1 00:00:00,991 --> 00:00:03,317 我早上起床为了两个原因。 2 00:00:03,341 --> 00:00:07,372 第一,小规模农民家庭 需要更多的粮食。 3 00:00:07,738 --> 00:00:12,916 2019年,为我们供应粮食的农民们 还要忍饥受饿,简直不可思议。 4 00:00:13,353 --> 00:00:18,186 第二,科学需要更多元化,更包容。 5 00:00:18,679 --> 00:00:22,101 如果我们要解决地球上 最艰难的挑战, 6 00:00:22,125 --> 00:00:26,458 如拯救成千上万地瘠民贫 的粮食短缺, 7 00:00:26,482 --> 00:00:28,321 就需要我们所有人的共同努力。 8 00:00:28,680 --> 00:00:31,260 我要用最先进的科技, 9 00:00:31,284 --> 00:00:34,577 和地球上最多元化 和包容的团队一起, 10 00:00:34,601 --> 00:00:36,668 帮助农民们生产更多的粮食。 11 00:00:37,545 --> 00:00:39,426 我是一位计算生物学家。 12 00:00:39,450 --> 00:00:42,854 你们可能会好奇,那是什么? 它将如何杜绝饥饿? 13 00:00:42,878 --> 00:00:46,124 这么说吧,我喜欢计算机和生物学, 14 00:00:46,148 --> 00:00:48,592 于是它们以某种方式结合 在一起就成了一项工作。 15 00:00:48,616 --> 00:00:49,699 (笑声) 16 00:00:49,723 --> 00:00:51,243 我没有从小 17 00:00:51,267 --> 00:00:54,553 要成为一个生物学家的故事。 18 00:00:54,577 --> 00:00:58,283 事实是,我在大学时是打篮球的。 19 00:00:58,585 --> 00:01:03,728 我一部分的经济来源依赖半工半读。 20 00:01:04,300 --> 00:01:05,840 突然有一天, 21 00:01:05,864 --> 00:01:09,061 我漫步到了宿舍 旁边的建筑物, 22 00:01:09,085 --> 00:01:11,765 那刚好是生物学系。 23 00:01:12,347 --> 00:01:14,933 我进去看到了招聘告示板。 24 00:01:15,493 --> 00:01:17,657 是的,那是在还没有互联网的时代。 25 00:01:18,430 --> 00:01:20,437 我看到了一张明信片大小的卡片, 26 00:01:20,461 --> 00:01:23,616 招募人员到植物标本室工作。 27 00:01:24,601 --> 00:01:26,602 我赶紧记下联络号码, 28 00:01:26,626 --> 00:01:28,331 因为它说"工作时间灵活", 29 00:01:28,355 --> 00:01:31,612 我需要那个来配合 我的篮球时间表。 30 00:01:32,204 --> 00:01:36,791 然后我跑去图书馆查 什么是植物标本室。 31 00:01:36,815 --> 00:01:39,022 (笑声) 32 00:01:39,046 --> 00:01:40,355 原来 33 00:01:40,379 --> 00:01:44,458 植物标本室是来收藏 死了,干了的植物。 34 00:01:45,379 --> 00:01:47,093 我幸运地被录取了。 35 00:01:47,117 --> 00:01:50,323 所以我的第一份科学工作 36 00:01:50,347 --> 00:01:55,682 就是花上几个小时 将枯死的植物粘在纸上。 37 00:01:55,706 --> 00:01:58,984 (笑声) 38 00:01:59,008 --> 00:02:00,158 它是如此的风光啊。 39 00:02:00,182 --> 00:02:03,321 这就是我如何成为了 计算生物学家。 40 00:02:04,323 --> 00:02:05,506 在那个时候, 41 00:02:05,530 --> 00:02:08,252 基因组学和计算学如日方升。 42 00:02:08,276 --> 00:02:10,680 毕业后我开始攻读结合 43 00:02:10,704 --> 00:02:13,799 生物学和计算机的硕士。 44 00:02:13,823 --> 00:02:14,832 当时, 45 00:02:14,832 --> 00:02:16,791 我在拉斯阿拉莫斯国家实验室 46 00:02:16,815 --> 00:02:19,333 理论生物学和生物物理学组工作。 47 00:02:19,776 --> 00:02:23,506 就在那里,我初次见证了超级计算机, 48 00:02:23,530 --> 00:02:25,204 真是惊为天人。 