-
Cím:
-
Leírás:
-
Pienso que quienes
van a curar el cáncer
-
serán quienes tengan
habilidades computacionales.
-
Quienes tengan habilidades de programación
pueden ser parte de esto,
-
Y eso es lo que queremos,
queremos involucrar a todos.
-
Creemos que la solución
para descifrar el cáncer
-
realmente vendrá
de todos nosotros
-
♪ (music) ♪
-
Eric Holland: El Centro de Investigación
Fred Hutchinson
-
es un centro de investigación en Seattle
especializado en entender el cáncer,
-
y en desarrollar nuevas curas,
-
que podremos usar para pacientes
con enfermedades incurables.
-
Lisa McFerrin: Nuesta meta es investigar
la biología del cáncer,
-
pero también cómo tratar a los pacientes,
-
somos parte de un consorcio
que incluye hospitales,
-
pero también incluye un gran
número de investigadores
-
Eric: Históricamente, cuando la gente
trataba de decidir
-
de qué tipo era un cáncer,
-
miraban bajo el microscopio,
-
y por cómo se veían las cosas,
le daban un nombre.
-
Actualmente, hemos tenido la capacidad
de secuenciar grandes cantidades de ADN
-
y de repente
-
hay muchos más tipos
de datos digitales
-
que describen completamente
un tumor de una mejor manera
-
que a través del microscopio,
-
Sin embargo, esto es bueno
y malo.
-
El problema es que
la cantidad de datos
-
para una persona cualquiera es enorme.
-
Y toda esa información tiene
que ser compilada
-
en alguna base de datos gigante,
-
y luego manipulada y visualizada,
-
y así conseguimos
juntar un equipo
-
para atacar este problema,
-
y hemos construido algunas
de estas herramientas,
-
con las que estamos muy contentos.
-
Dessert Horse-Grant: Oncoscape es
una aplicación web de código abierto
-
donde tomamos información
de un paciente con cáncer
-
y fácilmente la visualizamos
-
para que los doctores y científicos
entiendan
-
qué está pasando en
la enfermedad del paciente.
-
Sobre los campos, en este momento,
hay biólogos del cáncer
-
es decir, las personas
que están estudiando el cáncer,
-
y está la gente de computación.
-
Por eso queríamos una herramienta que pudiera
servir a ambos grupos,
-
y al mismo tiempo pensamos:
-
¿Cómo podemos hacerlos trabajar juntos?
-
Jenny Zhang: Mi trabajo incluye tanto trabajos de simulación como computacionales
-
y también la parte experimental, lo que significa
-
procesar tejidos humanos, y por tanto
-
trabajo en ambas partes.
-
El tejido está congelado, lo pondré en el
hielo seco,
-
y me cambio los guantes por unos térmicos.
-
Muchas veces sólo vemos los datos
como un científico computacional,
-
pero no sabes
cómo se generaron los datos.
-
Y tengo la oportunidad de ver al tejido,
-
y cuando la información no tiene sentido,
-
entonces regresas a tu espécimen.
-
Todo aspecto cuenta para generar
información de calidad.
-
Poder trabajar
en ambos lados tiene muchas ventajas .
-
Eric: Bueno, he estado en este campo por
20 años.
-
He aprendido más sobre la enfermedad
de la que estoy interesado,
-
que es cáncer cerebral,
-
simplemente con esta herramienta de
visualización
-
Y he aprendido
a través de los años pasados,
-
porque no estoy necesariamente viendo
-
solamente lo que está directamente bajo la luz.
-
Si miras todo el ADN,
-
realmente, es como prender las luces
del cuarto entero,
-
ves todo, y lo ves todo al tiempo,
-
y puedes ver las cosas
que sabes que existen,
-
pero están todas estas otras cosas
que ni siquiera conocías
-
pero están justo frente a ti.
-
Dessert: Queríamos que Oncoscape
fuera código abierto,
-
porque nuestra meta,
-
desde el principio ha sido la colaboración.
-
Este año tuvimos esta idea
porque alguien nos contactó
-
cuyo padre tuvo cáncer de pulmón,
-
Pero no tenía forma de ayudar
excepto por la programación
-
Y eso realmente nos dio una idea
-
que los programadores
realmente podrían ayudarnos.
-
Entonces creímos que sería una gran idea
para poner en GitHub,
-
y sentimos que aún podiamos dar
crédito a la gente
-
y usar sus nombres
y realmente felicitarlos
-
por ayudarnos en esta pelea
contra el cáncer.
-
Lisa: No tienes que ser un experto
en biología o biología computacional.
-
Queremos permitir a las personas
ser expertos en su propio campo,
-
entonces, hemos creado
todas estas tareas buscando ayuda
-
en cosas en las que no somos expertos,
y en las que tú podrías ser un experto,
-
y queremos que nuestro repositorio
de GitHub
-
sea un lugar donde la gente pueda venir
-
y contribuir con su propio conocimiento,
-
su propio software
y sus propios esfuerzos.
-
Jenny: Sé de sobra lo mucho que he
estado aprendiendo
-
de la comunidad de GitHub.
-
He estado revisando muchos repositorios
-
Solo viendo como programan.
-
Ya no podemos trabajar como competidores
en la investigación del cáncer,
-
porque las personas mueren,
-
por eso lo que realmente necesitamos es trabajar
juntos con diferentes centros de cáncer,
-
en diferentes campos,
-
y personas con experiencia diferente.
-
Eric: Es un momento muy emocionante
si estas herramientas pueden ser llevadas
-
al nivel donde cualquier persona
pueda hacer esto, y bueno,
-
realmente hace que la ciencia y la
investigación del cáncer
-
sean disponibles para todos, lo cual es realmente emocionante.
-
Dessert: No sé, digo, el cáncer será
resuelto en una computadora.
-
Queremos que las personas se nos unan
para hacer una herramienta
-
de la cual todos podamos beneficiarnos.
-
Contribuya en
github.com/FredHutch/Oncoscape