WEBVTT 00:00:00.991 --> 00:00:03.317 我早上起床为了两个原因。 00:00:03.341 --> 00:00:07.372 第一,小规模农民家庭 需要更多的粮食。 00:00:07.738 --> 00:00:12.916 2019年,为我们供应粮食的农民们 还要忍饥受饿,简直不可思议。 00:00:13.353 --> 00:00:18.186 第二,科学需要更多元化,更包容。 00:00:18.679 --> 00:00:22.101 如果我们要解决地球上 最艰难的挑战, 00:00:22.125 --> 00:00:26.458 如拯救成千上万地瘠民贫 的粮食短缺, 00:00:26.482 --> 00:00:28.321 就需要我们所有人的共同努力。 NOTE Paragraph 00:00:28.680 --> 00:00:31.260 我要用最先进的科技, 00:00:31.284 --> 00:00:34.577 和地球上最多元化 和包容的团队一起, 00:00:34.601 --> 00:00:36.668 帮助农民们生产更多的粮食。 00:00:37.545 --> 00:00:39.426 我是一位计算生物学家。 00:00:39.450 --> 00:00:42.854 你们可能会好奇,那是什么? 它将如何杜绝饥饿? 00:00:42.878 --> 00:00:46.124 这么说吧,我喜欢计算机和生物学, 00:00:46.148 --> 00:00:48.592 于是它们以某种方式结合 在一起就成了一项工作。 NOTE Paragraph 00:00:48.616 --> 00:00:49.699 (笑声) NOTE Paragraph 00:00:49.723 --> 00:00:51.243 我没有从小 00:00:51.267 --> 00:00:54.553 要成为一个生物学家的故事。 00:00:54.577 --> 00:00:58.283 事实是,我在大学时是打篮球的。 00:00:58.585 --> 00:01:03.728 我一部分的经济来源依赖半工半读。 00:01:04.300 --> 00:01:05.840 突然有一天, 00:01:05.864 --> 00:01:09.061 我漫步到了宿舍 旁边的建筑物, 00:01:09.085 --> 00:01:11.765 那刚好是生物学系。 00:01:12.347 --> 00:01:14.933 我进去看到了招聘告示板。 00:01:15.493 --> 00:01:17.657 是的,那是在还没有互联网的时代。 00:01:18.430 --> 00:01:20.437 我看到了一张明信片大小的卡片, 00:01:20.461 --> 00:01:23.616 招募人员到植物标本室工作。 00:01:24.601 --> 00:01:26.602 我赶紧记下联络号码, 00:01:26.626 --> 00:01:28.331 因为它说"工作时间灵活", 00:01:28.355 --> 00:01:31.612 我需要那个来配合 我的篮球时间表。 00:01:32.204 --> 00:01:36.791 然后我跑去图书馆查 什么是植物标本室。 NOTE Paragraph 00:01:36.815 --> 00:01:39.022 (笑声) NOTE Paragraph 00:01:39.046 --> 00:01:40.355 原来 00:01:40.379 --> 00:01:44.458 植物标本室是来收藏 死了,干了的植物。 00:01:45.379 --> 00:01:47.093 我幸运地被录取了。 00:01:47.117 --> 00:01:50.323 所以我的第一份科学工作 00:01:50.347 --> 00:01:55.682 就是花上几个小时 将枯死的植物粘在纸上。 NOTE Paragraph 00:01:55.706 --> 00:01:58.984 (笑声) NOTE Paragraph 00:01:59.008 --> 00:02:00.158 它是如此的风光啊。 00:02:00.182 --> 00:02:03.321 这就是我如何成为了 计算生物学家。 00:02:04.323 --> 00:02:05.506 在那个时候, 00:02:05.530 --> 00:02:08.252 基因组学和计算学如日方升。 00:02:08.276 --> 00:02:10.680 毕业后我开始攻读结合 00:02:10.704 --> 00:02:13.799 生物学和计算机的硕士。 NOTE Paragraph 00:02:13.823 --> 00:02:14.832 当时, 00:02:14.832 --> 00:02:16.791 我在拉斯阿拉莫斯国家实验室 00:02:16.815 --> 00:02:19.333 理论生物学和生物物理学组工作。 