Showing Revision 1 created 02/25/2018 by Carina Dulcic Maximino.

1. Títol:
   Unlocking DNA: The Center for Comparative Genomics
2. Descripció:

3. 404 0:00 - 0:02
   (música)
4. 3320 0:03 - 0:06
   Es Probable que lo que más me atrajo
   fuera responder
5. 6473 0:06 - 0:11
   esas preguntas que me hacía desde chico.
6. 10540 0:11 - 0:14
   La biología evolutiva nos ayuda a entender
   la naturaleza que nos rodea.
7. 15544 0:16 - 0:19
   Más que nada, estoy interesada
   en las cuestiones evolutivas.
8. 18824 0:19 - 0:23
   Me interesa la biodiversidad
   que vemos en la Tierra.
9. 23076 0:23 - 0:27
   Desde la identificación de especies
   hasta preguntas evolutivas complicadas,
10. 27285 0:27 - 0:29
    todo se puede abordar desde el ADN
11. 29017 0:29 - 0:33
    y el CCG brinda los recursos necesarios.
12. 32740 0:33 - 0:37
    Así, si alguien está recolectando aves,
    reptiles o lo que sea,
13. 36880 0:37 - 0:39
    lo trae al laboratorio y extrae el ADN.
14. 39347 0:39 - 0:44
    Purifica el ADN y lo separa del resto
    de los componentes celulares,
15. 43788 0:44 - 0:45
    así obtenemos ADN puro.
16. 45082 0:45 - 0:48
    Obtenido el ADN puro, se puede hacer
    todo tipo de cuestiones.
17. 48273 0:48 - 0:51
    Se puede secuenciar ese gen
    para distintos organismos
18. 50889 0:51 - 0:54
    y luego comparar unos con otros
    para armar una historia evolutiva
19. 54299 0:54 - 0:58
    o un "árbol familiar" para genes
    y especies.
20. 58080 0:58 - 1:02
    La plataforma principal para secuenciar,
    desde hace 30 años,
21. 61565 1:02 - 1:03
    es la secuenciación de Sanger.
22. 63448 1:03 - 1:08
    Con este método, observamos una sección
    del genoma por vez.
23. 69115 1:09 - 1:12
    Con los métodos de secuenciación
    de segunda generación
24. 71680 1:12 - 1:14
    la cantidad de datos obtenidos
    aumenta notablemente
25. 74138 1:14 - 1:17
    porque mucho del trabajo de secuenciación
    puede hacerse en paralelo
26. 76784 1:17 - 1:19
    Con el aparato de secuenciación MiSeq
27. 78775 1:19 - 1:23
    podemos producir 25 millones de secuencias
    de una sola leída.
28. 83785 1:24 - 1:27
    Actualmente, existe una secuenciación
    de tercera generación.
29. 86666 1:27 - 1:31
    Aquí tenemos un secuenciador MinION
    de Oxford Nanopore.
30. 90655 1:31 - 1:35
    Al leer esas señales eléctricas,
    podemos leer el ADN.
31. 95411 1:35 - 1:37
    Cabe en el bolsillo. Es genial.
32. 97173 1:37 - 1:38
    (risa)
33. 99709 1:40 - 1:44
    Matt Van Dam, quien trabaja con gorgojos,
    utiliza esta tecnología
34. 104497 1:44 - 1:48
    para tratar de entender su historia evolutiva.
35. 108090 1:48 - 1:51
    Los gorgojos son una familia particular
    de escarabajos.
36. 110921 1:51 - 1:53
    Un problema del ensamble de genomas
37. 112868 1:53 - 1:56
    es que se tienen pedacitos de información.
38. 115596 1:56 - 1:58
    Y que a veces,
39. 117838 1:58 - 2:01
    juntarlos de forma correcta
    es extremadamente complicado.
40. 121072 2:01 - 2:05
    El Nanopore funciona bastante bien
    con las lecturas más largas.
41. 126040 2:06 - 2:08
    Algunos de nosotros, acá en la Academia,
    estamos secuenciando
42. 128339 2:08 - 2:12
    el genoma completo del pez ángel marino
43. 131682 2:12 - 2:14
    y eso incluye todos los cromosomas,
44. 133522 2:14 - 2:16
    la mitocondria entera y todo.
