-
Cím:
Octotales • Fred Hutch
-
Leírás:
-
Jag tror att dom
som kommer att bota cancer
-
kommer att vara folk
som har datalogisk kunskap.
-
Om folk kan programmera,
så kan dom vara en del av det här.
-
Och det är vad vi vill,
vi vill att alla ska vara med
-
Vi tror verkligen att lösningen
på cancergåtan
-
kommer att komma från oss alla.
-
♪ (musik) ♪
-
(Eric Holland) Fred Hutchinsons
forskningscenter för cancer
-
är ett forskningcenter i Seattle
som specialiserar på att förstå cancer
-
och ta fram nya botemedel,
-
som vi kan ge till patienter
med sjukdommar som är obotliga.
-
(Lisa McFerrin) vårt mål är att både
forska cancerbiologi,
-
men även att behandla patienter,
-
vi är en del av ett konsortium
som inkluderar sjukhus,
-
men det inkluderar även
ett stort antal forskare.
-
(Eric) Historiskt sett när folk
försökte fastställa
-
vilken cancertyp det var,
-
så kollade dom under ett mikroskop,
-
och beroende på hur det såg ut,
så fick det ett namn.
-
Men nyligen har vi haft möjligheten
att sekvensera stora mängder DNA,
-
och så, helt plötsligt
-
finns det en hel del mer
digital data
-
som fullständigt beskriver ett tumör
på ett mycket bättre sätt
-
än vad ett mikroskop kan,
-
men det här är både en bra
och dåligt.
-
Det blir ett problem
i det att mängden av data
-
för varje person är enorm.
-
Och all den informationen
måste sammanställas
-
i någon stor databas,
-
och sedan manipulerad och visualiserad,
-
och så vi kunde
få ett team tillsammans
-
att attackera problemet,
-
och vi har byggt några av dessa verktyg,
-
som vi är rätt så glada med.
-
(Desert Horse-Grant) Oncoscape
är webbapplikation med en öppen källkod
-
Där vi tar en cancer patients information
-
och vi visualiserar den
-
så att läkare och forskare
kan lättare förstå
-
vad som händer
i patientens sjukdom.
-
Just nu så finns det cancerbiologer,
-
dom som studerar cancer,
-
och sen är det datalogiska människorna,
-
så vi ville ha ett verktyg
som talar till båda grupperna,
-
och sen samtidigt
-
hur kan vi få dom att arbeta tillsammans.
-
(Jenny Zhang) Mitt arbete inkluderar
torrlab,
-
datalogiska sidan plus våtlab,
-
vilket innebär bearbetning
av mänskliga vävnader
-
så jag arbetat på båda sidorna
-
Vävnaden är fryst,
jag lägger den bara på torr is,
-
och sen byter jag till min termiska handske.
-
Många gånger ser vi bara på datan
som datorforskare,
-
men man vet inte
hur datan genererades.
-
Och jag har möjligheten
att inspektera vävnaden,
-
och när datan inte stämmer,
-
så går man tillbaka till provet.
-
Varje aspekt spelar roll
för att få fram data med bra kvalitet.
-
Det finns många fördelar
med att kunna arbeta på båda sidorna.
-
(Eric) Jag har jobbat med
det här i 20 år.
-
Jag har lärt mig mer om sjukdomen
som jag är intresserad av,
-
vilket är hjärncancer,
-
med det här visualiseringsverktyget
-
har jag har lärt mig mycket
under dom senaste åren,
-
eftersom jag inte bara tittar
-
på vad gatubelysningen,
du vet, lyser upp
-
Om man tittar på alla DNA,
-
det är som att tända
lamporna i hela rummet,
-
man ser allt,
och man ser allt samtidigt,
-
och man kan se det
man vet finns,
-
men sen finns allt det andra,
som du inte ens visste fanns
-
men det finns rakt framför dig
-
(Desert) Så, vi ville att Oncoscape
skulle ha öppen källkod,
-
eftersom vårt mål,
-
och vårt mål från början
har verkligen varit om samarbete.
-
I år fick vi den här idén
när någon kontaktade oss
-
vars far hade lungcancer.
-
men han hade inte riktigt ett sätt att hjälpa
med undantag för programmering,
-
och det gav oss en idea
-
att programmerare där ute
kan verkligen hjälpa oss.
-
Vi tänkte att det här kunde vara
en bra sak att lägga in på GitHub
-
vi kände att vi fortfarande kunde
ge folk credit
-
och använda deras namn
och verkligen prisa dom
-
för hjälpen i kampen mot cancer.
-
(Lisa) Du behöver inte vara en expert
i biologi eller beräkningsbiologi.
-
Vi vill att människor ska kunna
vara en expert på sitt eget område,
-
så vi har skapat
alla dessa "hjälp behövs" uppgifter
-
för sånt som vi inte är experter på,
men som du kan vara en expert på,
-
och vi vill att vår GitHub repository
-
ska vara ett ställe där folk kan komma
-
och bidra med deras egen kunskap,
-
sin egen programvara
och sina egna insatser
-
(Jenny) Jag vet hur mycket
jag har fått lära mig
-
från GitHub community.
-
Jag har kollat
en hel del på respositories
-
tittar på hur dom programmerar.
-
Vi kan inte arbeta som konkurrenter
längre i cancerforskningen,
-
eftersom människor dör,
-
så vi måste verkligen jobba tillsammans
med olika cancer center,
-
med olika områden,
-
med folk som har olika kunskaper.
-
Det är en mycket spännande tid
om dessa verktyg kan komma
-
till den nivå att vem som helst
kan göra detta, och du vet,
-
det öppnar verkligen upp vetenskap
och cancerforskning till alla,
-
vilket faktiskt är riktigt spännande.
-
(Desert) Jag vet inte, jag menar,
cancer kommer att lösas på en dator.
-
Vi vill att folk ska gå med oss
för att skapa verktyget
-
som vi alla kan dra nytta av.
-
♪ (music) ♪