00:02:19.776 --> 00:02:23.506 就在那里,我初次见证了超级计算机, 00:02:23.530 --> 00:02:25.204 真是惊为天人。 00:02:25.840 --> 00:02:27.879 借助超级计算机, 00:02:27.903 --> 00:02:32.126 也就是数千台联网电脑的力量, 00:02:32.150 --> 00:02:37.623 我们能够发现流感病毒 和丙性肝炎的复杂性。 00:02:38.134 --> 00:02:40.465 正是这时候我看到了利用计算机 00:02:40.489 --> 00:02:44.609 和生物学相结合来造福人类的力量。 00:02:44.633 --> 00:02:47.005 我想把这当作终生事业。 00:02:48.030 --> 00:02:49.807 所以,从1999年开始, 00:02:49.831 --> 00:02:52.529 我大部分的科学生涯都在 00:02:52.553 --> 00:02:54.482 非常高科技的实验室里度过, 00:02:54.506 --> 00:02:57.239 周围都是非常昂贵的设备。 NOTE Paragraph 00:02:57.712 --> 00:02:59.355 很多人问我, 00:02:59.379 --> 00:03:03.246 我为什么,又是如何 为非洲的农民工作的。 00:03:03.804 --> 00:03:06.106 由于我的计算技能, 00:03:06.130 --> 00:03:10.669 在2013年,一个东非科学家小组 00:03:10.693 --> 00:03:14.782 邀请我加入拯救木薯的队伍。 00:03:15.766 --> 00:03:22.736 木薯的叶子和根部 能养活全球8亿人, 00:03:23.639 --> 00:03:26.676 有5亿人在东非。 00:03:26.994 --> 00:03:29.001 差不多有十亿人 00:03:29.025 --> 00:03:31.993 依靠这种植物来供应 他们每天的卡路里。 00:03:32.581 --> 00:03:36.426 如果一个小型家庭农场主 有足够的木薯, 00:03:36.450 --> 00:03:38.594 她就可以养活她的家人, 00:03:38.618 --> 00:03:42.664 并在市场上售卖这些木薯, 换取重要的东西,如学费, 00:03:42.688 --> 00:03:44.823 医疗费用和储蓄。 NOTE Paragraph 00:03:45.752 --> 00:03:49.283 但是,木薯的种植在非洲受到了冲击。 00:03:49.665 --> 00:03:54.101 粉虱和病毒在摧毁着木薯。 00:03:54.593 --> 00:03:56.799 粉虱是体型微小的昆虫, 00:03:56.823 --> 00:03:59.641 以超过600种植物的树叶为食。 00:03:59.665 --> 00:04:01.466 它们不请自来, 00:04:01.490 --> 00:04:02.649 有很多种类, 00:04:02.673 --> 00:04:04.942 具有抗药性, 00:04:04.966 --> 00:04:09.220 还能传播数百种植物病毒, 00:04:09.244 --> 00:04:11.768 导致木薯患上棕色条纹病 00:04:11.792 --> 00:04:13.592 和木薯马赛克病。 00:04:14.085 --> 00:04:16.219 这会彻底杀死作物。 00:04:17.038 --> 00:04:18.855 如果没有木薯, 00:04:18.879 --> 00:04:22.878 那数百万人就没有食物或收入。 NOTE Paragraph 00:04:24.141 --> 00:04:26.617 我去了一趟坦桑尼亚, 00:04:26.641 --> 00:04:29.379 意识到那里的妇女需要一些帮助。 00:04:29.403 --> 00:04:33.656 这些了不起的,坚强的, 小型家庭农场主, 00:04:33.680 --> 00:04:34.948 大多数是妇女, 00:04:34.972 --> 00:04:36.239 他们的生活苦不堪言。 00:04:36.744 --> 00:04:39.180 他们没有足够的食物来养活家人, 00:04:39.204 --> 00:04:40.792 这是一场真正的危机。 00:04:41.530 --> 00:04:43.029 现实情况是, 00:04:43.053 --> 00:04:46.045 当雨季来临的时候,她 们到木薯田里耕种。 00:04:46.069 --> 00:04:47.775 九个月之后, 00:04:47.799 --> 00:04:50.879 什么都没有,都是因为 这些害虫和病原体。 