0:00:00.917,0:00:03.825 Alors, comment allons-nous battre [br]ce nouveau coronavirus ? 0:00:04.317,0:00:06.948 En utilisant nos meilleurs outils : 0:00:06.972,0:00:09.011 notre science et notre technologie. 0:00:09.644,0:00:12.640 Dans mon laboratoire,[br]nous utilisons les outils de l'IA 0:00:12.750,0:00:14.329 et de la biologie synthétique 0:00:14.353,0:00:17.413 pour accélérer la lutte [br]contre cette pandémie. 0:00:18.078,0:00:19.941 Notre travail a été initialement conçu 0:00:19.941,0:00:22.902 pour s'attaquer au problème[br]de la résistance aux antibiotiques. 0:00:22.902,0:00:27.021 Notre projet vise à exploiter le pouvoir[br]de l'apprentissage automatique 0:00:27.021,0:00:29.401 pour réapprovisionner[br]notre arsenal d'antibiotiques 0:00:29.425,0:00:33.263 et éviter la catastrophe planétaire[br]d'une ère post-antibiotique. 0:00:33.415,0:00:36.529 Ce qui est intéressant est[br]qu'on peut utiliser la même technologie 0:00:36.529,0:00:38.601 pour rechercher des composés antiviraux 0:00:38.625,0:00:41.403 qui pourraient nous aider[br]à combattre la pandémie actuelle. 0:00:42.080,0:00:45.432 L'apprentissage automatique[br]va révolutionner le modèle traditionnel 0:00:45.432,0:00:47.410 de découverte de médicaments. 0:00:47.434,0:00:48.659 Avec cette approche, 0:00:48.683,0:00:52.761 au lieu de tester péniblement[br]des milliers de molécules existantes, 0:00:52.785,0:00:54.221 une par une en laboratoire, 0:00:54.245,0:00:55.832 pour vérifier leur efficacité, 0:00:55.856,0:01:00.513 on peut entraîner un ordinateur à explorer[br]l'espace exponentiellement plus large 0:01:00.537,0:01:04.121 de presque toutes les molécules possibles[br]qui pourraient être synthétisées, 0:01:04.145,0:01:09.759 et donc, au lieu de chercher une[br]aiguille dans une botte de foin, 0:01:09.783,0:01:13.543 nous pouvons utiliser l'aimant géant[br]de la puissance de calcul 0:01:13.567,0:01:17.672 pour trouver beaucoup d'aiguilles dans une[br]multitude de bottes de foin simultanément. 0:01:18.423,0:01:20.575 Nous avons déjà eu[br]quelques premiers succès. 0:01:21.010,0:01:26.055 On a utilisé l'apprentissage automatique[br]pour découvrir de nouveaux antibiotiques 0:01:26.055,0:01:29.059 pour nous aider à combattre[br]les infections bactériennes 0:01:29.083,0:01:32.694 qui peuvent surgir suite[br]aux infections du SARS-CoV-2. 0:01:33.181,0:01:37.350 Il y a deux mois, l'Audacious Projet[br]de TED nous a octroyé un financement 0:01:37.374,0:01:39.562 pour intensifier massivement notre travail 0:01:39.586,0:01:44.214 afin de découvrir[br]sept nouvelles classes d'antibiotiques 0:01:44.238,0:01:47.721 contre sept des bactéries[br]les plus mortelles au monde 0:01:47.745,0:01:49.800 au cours des sept prochaines années. 0:01:50.206,0:01:51.839 Pour vous donner une idée : 0:01:51.839,0:01:54.035 le nombre de nouvelles [br]classes d'antibiotiques 0:01:54.035,0:01:57.150 découvertes au cours[br]des 30 dernières années est zéro. 0:01:58.030,0:02:01.601 La rechercher de nouveaux antibiotiques[br]est notre objectif à moyen terme, 0:02:01.625,0:02:06.277 mais le nouveau coronavirus pose[br]une menace mortelle immédiate. 0:02:06.301,0:02:10.094 Je suis fier d'annoncer que nous pensons [br]pouvoir utiliser la même technologie 0:02:10.118,0:02:12.927 pour rechercher des thérapies[br]pour combattre ce virus. 0:02:13.446,0:02:15.109 Comment allons-nous faire ? 