.423 --> 00:01:20.575 Nous avons déjà eu quelques premiers succès. 00:01:21.010 --> 00:01:26.055 On a utilisé l'apprentissage automatique pour découvrir de nouveaux antibiotiques 00:01:26.055 --> 00:01:29.059 pour nous aider à combattre les infections bactériennes 00:01:29.083 --> 00:01:32.694 qui peuvent surgir suite aux infections du SARS-CoV-2. 00:01:33.181 --> 00:01:37.350 Il y a deux mois, l'Audacious Projet de TED nous a octroyé un financement 00:01:37.374 --> 00:01:39.562 pour intensifier massivement notre travail 00:01:39.586 --> 00:01:44.214 afin de découvrir sept nouvelles classes d'antibiotiques 00:01:44.238 --> 00:01:47.721 contre sept des bactéries les plus mortelles au monde 00:01:47.745 --> 00:01:49.800 au cours des sept prochaines années. 00:01:50.206 --> 00:01:51.839 Pour vous donner une idée : 00:01:51.839 --> 00:01:54.035 le nombre de nouvelles classes d'antibiotiques 00:01:54.035 --> 00:01:57.150 découvertes au cours des 30 dernières années est zéro. NOTE Paragraph 00:01:58.030 --> 00:02:01.601 La rechercher de nouveaux antibiotiques est notre objectif à moyen terme, 00:02:01.625 --> 00:02:06.277 mais le nouveau coronavirus pose une menace mortelle immédiate. 00:02:06.301 --> 00:02:10.094 Je suis fier d'annoncer que nous pensons pouvoir utiliser la même technologie 00:02:10.118 --> 00:02:12.927 pour rechercher des thérapies pour combattre ce virus. 00:02:13.446 --> 00:02:15.109 Comment allons-nous faire ? 00:02:15.109 --> 00:02:18.391 On est en train de créer une librairie d'entrainement sur les composés 00:02:18.391 --> 00:02:21.557 et, avec des collaborateurs qui appliquent ces molécules 00:02:21.557 --> 00:02:23.767 aux cellules infectées par le SARS-CoV-2, 00:02:23.767 --> 00:02:27.661 nous allons voir lesquelles d'entre elles présentent une activité efficace. 00:02:28.065 --> 00:02:31.561 Ces données serviront pour entraîner un modèle d'apprentissage automatique 00:02:31.561 --> 00:02:35.845 à appliquer à une bibliothèque in silico de plus d'un milliard de molécules 00:02:35.845 --> 00:02:39.689 pour rechercher de potentiels nouveaux composés antiviraux. 00:02:39.964 --> 00:02:43.206 Nous synthétiserons et testerons ceux avec les meilleures prédictions 00:02:43.206 --> 00:02:46.446 pour passer aux études cliniques avec les plus prometteurs. NOTE Paragraph 00:02:46.446 --> 00:02:48.134 Trop beau pour être vrai ? 00:02:48.158 --> 00:02:49.590 Eh bien, ça ne devrait pas. 00:02:49.614 --> 00:02:53.153 Le projet Antibiotics AI est basé sur notre recherche « preuve de concept » 00:02:53.153 --> 00:02:56.513 qui a conduit à la découverte d'un nouvel antibiotique à large spectre, 00:02:56.513 --> 00:02:58.443 appelé halicine. 00:02:58.443 --> 00:03:01.256 L'halicine exerce une puissante activité antibactérienne 00:03:01.280 --> 00:03:05.382 contre presque tous les pathogènes bactériens résistant aux antibiotiques, 00:03:05.406 --> 00:03:09.047 y compris les infections pan-résistantes non traitables. 00:03:09.722 --> 00:03:12.156 Et surtout, contrairement aux antibiotiques actuels, 00:03:12.156 --> 00:03:15.850 la fréquence à laquelle les bactéries développent une résistance à l'halicine 00:03:15.874 --> 00:03:17.358 est particulièrement réduite. 00:03:18.303 --> 00:03:23.013 Nous avons testé la capacité des bactéries à développer une résistance à l'halicine 00:03:23.037 --> 00:03:25.045 aussi bien qu'à la cipro en laboratoire. 00:03:25.299 --> 00:03:26.841 Dans le cas de la cipro, 00:03:26.865 --> 00:03:29.690 après juste un jour, nous avons remarqué une résistance. 00:03:30.213 --> 00:03:31.691 Dans le cas de l'halicine, 00:03:31.715 --> 00:03:34.040 après un jour, nous n'avons vu aucune résistance. 00:03:34.479 --> 00:03:37.781 Mais ce qui est étonnant, c'est que même après 30 jours, 00:03:37.805 --> 00:03:40.406 nous n'avons vu aucune résistance à l'halicine. NOTE Paragraph 00:03:41.098 --> 00:03:43.809 Pour ce projet pilote, nous avons d'abord testé 00:03:43.809 --> 00:03:47.259 environ 2 500 composés contre l'E. coli. 00:03:47.259 --> 00:03:50.039 Ce lot d'apprentissage incluait les antibiotiques connus, 00:03:50.063 --> 00:03:51.809 comme la cipro et la pénicilline, 00:03:51.833 --> 00:03:54.315 ainsi que de nombreux médicaments non antibiotiques. 00:03:54.984 --> 00:03:57.571 Nous avons utilisé ces données pour entraîner un modèle 00:03:57.571 --> 00:04:01.269 sur les caractéristiques moléculaires liées à l'activité antibactérienne. 