49 00:02:25,840 --> 00:02:27,879 借助超级计算机, 50 00:02:27,903 --> 00:02:32,126 也就是数千台联网电脑的力量, 51 00:02:32,150 --> 00:02:37,623 我们能够发现流感病毒 和丙性肝炎的复杂性。 52 00:02:38,134 --> 00:02:40,465 正是这时候我看到了利用计算机 53 00:02:40,489 --> 00:02:44,609 和生物学相结合来造福人类的力量。 54 00:02:44,633 --> 00:02:47,005 我想把这当作终生事业。 55 00:02:48,030 --> 00:02:49,807 所以,从1999年开始, 56 00:02:49,831 --> 00:02:52,529 我大部分的科学生涯都在 57 00:02:52,553 --> 00:02:54,482 非常高科技的实验室里度过, 58 00:02:54,506 --> 00:02:57,239 周围都是非常昂贵的设备。 59 00:02:57,712 --> 00:02:59,355 很多人问我, 60 00:02:59,379 --> 00:03:03,246 我为什么,又是如何 为非洲的农民工作的。 61 00:03:03,804 --> 00:03:06,106 由于我的计算技能, 62 00:03:06,130 --> 00:03:10,669 在2013年,一个东非科学家小组 63 00:03:10,693 --> 00:03:14,782 邀请我加入拯救木薯的队伍。 64 00:03:15,766 --> 00:03:22,736 木薯的叶子和根部 能养活全球8亿人, 65 00:03:23,639 --> 00:03:26,676 有5亿人在东非。 66 00:03:26,994 --> 00:03:29,001 差不多有十亿人 67 00:03:29,025 --> 00:03:31,993 依靠这种植物来供应 他们每天的卡路里。 68 00:03:32,581 --> 00:03:36,426 如果一个小型家庭农场主 有足够的木薯, 69 00:03:36,450 --> 00:03:38,594 她就可以养活她的家人, 70 00:03:38,618 --> 00:03:42,664 并在市场上售卖这些木薯, 换取重要的东西,如学费, 71 00:03:42,688 --> 00:03:44,823 医疗费用和储蓄。 72 00:03:45,752 --> 00:03:49,283 但是,木薯的种植在非洲受到了冲击。 73 00:03:49,665 --> 00:03:54,101 粉虱和病毒在摧毁着木薯。 74 00:03:54,593 --> 00:03:56,799 粉虱是体型微小的昆虫, 75 00:03:56,823 --> 00:03:59,641 以超过600种植物的树叶为食。 76 00:03:59,665 --> 00:04:01,466 它们不请自来, 77 00:04:01,490 --> 00:04:02,649 有很多种类, 78 00:04:02,673 --> 00:04:04,942 具有抗药性, 79 00:04:04,966 --> 00:04:09,220 还能传播数百种植物病毒, 80 00:04:09,244 --> 00:04:11,768 导致木薯患上棕色条纹病 81 00:04:11,792 --> 00:04:13,592 和木薯马赛克病。 82 00:04:14,085 --> 00:04:16,219 这会彻底杀死作物。 83 00:04:17,038 --> 00:04:18,855 如果没有木薯, 84 00:04:18,879 --> 00:04:22,878 那数百万人就没有食物或收入。 85 00:04:24,141 --> 00:04:26,617 我去了一趟坦桑尼亚, 86 00:04:26,641 --> 00:04:29,379 意识到那里的妇女需要一些帮助。 87 00:04:29,403 --> 00:04:33,656 这些了不起的,坚强的, 小型家庭农场主, 88 00:04:33,680 --> 00:04:34,948 大多数是妇女, 89 00:04:34,972 --> 00:04:36,239 他们的生活苦不堪言。 90 00:04:36,744 --> 00:04:39,180 他们没有足够的食物来养活家人, 91 00:04:39,204 --> 00:04:40,792 这是一场真正的危机。 92 00:04:41,530 --> 00:04:43,029 现实情况是, 93 00:04:43,053 --> 00:04:46,045 当雨季来临的时候,她 们到木薯田里耕种。 94 00:04:46,069 --> 00:04:47,775 九个月之后, 95 00:04:47,799 --> 00:04:50,879 什么都没有,都是因为 这些害虫和病原体。 96 00:04:50,903 --> 00:04:53,061 我不禁心想, 97 00:04:53,085 --> 00:04:56,283 这世界上怎么还有食不果腹的农民呢? 