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Cím:
Octotales • Fred Hutchinson
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Leírás:
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Creo que las personas
que curarán el cáncer
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son aquellas
con habilidades computacionales.
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Si conocen de programación,
pueden fácilmente ser parte del proyecto.
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Y eso es lo que queremos,
que todos se involucren en el proceso.
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En verdad creemos que la solución
para erradicar el cáncer
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provendrá de todos nosotros.
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♪ (música) ♪
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(Eric Holland) El Centro de Investigación
del Cáncer "Fred Hutchinson"
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es un centro de investigación en Seattle
dedicado al estudio del cáncer,
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y desarrollar nuevos tratamientos
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que podemos emplear en pacientes
con enfermedades incurables.
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(Lisa McFerrin) Nuestro objetivo es
investigar la naturaleza del cáncer,
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y también
tratar a los pacientes
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así que somos un consorcio
que incluye hospitales,
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pero también incluye
a un gran número de investigadores.
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(Eric) Tradicionalmente,
si se quería clasificar
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algún tipo de cáncer,
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se observaba en el microscopio,
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y al ver sus características,
se le daba una clasificación.
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Pero adquirimos la capacidad
de secuenciar grandes cantidades de ADN,
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y de pronto
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hay una mayor cantidad
de información digitalizada
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que describe un tumor a detalle
y de forma más eficiente
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que si tan sólo
miramos el microscopio.
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Pero esto es
tanto bueno, como malo.
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Ahora surge el problema
de que la cantidad de información
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para una sola persona es inmensa.
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Y toda esa información
debe recopilarse
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en una enorme base de datos,
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manipularse y poder ser visualizada.
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Así que tuvimos que
formar un equipo
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para atacar el problema
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y construimos estas herramientas
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que nos dejaron muy satisfechos.
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(Desert Horse Grant) "Oncoscape"
es una aplicación de código abierto
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en la que podemos ingresar
los datos del paciente de cancer
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para que doctores y científicos
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puedan visualizarlos
fácilmente y entiendan
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lo que sucede
con la enfermedad del paciente.
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En nuestro equipo están
los biólogos del cáncer,
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que son aquellos que estudian el cáncer;
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y también están
los expertos en computación,
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así que necesitábamos algo
con que ambos pudieran trabajar
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pero que al mismo tiempo
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les permitiera trabajar conjuntamente.
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(Jenny Zhang) Mi trabajo
incluye una parte simulada
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en la computadora;
y una parte experimental,
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donde trabajamos con tejidos humanos,
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es decir, trabajo en ambos lados.
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Saco el tejido congelado
y lo coloco en el hielo seco,
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y ahora me pongo mi guante térmico.
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Por lo regular,
sólo analizamos datos en la computadora,
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pero no sabemos
como se creó dicha información.
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Pero aquí tengo la oportunidad
de observar el tejido,
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y cuando los datos no concuerdan,
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puedes volver a analizar la muestra.
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Cada aspecto es importante
para generar datos de buena calidad.
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Hay muchas ventajas
al trabajar desde ambos lados.
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(Eric) He trabajado
en esto por veinte años.
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Y he aprendido mucho más
sobre la enfermedad que me interesa,
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que es el cáncer cerebral,
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con tan sólo usar esta herramienta,
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de lo que aprendí
en los años anteriores
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porque no sólo visualizo
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las áreas más obvias y superficiales.
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Si visualizas todo el ADN,
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es como si prendieras
las luces de una habitación:
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puedes ver todo al mismo tiempo,
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y claro, puedes ver
aquello que sabes que existe,
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pero también está aquello
que no sabías que debías buscar
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y que está justo frente a tus ojos.
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(Desert) Oncoscape
es de código abierto
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porque nuestro objetivo,
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desde un inicio,
siempre ha sido la colaboración.
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Y este año tuvimos la idea
porque nos contactó una persona
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cuyo padre sufría cáncer pulmonar,
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pero no tenía forma de ayudar
mas que ayudar con la programación
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y eso nos dio la idea
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de que los programadores
podían ser muy útiles para el proyecto.
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Pensamos que sería buena idea
publicarlo en GitHub,
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y aún así podríamos
darle crédito a todos,
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poner su nombre
y homenajearlos
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por ayudarnos
en la lucha contra el cáncer.
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(Lisa) no necesitas ser experto
en biología o en biología computacional.
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Queremos dejar que todos
sean expertos en su propia área,
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así que creamos
estas tareas llamadas "Se busca"
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para lo que no somos expertos,
pero que puede que tú sí lo seas,
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y queremos que
nuestro repositorio en GitHub
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sea un espacio donde las personas puedan
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contribuir con su conocimiento,
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su propio software
y su propio esfuerzo.
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(Jenny) No puedo creer
todo lo que he aprendido
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de la comunidad en GitHub.
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He revisado
muchos repositorios
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sólo para ver cómo programan.
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No podemos seguir compitiendo
en la investigación sobre el cáncer,
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porque la gente sigue muriendo.
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Debemos trabajar en conjunto
con otros centros de investigación,
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con diferentes especialidades,
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y personas expertas en diferentes áreas.
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(Eric) Será muy emocionante
si estas herramientas llegan
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al punto en que
cualquier persona mayor pueda analizarlas.
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Abririamos la ciencia
y la investigación del cáncer para todos
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lo que sería muy emocionante.
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(Desert) Podría ser que la cura
del cáncer saliera de una computadora.
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Queremos que se unan
en la creación de una herramienta
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que nos podría beneficiar a todos.
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♪ (musica) ♪