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← Unlocking DNA: The Center for Comparative Genomics

Obtén el codi d'incrustació
26 llengües

Showing Revision 5 created 03/01/2018 by Nuridiaz.

  1. ♪ (música) ♪
  2. Quizá lo que más me atrajo fue contestar a
  3. esas preguntas que he tenido desde niño.
  4. La biología evolutiva nos ayuda a
    entender la naturaleza que nos rodea.
  5. Ante todo me interesan
    las cuestiones evolutivas.
  6. Me interesa mucho la biodiversidad
    que vemos en la Tierra.
  7. Todo, desde la identificación de especies,
    a las cuestiones evolutivas más profundas
  8. se pueden abordar con el ADN
  9. y el CCG proporciona todos
    los recursos necesarios.
  10. Si alguien está por ahí recogiendo
    muestras de aves o reptiles,
  11. lo trae al laboratorio y le extrae el ADN.
  12. El cuál se purifica y se separa de
    todo el material celular
  13. y se obtiene así el ADN puro.
  14. Una vez que lo tienes, puedes hacer
    todo tipo de cosas con él
  15. Se puede secuenciar ese gen para
    muchos organismos
  16. para luego compararlos entre sí
    y construir una historia evolutiva
  17. o «árbol genealógico» para los
    genes y las especies.
  18. La plataforma principal para secuenciar
    de los últimos 30 años
  19. ha sido el método de secuenciación
    de Sanger,
  20. el cuál nos permite observar distintas
    secciones del genoma una por una.
  21. Con el método de secuenciación
    de alto rendimiento,
  22. los datos que obtenemos son
    muchos más, ya que
  23. se pueden hacer varias
    secuenciaciones en paralelo.
  24. Este es el dispositivo de secuenciación
    MiSeq
  25. que puede producir 25 millones
    de secuencias en una sola lectura.
  26. Hoy en día, existe una tercera generación
    de secuenciadores.
  27. Este de aquí es el Oxford Nanopore MinIon
  28. que analiza las señales eléctricas y así
    somos capaces de leer el ADN
  29. Me cabe en el bolsillo. Es increíble.
  30. (risas)
  31. Matt Van Dam está trabajando con gorgojos
    usando esta nueva tecnología
  32. para tratar de entender la historia
    evolutiva de estos insectos.
  33. Los gorgojos son parte de la familia
    de los escarabajos.
  34. Un problema al ensamblar genomas
  35. es que tienes todos estos
    trocitos de información,
  36. y, a menudo, juntarlos de nuevo
  37. en el orden correctos es
    extremadamente complicado.
  38. El Nanopore funciona bastante bien
    para las lecturas más largas.
  39. Un grupo aquí en la Academia
    está secuenciando
  40. el genoma completo del pez ángel pigmeo
  41. eso incluye todos los cromosomas,
  42. las miticondrias y demás.
  43. Es algo muy interesante
  44. Lauren está intentando ver qué
    genes están activos o encendidos
  45. y qué tipo de combinaciones se puede hacer
  46. con los genes, activándolos
    o desactivándolos.
  47. Una cosa asombrosa es que
    solo hemos conseguido caracterizar
  48. cerca de un 1% de los venenos
    de los escorpiones.
  49. Un sólo escorpión puede tener
  50. 150 tipos únicos de veneno en la glándula
    donde lo almacena.
  51. Y por eso, tiene genes para
    crear distintos tipos de veneno,
  52. los cuales son extremadamente específicos.
  53. Hay una investigación en activo
    que trata de usar veneno de escorpión
  54. para tratar el cáncer,
    artrítis y esclerósis múltiple.
  55. Ella esta usando el RNA-Seq
    o transcriptonomía,
  56. lo que haces es secuenciar
    todas las proteínas,
  57. es una manera de evitar secuenciar
    todo el genoma
  58. y así poder centrarse solo en el RNA
    que es el que produce proteínas.
  59. El proyecto Hipocampo es algo
  60. en lo que llevo muchos años
    involucrado
  61. Hemos estado tratando de entender
    este grupo extremadamente complejo,
  62. Aparentemente han evolucionado muy deprisa
    y se han creado de diferentes formas,
  63. A sí que tenemos caballitos de mar,
    peces aguja y dragones de agua.
  64. Todos estos peces de aspecto salvaje,
    pero nadie sabe que relación comparten
  65. por que han evolucionado y separado
    muy rápido
  66. en un periodo muy corto de tiempo
  67. Estamos utilizando una nueva tecnología
    llamada elementos ultra conservados
  68. estas son partes del genoma
    que no han cambiado
  69. durante cientos de millones de años
    y han reconstruido esas ramas perdidas.
  70. Nuestras exhibiciones tienen muchos anfibios,
    y cuando los movemos,
  71. tenemos que asegurarnos de no extender
  72. el hongo quitridio al resto de anfibios.
  73. Si los ponemos con el resto que
    están de exposición
  74. probablemente morirían todos
  75. Básicamente creamos unas sondas,
    que son trozos de ADN
  76. que encajen esos marcadores
    con el hongo quitridio.
  77. Si la sonda encaja,
    entonces tiene el hongo.
  78. Si no hay coincidencia, podemos estar
    bastante seguros
  79. de que no hay infección fúngica
  80. Creo que el papel del CCG
    es ayudar a los científicos
  81. a contestar sus preguntas,
    y existen muy pocas
  82. que se puedan abordar sin datos genéticos.
  83. Tenemos acceso a toda la información
    que se ha acumulado durante décadas
  84. por científicos y naturalistas. y que están depositando
  85. en nuestra colección
    con muy buenos datos ecológicos
  86. que están asociados con esto.
  87. Es muy importante que podamos
    desbloquear ese conocimiento.
  88. ♪ (música) ♪