98 00:04:56,815 --> 00:04:59,135 所以我决定花一段时间在田里, 99 00:04:59,159 --> 00:05:00,839 跟着农民和科学家们, 100 00:05:00,863 --> 00:05:03,466 看看我是否有帮得上忙的技能。 101 00:05:04,427 --> 00:05:07,283 当地局势令人震惊。 102 00:05:07,307 --> 00:05:11,577 粉虱毁坏树叶为摄取蛋白质, 103 00:05:11,601 --> 00:05:15,183 病毒摧毁根部为摄取淀粉。 104 00:05:15,592 --> 00:05:18,037 在整个生长季节过去后, 105 00:05:18,061 --> 00:05:22,171 农民将失去整整一年 的收入和食物, 106 00:05:22,195 --> 00:05:25,393 他们的家庭将遭受 一个漫长的饥饿季节。 107 00:05:25,942 --> 00:05:28,022 这完全是可以预防的。 108 00:05:28,046 --> 00:05:29,370 如果农民知道 109 00:05:29,394 --> 00:05:32,458 在她的田里种植什么品种的木薯 110 00:05:32,482 --> 00:05:36,807 可以抵抗这些病毒和病原体, 111 00:05:36,831 --> 00:05:38,736 她们就会有更多的食物。 112 00:05:38,760 --> 00:05:41,595 我们拥有我们需要的所有科技, 113 00:05:41,619 --> 00:05:44,823 但这些知识和资源 114 00:05:44,847 --> 00:05:47,982 在全球的分布非常不均衡。 115 00:05:48,712 --> 00:05:51,274 我想强调的是, 116 00:05:51,298 --> 00:05:53,150 传统的基因组技术 117 00:05:53,174 --> 00:05:56,037 被用于揭露这些害虫和病原体 118 00:05:56,061 --> 00:05:59,123 的复杂性—— 119 00:05:59,147 --> 00:06:02,145 这些技术不是为 南非撒哈拉地带而设的。 120 00:06:03,058 --> 00:06:05,399 它们的花费在一百万美元以上, 121 00:06:05,423 --> 00:06:07,311 需要不断的电力供应 122 00:06:07,335 --> 00:06:09,135 和专门的技术人员操作。 123 00:06:09,970 --> 00:06:12,831 这些机器在非洲大陆上寥寥无几, 124 00:06:12,855 --> 00:06:17,476 让许多在前线战斗 的科学家不得不 125 00:06:17,500 --> 00:06:19,499 把样品送到海外。 126 00:06:19,523 --> 00:06:21,483 当你把样品送到海外时, 127 00:06:21,507 --> 00:06:24,133 样品会降解,花费很昂贵, 128 00:06:24,157 --> 00:06:27,324 而且在糟糕的互联网中取回数据 129 00:06:27,348 --> 00:06:28,748 几乎是不可能的。 130 00:06:29,142 --> 00:06:33,441 所以有时可能需要六个月 的时间把结果送回农民手里。 131 00:06:33,465 --> 00:06:35,219 那时已经太晚了。 132 00:06:35,243 --> 00:06:36,830 作物已经被摧毁, 133 00:06:36,854 --> 00:06:40,020 造成持续的贫困和更多的饥饿。 134 00:06:41,306 --> 00:06:43,464 我们知道我们可以解决这个问题。 135 00:06:43,989 --> 00:06:45,393 在2017年, 136 00:06:45,417 --> 00:06:50,203 我们听说了这个叫做 Oxford Nanopore MinION 的 137 00:06:50,227 --> 00:06:52,736 手持便携式DNA测序仪。 138 00:06:52,760 --> 00:06:56,913 它曾在西非抗击埃博拉时功不可没。 139 00:06:56,937 --> 00:06:58,434 因此,我们认为: 140 00:06:58,458 --> 00:07:01,744 为什么不用这个在东非帮助农民呢? 141 00:07:01,768 --> 00:07:06,101 于是,我们要做的就是开始着手行动。 142 00:07:06,609 --> 00:07:09,307 当时,这项科技非常新颖, 143 00:07:09,331 --> 00:07:12,283 许多人怀疑我们能否在 农地里复制相似的结果。 144 00:07:12,879 --> 00:07:14,196 当我们开始这样做时, 145 00:07:14,220 --> 00:07:18,101 我们有个英国的"合作伙伴" 146 00:07:18,125 --> 00:07:21,752 告诉我们,这永远都不会发生在东非, 147 00:07:21,776 --> 00:07:23,242 更别说在农田里了。 