Showing Revision 15 created 01/30/2020 by Milena Moledda.

1. Cím:
   Octotales • Fred Hutch
2. Leírás:

   Il Centro di ricerca sul cancro Fred Hutchinson sta lavorando per abbattere i silos di conoscenza nella ricerca sul cancro mettendo i propri dati a disposizione di tutti. Aiutali a costruire Oncoscape su github.com/fredhutch/oncoscape.

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3. 939 0:01 - 0:03
   Credo che a
   sconfiggere il cancro
4. 3376 0:03 - 0:07
   saranno i tecnici e gli informatici.
5. 6506 0:07 - 0:11
   Se sei un bravo programmatore,
   puoi entrare a far parte della squadra.
6. 11256 0:11 - 0:14
   È quello che vogliamo,
   vogliamo coinvolgere tutti.
7. 14303 0:14 - 0:18
   Pensiamo davvero che
   l'unico modo di sconfiggere il cancro
8. 17813 0:18 - 0:20
   sia la collaborazione di tutti noi.
9. 19533 0:20 - 0:21
   (musica)
10. 38691 0:39 - 0:41
    (Eric Holland) L'Istituto di ricerca
    Fred Hutchinson
11. 40971 0:41 - 0:47
    si trova a Seattle ed è
    specializzato nello studio del cancro,
12. 47113 0:47 - 0:50
    oltre che nell'elaborazione di
    nuove cure
13. 49503 0:50 - 0:53
    dedicate ai pazienti che sono vittime
    di malattie incurabili.
14. 53986 0:54 - 0:58
    (Lisa McFerrin) Il nostro scopo è
    studiare la biologia del cancro,
15. 57586 0:58 - 0:59
    ma anche curare i pazienti.
16. 59096 0:59 - 1:01
    Facciamo parte di un consorzio
    che comprende gli ospedali,
17. 61386 1:01 - 1:04
    ma anche un gran numero di ricercatori.
18. 65027 1:05 - 1:07
    (Eric) In passato, quando i medici
    cercavano di stabilire
19. 67287 1:07 - 1:09
    con che tipo di cancro
    avessero a che fare,
20. 69077 1:09 - 1:11
    erano soliti utilizzare un microscopio e,
21. 70857 1:11 - 1:14
    in base a quello che riscontravano,
    gli davano un nome.
22. 74017 1:14 - 1:19
    Di recente invece, siamo riusciti a
    sequenziare moltissimi frammenti di DNA
23. 78697 1:19 - 1:20
    e così ci siamo ritrovati
24. 79946 1:20 - 1:22
    con un enorme ammasso di
    dati digitali da analizzare
25. 82496 1:22 - 1:26
    che descrivono il tumore
    in maniera molto più precisa
26. 85546 1:26 - 1:27
    di un semplice microscopio.
27. 87426 1:27 - 1:29
    Questa è una notizia
    sia bella che brutta
28. 89436 1:29 - 1:33
    poiché la quantità di dati che
    una singola persona dovrebbe analizzare
29. 92756 1:33 - 1:35
    è a dir poco enorme.
30. 96489 1:36 - 1:39
    Tutte le informazioni vengono raccolte
31. 99388 1:39 - 1:41
    in un database gigantesco,
32. 101468 1:41 - 1:43
    per poi essere analizzate con cura.
33. 103338 1:43 - 1:46
    Siamo quindi riusciti a
    mettere insieme una squadra
34. 106048 1:46 - 1:47
    per risolvere il problema
35. 107278 1:47 - 1:50
    e abbiamo creato alcuni strumenti
36. 110308 1:50 - 1:52
    di cui andiamo molto fieri.
37. 113585 1:54 - 1:57
    (Desert Horse-Grant) Oncoscape è
    un'applicazione web
38. 117025 1:57 - 2:00
    che usiamo per raccogliere dati
    sui pazienti malati di cancro,
39. 119855 2:00 - 2:01
    Questa semplice interfaccia permette
40. 121455 2:01 - 2:04
    a dottori e scienziati di capire
41. 123555 2:04 - 2:06
    come si evolve la malattia.
42. 125805 2:06 - 2:09
    Al momento nel settore operano
    sia esperti biologi,
43. 128866 2:09 - 2:11
    ovvero le persone che
    fanno ricerca sul cancro,
44. 130816 2:11 - 2:13
    sia tecnici informatici,
45. 132976 2:13 - 2:16
    quindi abbiamo bisogno di uno strumento
    che sia comprensibile
46. 135776 2:16 - 2:17
    per entrambi, in modo che
47. 137286 2:17 - 2:20
    possano lavorare insieme con facilità.
48. 139566 2:20 - 2:22
    (Jenny Zhang) Mi occupo di
    analisi tecniche a secco,
49. 142046 2:22 - 2:25
    ma lavoro anche nel laboratorio umido,
50. 145056 2:25 - 2:28
    in cui tratto i tessuti umani,
51. 147746 2:28 - 2:30
    quindi lavoro su entrambi i fronti.
52. 149676 2:30 - 2:35
    Il tessuto è congelato,
    lo metto sul ghiaccio secco
53. 155056 2:35 - 2:38
    e poi indosso il guanto termico.
54. 157532 2:38 - 2:41
