Showing Revision 1 created 03/06/2020 by Ninja Katja Horr.

1. Cím:
   Octotales • Fred Hutch
2. Leírás:

   Das Fred Hutchinson Krebsforschungszentrum bricht die Schranken in der Krebsforschung, indem es seine Daten offen legt. Helf ihnen Oncoscape zu entwickeln auf github.com/fredhutch/oncoscape.

   Wie immer, könnt ihr unten gerne eure Kommentare hinterlassen und vergesst nicht unseren Kanal zu abbonieren: http://bit.ly/subgithub

   Danke!

3. 750 0:01 - 0:02
   (Desert Horse-Grant)
4. 1777 0:02 - 0:04
   Ich glaube, wer am Ende
   Krebs heilen wird,
5. 3856 0:04 - 0:07
   sind Leute mit guten
   Computerkenntnissen.
6. 6506 0:07 - 0:08
   Leute mit Programmierkenntnissen,
7. 8236 0:08 - 0:11
   können kommen
   und Teil dieser Sache sein.
8. 11256 0:11 - 0:14
   Und das ist es, was wir wollen,
   wir wollen alle miteinbeziehen.
9. 14303 0:14 - 0:18
   Wir glauben wirklich, dass
   die Lösung gegen Krebs,
10. 17813 0:18 - 0:20
    von uns allen kommen muss.
11. 19663 0:20 - 0:22
    ♪ (Musik) ♪
12. 38481 0:38 - 0:39
    (Eric Holland)
13. 39441 0:39 - 0:41
    Das Fred Hutchinson
    Krebsforschungszentrum
14. 41401 0:41 - 0:46
    ist ein Forschungszentrum
    in Seattle spezialisiert darauf,
15. 45571 0:46 - 0:50
    Krebs zu verstehen und neue
    Heilmethoden zu entwickeln,
16. 49503 0:50 - 0:53
    für Patienten mit
    unheilbaren Krankheiten.
17. 53986 0:54 - 0:57
    (Lisa McFerrin) Unser Ziel ist es,
    sowohl Krebs zu erforschen,
18. 57456 0:57 - 0:59
    als auch Patienten zu behandeln,
19. 59096 0:59 - 1:01
    deshalb hat die Gemeinschaft
    viele Krankenhäuser,
20. 61486 1:01 - 1:04
    aber auch zahlreichen Forscher.
21. 65027 1:05 - 1:07
    (Eric) Um auf traditionelle Art
    herauszufinden,
22. 67287 1:07 - 1:09
    mit welchen Krebstyp
    man es zu tun hat,
23. 69197 1:09 - 1:11
    schaute man
    durch das Mikroskop
24. 70857 1:11 - 1:14
    und benannte den Krebs
    nach seinem Aussehen.
25. 74017 1:14 - 1:19
    Aber nun können wir große
    Mengen an DNS entschlüsseln,
26. 78697 1:19 - 1:20
    und haben jetzt plötzlich
27. 79946 1:20 - 1:22
    große Mengen an digitalen Daten,
28. 82496 1:22 - 1:26
    die einen Tumor auf
    viel bessere Weise beschreiben,
29. 85546 1:26 - 1:27
    als auf Grundlage
    des Mikroskops.
30. 87426 1:27 - 1:29
    Aber das hat Vor- und Nachteile.
31. 89436 1:29 - 1:33
    Es führt dazu,
    dass die Datenmenge,
32. 92756 1:33 - 1:35
    für jede einzelne Person rießig ist.
33. 96489 1:36 - 1:39
    Und alle Informationen müssen
    zusammengetragen werden,
34. 99388 1:39 - 1:41
    in einer rießigen Datenbank,
35. 101468 1:41 - 1:44
    und dann verarbeitet
    und visualisiert werden.
36. 103598 1:44 - 1:46
    Und deswegen haben wir
    ein Team zusammengebracht,
37. 106048 1:46 - 1:47
    um dieses Problem anzugehen,
38. 107468 1:47 - 1:50
    und wir haben
    einige Werkzeuge entwickelt,
39. 110308 1:50 - 1:52
    mit denen wir ziemlich