148 00:07:23,863 --> 00:07:25,632 因此,我们接受了挑战。 149 00:07:25,934 --> 00:07:32,387 这个人甚至和我们打赌 两瓶最好的香槟, 150 00:07:32,411 --> 00:07:35,369 说我们永远不会实现的。 151 00:07:36,871 --> 00:07:38,450 三个字: 152 00:07:38,474 --> 00:07:39,625 买单吧。 153 00:07:39,649 --> 00:07:41,823 (笑声) 154 00:07:41,847 --> 00:07:45,999 (掌声) 155 00:07:46,023 --> 00:07:48,936 买单吧,因为我们做到了。 156 00:07:48,960 --> 00:07:52,245 我们把整个高科技分子实验室 157 00:07:52,269 --> 00:07:55,918 带给了坦桑尼亚,肯尼亚 和乌干达的农民们, 158 00:07:55,942 --> 00:07:57,974 我们称它为"树实验室"。 159 00:07:58,942 --> 00:08:00,133 那我们做了什么? 160 00:08:00,157 --> 00:08:02,736 首先我们给自己取了一个队名—— 161 00:08:02,760 --> 00:08:04,934 叫做木薯病毒行动项目。 162 00:08:04,958 --> 00:08:06,315 我们制作了一个网站, 163 00:08:06,339 --> 00:08:09,950 从基因组学和计算社区中召集支持, 164 00:08:09,974 --> 00:08:11,855 然后去农民那里。 165 00:08:12,411 --> 00:08:15,220 "树实验室"所需的一切 166 00:08:15,244 --> 00:08:17,653 由团队携带着来到这里。 167 00:08:17,677 --> 00:08:21,724 所有分子和计算学需要用来 168 00:08:21,748 --> 00:08:25,049 诊断植物病理的条件都准备就绪了。 169 00:08:25,431 --> 00:08:28,259 实际上,所有这些 全都在这个舞台上。 170 00:08:29,161 --> 00:08:32,748 我们认为,如果我们能 使数据更贴近问题, 171 00:08:32,772 --> 00:08:34,390 更贴近农民, 172 00:08:34,414 --> 00:08:37,770 我们就能更快地判断 她的植物出了什么问题。 173 00:08:38,169 --> 00:08:40,042 不仅能诊断出问题—— 174 00:08:40,066 --> 00:08:41,458 还能给她解决方案。 175 00:08:41,482 --> 00:08:42,807 解决办法就是, 176 00:08:42,831 --> 00:08:45,454 烧掉那片田地,并种上 177 00:08:45,478 --> 00:08:48,982 对害虫和病原体具有 抵抗力的植物品种。 178 00:08:49,942 --> 00:08:54,146 所以,我们必须做的第一件事 是进行DNA提取。 179 00:08:54,170 --> 00:08:56,709 我们在这里用的是这台机器, 180 00:08:57,050 --> 00:09:00,249 叫做"PDQeX", 181 00:09:00,273 --> 00:09:04,164 代表“死快死快的提取"。 182 00:09:04,188 --> 00:09:06,236 (笑声) 183 00:09:06,260 --> 00:09:07,410 有意思吧。 184 00:09:07,768 --> 00:09:10,262 我的朋友乔真的很酷。 185 00:09:11,394 --> 00:09:14,754 最大的挑战之一是进行DNA提取, 186 00:09:14,778 --> 00:09:18,093 它通常需要非常昂贵的设备, 187 00:09:18,117 --> 00:09:19,521 需要几个小时。 188 00:09:19,545 --> 00:09:21,037 但是有了这台机器, 189 00:09:21,061 --> 00:09:23,815 我们在二十分钟内就能完成, 190 00:09:23,839 --> 00:09:25,085 而且成本低廉, 191 00:09:25,109 --> 00:09:27,997 只需要摩托车的电池供电。 192 00:09:29,164 --> 00:09:34,307 我们将提取的DNA存入序列库, 193 00:09:34,331 --> 00:09:36,110 准备加载到 194 00:09:36,134 --> 00:09:40,426 这个便携式手持基因组测序仪中, 195 00:09:40,450 --> 00:09:41,505 就是这个装置, 196 00:09:41,505 --> 00:09:45,363 然后我们将它连上一台 微型超级计算机, 197 00:09:45,387 --> 00:09:47,209 称为" MinIT"。 