Octotales • Fred Hutch

Pienso que quienes
van a curar el cáncer

serán quienes tengan
habilidades computacionales.

Quienes tengan habilidades de programación
pueden ser parte de esto,

Y eso es lo que queremos,
queremos involucrar a todos.

Creemos que la solución
para descifrar el cáncer

realmente vendrá
de todos nosotros

♪ (music) ♪

Eric Holland: El Centro de Investigación
Fred Hutchinson

es un centro de investigación en Seattle
especializado en entender el cáncer,

y en desarrollar nuevas curas,

que podremos usar para pacientes
con enfermedades incurables.

Lisa McFerrin: Nuesta meta es investigar
la biología del cáncer,

pero también cómo tratar a los pacientes,

somos parte de un consorcio
que incluye hospitales,

pero también incluye un gran
número de investigadores

Eric: Históricamente, cuando la gente
trataba de decidir

de qué tipo era un cáncer,

miraban bajo el microscopio,

y por cómo se veían las cosas,
le daban un nombre.

Actualmente, hemos tenido la capacidad
de secuenciar grandes cantidades de ADN

y de repente

hay muchos más tipos
de datos digitales

que describen completamente
un tumor de una mejor manera

que a través del microscopio,

Sin embargo, esto es bueno
y malo.

El problema es que
la cantidad de datos

para una persona cualquiera es enorme.

Y toda esa información tiene
que ser compilada

en alguna base de datos gigante,

y luego manipulada y visualizada,

y así conseguimos
juntar un equipo

para atacar este problema,

y hemos construido algunas
de estas herramientas,

con las que estamos muy contentos.

Dessert Horse-Grant: Oncoscape es
una aplicación web de código abierto

donde tomamos información
de un paciente con cáncer

y fácilmente la visualizamos

para que los doctores y científicos
entiendan

qué está pasando en
la enfermedad del paciente.

Sobre los campos, en este momento,
hay biólogos del cáncer

es decir, las personas
que están estudiando el cáncer,

y está la gente de computación.

Por eso queríamos una herramienta que pudiera
servir a ambos grupos,

y al mismo tiempo pensamos:

¿Cómo podemos hacerlos trabajar juntos?

Jenny Zhang: Mi trabajo incluye tanto trabajos de simulación como computacionales

y también la parte experimental, lo que significa

procesar tejidos humanos, y por tanto

trabajo en ambas partes.

El tejido está congelado, lo pondré en el
hielo seco,

y me cambio los guantes por unos térmicos.

Muchas veces sólo vemos los datos
como un científico computacional,

pero no sabes
cómo se generaron los datos.

Y tengo la oportunidad de ver al tejido,

y cuando la información no tiene sentido,

entonces regresas a tu espécimen.

Todo aspecto cuenta para generar
información de calidad.

Poder trabajar
en ambos lados tiene muchas ventajas .

Eric: Bueno, he estado en este campo por
20 años.

He aprendido más sobre la enfermedad
de la que estoy interesado,

que es cáncer cerebral,

simplemente con esta herramienta de
visualización

Y he aprendido
a través de los años pasados,

porque no estoy necesariamente viendo

solamente lo que está directamente bajo la luz.

Si miras todo el ADN,

realmente, es como prender las luces
del cuarto entero,

ves todo, y lo ves todo al tiempo,

y puedes ver las cosas
que sabes que existen,

pero están todas estas otras cosas
que ni siquiera conocías

pero están justo frente a ti.

Dessert: Queríamos que Oncoscape
fuera código abierto,

porque nuestra meta,

desde el principio ha sido la colaboración.

Este año tuvimos esta idea
porque alguien nos contactó

cuyo padre tuvo cáncer de pulmón,

Pero no tenía forma de ayudar
excepto por la programación

Y eso realmente nos dio una idea

que los programadores
realmente podrían ayudarnos.

Entonces creímos que sería una gran idea
para poner en GitHub,

y sentimos que aún podiamos dar
crédito a la gente

y usar sus nombres
y realmente felicitarlos

por ayudarnos en esta pelea
contra el cáncer.

Lisa: No tienes que ser un experto
en biología o biología computacional.

Queremos permitir a las personas
ser expertos en su propio campo,

entonces, hemos creado
todas estas tareas buscando ayuda

en cosas en las que no somos expertos,
y en las que tú podrías ser un experto,

y queremos que nuestro repositorio
de GitHub

sea un lugar donde la gente pueda venir

y contribuir con su propio conocimiento,

su propio software
y sus propios esfuerzos.

Jenny: Sé de sobra lo mucho que he
estado aprendiendo

de la comunidad de GitHub.

He estado revisando muchos repositorios

Solo viendo como programan.

Ya no podemos trabajar como competidores
en la investigación del cáncer,

porque las personas mueren,

por eso lo que realmente necesitamos es trabajar
juntos con diferentes centros de cáncer,

en diferentes campos,

y personas con experiencia diferente.

Eric: Es un momento muy emocionante
si estas herramientas pueden ser llevadas

al nivel donde cualquier persona
pueda hacer esto, y bueno,

realmente hace que la ciencia y la
investigación del cáncer

sean disponibles para todos, lo cual es realmente emocionante.

Dessert: No sé, digo, el cáncer será
resuelto en una computadora.

Queremos que las personas se nos unan
para hacer una herramienta

de la cual todos podamos beneficiarnos.

Contribuya en
github.com/FredHutch/Oncoscape