Greek subtítols

← Ξεκλειδώνοντας το DNA: Το Κέντρο για Συγκριτική Γονιδιωματική

Πως το Κέντρο για Συγκριτική Γονιδιωματική αποκαλύπτει τα μυστικά του DNA, βοηθώντας μας να καταλάβουμε την επαναστατική βιολογία και την πιθανή της επίδραση για νέες ιατρικές εφαρμογές.

Obtén el codi d'incrustació
27 llengües

Showing Revision 2 created 04/15/2020 by Kalliope Kountourogianni.

  1. (μουσική)
  2. Πιθανά το πιο ελκυστικό
    μέρος για μένα ήταν
  3. το να απαντώ σε μακροχρόνιες ερωτήσεις
    που είχα από παιδί.
  4. Η επαναστατική βιολογία μας βοηθά
    να καταλάβουμε την φύση γύρω μας.
  5. Πρώτα από όλα, ενδιαφέρομαι
    για επαναστατικές ερωτήσεις.
  6. Ενδιαφέρομαι πολύ για την βιοποικιλότητα
    που έχουμε στη Γη.
  7. Τα πάντα από ταυτοποίηση ειδών σε βαθειές επαναστατικές ερωτήσεις
  8. που μπορούν να αντιμετωπιστούν
    με το DNA
  9. και το CCG προμηθεύει όλες
    τις απαιτούμενες πηγές
  10. Έτσι αν κάποιος μαζεύει πουλιά
    ή ερπετά ή οτιδήποτε,
  11. τα φέρνουν στο εργαστήριο
    και εξάγουν το DNA,
  12. Καθαρίζουν το DNA, ξεχωρίζουν
    όλο το κυτταρικό υλικό από αυτό,
  13. και μετά έχουμε καθαρό DNA.
  14. Από τη στιγμή που έχεις καθαρό DNA,
    μπορείς να κάνεις οτιδήποτε με αυτό.
  15. Μπορείς να κάνεις αλληλουχία του γονιδίου
    για πολλούς διαφορετικούς οργανισμούς,
  16. μετά να τα συγκρίνεις μεταξύ τους
    και να χτίσεις μία επαναστατική ιστορία,
  17. ή ενα «οικογενειακό δέντρο»
    για τα γονίδια και τα είδη.
  18. Τα τελευταία 30 χρόνια,
  19. η κύρια πλατφόρμα για αλληλουχία,
    είναι η Sanger.
  20. Με αυτή τη μέθοδο βλέπουμε έναν
    τομέα του γονιδίου τη φορά.
  21. Με τις μεθόδους αλληλουχίας
    επόμενης γενιάς,
  22. τα δεδομένα που μπορούμε
    να πάρουμε αυξάνονται μαζικά
  23. επειδή μπορούμε να κάνουμε
    μεγάλη αλληλουχία παράλληλα.
  24. Έχουμε την μηχανή αλληλουχίας Miseq εκεί,
  25. και μπορούμε να παράξουμε 25 εκατομ.
    ακολουθίες με ένα διάβασμα.
  26. Πολύ πρόσφατα υπάρχει μία τρίτη
    γενιά αλληλουχίας.
  27. Εδώ έχουμε μία μηχανή
    Oxford Nanopore MiniOn.
  28. Έτσι, διαβάζοντας τα ηλεκτρικά σήματα,
    μπορούμε να διαβάσουμε το DNA.
  29. Χωράει στη τσέπη μου.
    Είναι φανταστικό.
  30. (Γέλια)
  31. Ο Ματ Βαν Νταμ δουλεύει τώρα σε υφάσματα,
  32. χρησιμοποιώντας νέα τεχνολογία να προσπαθήσει να καταλάβει την επαναστατική τους τεχνολογία.
  33. Τα υφάσματα είναι μία συγκεκριμένη οικογένεια σκαθαριών.
  34. Ένα από τα προβλήματα
    στη συναρμολόγηση γονιδίωματος
  35. είναι ότι έχεις όλα αυτά
    τα μικρά κομμάτια πληροφοριών.
  36. Και μετά, μερικές φορές,
  37. κολλώντας τα μαζί με σωστό τρόπο
    είναι εξαιρετικά πολύπλοκο.
  38. Το Nanopore κάνει αρκετά καλά
    γι'αυτές τις μεγαλύτερες διαβάσεις.
  39. Μια ομάδα από εμάς, στην Ακαδημία,
    κάνει αλληλουχία
  40. το ολοκληρωμένο γονιδίωμα
    του Πυγμαίου Αγγελόψαρου.
  41. Και αυτό συμπεριλαμβάνει όλα τα χρωμοσώματα,
