Showing Revision 2 created 05/26/2016 by Manuela Silva.

1. Cím:
   Octotales • Fred Hutch
2. Leírás:

   O Centro de Investigação de Cancro Fred Hutchinson está a trabalhar descobrir uma solução para o cancro, proporcionando os seus para o código aberto. Para os ajudar a criar o Oncoscape em github.com/fredhutch/oncoscape.

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3. 939 0:01 - 0:03
   Eu penso que as pessoas que
   vão curar o cancro
4. 3376 0:03 - 0:07
   vão ser as pessoas que tem
   conhecimentos computacionais.
5. 6506 0:07 - 0:11
   Se as pessoas tiverem conhecimentos
   de programação, eles podem
   juntar-se e fazer parte disto.
6. 11256 0:11 - 0:14
   E é isso que nós queremos,
   ter toda a gente a participar.
7. 14303 0:14 - 0:18
   Nós pensamos que realmente é a
   solução para desvendar o cancro,
8. 17813 0:18 - 0:20
   vai ser realmente de todos nós.
9. 19533 0:20 - 0:21
   ♪ ♪
10. 38691 0:39 - 0:41
    (Eric Holland) O Centro de Pesquisa de Cancro
    The Fred Hutchinson
11. 40971 0:41 - 0:47
    é um centro de investigação em Seatle, que
    se especializa na compreensão do cancro
12. 47113 0:47 - 0:50
    e apresentar novas curas,
13. 49503 0:50 - 0:53
    e que nós podemos utilizar em doentes
    com doenças que são incuráveis.
14. 53986 0:54 - 0:58
    (Lisa McFerrin) O nosso objetivo é que
    ambas investiguem a biologia do cancro,
15. 57586 0:58 - 0:59
    mas também tratar doentes,
16. 59096 0:59 - 1:01
    e assim, nós somos parte de um
    consórcio que inclui hospitais,
17. 61386 1:01 - 1:04
    mas também inclui um grande
    número de investigações.
18. 65027 1:05 - 1:07
    (Eric) Historicamente, quando as pessoas
    estavam a tentar decidir
19. 67287 1:07 - 1:09
    que tipo de cancro era,
20. 69077 1:09 - 1:11
    eles observariam ao microscópio,
21. 70857 1:11 - 1:14
    e devido ao modo que as coisas pareciam,
    eles davam-lhe um nome.
22. 74017 1:14 - 1:19
    Mas recentemente, nós temos tido a capacidade
    para sequenciar um grande número de DNA,
23. 78697 1:19 - 1:20
    e assim, subitamente
24. 79946 1:20 - 1:22
    existe um conjunto de muitos mais dados digitais
25. 82496 1:22 - 1:26
    que descrevem completamente um
    tumor num modo muito melhor
26. 85546 1:26 - 1:27
    do que simplesmente o modo de um microscópio,
27. 87426 1:27 - 1:29
    mas isto é uma coisa boa e uma coisa má.
28. 89436 1:29 - 1:33
    Isto coloca um problema em
    que a quantidade de dados
29. 92756 1:33 - 1:35
    para qualquer pessoa, é enorme.
30. 96489 1:36 - 1:39
    E toda essa informação tem de ser compilada
31. 99388 1:39 - 1:41
    em algumas bases de dados gigantes,
32. 101468 1:41 - 1:43
    e depois manipulada e visualizada,
33. 103338 1:43 - 1:46
    e assim, nós conseguimos reunir uma equipa
34. 106048 1:46 - 1:47
    para atacar este problema,
35. 107278 1:47 - 1:50
    e nós criamos algumas dessas ferramentas,
36. 110308 1:50 - 1:52
    e que nós estamos bastante satisfeitos com elas.
37. 113585 1:54 - 1:57
    (Desert Horse-Grant) Oncoscape
    é uma aplicação da Web de código aberto
38. 117025 1:57 - 2:00
    onde nós registamos a informação do doente
39. 119855 2:00 - 2:01
    e nós facilmente a visualizamos
40. 121455 2:01 - 2:04
    para os doutores e cientistas compreenderem
41. 123555 2:04 - 2:06
    o que se passa com a doença do paciente.
42. 125805 2:06 - 2:09
    De momento, na área, existem
    biologistas de cancro,
43. 128866 2:09 - 2:11
    e assim, as pessoas que estudam o cancro,
44. 130816 2:11 - 2:13
    e depois existem as pessoas computacionais,
45. 132976 2:13 - 2:16
    e por isso nós queríamos uma ferramenta que
    realmente pudesse exprimir ambos os grupos,
46. 135776 2:16 - 2:17
    e depois ao mesmo tempo
47. 137286 2:17 - 2:20
    apenas como nós podemos fazer com que eles trabalhem em conjunto.
48. 139566 2:20 - 2:22
    (Jenny Zhang) O meu trabalho inclui o laboratório "dry",
49. 142046 2:22 - 2:25
    lado computacional, mais o laboratório "wet"
50. 145056 2:25 - 2:28
    o que significa, o processamento de tecidos humano,
51. 147746 2:28 - 2:30
    deste modo, eu trabalho em ambos os lados.
52. 149676 2:30 - 2:35
    De modo que o tecido é congelado, eu irei
    apenas colocá-la em gelo seco,
53. 155056 2:35 - 2:38
    e depois mudo para a minha luva termal.
54. 157532 2:38 - 2:41
    Muitas das vezes, nós só olhamos para os
    dados como um cientista de computador,
55. 160772 2:41 - 2:44
    mas tu não sabes como é que
    os dados foram gerados.
56. 163742 2:44 - 2:47