00:04:50.903 --> 00:04:53.061 我不禁心想, 00:04:53.085 --> 00:04:56.283 这世界上怎么还有食不果腹的农民呢? NOTE Paragraph 00:04:56.815 --> 00:04:59.135 所以我决定花一段时间在田里, 00:04:59.159 --> 00:05:00.839 跟着农民和科学家们, 00:05:00.863 --> 00:05:03.466 看看我是否有帮得上忙的技能。 00:05:04.427 --> 00:05:07.283 当地局势令人震惊。 00:05:07.307 --> 00:05:11.577 粉虱毁坏树叶为摄取蛋白质, 00:05:11.601 --> 00:05:15.183 病毒摧毁根部为摄取淀粉。 00:05:15.592 --> 00:05:18.037 在整个生长季节过去后, 00:05:18.061 --> 00:05:22.171 农民将失去整整一年 的收入和食物, 00:05:22.195 --> 00:05:25.393 他们的家庭将遭受 一个漫长的饥饿季节。 00:05:25.942 --> 00:05:28.022 这完全是可以预防的。 00:05:28.046 --> 00:05:29.370 如果农民知道 00:05:29.394 --> 00:05:32.458 在她的田里种植什么品种的木薯 00:05:32.482 --> 00:05:36.807 可以抵抗这些病毒和病原体, 00:05:36.831 --> 00:05:38.736 她们就会有更多的食物。 NOTE Paragraph 00:05:38.760 --> 00:05:41.595 我们拥有我们需要的所有科技, 00:05:41.619 --> 00:05:44.823 但这些知识和资源 00:05:44.847 --> 00:05:47.982 在全球的分布非常不均衡。 00:05:48.712 --> 00:05:51.274 我想强调的是, 00:05:51.298 --> 00:05:53.150 传统的基因组技术 00:05:53.174 --> 00:05:56.037 被用于揭露这些害虫和病原体 00:05:56.061 --> 00:05:59.123 的复杂性—— 00:05:59.147 --> 00:06:02.145 这些技术不是为 南非撒哈拉地带而设的。 00:06:03.058 --> 00:06:05.399 它们的花费在一百万美元以上, 00:06:05.423 --> 00:06:07.311 需要不断的电力供应 00:06:07.335 --> 00:06:09.135 和专门的技术人员操作。 00:06:09.970 --> 00:06:12.831 这些机器在非洲大陆上寥寥无几, 00:06:12.855 --> 00:06:17.476 让许多在前线战斗 的科学家不得不 00:06:17.500 --> 00:06:19.499 把样品送到海外。 00:06:19.523 --> 00:06:21.483 当你把样品送到海外时, 00:06:21.507 --> 00:06:24.133 样品会降解,花费很昂贵, 00:06:24.157 --> 00:06:27.324 而且在糟糕的互联网中取回数据 00:06:27.348 --> 00:06:28.748 几乎是不可能的。 00:06:29.142 --> 00:06:33.441 所以有时可能需要六个月 的时间把结果送回农民手里。 00:06:33.465 --> 00:06:35.219 那时已经太晚了。 00:06:35.243 --> 00:06:36.830 作物已经被摧毁, 00:06:36.854 --> 00:06:40.020 造成持续的贫困和更多的饥饿。 NOTE Paragraph 00:06:41.306 --> 00:06:43.464 我们知道我们可以解决这个问题。 00:06:43.989 --> 00:06:45.393 在2017年, 00:06:45.417 --> 00:06:50.203 我们听说了这个叫做 Oxford Nanopore MinION 的 00:06:50.227 --> 00:06:52.736 手持便携式DNA测序仪。 00:06:52.760 --> 00:06:56.913 它曾在西非抗击埃博拉时功不可没。 00:06:56.937 --> 00:06:58.434 因此,我们认为: 00:06:58.458 --> 00:07:01.744 为什么不用这个在东非帮助农民呢? 00:07:01.768 --> 00:07:06.101 于是,我们要做的就是开始着手行动。 00:07:06.609 --> 00:07:09.307 当时,这项科技非常新颖, 00:07:09.331 --> 00:07:12.283 许多人怀疑我们能否在 农地里复制相似的结果。 00:07:12.879 --> 00:07:14.196 当我们开始这样做时, 00:07:14.220 --> 00:07:18.101 我们有个英国的"合作伙伴" 00:07:18.125 --> 00:07:21.752 告诉我们,这永远都不会发生在东非, 00:07:21.776 --> 00:07:23.242 更别说在农田里了。 