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Cím:
Octotales • Fred Hutch
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Leírás:
Das Fred Hutchinson Krebsforschungszentrum bricht die Schranken in der Krebsforschung, indem es seine Daten offen legt. Helf ihnen Oncoscape zu entwickeln auf github.com/fredhutch/oncoscape.
Wie immer, könnt ihr unten gerne eure Kommentare hinterlassen und vergesst nicht unseren Kanal zu abbonieren: http://bit.ly/subgithub
Danke!
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(Desert Horse-Grant)
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Ich glaube, wer am Ende
Krebs heilen wird,
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sind Leute mit guten
Computerkenntnissen.
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Leute mit Programmierkenntnissen,
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können kommen
und Teil dieser Sache sein.
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Und das ist es, was wir wollen,
wir wollen alle miteinbeziehen.
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Wir glauben wirklich, dass
die Lösung gegen Krebs,
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von uns allen kommen muss.
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♪ (Musik) ♪
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(Eric Holland)
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Das Fred Hutchinson
Krebsforschungszentrum
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ist ein Forschungszentrum
in Seattle spezialisiert darauf,
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Krebs zu verstehen und neue
Heilmethoden zu entwickeln,
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für Patienten mit
unheilbaren Krankheiten.
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(Lisa McFerrin) Unser Ziel ist es,
sowohl Krebs zu erforschen,
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als auch Patienten zu behandeln,
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deshalb hat die Gemeinschaft
viele Krankenhäuser,
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aber auch zahlreichen Forscher.
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(Eric) Um auf traditionelle Art
herauszufinden,
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mit welchen Krebstyp
man es zu tun hat,
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schaute man
durch das Mikroskop
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und benannte den Krebs
nach seinem Aussehen.
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Aber nun können wir große
Mengen an DNS entschlüsseln,
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und haben jetzt plötzlich
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große Mengen an digitalen Daten,
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die einen Tumor auf
viel bessere Weise beschreiben,
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als auf Grundlage
des Mikroskops.
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Aber das hat Vor- und Nachteile.
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Es führt dazu,
dass die Datenmenge,
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für jede einzelne Person rießig ist.
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Und alle Informationen müssen
zusammengetragen werden,
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in einer rießigen Datenbank,
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und dann verarbeitet
und visualisiert werden.
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Und deswegen haben wir
ein Team zusammengebracht,
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um dieses Problem anzugehen,
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und wir haben
einige Werkzeuge entwickelt,
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mit denen wir ziemlich
zufrieden sind.
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(Desert) Oncoscape ist eine frei
zugänglichen Webanwendung,
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mit der wir die Informationen
von Krebspatienten nehmen,
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und sie auf einfache Weise
visualisieren,
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sodass Ärzte und Forscher
verstehen,
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was es mit der Krankheit
des Patienten auf sich hat.
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Bezüglich der Disziplinen,
wir haben Krebsbiologen,
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also die Leute,
die den Krebs erforschen,
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und dann haben wir die
Computerexperten,
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und wir wollten ein Werkzeug,
das sie beide anspricht,
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und Wege findet,
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dass sie zusammen
arbeiten können.
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(Jenny Zhang) Meine Arbeit
beinhaltet das "Trockenlabor",
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also die Rechnerseite und
das "Nasslabor",
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wo wir menschliches Gewebe
analysieren,
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also arbeite ich auf beiden Seite.
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Also, das Gewebe ist gefroren,
jetzt lege ich es auf's Trockeneis,
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und ziehe temperaturresistenten
Handschuhe an.
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Computerwissenschaftler schauen
oft nur auf die Daten,
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aber sie wissen gar nicht,
wo sie herkommen.
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Ich habe die Möglichkeit,
mir das Gewebe anzuschauen,
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und wenn die Daten
keinen Sinn ergeben,
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kann ich zurück
zu den Proben gehen.
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Jedes Detail ist wichtig, um Daten
guter Qualität zu erzeugen.
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Es hat viele Vorteile,
auf beiden Seiten zu arbeiten.
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(Eric) Ich arbeite seit 20 Jahren
in dieser Disziplin.
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Ich habe mit diesem
Visualisierungswerkzeug
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mehr über mein Spezialgebiet,
Hirntumore, gelernt,
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als in den ganzen
vorhergehenden Jahren,
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denn mit ihm
schaut man nicht nur,
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auf einen bestimmten Punkt,
der gerade beleuchtet wird.
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Wenn man die
gesamte DNS anschaut,
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ist es so, als würde man,
den gesamten Raum beleuchten,
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man sieht alles,
und alles auf einmal,
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Und dann sieht man Dinge,
die man schon kennt,
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und dann noch ganz viel anderes,
nach dem man nie gesucht hätte,
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aber jetzt hat man es direkt
vor der Nase.
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(Desert) Deshalb wollten wir, dass
Oncoscape frei zugänglich ist,
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denn unser Ziel ist es,
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und war es immer, mit anderen
zusammenzuarbeiten.
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Die Idee kam uns dieses Jahr,
nachdem uns jemand kontaktierte,
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dessen Vater Lungenkrebs hatte,
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und er konnte nur mit seinen
Programmierfähigkeiten helfen,
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und das brachte uns auf die Idee,
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dass Programmierer da draußen,
uns wirklich helfen könnten.
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Und daher dachten wäre, das wäre
ein tolles Project für GitHub,
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so können wir, die Arbeit
der Leute anerkennen
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und ihre Namen verwenden
und sie wirklich feiern,
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feiern, dass sie uns beim Kampf
gegen den Krebs helfen.
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(Lisa) Man muss kein
Experte in Biologie
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oder analytischer Biologie sein.
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Wir wollen Leute, die Experten,
in ihren Disziplinen sind,
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und daher haben wir
"Hilfe gesucht" Aufgaben erstellt,
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für Gebiete, wo wir keine Experten
sind, aber andere vielleicht,
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und wir wollen,
dass unser GitHub Repository
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ein Ort ist, wo alle Leute
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mit ihrem eigenen Wissen,
ihrer eigenen Software,
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ihren eigenen Leistungen
beitragen können.
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(Jenny) Ich weiß,
ich habe so viel
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von der GitHub
Gemeinschaft gelernt.
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Ich habe in viele Repositories
hineingeschaut,
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mir angeschaut,
wie sie coden.
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Wir können in der Krebsforschung
keine Konkurrenten mehr sein,
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denn Menschen sterben,
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also müssen wirklich
zusammenarbeiten,
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mit verschiedenen Krebszentren,
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mit verschiedenen Disziplinen,
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mit Leuten aus
allen möglichen Bereichen.
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(Eric) Es ist eine
wirklich spannende Zeit,
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wenn diese Werkzeuge wirklich
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an einen Punkt kommen,
wo jeder sie verwenden kann,
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und es öffnet die Wissenschaft
und Krebsforschung für alle.
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Und das ist richtig spannend.
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(Desert) Ich weiß nicht, Krebs wird
am Computer geheilt werden.
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Wir wollen, dass Menschen
mit uns zusammen,
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ein Werkzeug entwickeln,
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von dem wir wirklich
alle profitieren.
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♪ (Musik) ♪