198 00:09:47,728 --> 00:09:51,830 这两个装置由便携式电池供电。 199 00:09:52,569 --> 00:09:54,442 这样一来,我们就能够排除 200 00:09:54,466 --> 00:09:56,871 对主要电源和互联网的依赖, 201 00:09:56,895 --> 00:10:00,823 这两者是一个小型家庭农场 运作的局限因素。 202 00:10:01,807 --> 00:10:04,678 快速分析数据也可能是个问题。 203 00:10:05,033 --> 00:10:08,939 但是,我这位计算生物学家 的存在派上了用场。 204 00:10:09,382 --> 00:10:11,612 所有枯死植物的标本, 205 00:10:11,636 --> 00:10:13,196 所有的测量, 206 00:10:13,220 --> 00:10:15,212 和所有的计算, 207 00:10:15,236 --> 00:10:19,387 终于在现实世界中 以实时方式派上用场了。 208 00:10:19,411 --> 00:10:22,464 我能够定制数据库, 209 00:10:22,488 --> 00:10:27,083 在三小时内给农民结果, 210 00:10:27,107 --> 00:10:28,971 而不是六个月。 211 00:10:29,694 --> 00:10:36,662 (掌声) 212 00:10:38,085 --> 00:10:40,719 农民们欣喜若狂。 213 00:10:41,799 --> 00:10:44,595 那么我们又怎么知道 我们的策略产生了影响呢? 214 00:10:44,619 --> 00:10:46,619 "树实验室"之后的九个月, 215 00:10:46,643 --> 00:10:49,873 阿莎的收获从每公顷零吨木薯 216 00:10:49,897 --> 00:10:51,905 上升到了每公顷40吨木薯。 217 00:10:51,929 --> 00:10:53,728 她有足够的粮食养活她的家人, 218 00:10:53,752 --> 00:10:56,442 还有多余在市场上售卖, 219 00:10:56,466 --> 00:10:59,201 现在,她已经能够为家人盖房子了。 220 00:11:00,212 --> 00:11:01,371 是的,太酷了。 221 00:11:01,395 --> 00:11:05,649 (掌声) 222 00:11:05,673 --> 00:11:07,539 那么,我们如何扩展"树实验室"呢? 223 00:11:07,940 --> 00:11:09,320 事实上, 224 00:11:09,344 --> 00:11:11,447 农民在非洲已颇具规模。 225 00:11:11,471 --> 00:11:13,360 这些妇女以团体为单位进行劳作, 226 00:11:13,384 --> 00:11:17,510 所以帮助阿莎,实际上就 帮助了她村子里的3000人, 227 00:11:17,534 --> 00:11:21,186 因为她分享了结果以及解决方案。 228 00:11:21,673 --> 00:11:25,864 我记得我见过的每一个农民。 229 00:11:26,665 --> 00:11:30,228 他们的痛苦和喜悦 230 00:11:30,252 --> 00:11:32,052 深深的刻在我的记忆中。 231 00:11:32,958 --> 00:11:34,823 我们的科学是为他们而进行的。 232 00:11:35,711 --> 00:11:40,758 "树实验室"是我们在帮助他们 提升食品安全方面最好的尝试。 233 00:11:41,180 --> 00:11:42,966 我从未梦想过 234 00:11:42,990 --> 00:11:45,934 我一生中做过最好的科学实验 235 00:11:45,958 --> 00:11:49,457 会在东非的毯子上, 236 00:11:49,481 --> 00:11:51,847 用最先进的基因组工具包。 237 00:11:52,312 --> 00:11:54,764 但我们的团队确实梦想过 238 00:11:54,788 --> 00:11:59,058 在三小时内给农民答案, 而不再需要六个月, 239 00:11:59,082 --> 00:12:00,518 然后我们做到了。 240 00:12:00,542 --> 00:12:04,650 因为那是科学多元化和包容性的力量。 241 00:12:05,156 --> 00:12:06,307 谢谢。 242 00:12:06,331 --> 00:12:09,482 (掌声) 243 00:12:09,506 --> 00:12:13,589 (欢呼声)