    E eu tenho a oportunidade
    de observar o tecido,
57. 167112 2:47 - 2:49
    e quando os dados não fazem sentido,
58. 169302 2:49 - 2:51
    então, tu voltas ao espécime.
59. 172155 2:52 - 2:56
    Cada aspeto é importante para gerar
    uma boa qualidade de dados.
60. 175865 2:56 - 3:00
    Há muitas vantagens em poder
    trabalhar em ambos os lados.
61. 180221 3:00 - 3:03
    (Eric) Bem, eu tenho estado neste campo há 20 anos.
62. 182811 3:03 - 3:06
    Eu aprendi muito sobre a doença que
    eu estou particularmente interessado,
63. 185691 3:06 - 3:07
    que é o cancro cerebral,
64. 187672 3:08 - 3:10
    com simplesmente esta ferramenta de visualização
65. 189806 3:10 - 3:13
    para tudo o que eu aprendi,
    sobre muito dos anos anteriores,
66. 193292 3:13 - 3:15
    porque eu não estou necessariamente a olhar
67. 195040 3:15 - 3:19
    apenas, para o que a luz da rua, você sabe, é iluminar.
68. 199345 3:19 - 3:22
    Se olhar para todo o DNA,
69. 201875 3:22 - 3:24
    está atualmente, é como ligar
    as luzes em toda a sala,
70. 204225 3:24 - 3:26
    vê tudo, e vê tudo de uma vez só,
71. 206475 3:26 - 3:29
    e pode ver as coisas que sabe que existem,
72. 208715 3:29 - 3:32
    mas depois existem todas estas coisas
    que não sabe sequer o que procurar
73. 211605 3:32 - 3:34
    mas que estão lá, à sua frente.
74. 216892 3:37 - 3:39
    (Desert) Assim, nós quisemos que Oncoscape
    fosse em código aberto,
75. 219292 3:39 - 3:41
    porque o nosso objetivo,
76. 220552 3:41 - 3:43
    e o nosso objetivo desde o início, tem sido
    realmente sobre a colaboração.
77. 223382 3:43 - 3:47
    Este ano nós tivemos esta ideia
    porque alguém nos contactou
78. 226652 3:47 - 3:49
    cujo pai tinha cancro de pulmão,
79. 228952 3:49 - 3:52
    mas ele realmente não tinha uma maneira
    de como ajudar, exceto, programação,
80. 232052 3:52 - 3:54
    e realmente deu-nos esta ideia
81. 234152 3:54 - 3:57
    que os codificadores que por aí andam,
    poderiam nos ajudar.
82. 237192 3:57 - 4:00
    E por isso, nós pensamos que isto seria uma
    grande coisa, em colocar no GitHib,
83. 240282 4:00 - 4:03
    e nós pensamos em como é que
    poderíamos dar crédito às pessoas
84. 242722 4:03 - 4:05
    e utilizar os nomes deles e realmente
    agradecer aos mesmos
85. 244952 4:05 - 4:08
    por nos ajudarem nesta luta contra o cancro.
86. 249354 4:09 - 4:15
    (Lisa) Você não tem de ser um especialista em biologia ou em biologia computacional.
87. 254654 4:15 - 4:18
    Nós queremos que as pessoas sejam um
    especialista no seu próprio campo,
88. 257990 4:18 - 4:21
    e por isso, nós criamos todas estas
    tarefas de "precisa-se de ajuda"
89. 260750 4:21 - 4:25
    nas coisas em que nós não somos especialistas, que você poderia ser um especialista,
90. 265256 4:25 - 4:28
    e nós queremos que o nosso repositório no GitHub
91. 267996 4:28 - 4:30
    seja o local onde as pessoas podem vir
92. 270172 4:30 - 4:32
    e contribuir com o seu próprio conhecimento,
93. 272116 4:32 - 4:34
    o seu próprio software, e o seu próprio esforço.
94. 274006 4:34 - 4:38
    (Jenny) Eu sei apenas de longe,
    o quanto eu tenho aprendido
95. 277576 4:38 - 4:39
    a partir da comunidade do GitHub.
96. 279396 4:39 - 4:42
    Eu tenho estado a consultar muitos repositórios
97. 282456 4:42 - 4:44
    olhando apenas para como
    eles escrevem o código.
98. 284036 4:44 - 4:48
    Nós já não podemos trabalhar com os
    competidores na pesquisa do cancro,
99. 288416 4:48 - 4:50
    porque as pessoas morrem,
100. 290718 4:51 - 4:55
     por isso, nós realmente precisamos de trabalhar
     juntos com diferentes centros de cancro,
101. 295180 4:55 - 4:57
     com diferentes campos,
102. 296868 4:57 - 4:59
     com pessoas de todas as
     diferentes especialidades.
103. 299538 5:00 - 5:03
     (Eric) É uma momento muito emocionante,
     se estas ferramentas pudessem
     ser realmente trazidas
104. 303299 5:03 - 5:08
     para o nível em que apenas uma pessoa idosa pudesse fazer isto, e você sabe,
105. 308756 5:09 - 5:12
     isto realmente abre a ciência e a investigação
     do cancro para toda a gente,
106. 311912 5:12 - 5:14
     o que é atualmente muito emocionante.
107. 314013 5:14 - 5:18
     (Desert) Eu não sei, eu quero dizer,
     o cancro irá ser resolvido em um computador.
108. 318253 5:18 - 5:21
     Nós queremos que as pessoas se juntem
     a nós na criação de uma ferramenta
109. 321281 5:21 - 5:23
     que realmente todos nós pudéssemos beneficiar.