0:02:15.109,0:02:18.391 On est en train de créer une librairie[br]d'entrainement sur les composés 0:02:18.391,0:02:21.557 et, avec des collaborateurs[br]qui appliquent ces molécules 0:02:21.557,0:02:23.767 aux cellules infectées par le SARS-CoV-2, 0:02:23.767,0:02:27.661 nous allons voir lesquelles d'entre elles[br]présentent une activité efficace. 0:02:28.065,0:02:31.561 Ces données serviront pour entraîner[br]un modèle d'apprentissage automatique 0:02:31.561,0:02:35.845 à appliquer à une bibliothèque in silico[br]de plus d'un milliard de molécules 0:02:35.845,0:02:39.689 pour rechercher de potentiels[br]nouveaux composés antiviraux. 0:02:39.964,0:02:43.206 Nous synthétiserons et testerons[br]ceux avec les meilleures prédictions 0:02:43.206,0:02:46.446 pour passer aux études cliniques[br]avec les plus prometteurs. 0:02:46.446,0:02:48.134 Trop beau pour être vrai ? 0:02:48.158,0:02:49.590 Eh bien, ça ne devrait pas. 0:02:49.614,0:02:53.153 Le projet Antibiotics AI est basé[br]sur notre recherche « preuve de concept » 0:02:53.153,0:02:56.513 qui a conduit à la découverte d'un nouvel[br]antibiotique à large spectre, 0:02:56.513,0:02:58.443 appelé halicine. 0:02:58.443,0:03:01.256 L'halicine exerce[br]une puissante activité antibactérienne 0:03:01.280,0:03:05.382 contre presque tous les pathogènes[br]bactériens résistant aux antibiotiques, 0:03:05.406,0:03:09.047 y compris les infections pan-résistantes[br]non traitables. 0:03:09.722,0:03:12.156 Et surtout, contrairement[br]aux antibiotiques actuels, 0:03:12.156,0:03:15.850 la fréquence à laquelle les bactéries [br]développent une résistance à l'halicine 0:03:15.874,0:03:17.358 est particulièrement réduite. 0:03:18.303,0:03:23.013 Nous avons testé la capacité des bactéries[br]à développer une résistance à l'halicine 0:03:23.037,0:03:25.045 aussi bien qu'à la cipro en laboratoire. 0:03:25.299,0:03:26.841 Dans le cas de la cipro, 0:03:26.865,0:03:29.690 après juste un jour, nous avons[br]remarqué une résistance. 0:03:30.213,0:03:31.691 Dans le cas de l'halicine, 0:03:31.715,0:03:34.040 après un jour, nous n'avons vu[br]aucune résistance. 0:03:34.479,0:03:37.781 Mais ce qui est étonnant,[br]c'est que même après 30 jours, 0:03:37.805,0:03:40.406 nous n'avons vu aucune résistance[br]à l'halicine. 0:03:41.098,0:03:43.809 Pour ce projet pilote,[br]nous avons d'abord testé 0:03:43.809,0:03:47.259 environ 2 500 composés contre l'E. coli. 0:03:47.259,0:03:50.039 Ce lot d'apprentissage incluait[br]les antibiotiques connus, 0:03:50.063,0:03:51.809 comme la cipro et la pénicilline, 0:03:51.833,0:03:54.315 ainsi que de nombreux médicaments[br]non antibiotiques. 0:03:54.984,0:03:57.571 Nous avons utilisé ces données[br]pour entraîner un modèle 0:03:57.571,0:04:01.269 sur les caractéristiques moléculaires[br]liées à l'activité antibactérienne. 0:04:01.999,0:04:03.384 Nous l'avons ensuite appliqué 0:04:03.384,0:04:05.704 à une bibliothèque[br]de réemploi des médicaments 0:04:05.704,0:04:07.472 comprenant des milliers de molécules 0:04:07.496,0:04:10.114 et demandé au modèle d'identifier celles 0:04:10.138,0:04:12.922 qui étaient présumées avoir[br]des propriétés antibactériennes 0:04:12.946,0:04:15.769 mais qui ne ressemblaient pas[br]aux antibiotiques existants. 0:04:16.427,0:04:21.224 Or, une seule molécule de cette [br]librairie respectait ces critères, 0:04:21.248,0:04:23.584 et cette molécule était l'halicine. 0:04:24.444,0:04:27.866 Étant donné que l'halicine ne ressemblait[br]à aucun antibiotique existant, 0:04:27.866,0:04:31.710 il aurait été impossible pour un humain, [br]même un expert en antibiotiques, 0:04:31.734,0:04:33.918 d'identifier l'halicine de cette manière. 