    όλα τα μιτοχόνδρια και τα πάντα.
  42. Είναι πολλή συναρπαστική
    δουλειά.
  43. Η Λώρεν προσπαθεί να δει ποια
    γονίδια είναι ενεργά ή ενεργοποιημένα,
  44. και τι είδους συνδυασμούς μπορεί να παράγει
    από αυτά τα διαφορετικά γονίδια.
  45. όταν είναι ενεργοποιημένα ή όχι.
  46. Ένα από τα πιο τρελά
    πράγματα είναι
  47. πως έχουμε χαρακτηρίσει μόνο
    το 1% των δηλητηρίων του σκορπιού.
  48. Ένα μοναδικός σκορπιός μπορεί να έχει
  49. 150 μοναδικούς τύπους
    δηλητηρίου στον αδένα του.
  50. Και έτσι έχει γονίδια να δημιουργήσουν
    όλα αυτά τα διαφορετικά δηλητήρια,
  51. και αυτά τα δηλητήρια
    είναι πολύ συγκεκριμένα.
  52. Υπάρχει ενεργή έρευνα πάνω στη
    χρήση του δηλητηρίου του σκορπιού
  53. για την θεραπεία του καρκίνου, της αρθρίτιδας, της πολλαπλής σκλήρυνσης.
  54. Έτσι χρησιμοποιεί κάτι που ονομάζεται
    RNA-Seq ή μεταγραφική,
  55. και αυτό που κάνεις είναι
    να ακολουθείς όλες τις πρωτεΐνες.
  56. Αυτός είναι ένας τρόπος να παραλείψεις
    ολόκληρη την ακολουθία του γονιδιώματος
  57. και μπορείς να εστιάσεις απλά στο RNA, που είναι αυτό που παράγει τις πρωτεΐνες.
  58. Έχω ασχοληθεί με το έργο
    ιππόκαμπος για πολλά χρόνια.
  59. Προσπαθούσαμε να καταλάβουμε
    αυτή την πολύπλοκη ομάδα.
  60. Προφανώς εξελίχθηκαν πολύ γρήγορα
    και δημιούργησαν πολλές διαφορετικές μορφές,
  61. έτσι έχουμε ιππόκαμπους,
    θαλάσσιους δράκους,
  62. όλα αυτά τα άγρια σε εμφάνιση ψάρια, και κανείς πραγματικά δεν ξέρει την σχέση τους
  63. επειδή εξελίχθηκαν
    και ακτινοβολήθηκαν ραγδαία
  64. και σε πολύ μικρή χρονική περίοδο.
  65. Χρησιμοποιούμε νέα τεχνολογία που ονομάζεται
    εξαιρετικά-συντηρημένα στοιχεία,
  66. και αυτά τα μέρη των γονιδιωμάτων
    που δεν άλλαξαν
  67. μέσα σε χιλιάδες εκατομμυρίων ετών για την ανοικοδόμηση αυτών των κλάδων.
  68. Τα εκθέματά μας έχουν πολλά αμφίβια,
  69. έτσι όταν τα φέρνουμε μέσα,
    πρέπει να σιγουρευτούμε
  70. ότι δεν διαδίδουμε μύκητα από κυτρίτες
    στους υπόλοιπους.
  71. Αν το βάλουμε μέσα με τα υπόλοιπα εκθέματα,
  72. πιθανόν να πεθάνουν όλα.
  73. Δημιουργούμε αυτούς τους ανιχνευτές,
    που είναι κομμάτια DNA
  74. που ταιριάζουν με αυτούς τους μοναδικούς
    δείκτες στον μύκητα του chytrid.
  75. Εάν ο καθετήρας ταιριάζει,
    ξέρουμε ότι έχει αυτόν τον μύκητα.
  76. Αν δεν ταιριάζει, μπορούμε να σιγουρευτούμε
    ότι δεν υπάρχουν μολύνσεις μύκητα.
  77. Νομίζω ότι ο ρόλος του CCG
  78. είναι να βοηθήσει κάθε επιστήμονα
    να απαντήσει στις ερωτήσεις του.
  79. Και υπάρχουν ερωτήσεις που μπορείς
    να κάνεις χωρίς γενετικά δεδομένα.
  80. Έχουμε όλες αυτές τις πληροφορίες,
    που έχουν συσσωρευτεί για δεκαετίες
  81. από επιστήμονες και φυσιολόγους,
  82. και το καταθέτουν στη συλλογή μας
  83. με πολύ καλά οικολογικά δεδομένα
    που συνδέονται με αυτό.
  84. Είναι πολύ σημαντικό το να μπορούμε
    να ξεκλειδώσουμε αυτή τη γνώση.
  85. (μουσική)