45. 135594 2:16 - 2:17
    Es un trabajo muy fascinante.
46. 138204 2:18 - 2:23
    Lauren trata de ver
    qué genes están activos o encendidos
47. 143040 2:23 - 2:26
    y qué tipo de combinaciones
    pueden producirse
48. 145544 2:26 - 2:29
    cuando estos genes se encienden o apagan.
49. 148847 2:29 - 2:32
    Lo más loco es que solo caracterizamos
50. 151657 2:32 - 2:34
    el 1% de los venenos de escorpión.
51. 154172 2:34 - 2:37
    Un único escorpión puede tener
52. 156534 2:37 - 2:41
    150 tipos de veneno en su glándula venenosa.
53. 160682 2:41 - 2:44
    Por lo tanto, tiene genes
    para crear todos esos venenos
54. 164380 2:44 - 2:47
    y estos venenos son muy específicos.
55. 166720 2:47 - 2:51
    Se está investigando el uso de veneno
    de escorpión para tratar el cáncer,
56. 171231 2:51 - 2:55
    la artritis, la esclerosis múltiple.
57. 175492 2:55 - 2:59
    Está usando algo llamado
    RNA-Seq o transcriptómica
58. 179089 2:59 - 3:03
    y lo que se hace
    es secuenciar todas las proteínas,
59. 183333 3:03 - 3:06
    es una forma de saltear
    la secuenciación genómica
60. 185797 3:06 - 3:10
    y poder concentrarnos solo en el ARN,
    que es lo que produce las proteínas.
61. 191580 3:12 - 3:13
    El proyecto hipocampo
62. 192951 3:13 - 3:15
    es algo en lo que trabajo hace años.
63. 194916 3:15 - 3:18
    Hemos tratado de entender
    a este grupo complejo.
64. 198356 3:18 - 3:23
    Al parecer, evolucionaron muy rápidamente
    y crearon varias formas,
65. 202597 3:23 - 3:26
    por eso tenemos hipocampos, peces pipa,
    dragones de mar
66. 206430 3:26 - 3:30
    y todos estos peces de aspecto salvaje
    y nadie sabe bien qué relación tienen,
67. 210200 3:30 - 3:34
    porque evolucionaron
    y se dispersaron muy rápido
68. 214312 3:34 - 3:36
    y en un período de tiempo corto.
69. 216191 3:36 - 3:40
    Estamos usando una tecnología nueva
    llamada elementos ultraconservados
70. 219916 3:40 - 3:44
    y estas son partes del genoma
    que no han cambiado
71. 223769 3:44 - 3:48
    durante los cientos de millones de años,
    para poder reconstruir esas ramas.
72. 229371 3:49 - 3:52
    Nuestras muestras tienen muchos anfibios,
    por eso cuando los traemos,
73. 232232 3:52 - 3:55
    debemos asegurarnos de no desperdigar
74. 234577 3:55 - 3:57
    hongo quítrido al resto de los anfibios.
75. 236617 3:57 - 3:59
    Si lo pusiéramos
    con el resto de las muestras,
76. 239052 3:59 - 4:01
    seguramente todos morirían.
77. 241255 4:01 - 4:05
    Básicamente, creamos unas sondas,
    que son partes de ADN
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    que coinciden con marcadores únicos
    del hongo quítrido.
79. 248051 4:08 - 4:10
    Si la sonda coincide, tiene ese hongo.
80. 250110 4:10 - 4:12
    Si no coincide, estamos casi seguros
81. 252043 4:12 - 4:14
    de que no hay infección de hongos.
82. 255248 4:15 - 4:19
    Creo que el rol del CCG
    es ayudar a que cada científico
83. 258709 4:19 - 4:22
    responda sus preguntas
    y hay muy pocas preguntas
84. 262086 4:22 - 4:25
    que se pueden abordar sin datos genéticos.
85. 264924 4:25 - 4:29
    Tenemos tanta información
    que se fue acumulando durante décadas,
86. 268730 4:29 - 4:32
    gracias a científicos y naturalistas
    que la depositan
87. 271572 4:32 - 4:35
    en nuestra colección que incluye
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    datos ecológicos asociados a ella.
89. 276204 4:36 - 4:40
    Es muy importante
    que podamos descifrar ese conocimiento.
90. 279922 4:40 - 4:42
    (música)