0:04:34.534,0:04:37.318 Imaginez donc ce qu'on peut réaliser[br]avec cette technologie 0:04:37.318,0:04:38.969 contre le SARS-CoV-2. 0:04:39.783,0:04:41.148 Et ce n'est pas tout. 0:04:41.172,0:04:43.992 Nous utilisons aussi les outils[br]de la biologie synthétique, 0:04:44.016,0:04:46.627 bricolant l'ADN et d'autres[br]mécanismes cellulaires, 0:04:46.651,0:04:50.561 pour poursuivre nos objectifs humains,[br]comme la lutte contre le COVID-19. 0:04:50.585,0:04:54.232 Par exemple, nous travaillons pour[br]développer un masque de protection 0:04:54.256,0:04:57.688 qui puisse aussi servir[br]d'outil de diagnostic rapide. 0:04:58.192,0:04:59.614 Comment ça marche ? 0:04:59.614,0:05:00.917 Nous avons récemment montré 0:05:00.917,0:05:03.924 qu'on peut prendre le mécanisme[br]cellulaire d'une cellule vivante 0:05:03.924,0:05:07.976 et le lyophiliser avec des[br]capteurs d'ARN sur du papier 0:05:08.000,0:05:12.916 afin de créer des outils de diagnostic[br]à faible coût pour l'Ebola et le Zika. 0:05:13.503,0:05:18.730 Les capteurs sont activés quand ils sont[br]réhydratés par un échantillon du patient 0:05:18.754,0:05:21.576 comme par exemple du sang ou de la salive. 0:05:21.600,0:05:24.861 Il s'avère que cette technologie[br]n'est pas limitée au papier 0:05:24.885,0:05:27.881 et peut être appliquée à d'autres[br]matériaux, y compris le tissu. 0:05:28.671,0:05:30.613 Pour la pandémie de COVID-19, 0:05:30.637,0:05:34.983 nous travaillons pour réaliser[br]de capteurs ARN pour détecter le virus 0:05:35.007,0:05:38.217 et les lyophiliser avec[br]le mécanisme cellulaire nécessaire 0:05:38.241,0:05:40.948 dans le tissu d'un masque, 0:05:40.972,0:05:43.201 où le simple fait de respirer, 0:05:43.225,0:05:45.502 grâce à la vapeur d'eau, 0:05:45.526,0:05:47.286 peut activer le test. 0:05:47.804,0:05:52.064 Ainsi, si un patient est infecté[br]par le SARS-CoV-2, 0:05:52.088,0:05:54.161 le masque produira un signal fluorescent 0:05:54.185,0:05:58.015 qui pourrait être détecté par un simple[br]appareil portable et pas cher. 0:05:58.534,0:06:03.018 En une ou deux heures, on pourrait[br]ainsi diagnostiquer un patient, 0:06:03.042,0:06:06.014 sûrement, à distance et avec précision. 0:06:06.735,0:06:09.155 Nous utilisons aussi[br]la biologique synthétique 0:06:09.155,0:06:11.999 pour développer un possible vaccin[br]contre le COVID-19. 0:06:13.014,0:06:15.587 Nous retravaillons le vaccin BCG, 0:06:15.587,0:06:18.585 qui a été utilisé pendant presque 100 ans[br]contre la tuberculose. 0:06:18.585,0:06:20.126 C'est un vaccin vivant atténué, 0:06:20.150,0:06:24.727 et nous le retravaillons pour lui faire[br]exprimer les antigènes du SARS-CoV-2, 0:06:24.727,0:06:27.739 ce qui devrait déclencher la production[br]d'anticorps protecteurs 0:06:27.739,0:06:29.304 par le système immunitaire. 0:06:29.304,0:06:32.146 En plus, le BCG peut être produit[br]en énormes quantités 0:06:32.146,0:06:36.659 et son profil de sécurité est l'un[br]des meilleurs de tous les vaccins connus. 0:06:37.881,0:06:42.986 Avec les outils de la biologie synthétique[br]et de l'intelligence artificielle, 0:06:43.010,0:06:46.358 nous pouvons gagner la lutte[br]contre le nouveau coronavirus. 0:06:46.844,0:06:50.163 Ce travail en est à ses débuts, [br]mais la promesse est réelle. 0:06:50.798,0:06:54.243 Science et technologie peuvent nous donner[br]un important avantage 0:06:54.267,0:06:57.802 dans la bataille des cerveaux humains[br]contre les gènes des super-bactéries, 0:06:57.802,0:06:59.703 une bataille que nous pouvons remporter. 0:06:59.990,0:07:01.223 Merci.