0:00:00.991,0:00:03.317 我早上起床为了两个原因。 0:00:03.341,0:00:07.372 第一,小规模农民家庭[br]需要更多的粮食。 0:00:07.738,0:00:12.916 2019年,为我们供应粮食的农民们[br]还要忍饥受饿,简直不可思议。 0:00:13.353,0:00:18.186 第二,科学需要更多元化,更包容。 0:00:18.679,0:00:22.101 如果我们要解决地球上[br]最艰难的挑战, 0:00:22.125,0:00:26.458 如拯救成千上万地瘠民贫[br]的粮食短缺, 0:00:26.482,0:00:28.321 就需要我们所有人的共同努力。 0:00:28.680,0:00:31.260 我要用最先进的科技, 0:00:31.284,0:00:34.577 和地球上最多元化[br]和包容的团队一起, 0:00:34.601,0:00:36.668 帮助农民们生产更多的粮食。 0:00:37.545,0:00:39.426 我是一位计算生物学家。 0:00:39.450,0:00:42.854 你们可能会好奇,那是什么?[br]它将如何杜绝饥饿? 0:00:42.878,0:00:46.124 这么说吧,我喜欢计算机和生物学, 0:00:46.148,0:00:48.592 于是它们以某种方式结合[br]在一起就成了一项工作。 0:00:48.616,0:00:49.699 (笑声) 0:00:49.723,0:00:51.243 我没有从小 0:00:51.267,0:00:54.553 要成为一个生物学家的故事。 0:00:54.577,0:00:58.283 事实是,我在大学时是打篮球的。 0:00:58.585,0:01:03.728 我一部分的经济来源依赖半工半读。 0:01:04.300,0:01:05.840 突然有一天, 0:01:05.864,0:01:09.061 我漫步到了宿舍[br]旁边的建筑物, 0:01:09.085,0:01:11.765 那刚好是生物学系。 0:01:12.347,0:01:14.933 我进去看到了招聘告示板。 0:01:15.493,0:01:17.657 是的,那是在还没有互联网的时代。 0:01:18.430,0:01:20.437 我看到了一张明信片大小的卡片, 0:01:20.461,0:01:23.616 招募人员到植物标本室工作。 0:01:24.601,0:01:26.602 我赶紧记下联络号码, 0:01:26.626,0:01:28.331 因为它说"工作时间灵活", 0:01:28.355,0:01:31.612 我需要那个来配合[br]我的篮球时间表。 0:01:32.204,0:01:36.791 然后我跑去图书馆查[br]什么是植物标本室。 0:01:36.815,0:01:39.022 (笑声) 0:01:39.046,0:01:40.355 原来 0:01:40.379,0:01:44.458 植物标本室是来收藏[br]死了,干了的植物。 0:01:45.379,0:01:47.093 我幸运地被录取了。 0:01:47.117,0:01:50.323 所以我的第一份科学工作 0:01:50.347,0:01:55.682 就是花上几个小时[br]将枯死的植物粘在纸上。 0:01:55.706,0:01:58.984 (笑声) 0:01:59.008,0:02:00.158 它是如此的风光啊。 0:02:00.182,0:02:03.321 这就是我如何成为了[br]计算生物学家。 0:02:04.323,0:02:05.506 在那个时候, 0:02:05.530,0:02:08.252 基因组学和计算学如日方升。 0:02:08.276,0:02:10.680 毕业后我开始攻读结合 0:02:10.704,0:02:13.799 生物学和计算机的硕士。 0:02:13.823,0:02:14.832 当时, 0:02:14.832,0:02:16.791 我在拉斯阿拉莫斯国家实验室 0:02:16.815,0:02:19.333 理论生物学和生物物理学组工作。 0:02:19.776,0:02:23.506 就在那里,我初次见证了超级计算机, 0:02:23.530,0:02:25.204 真是惊为天人。 0:02:25.840,0:02:27.879 借助超级计算机, 0:02:27.903,0:02:32.126 也就是数千台联网电脑的力量, 0:02:32.150,0:02:37.623 我们能够发现流感病毒[br]和丙性肝炎的复杂性。 0:02:38.134,0:02:40.465 正是这时候我看到了利用计算机 0:02:40.489,0:02:44.609 和生物学相结合来造福人类的力量。 0:02:44.633,0:02:47.005 我想把这当作终生事业。 0:02:48.030,0:02:49.807 所以,从1999年开始, 0:02:49.831,0:02:52.529 我大部分的科学生涯都在 0:02:52.553,0:02:54.482 非常高科技的实验室里度过, 0:02:54.506,0:02:57.239 周围都是非常昂贵的设备。 0:02:57.712,0:02:59.355 很多人问我, 0:02:59.379,0:03:03.246 我为什么,又是如何[br]为非洲的农民工作的。 