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Cím:
Octotales • Fred Hutch
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Leírás:
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Eu penso que as pessoas que
vão curar o cancro
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vão ser as pessoas que tem
conhecimentos computacionais.
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Se as pessoas tiverem conhecimentos
de programação, eles podem
juntar-se e fazer parte disto.
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E é isso que nós queremos,
ter toda a gente a participar.
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Nós pensamos que realmente é a
solução para desvendar o cancro,
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vai ser realmente de todos nós.
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(Eric Holland) O Centro de Pesquisa de Cancro
The Fred Hutchinson
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é um centro de investigação em Seatle, que
se especializa na compreensão do cancro
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e apresentar novas curas,
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e que nós podemos utilizar em doentes
com doenças que são incuráveis.
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(Lisa McFerrin) O nosso objetivo é que
ambas investiguem a biologia do cancro,
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mas também tratar doentes,
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e assim, nós somos parte de um
consórcio que inclui hospitais,
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mas também inclui um grande
número de investigações.
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(Eric) Historicamente, quando as pessoas
estavam a tentar decidir
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que tipo de cancro era,
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eles observariam ao microscópio,
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e devido ao modo que as coisas pareciam,
eles davam-lhe um nome.
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Mas recentemente, nós temos tido a capacidade
para sequenciar um grande número de DNA,
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e assim, subitamente
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existe um conjunto de muitos mais dados digitais
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que descrevem completamente um
tumor num modo muito melhor
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do que simplesmente o modo de um microscópio,
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mas isto é uma coisa boa e uma coisa má.
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Isto coloca um problema em
que a quantidade de dados
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para qualquer pessoa, é enorme.
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E toda essa informação tem de ser compilada
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em algumas bases de dados gigantes,
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e depois manipulada e visualizada,
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e assim, nós conseguimos reunir uma equipa
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para atacar este problema,
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e nós criamos algumas dessas ferramentas,
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e que nós estamos bastante satisfeitos com elas.
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(Desert Horse-Grant) Oncoscape
é uma aplicação da Web de código aberto
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onde nós registamos a informação do doente
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e nós facilmente a visualizamos
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para os doutores e cientistas compreenderem
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o que se passa com a doença do paciente.
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De momento, na área, existem
biologistas de cancro,
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e assim, as pessoas que estudam o cancro,
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e depois existem as pessoas computacionais,
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e por isso nós queríamos uma ferramenta que
realmente pudesse exprimir ambos os grupos,
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e depois ao mesmo tempo
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apenas como nós podemos fazer com que eles trabalhem em conjunto.
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(Jenny Zhang) O meu trabalho inclui o laboratório "dry",
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lado computacional, mais o laboratório "wet"
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o que significa, o processamento de tecidos humano,
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deste modo, eu trabalho em ambos os lados.
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De modo que o tecido é congelado, eu irei
apenas colocá-la em gelo seco,
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e depois mudo para a minha luva termal.
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Muitas das vezes, nós só olhamos para os
dados como um cientista de computador,
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mas tu não sabes como é que
os dados foram gerados.
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E eu tenho a oportunidade
de observar o tecido,
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e quando os dados não fazem sentido,
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então, tu voltas ao espécime.
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Cada aspeto é importante para gerar
uma boa qualidade de dados.
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Há muitas vantagens em poder
trabalhar em ambos os lados.
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(Eric) Bem, eu tenho estado neste campo há 20 anos.
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Eu aprendi muito sobre a doença que
eu estou particularmente interessado,
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que é o cancro cerebral,
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com simplesmente esta ferramenta de visualização
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para tudo o que eu aprendi,
sobre muito dos anos anteriores,
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porque eu não estou necessariamente a olhar
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apenas, para o que a luz da rua, você sabe, é iluminar.
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Se olhar para todo o DNA,
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está atualmente, é como ligar
as luzes em toda a sala,
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vê tudo, e vê tudo de uma vez só,
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e pode ver as coisas que sabe que existem,
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mas depois existem todas estas coisas
que não sabe sequer o que procurar
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mas que estão lá, à sua frente.
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(Desert) Assim, nós quisemos que Oncoscape
fosse em código aberto,
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porque o nosso objetivo,
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e o nosso objetivo desde o início, tem sido
realmente sobre a colaboração.
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Este ano nós tivemos esta ideia
porque alguém nos contactou
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cujo pai tinha cancro de pulmão,
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mas ele realmente não tinha uma maneira
de como ajudar, exceto, programação,
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e realmente deu-nos esta ideia
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que os codificadores que por aí andam,
poderiam nos ajudar.
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E por isso, nós pensamos que isto seria uma
grande coisa, em colocar no GitHib,
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e nós pensamos em como é que
poderíamos dar crédito às pessoas
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e utilizar os nomes deles e realmente
agradecer aos mesmos
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por nos ajudarem nesta luta contra o cancro.
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(Lisa) Você não tem de ser um especialista em biologia ou em biologia computacional.
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Nós queremos que as pessoas sejam um
especialista no seu próprio campo,
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e por isso, nós criamos todas estas
tarefas de "precisa-se de ajuda"
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nas coisas em que nós não somos especialistas, que você poderia ser um especialista,
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e nós queremos que o nosso repositório no GitHub
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seja o local onde as pessoas podem vir
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e contribuir com o seu próprio conhecimento,
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o seu próprio software, e o seu próprio esforço.
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(Jenny) Eu sei apenas de longe,
o quanto eu tenho aprendido
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a partir da comunidade do GitHub.
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Eu tenho estado a consultar muitos repositórios
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olhando apenas para como
eles escrevem o código.
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Nós já não podemos trabalhar com os
competidores na pesquisa do cancro,
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porque as pessoas morrem,
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por isso, nós realmente precisamos de trabalhar
juntos com diferentes centros de cancro,
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com diferentes campos,
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com pessoas de todas as
diferentes especialidades.
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(Eric) É uma momento muito emocionante,
se estas ferramentas pudessem
ser realmente trazidas
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para o nível em que apenas uma pessoa idosa pudesse fazer isto, e você sabe,
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isto realmente abre a ciência e a investigação
do cancro para toda a gente,
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o que é atualmente muito emocionante.
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(Desert) Eu não sei, eu quero dizer,
o cancro irá ser resolvido em um computador.
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Nós queremos que as pessoas se juntem
a nós na criação de uma ferramenta
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que realmente todos nós pudéssemos beneficiar.
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