00:07:23.863 --> 00:07:25.632 因此,我们接受了挑战。 00:07:25.934 --> 00:07:32.387 这个人甚至和我们打赌 两瓶最好的香槟, 00:07:32.411 --> 00:07:35.369 说我们永远不会实现的。 00:07:36.871 --> 00:07:38.450 三个字: 00:07:38.474 --> 00:07:39.625 买单吧。 NOTE Paragraph 00:07:39.649 --> 00:07:41.823 (笑声) NOTE Paragraph 00:07:41.847 --> 00:07:45.999 (掌声) NOTE Paragraph 00:07:46.023 --> 00:07:48.936 买单吧,因为我们做到了。 00:07:48.960 --> 00:07:52.245 我们把整个高科技分子实验室 00:07:52.269 --> 00:07:55.918 带给了坦桑尼亚,肯尼亚 和乌干达的农民们, 00:07:55.942 --> 00:07:57.974 我们称它为"树实验室"。 00:07:58.942 --> 00:08:00.133 那我们做了什么? 00:08:00.157 --> 00:08:02.736 首先我们给自己取了一个队名—— 00:08:02.760 --> 00:08:04.934 叫做木薯病毒行动项目。 00:08:04.958 --> 00:08:06.315 我们制作了一个网站, 00:08:06.339 --> 00:08:09.950 从基因组学和计算社区中召集支持, 00:08:09.974 --> 00:08:11.855 然后去农民那里。 00:08:12.411 --> 00:08:15.220 "树实验室"所需的一切 00:08:15.244 --> 00:08:17.653 由团队携带着来到这里。 00:08:17.677 --> 00:08:21.724 所有分子和计算学需要用来 00:08:21.748 --> 00:08:25.049 诊断植物病理的条件都准备就绪了。 00:08:25.431 --> 00:08:28.259 实际上,所有这些 全都在这个舞台上。 NOTE Paragraph 00:08:29.161 --> 00:08:32.748 我们认为,如果我们能 使数据更贴近问题, 00:08:32.772 --> 00:08:34.390 更贴近农民, 00:08:34.414 --> 00:08:37.770 我们就能更快地判断 她的植物出了什么问题。 00:08:38.169 --> 00:08:40.042 不仅能诊断出问题—— 00:08:40.066 --> 00:08:41.458 还能给她解决方案。 00:08:41.482 --> 00:08:42.807 解决办法就是, 00:08:42.831 --> 00:08:45.454 烧掉那片田地,并种上 00:08:45.478 --> 00:08:48.982 对害虫和病原体具有 抵抗力的植物品种。 00:08:49.942 --> 00:08:54.146 所以,我们必须做的第一件事 是进行DNA提取。 00:08:54.170 --> 00:08:56.709 我们在这里用的是这台机器, 00:08:57.050 --> 00:09:00.249 叫做"PDQeX", 00:09:00.273 --> 00:09:04.164 代表“死快死快的提取"。 NOTE Paragraph 00:09:04.188 --> 00:09:06.236 (笑声) NOTE Paragraph 00:09:06.260 --> 00:09:07.410 有意思吧。 00:09:07.768 --> 00:09:10.262 我的朋友乔真的很酷。 00:09:11.394 --> 00:09:14.754 最大的挑战之一是进行DNA提取, 00:09:14.778 --> 00:09:18.093 它通常需要非常昂贵的设备, 00:09:18.117 --> 00:09:19.521 需要几个小时。 00:09:19.545 --> 00:09:21.037 但是有了这台机器, 00:09:21.061 --> 00:09:23.815 我们在二十分钟内就能完成, 00:09:23.839 --> 00:09:25.085 而且成本低廉, 00:09:25.109 --> 00:09:27.997 只需要摩托车的电池供电。 NOTE Paragraph 00:09:29.164 --> 00:09:34.307 我们将提取的DNA存入序列库, 00:09:34.331 --> 00:09:36.110 准备加载到 00:09:36.134 --> 00:09:40.426 这个便携式手持基因组测序仪中, 00:09:40.450 --> 00:09:41.505 就是这个装置, 00:09:41.505 --> 00:09:45.363 然后我们将它连上一台 微型超级计算机, 00:09:45.387 --> 00:09:47.209 称为" MinIT"。 