0:03:03.804,0:03:06.106 由于我的计算技能, 0:03:06.130,0:03:10.669 在2013年,一个东非科学家小组 0:03:10.693,0:03:14.782 邀请我加入拯救木薯的队伍。 0:03:15.766,0:03:22.736 木薯的叶子和根部[br]能养活全球8亿人, 0:03:23.639,0:03:26.676 有5亿人在东非。 0:03:26.994,0:03:29.001 差不多有十亿人 0:03:29.025,0:03:31.993 依靠这种植物来供应[br]他们每天的卡路里。 0:03:32.581,0:03:36.426 如果一个小型家庭农场主[br]有足够的木薯, 0:03:36.450,0:03:38.594 她就可以养活她的家人, 0:03:38.618,0:03:42.664 并在市场上售卖这些木薯,[br]换取重要的东西,如学费, 0:03:42.688,0:03:44.823 医疗费用和储蓄。 0:03:45.752,0:03:49.283 但是,木薯的种植在非洲受到了冲击。 0:03:49.665,0:03:54.101 粉虱和病毒在摧毁着木薯。 0:03:54.593,0:03:56.799 粉虱是体型微小的昆虫, 0:03:56.823,0:03:59.641 以超过600种植物的树叶为食。 0:03:59.665,0:04:01.466 它们不请自来, 0:04:01.490,0:04:02.649 有很多种类, 0:04:02.673,0:04:04.942 具有抗药性, 0:04:04.966,0:04:09.220 还能传播数百种植物病毒, 0:04:09.244,0:04:11.768 导致木薯患上棕色条纹病 0:04:11.792,0:04:13.592 和木薯马赛克病。 0:04:14.085,0:04:16.219 这会彻底杀死作物。 0:04:17.038,0:04:18.855 如果没有木薯, 0:04:18.879,0:04:22.878 那数百万人就没有食物或收入。 0:04:24.141,0:04:26.617 我去了一趟坦桑尼亚, 0:04:26.641,0:04:29.379 意识到那里的妇女需要一些帮助。 0:04:29.403,0:04:33.656 这些了不起的,坚强的,[br]小型家庭农场主, 0:04:33.680,0:04:34.948 大多数是妇女, 0:04:34.972,0:04:36.239 他们的生活苦不堪言。 0:04:36.744,0:04:39.180 他们没有足够的食物来养活家人, 0:04:39.204,0:04:40.792 这是一场真正的危机。 0:04:41.530,0:04:43.029 现实情况是, 0:04:43.053,0:04:46.045 当雨季来临的时候,她[br]们到木薯田里耕种。 0:04:46.069,0:04:47.775 九个月之后, 0:04:47.799,0:04:50.879 什么都没有,都是因为[br]这些害虫和病原体。 0:04:50.903,0:04:53.061 我不禁心想, 0:04:53.085,0:04:56.283 这世界上怎么还有食不果腹的农民呢? 0:04:56.815,0:04:59.135 所以我决定花一段时间在田里, 0:04:59.159,0:05:00.839 跟着农民和科学家们, 0:05:00.863,0:05:03.466 看看我是否有帮得上忙的技能。[br] 0:05:04.427,0:05:07.283 当地局势令人震惊。 0:05:07.307,0:05:11.577 粉虱毁坏树叶为摄取蛋白质,[br] 0:05:11.601,0:05:15.183 病毒摧毁根部为摄取淀粉。[br] 0:05:15.592,0:05:18.037 在整个生长季节过去后, 0:05:18.061,0:05:22.171 农民将失去整整一年[br]的收入和食物, 0:05:22.195,0:05:25.393 他们的家庭将遭受[br]一个漫长的饥饿季节。 0:05:25.942,0:05:28.022 这完全是可以预防的。 0:05:28.046,0:05:29.370 如果农民知道[br] 0:05:29.394,0:05:32.458 在她的田里种植什么品种的木薯 0:05:32.482,0:05:36.807 可以抵抗这些病毒和病原体, 0:05:36.831,0:05:38.736 她们就会有更多的食物。 0:05:38.760,0:05:41.595 我们拥有我们需要的所有科技, 0:05:41.619,0:05:44.823 但这些知识和资源 0:05:44.847,0:05:47.982 在全球的分布非常不均衡。 0:05:48.712,0:05:51.274 我想强调的是, 0:05:51.298,0:05:53.150 传统的基因组技术 0:05:53.174,0:05:56.037 被用于揭露这些害虫和病原体 0:05:56.061,0:05:59.123 的复杂性—— 0:05:59.147,0:06:02.145 这些技术不是为[br]南非撒哈拉地带而设的。 0:06:03.058,0:06:05.399 它们的花费在一百万美元以上, 0:06:05.423,0:06:07.311 需要不断的电力供应 0:06:07.335,0:06:09.135 和专门的技术人员操作。 