    Il più delle volte analizziamo i dati
    da un punto di vista informatico,
55. 160772 2:41 - 2:44
    ma non sappiamo davvero come
    sono stati generati.
56. 163742 2:44 - 2:47
    Ora ho l'opportunità di vedere
    e toccare il tessuto,
57. 167112 2:47 - 2:49
    e quando i dati sembrano
    non avere senso,
58. 169302 2:49 - 2:51
    posso dare un'altra occhiata
    ai campioni.
59. 172155 2:52 - 2:56
    Ogni elemento
    contribuisce alla raccolta dati.
60. 175865 2:56 - 3:00
    Poter lavorare in entrambi i fronti
    ha molti vantaggi.
61. 180221 3:00 - 3:03
    (Eric) Beh, lavoro in questo campo da 20 anni.
62. 182811 3:03 - 3:06
    Ho imparato molto più sui tumori al cervello,
63. 185691 3:06 - 3:07
    malattia che mi interessava particolarmente,
64. 187672 3:08 - 3:10
    con questo strumento di visualizzazione
65. 189806 3:10 - 3:13
    di quanto non avessi imparato precedentemente
66. 193292 3:13 - 3:15
    perchè non osservo solo
67. 195040 3:15 - 3:19
    ciò che è ovvio.
68. 199345 3:19 - 3:22
    Osservare tutto il DNA
69. 201875 3:22 - 3:24
    è come accendere le luci in una stanza,
70. 204225 3:24 - 3:26
    vedi tutto e lo vedi insieme
71. 206475 3:26 - 3:29
    e puoi vedere sia le cose di cui conoscevi l´esistenza
72. 208715 3:29 - 3:32
    sia tutto il resto che non ti aspettavi di vedere
73. 211605 3:32 - 3:34
    che è lì davanti ai tuoi occhi.
74. 216892 3:37 - 3:39
    (Desert) Volevamo che Oncosape fosse una fonte a disposizione di tutti,
75. 219292 3:39 - 3:41
    perche il nostro intento
76. 220552 3:41 - 3:43
    sin dall´inizio era di poter collaborare.
77. 223382 3:43 - 3:47
    Quest´anno un´idea è nata quando qualcuno ci ha contattati
78. 226652 3:47 - 3:49
    dicendo che suo padre aveva il cancro ai polmoni,
79. 228952 3:49 - 3:52
    ma non sapeva come contribuire
    avendo solo esperienza di programmatore
80. 232052 3:52 - 3:54
    e ciò ci ha fatto pensare
81. 234152 3:54 - 3:57
    che i programmatori potrebbero
    davvero contribuire al nostro lavoro.
82. 237192 3:57 - 4:00
    Cosí abbiamo pensato che questa sarebbe stata
    un´ottima aggiunta per GitHub,
83. 240282 4:00 - 4:03
    siamo felici di dare credito a chi ci aiuta,
84. 242722 4:03 - 4:05
    usando i loro nomi e celebrandone il lavoro
85. 244952 4:05 - 4:08
    fatto insieme a noi nella lotta contro il cancro.
86. 249354 4:09 - 4:13
    (Lisa) Non si tratta solo di essere esperti in biologia o biologia computazionale
87. 254404 4:14 - 4:18
    Si tratta di permettere a tutti di eccellere
    nel proprio campo,
88. 258336 4:18 - 4:20
    cosi abbiamo creato lo spazio "aiutaci"
89. 259730 4:20 - 4:23
    in materie sulle quali noi non siamo preparati
90. 263180 4:23 - 4:27
    col desiderio di trasformare GitHub
91. 267166 4:27 - 4:30
    in una piattaforma a cui la gente può accedere
92. 269996 4:30 - 4:31
    mettendo a disposizion la propria conoscenza,
93. 271122 4:31 - 4:34
    i propri software e i propri sforzi.
94. 274336 4:34 - 4:37
    (Jenny) Ho imparato tantissimo dalla community di GitHub.
95. 277401 4:37 - 4:40
    Accedendo ai contributi
96. 279756 4:40 - 4:44
    e semplicemente osservando come altri codificano.
97. 284406 4:44 - 4:49
    Nella ricerca sul cancro non c'è più posto per la competizione,
98. 288906 4:49 - 4:50
    perché la gente sta morendo.
99. 290838 4:51 - 4:54
    Quindi i vari centri devono cooperare
100. 293528 4:54 - 4:55
     con i vari settori,
101. 296560 4:57 - 4:59
     e con i professionisti dei vari campi.
102. 299451 4:59 - 5:01
     (Eric) Sarebbe fantastico se questi strumenti
103. 301768 5:02 - 5:06
     fossero accessibili a chiunque
104. 309029 5:09 - 5:12
     mettendo la scienza e la ricerca sul cancro alla portata di tutti,
105. 311586 5:12 - 5:14
     sarebbe davvero fantastico!
106. 314397 5:14 - 5:18
     (Desert) Il cancro verrà sconfitto al computer.
107. 318593 5:19 - 5:21
     Vogliamo invitare tutti ad aiutarci a creare uno strumento
108. 321031 5:21 - 5:24
     di cui tutti potremo beneficiare.
109. 323711 5:24 - 5:28
     ♪ (musica) ♪