00:09:47.728 --> 00:09:51.830 这两个装置由便携式电池供电。 00:09:52.569 --> 00:09:54.442 这样一来,我们就能够排除 00:09:54.466 --> 00:09:56.871 对主要电源和互联网的依赖, 00:09:56.895 --> 00:10:00.823 这两者是一个小型家庭农场 运作的局限因素。 00:10:01.807 --> 00:10:04.678 快速分析数据也可能是个问题。 00:10:05.033 --> 00:10:08.939 但是,我这位计算生物学家 的存在派上了用场。 00:10:09.382 --> 00:10:11.612 所有枯死植物的标本, 00:10:11.636 --> 00:10:13.196 所有的测量, 00:10:13.220 --> 00:10:15.212 和所有的计算, 00:10:15.236 --> 00:10:19.387 终于在现实世界中 以实时方式派上用场了。 00:10:19.411 --> 00:10:22.464 我能够定制数据库, 00:10:22.488 --> 00:10:27.083 在三小时内给农民结果, 00:10:27.107 --> 00:10:28.971 而不是六个月。 NOTE Paragraph 00:10:29.694 --> 00:10:36.662 (掌声) NOTE Paragraph 00:10:38.085 --> 00:10:40.719 农民们欣喜若狂。 00:10:41.799 --> 00:10:44.595 那么我们又怎么知道 我们的策略产生了影响呢? 00:10:44.619 --> 00:10:46.619 "树实验室"之后的九个月, 00:10:46.643 --> 00:10:49.873 阿莎的收获从每公顷零吨木薯 00:10:49.897 --> 00:10:51.905 上升到了每公顷40吨木薯。 00:10:51.929 --> 00:10:53.728 她有足够的粮食养活她的家人, 00:10:53.752 --> 00:10:56.442 还有多余在市场上售卖, 00:10:56.466 --> 00:10:59.201 现在,她已经能够为家人盖房子了。 00:11:00.212 --> 00:11:01.371 是的,太酷了。 NOTE Paragraph 00:11:01.395 --> 00:11:05.649 (掌声) NOTE Paragraph 00:11:05.673 --> 00:11:07.539 那么,我们如何扩展"树实验室"呢? 00:11:07.940 --> 00:11:09.320 事实上, 00:11:09.344 --> 00:11:11.447 农民在非洲已颇具规模。 00:11:11.471 --> 00:11:13.360 这些妇女以团体为单位进行劳作, 00:11:13.384 --> 00:11:17.510 所以帮助阿莎,实际上就 帮助了她村子里的3000人, 00:11:17.534 --> 00:11:21.186 因为她分享了结果以及解决方案。 NOTE Paragraph 00:11:21.673 --> 00:11:25.864 我记得我见过的每一个农民。 00:11:26.665 --> 00:11:30.228 他们的痛苦和喜悦 00:11:30.252 --> 00:11:32.052 深深的刻在我的记忆中。 00:11:32.958 --> 00:11:34.823 我们的科学是为他们而进行的。 00:11:35.711 --> 00:11:40.758 "树实验室"是我们在帮助他们 提升食品安全方面最好的尝试。 00:11:41.180 --> 00:11:42.966 我从未梦想过 00:11:42.990 --> 00:11:45.934 我一生中做过最好的科学实验 00:11:45.958 --> 00:11:49.457 会在东非的毯子上, 00:11:49.481 --> 00:11:51.847 用最先进的基因组工具包。 00:11:52.312 --> 00:11:54.764 但我们的团队确实梦想过 00:11:54.788 --> 00:11:59.058 在三小时内给农民答案, 而不再需要六个月, 00:11:59.082 --> 00:12:00.518 然后我们做到了。 00:12:00.542 --> 00:12:04.650 因为那是科学多元化和包容性的力量。 NOTE Paragraph 00:12:05.156 --> 00:12:06.307 谢谢。 NOTE Paragraph 00:12:06.331 --> 00:12:09.482 (掌声) NOTE Paragraph 00:12:09.506 --> 00:12:13.589 (欢呼声)