0:06:09.970,0:06:12.831 这些机器在非洲大陆上寥寥无几, 0:06:12.855,0:06:17.476 让许多在前线战斗[br]的科学家不得不 0:06:17.500,0:06:19.499 把样品送到海外。 0:06:19.523,0:06:21.483 当你把样品送到海外时, 0:06:21.507,0:06:24.133 样品会降解,花费很昂贵, 0:06:24.157,0:06:27.324 而且在糟糕的互联网中取回数据 0:06:27.348,0:06:28.748 几乎是不可能的。 0:06:29.142,0:06:33.441 所以有时可能需要六个月[br]的时间把结果送回农民手里。 0:06:33.465,0:06:35.219 那时已经太晚了。 0:06:35.243,0:06:36.830 作物已经被摧毁, 0:06:36.854,0:06:40.020 造成持续的贫困和更多的饥饿。 0:06:41.306,0:06:43.464 我们知道我们可以解决这个问题。 0:06:43.989,0:06:45.393 在2017年, 0:06:45.417,0:06:50.203 我们听说了这个叫做[br]Oxford Nanopore MinION 的 0:06:50.227,0:06:52.736 手持便携式DNA测序仪。 0:06:52.760,0:06:56.913 它曾在西非抗击埃博拉时功不可没。 0:06:56.937,0:06:58.434 因此,我们认为:[br] 0:06:58.458,0:07:01.744 为什么不用这个在东非帮助农民呢? 0:07:01.768,0:07:06.101 于是,我们要做的就是开始着手行动。 0:07:06.609,0:07:09.307 当时,这项科技非常新颖, 0:07:09.331,0:07:12.283 许多人怀疑我们能否在[br]农地里复制相似的结果。 0:07:12.879,0:07:14.196 当我们开始这样做时,[br] 0:07:14.220,0:07:18.101 我们有个英国的"合作伙伴" 0:07:18.125,0:07:21.752 告诉我们,这永远都不会发生在东非, 0:07:21.776,0:07:23.242 更别说在农田里了。[br] 0:07:23.863,0:07:25.632 因此,我们接受了挑战。 0:07:25.934,0:07:32.387 这个人甚至和我们打赌[br]两瓶最好的香槟, 0:07:32.411,0:07:35.369 说我们永远不会实现的。 0:07:36.871,0:07:38.450 三个字: 0:07:38.474,0:07:39.625 买单吧。 0:07:39.649,0:07:41.823 (笑声) 0:07:41.847,0:07:45.999 (掌声) 0:07:46.023,0:07:48.936 买单吧,因为我们做到了。 0:07:48.960,0:07:52.245 我们把整个高科技分子实验室 0:07:52.269,0:07:55.918 带给了坦桑尼亚,肯尼亚[br]和乌干达的农民们, 0:07:55.942,0:07:57.974 我们称它为"树实验室"。 0:07:58.942,0:08:00.133 那我们做了什么?[br][br] 0:08:00.157,0:08:02.736 首先我们给自己取了一个队名—— 0:08:02.760,0:08:04.934 叫做木薯病毒行动项目。 0:08:04.958,0:08:06.315 我们制作了一个网站, 0:08:06.339,0:08:09.950 从基因组学和计算社区中召集支持, 0:08:09.974,0:08:11.855 然后去农民那里。 0:08:12.411,0:08:15.220 "树实验室"所需的一切 0:08:15.244,0:08:17.653 由团队携带着来到这里。 0:08:17.677,0:08:21.724 所有分子和计算学需要用来 0:08:21.748,0:08:25.049 诊断植物病理的条件都准备就绪了。 0:08:25.431,0:08:28.259 实际上,所有这些[br]全都在这个舞台上。 0:08:29.161,0:08:32.748 我们认为,如果我们能[br]使数据更贴近问题, 0:08:32.772,0:08:34.390 更贴近农民, 0:08:34.414,0:08:37.770 我们就能更快地判断[br]她的植物出了什么问题。 0:08:38.169,0:08:40.042 不仅能诊断出问题—— 0:08:40.066,0:08:41.458 还能给她解决方案。 0:08:41.482,0:08:42.807 解决办法就是, 0:08:42.831,0:08:45.454 烧掉那片田地,并种上 0:08:45.478,0:08:48.982 对害虫和病原体具有[br]抵抗力的植物品种。 0:08:49.942,0:08:54.146 所以,我们必须做的第一件事[br]是进行DNA提取。 0:08:54.170,0:08:56.709 我们在这里用的是这台机器, 0:08:57.050,0:09:00.249 叫做"PDQeX", 0:09:00.273,0:09:04.164 代表“死快死快的提取"。 