00:04:01.999 --> 00:04:03.384 Nous l'avons ensuite appliqué 00:04:03.384 --> 00:04:05.704 à une bibliothèque de réemploi des médicaments 00:04:05.704 --> 00:04:07.472 comprenant des milliers de molécules 00:04:07.496 --> 00:04:10.114 et demandé au modèle d'identifier celles 00:04:10.138 --> 00:04:12.922 qui étaient présumées avoir des propriétés antibactériennes 00:04:12.946 --> 00:04:15.769 mais qui ne ressemblaient pas aux antibiotiques existants. 00:04:16.427 --> 00:04:21.224 Or, une seule molécule de cette librairie respectait ces critères, 00:04:21.248 --> 00:04:23.584 et cette molécule était l'halicine. 00:04:24.444 --> 00:04:27.866 Étant donné que l'halicine ne ressemblait à aucun antibiotique existant, 00:04:27.866 --> 00:04:31.710 il aurait été impossible pour un humain, même un expert en antibiotiques, 00:04:31.734 --> 00:04:33.918 d'identifier l'halicine de cette manière. 00:04:34.534 --> 00:04:37.318 Imaginez donc ce qu'on peut réaliser avec cette technologie 00:04:37.318 --> 00:04:38.969 contre le SARS-CoV-2. NOTE Paragraph 00:04:39.783 --> 00:04:41.148 Et ce n'est pas tout. 00:04:41.172 --> 00:04:43.992 Nous utilisons aussi les outils de la biologie synthétique, 00:04:44.016 --> 00:04:46.627 bricolant l'ADN et d'autres mécanismes cellulaires, 00:04:46.651 --> 00:04:50.561 pour poursuivre nos objectifs humains, comme la lutte contre le COVID-19. 00:04:50.585 --> 00:04:54.232 Par exemple, nous travaillons pour développer un masque de protection 00:04:54.256 --> 00:04:57.688 qui puisse aussi servir d'outil de diagnostic rapide. 00:04:58.192 --> 00:04:59.614 Comment ça marche ? 00:04:59.614 --> 00:05:00.917 Nous avons récemment montré 00:05:00.917 --> 00:05:03.924 qu'on peut prendre le mécanisme cellulaire d'une cellule vivante 00:05:03.924 --> 00:05:07.976 et le lyophiliser avec des capteurs d'ARN sur du papier 00:05:08.000 --> 00:05:12.916 afin de créer des outils de diagnostic à faible coût pour l'Ebola et le Zika. 00:05:13.503 --> 00:05:18.730 Les capteurs sont activés quand ils sont réhydratés par un échantillon du patient 00:05:18.754 --> 00:05:21.576 comme par exemple du sang ou de la salive. 00:05:21.600 --> 00:05:24.861 Il s'avère que cette technologie n'est pas limitée au papier 00:05:24.885 --> 00:05:27.881 et peut être appliquée à d'autres matériaux, y compris le tissu. 00:05:28.671 --> 00:05:30.613 Pour la pandémie de COVID-19, 00:05:30.637 --> 00:05:34.983 nous travaillons pour réaliser de capteurs ARN pour détecter le virus 00:05:35.007 --> 00:05:38.217 et les lyophiliser avec le mécanisme cellulaire nécessaire 00:05:38.241 --> 00:05:40.948 dans le tissu d'un masque, 00:05:40.972 --> 00:05:43.201 où le simple fait de respirer, 00:05:43.225 --> 00:05:45.502 grâce à la vapeur d'eau, 00:05:45.526 --> 00:05:47.286 peut activer le test. 00:05:47.804 --> 00:05:52.064 Ainsi, si un patient est infecté par le SARS-CoV-2, 00:05:52.088 --> 00:05:54.161 le masque produira un signal fluorescent 00:05:54.185 --> 00:05:58.015 qui pourrait être détecté par un simple appareil portable et pas cher. 00:05:58.534 --> 00:06:03.018 En une ou deux heures, on pourrait ainsi diagnostiquer un patient, 00:06:03.042 --> 00:06:06.014 sûrement, à distance et avec précision. NOTE Paragraph 00:06:06.735 --> 00:06:09.155 Nous utilisons aussi la biologique synthétique 00:06:09.155 --> 00:06:11.999 pour développer un possible vaccin contre le COVID-19. 00:06:13.014 --> 00:06:15.587 Nous retravaillons le vaccin BCG, 00:06:15.587 --> 00:06:18.585 qui a été utilisé pendant presque 100 ans contre la tuberculose. 00:06:18.585 --> 00:06:20.126 C'est un vaccin vivant atténué, 00:06:20.150 --> 00:06:24.727 et nous le retravaillons pour lui faire exprimer les antigènes du SARS-CoV-2, 00:06:24.727 --> 00:06:27.739 ce qui devrait déclencher la production d'anticorps protecteurs 00:06:27.739 --> 00:06:29.304 par le système immunitaire. NOTE Paragraph 00:06:29.304 --> 00:06:32.146 En plus, le BCG peut être produit en énormes quantités 00:06:32.146 --> 00:06:36.659 et son profil de sécurité est l'un des meilleurs de tous les vaccins connus. NOTE Paragraph 00:06:37.881 --> 00:06:42.986 Avec les outils de la biologie synthétique et de l'intelligence artificielle, 00:06:43.010 --> 00:06:46.358 nous pouvons gagner la lutte contre le nouveau coronavirus. 00:06:46.844 --> 00:06:50.163 Ce travail en est à ses débuts, mais la promesse est réelle. 00:06:50.798 --> 00:06:54.243 Science et technologie peuvent nous donner un important avantage 00:06:54.267 --> 00:06:57.802 dans la bataille des cerveaux humains contre les gènes des super-bactéries, 00:06:57.802 --> 00:06:59.703 une bataille que nous pouvons remporter. NOTE Paragraph 00:06:59.990 --> 00:07:01.223 Merci.