    zufrieden sind.
40. 113585 1:54 - 1:57
    (Desert) Oncoscape ist eine frei
    zugänglichen Webanwendung,
41. 117025 1:57 - 2:00
    mit der wir die Informationen
    von Krebspatienten nehmen,
42. 119725 2:00 - 2:02
    und sie auf einfache Weise
    visualisieren,
43. 121695 2:02 - 2:04
    sodass Ärzte und Forscher
    verstehen,
44. 123555 2:04 - 2:06
    was es mit der Krankheit
    des Patienten auf sich hat.
45. 126115 2:06 - 2:09
    Bezüglich der Disziplinen,
    wir haben Krebsbiologen,
46. 128866 2:09 - 2:11
    also die Leute,
    die den Krebs erforschen,
47. 130966 2:11 - 2:13
    und dann haben wir die
    Computerexperten,
48. 132976 2:13 - 2:16
    und wir wollten ein Werkzeug,
    das sie beide anspricht,
49. 135776 2:16 - 2:17
    und Wege findet,
50. 137286 2:17 - 2:20
    dass sie zusammen
    arbeiten können.
51. 139566 2:20 - 2:22
    (Jenny Zhang) Meine Arbeit
    beinhaltet das "Trockenlabor",
52. 142366 2:22 - 2:25
    also die Rechnerseite und
    das "Nasslabor",
53. 145056 2:25 - 2:28
    wo wir menschliches Gewebe
    analysieren,
54. 147746 2:28 - 2:30
    also arbeite ich auf beiden Seite.
55. 149676 2:30 - 2:35
    Also, das Gewebe ist gefroren,
    jetzt lege ich es auf's Trockeneis,
56. 155056 2:35 - 2:38
    und ziehe temperaturresistenten
    Handschuhe an.
57. 157532 2:38 - 2:41
    Computerwissenschaftler schauen
    oft nur auf die Daten,
58. 160772 2:41 - 2:44
    aber sie wissen gar nicht,
    wo sie herkommen.
59. 163742 2:44 - 2:47
    Ich habe die Möglichkeit,
    mir das Gewebe anzuschauen,
60. 167112 2:47 - 2:49
    und wenn die Daten
    keinen Sinn ergeben,
61. 169302 2:49 - 2:51
    kann ich zurück
    zu den Proben gehen.
62. 172155 2:52 - 2:56
    Jedes Detail ist wichtig, um Daten
    guter Qualität zu erzeugen.
63. 175865 2:56 - 3:00
    Es hat viele Vorteile,
    auf beiden Seiten zu arbeiten.
64. 180221 3:00 - 3:03
    (Eric) Ich arbeite seit 20 Jahren
    in dieser Disziplin.
65. 182811 3:03 - 3:06
    Ich habe mit diesem
    Visualisierungswerkzeug
66. 185691 3:06 - 3:10
    mehr über mein Spezialgebiet,
    Hirntumore, gelernt,
67. 189806 3:10 - 3:13
    als in den ganzen
    vorhergehenden Jahren,
68. 193292 3:13 - 3:15
    denn mit ihm
    schaut man nicht nur,
69. 195230 3:15 - 3:19
    auf einen bestimmten Punkt,
    der gerade beleuchtet wird.
70. 199345 3:19 - 3:22
    Wenn man die
    gesamte DNS anschaut,
71. 201875 3:22 - 3:25
    ist es so, als würde man,
    den gesamten Raum beleuchten,
72. 204545 3:25 - 3:26
    man sieht alles,
    und alles auf einmal,
73. 206475 3:26 - 3:29
    Und dann sieht man Dinge,
    die man schon kennt,
74. 208715 3:29 - 3:32
    und dann noch ganz viel anderes,
    nach dem man nie gesucht hätte,
75. 211805 3:32 - 3:34
    aber jetzt hat man es direkt
    vor der Nase.
76. 216102 3:36 - 3:39
    (Desert) Deshalb wollten wir, dass
    Oncoscape frei zugänglich ist,
77. 219292 3:39 - 3:41