0:09:04.188,0:09:06.236 (笑声) 0:09:06.260,0:09:07.410 有意思吧。 0:09:07.768,0:09:10.262 我的朋友乔真的很酷。 0:09:11.394,0:09:14.754 最大的挑战之一是进行DNA提取, 0:09:14.778,0:09:18.093 它通常需要非常昂贵的设备, 0:09:18.117,0:09:19.521 需要几个小时。 0:09:19.545,0:09:21.037 但是有了这台机器, 0:09:21.061,0:09:23.815 我们在二十分钟内就能完成, 0:09:23.839,0:09:25.085 而且成本低廉, 0:09:25.109,0:09:27.997 只需要摩托车的电池供电。 0:09:29.164,0:09:34.307 我们将提取的DNA存入序列库, 0:09:34.331,0:09:36.110 准备加载到 0:09:36.134,0:09:40.426 这个便携式手持基因组测序仪中, 0:09:40.450,0:09:41.505 就是这个装置, 0:09:41.505,0:09:45.363 然后我们将它连上一台[br]微型超级计算机, 0:09:45.387,0:09:47.209 称为" MinIT"。 0:09:47.728,0:09:51.830 这两个装置由便携式电池供电。 0:09:52.569,0:09:54.442 这样一来,我们就能够排除 0:09:54.466,0:09:56.871 对主要电源和互联网的依赖, 0:09:56.895,0:10:00.823 这两者是一个小型家庭农场[br]运作的局限因素。 0:10:01.807,0:10:04.678 快速分析数据也可能是个问题。 0:10:05.033,0:10:08.939 但是,我这位计算生物学家[br]的存在派上了用场。 0:10:09.382,0:10:11.612 所有枯死植物的标本, 0:10:11.636,0:10:13.196 所有的测量, 0:10:13.220,0:10:15.212 和所有的计算, 0:10:15.236,0:10:19.387 终于在现实世界中[br]以实时方式派上用场了。 0:10:19.411,0:10:22.464 我能够定制数据库, 0:10:22.488,0:10:27.083 在三小时内给农民结果, 0:10:27.107,0:10:28.971 而不是六个月。 0:10:29.694,0:10:36.662 (掌声) 0:10:38.085,0:10:40.719 农民们欣喜若狂。 0:10:41.799,0:10:44.595 那么我们又怎么知道[br]我们的策略产生了影响呢? 0:10:44.619,0:10:46.619 "树实验室"之后的九个月, 0:10:46.643,0:10:49.873 阿莎的收获从每公顷零吨木薯 0:10:49.897,0:10:51.905 上升到了每公顷40吨木薯。 0:10:51.929,0:10:53.728 她有足够的粮食养活她的家人, 0:10:53.752,0:10:56.442 还有多余在市场上售卖, 0:10:56.466,0:10:59.201 现在,她已经能够为家人盖房子了。 0:11:00.212,0:11:01.371 是的,太酷了。 0:11:01.395,0:11:05.649 (掌声) 0:11:05.673,0:11:07.539 那么,我们如何扩展"树实验室"呢? 0:11:07.940,0:11:09.320 事实上, 0:11:09.344,0:11:11.447 农民在非洲已颇具规模。 0:11:11.471,0:11:13.360 这些妇女以团体为单位进行劳作, 0:11:13.384,0:11:17.510 所以帮助阿莎,实际上就[br]帮助了她村子里的3000人, 0:11:17.534,0:11:21.186 因为她分享了结果以及解决方案。 0:11:21.673,0:11:25.864 我记得我见过的每一个农民。 0:11:26.665,0:11:30.228 他们的痛苦和喜悦 0:11:30.252,0:11:32.052 深深的刻在我的记忆中。 0:11:32.958,0:11:34.823 我们的科学是为他们而进行的。 0:11:35.711,0:11:40.758 "树实验室"是我们在帮助他们[br]提升食品安全方面最好的尝试。 0:11:41.180,0:11:42.966 我从未梦想过 0:11:42.990,0:11:45.934 我一生中做过最好的科学实验 0:11:45.958,0:11:49.457 会在东非的毯子上, 0:11:49.481,0:11:51.847 用最先进的基因组工具包。 0:11:52.312,0:11:54.764 但我们的团队确实梦想过 0:11:54.788,0:11:59.058 在三小时内给农民答案,[br]而不再需要六个月, 0:11:59.082,0:12:00.518 然后我们做到了。 0:12:00.542,0:12:04.650 因为那是科学多元化和包容性的力量。 0:12:05.156,0:12:06.307 谢谢。 0:12:06.331,0:12:09.482 (掌声) 0:12:09.506,0:12:13.589 (欢呼声)