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← Déverrouiller l'ADN : Le Centre de la Génomique Comparative

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26 llengües

Showing Revision 2 created 01/27/2019 by Malika Azaroual.

  1. ♪ (musique) ♪
  2. La partie la plus attrayante pour moi a
    probablement été de répondre
  3. à ces questions de longue date que j'ai
    depuis mon enfance.
  4. La biologie évolutionnaire nous aide à
    comprendre la nature qui nous entoure.
  5. Avant toute chose, je m'intéresse aux
    questions évolutives.
  6. Je suis très intéressée par
    la biodiversité que nous voyons sur Terre.
  7. Tout de l'identification des espèces aux
    questions évolutives profondes
  8. peut être abordé avec l'ADN,
  9. et le CCG fournit toutes
    les ressources nécessaires.
  10. Donc si quelqu'un collecte des oiseaux
    ou reptiles ou autres,
  11. il les ramène au labo
    et en extrait l'ADN.
  12. Il purifie l'ADN et sépare tout
    le matériel cellulaire de l'ADN,
  13. et on a de l'ADN pur.
  14. Une fois qu'on a de l'ADN pur,
    on peut en faire plein de choses.
  15. On peut séquencer ce gène
    pour divers organismes
  16. et les comparer les uns aux autres,
    et construire une histoire évolutive
  17. ou un "arbre généalogique"
    pour les gènes et les espèces.
  18. La principale plateforme pour le
    séquençage ces 30 dernières années
  19. est le séquençage Sanger.
  20. Avec cette méthode, on regarde
    une portion du génome à la fois.
  21. Avec les méthodes de séquençage nouvelle
    génération,
  22. les données qu'on a sont
    grandement augmentées
  23. parce qu'on peut faire plusieurs
    séquençages en parallèle.
  24. On a ici la machine de séquençage MiSeq
  25. et on peut produire 25 millions de
    séquences en un passage.
  26. Plus récemment, il y a un séquençage
    de 3ème génération.
  27. Ici, on a une machine
    Oxford Nanopore MinION.
  28. Donc en lisant ces signaux électriques,
    on est capable de lire l'ADN.
  29. Ça tient dans ma poche. C'est génial.
  30. (Rires)
  31. Matt Van Dam travaille actuellement sur
    des charançons avec cette technologie
  32. pour essayer de comprendre
    l'histoire évolutive des charançons.
  33. Les charançons sont une famille
    particulière de coléoptères.
  34. Un des problèmes de
    l'assemblage du génome
  35. c'est qu'on a tous
    ces fragments d'information.
  36. Et parfois, les assembler
    de la bonne manière
  37. s'avère très compliqué.
  38. Le Nanopore s'en sort plutôt bien pour
    ces lectures plus longues.
  39. On a un groupe ici à l'Académie
    qui séquence
  40. le génome complet du
    poisson-ange nain à tête jaune,
  41. et ça inclut tous les chromosomes,
  42. toutes les mitochondries,
    et tout le reste.
  43. C'est un travail très excitant.
  44. Lauren essaye de déterminer les gènes
    qui sont actifs ou qui s'activent
  45. et quel type de combinaisons
    peut être produite
  46. par l'activation et la désactivation
    de ces différents gènes.
  47. Une des choses les plus folles est
    qu'on a caractérisé
  48. uniquement 1% des venins de scorpions.
  49. Un même scorpion peut avoir
  50. 150 types de venin uniques
    dans sa glande à venin.
  51. Et il a des gènes qui créent tous ces
    venins différents,
  52. et ces venins sont
    hautement spécifiques.
  53. Il y a de la recherche active sur
    l'utilisation de venin de scorpion
  54. pour traiter le cancer,
  55. pour traiter l'arthrite,
    la sclérose en plaques.
  56. Donc elle utilise ce qu'on appelle
    le RNA-Seq ou la transcriptomique,
  57. et ce qu'on fait c'est qu'on
    séquence toutes les protéines.
  58. C'est une façon d'éviter de séquencer
    tout le génome
  59. et de se focaliser uniquement sur l'ARN
    qui produit les protéines.
  60. Le projet Hippocampe, j'y étais
    impliqué plusieurs années.
  61. On essayait de comprendre ce groupe
    très complexe.
  62. Apparemment ils ont évolué rapidement
    et ont créé différentes formes,
  63. donc on a des hippocampes, des syngnathes,
    des poissons-dragons,
  64. tous ces poissons à l'aspect sauvage,
    personne ne connait vraiment leur relation
  65. parce qu'ils ont évolué et
    ont divergé très rapidement
  66. et sur une très courte période.
  67. On utilise une nouvelle technologie
    appelée "éléments ultra-conservés",
  68. ce sont des parties du génome qui
    n'ont pas changé
  69. au cours des centaines de millions
    d'années pour reconstruire ces branches.
  70. Nos expositions ont beaucoup d'amphibiens
    donc quand on en ramène,
  71. on doit s'assurer qu'on ne répand pas
  72. le champignon chytride
    à nos autres amphibiens.
  73. Si on le mettait avec
    le reste des expositions,
  74. ils mourraient probablement tous.
  75. On créée essentiellement ces sondes,
    qui sont des portions d'ADN
  76. qui correspondent à ces marqueurs uniques
    du champignon chytride.
  77. Si la sonde correspond,
    on sait qu'il a ce champignon
  78. S'il n'y a pas de concordance, on sait
    qu'il n'y a pas d'infections fongiques.
  79. Je pense que le rôle du CCG est d'aider
    chaque scientifique
  80. à répondre à ses questions,
    et il y a très peu de questions
  81. qu'on peut aborder
    sans données génétiques.
  82. On a toute ces informations qui ont
    été accumulées pendant des décennies
  83. par des scientifiques et des naturalistes,
    et ils les déposent
  84. dans notre collection avec de très bonnes
    données écologiques associées.
  85. Il est très important qu'on puisse aussi
    révéler ce savoir.
  86. ♪ (musique) ♪