    denn unser Ziel ist es,
78. 220552 3:41 - 3:43
    und war es immer, mit anderen
    zusammenzuarbeiten.
79. 223382 3:43 - 3:47
    Die Idee kam uns dieses Jahr,
    nachdem uns jemand kontaktierte,
80. 226652 3:47 - 3:49
    dessen Vater Lungenkrebs hatte,
81. 228952 3:49 - 3:52
    und er konnte nur mit seinen
    Programmierfähigkeiten helfen,
82. 232052 3:52 - 3:54
    und das brachte uns auf die Idee,
83. 234152 3:54 - 3:57
    dass Programmierer da draußen,
    uns wirklich helfen könnten.
84. 237192 3:57 - 4:00
    Und daher dachten wäre, das wäre
    ein tolles Project für GitHub,
85. 240282 4:00 - 4:03
    so können wir, die Arbeit
    der Leute anerkennen
86. 242772 4:03 - 4:05
    und ihre Namen verwenden
    und sie wirklich feiern,
87. 245262 4:05 - 4:08
    feiern, dass sie uns beim Kampf
    gegen den Krebs helfen.
88. 249354 4:09 - 4:12
    (Lisa) Man muss kein
    Experte in Biologie
89. 252494 4:12 - 4:15
    oder analytischer Biologie sein.
90. 254654 4:15 - 4:18
    Wir wollen Leute, die Experten,
    in ihren Disziplinen sind,
91. 257990 4:18 - 4:21
    und daher haben wir
    "Hilfe gesucht" Aufgaben erstellt,
92. 260750 4:21 - 4:25
    für Gebiete, wo wir keine Experten
    sind, aber andere vielleicht,
93. 265256 4:25 - 4:28
    und wir wollen,
    dass unser GitHub Repository
94. 267646 4:28 - 4:30
    ein Ort ist, wo alle Leute
95. 269712 4:30 - 4:32
    mit ihrem eigenen Wissen,
    ihrer eigenen Software,
96. 272106 4:32 - 4:34
    ihren eigenen Leistungen
    beitragen können.
97. 274181 4:34 - 4:36
    (Jenny) Ich weiß,
    ich habe so viel
98. 275992 4:36 - 4:39
    von der GitHub
    Gemeinschaft gelernt.
99. 279396 4:39 - 4:42
    Ich habe in viele Repositories
    hineingeschaut,
100. 282456 4:42 - 4:44
     mir angeschaut,
     wie sie coden.
101. 284036 4:44 - 4:48
     Wir können in der Krebsforschung
     keine Konkurrenten mehr sein,
102. 288416 4:48 - 4:50
     denn Menschen sterben,
103. 290718 4:51 - 4:53
     also müssen wirklich
     zusammenarbeiten,
104. 293070 4:53 - 4:55
     mit verschiedenen Krebszentren,
105. 295180 4:55 - 4:57
     mit verschiedenen Disziplinen,
106. 296868 4:57 - 4:59
     mit Leuten aus
     allen möglichen Bereichen.
107. 299538 5:00 - 5:02
     (Eric) Es ist eine
     wirklich spannende Zeit,
108. 301669 5:02 - 5:03
     wenn diese Werkzeuge wirklich
109. 303299 5:03 - 5:08
     an einen Punkt kommen,
     wo jeder sie verwenden kann,
110. 308199 5:08 - 5:12
     und es öffnet die Wissenschaft
     und Krebsforschung für alle.
111. 311912 5:12 - 5:14
     Und das ist richtig spannend.
112. 314123 5:14 - 5:18
     (Desert) Ich weiß nicht, Krebs wird
     am Computer geheilt werden.
113. 318163 5:18 - 5:20
     Wir wollen, dass Menschen
     mit uns zusammen,
114. 320321 5:20 - 5:22
     ein Werkzeug entwickeln,
115. 321541 5:22 - 5:23
     von dem wir wirklich
     alle profitieren.
116. 323361 5:23 - 5:26
     ♪ (Musik) ♪