YouTube

Teniu un compte YouTube?

New: enable viewer-created translations and captions on your YouTube channel!

Russian subtítols

← Раскрываем тайны ДНК: Центр сравнительной геномики (CCG)

Obtén el codi d'incrustació
26 llengües

Showing Revision 13 created 02/10/2018 by Tatiana Nikitina.

  1. ♪ (играет музыка) ♪
  2. Вероятно, больше всего меня привлекала
    возможность найти ответы
  3. на те давние вопросы,
    которые появились у меня ещё в детстве.
  4. Эволюционная биология помогает нам
    понять окружающую нас природу.
  5. Прежде и более всего меня интересуют
    эволюционные вопросы.
  6. Мне интересно то биоразнообразие,
    которое мы наблюдаем на Земле.
  7. Всё, от определения видов и до
    решения сложных эволюционных вопросов,
  8. можно проводить с помощью ДНК,
  9. и центр сравнительной геномики CCG
    предоставляет для этого всё необходимое.
  10. Так что когда кто-то выезжает
    ловить птиц, рептилий, да кого угодно,
  11. они приносят их в лабораторию
    и здесь выделяют ДНК.
  12. Очищают ДНК и отделяют от ДНК
    все составляющие части клетки,
  13. и вот у нас очищенная ДНК.
  14. Когда у вас есть очищенная ДНК,
    с ней можно работать.
  15. Можно секвенировать определённый ген
    у разных организмов
  16. и затем сравнить их друг с другом
    и выяснить эволюционную историю,
  17. или построить «фамильное древо»
    для генов и видов живых организмов.
  18. В последние 30 лет
    основная платформа для секвенирования —
  19. это секвенирование по Сэнгеру.
  20. Используя этот метод, мы изучаем
    по одному фрагменту генома за раз.
  21. Методы секвенирования нового поколения
  22. позволяют получать намного больше данных,
  23. так как мы можем параллельно вести
    секвенирование многих фрагментов.
  24. Вот прибор для секвенирования MiSeq,
  25. и он позволяет получать 25 миллионов
    последовательностей за один цикл.
  26. Недавно появился метод секвенирования
    третьего поколения.
  27. Вот устройство Oxford Nanopore MinION.
  28. Считывая эти электрические сигналы,
    мы можем прочитать последовательность ДНК.
  29. И он помещается у меня в кармане.
    Это поразительно.
  30. (смеётся)
  31. Мэтт Ван Дэм с помощью этой новой
    технологии изучает долгоносиков,
  32. пытаясь выяснить их эволюционную историю.
  33. Долгоносики — это отдельное
    семейство жуков.
  34. Одна из трудностей при сборке генома —
  35. это то, что информация находится
    в маленьких фрагментах.
  36. И поэтому иногда соединить их
  37. правильным образом крайне сложно.
  38. Nanopore довольно хорошо справляется
    с этими более длинными фрагментами.
  39. Наши коллеги здесь, в Академии,
    секвенируют
  40. полный геном рыбки под названием
    центропиг херувим,
  41. то есть, секвенируют все хромосомы,
  42. всю ДНК митохондрий — всё.
  43. Это захватывающий проект.
  44. Лорен пытается выяснить,
    какие гены активны, или «включены»,
  45. и какие комбинации могут образовывать
  46. эти различные гены
    при их включении и выключении.
  47. Самое поразительное,
    что мы пока охарактеризовали
  48. всего примерно 1% ядов скорпионов.
  49. У одного отдельного скорпиона может быть
  50. 150 уникальных типов яда
    в его ядовитой железе.
  51. И у него имеются гены
    для создания всех этих различных ядов,
  52. и эти яды очень индивидуальны.
  53. Сейчас активно изучают применение
    яда скорпионов для лечения рака,
  54. для лечения артрита, рассеянного склероза.
  55. Она использует такой подход как RNA-Seq,
    или транскриптомика,
  56. при котором секвенируют все белки,
  57. что позволяет избежать
    секвенирования всего генома,
  58. и можно сосредоточиться
    только на РНК, которая дает белки.
  59. Я уже много лет
  60. участвую в проекте
    изучения морских коньков.
  61. Мы пытаемся разобраться в этой
    очень сложной группе рыб.
  62. Они, видимо, очень быстро эволюционировали
    и создали множество разных форм:
  63. есть морские коньки, морская игла,
    морские коньки-тряпичники,
  64. все эти причудливо выглядящие рыбы,
    и никто не знает, какие между ними связи,
  65. потому что они эволюционировали
    и разошлись очень быстро,
  66. за очень короткий период времени.
  67. Мы используем новую технологию под
    названием ультра-консервативные элементы.
  68. Это части генома,
    которые остаются неизменными
  69. на протяжении сотен миллионов лет,
    и их используют для восстановления ветвей.
  70. Среди наших экспонатов много амфибий,
    и когда мы их привозим,
  71. нам нужно убедиться,
    что мы не заразим
  72. хитридиевыми грибами остальных амфибий.
  73. Если сразу посадить их
    к другим обитателям выставки,
  74. они могут все погибнуть.
  75. Фактически, мы создаём зонды,
    то есть, кусочки ДНК,
  76. которые соединяются с уникальными
    маркёрами хитридиевых грибов.
  77. Если зонд присоединится,
    ясно, что грибок есть.
  78. Если не присоединится,
    то можно быть уверенным
  79. в отсутствии грибковой инфекции.
  80. Я полагаю, что роль центра CCG —
    помогать всем учёным
  81. в поиске ответов на их вопросы,
    а существует очень мало вопросов,
  82. на которые можно ответить,
    не используя генетические данные.
  83. У нас десятилетиями
    накапливается информация
  84. от учёных и натуралистов,
    которые хранят эту информацию
  85. в наших коллекциях вместе с очень
    хорошими экологическими данными,
  86. служащими ей дополнением.
  87. Очень важно, что у нас есть возможность
    получать такие знания.
  88. ♪ (играет музыка) ♪