WEBVTT 00:00:00.991 --> 00:00:03.317 Ada 2 alasan yang membuat saya bangkit. 00:00:03.427 --> 00:00:07.458 Pertama, keluarga petani skala kecil membutuhkan lebih banyak pangan. 00:00:07.915 --> 00:00:13.353 Tragisnya pada 2019 petani kelaparan, padahal mereka yang memberi kita makan. 00:00:13.353 --> 00:00:18.186 Kedua, ilmu pengetahuan harus lebih beragam dan terbuka. 00:00:18.679 --> 00:00:22.101 Jika kita ingin mengatasi tantangan tersulit di planet bumi, 00:00:22.125 --> 00:00:26.458 seperti kerawanan pangan pada jutaan orang yang hidup di bawah garis kemiskinan, 00:00:26.482 --> 00:00:28.651 hal ini akan melibatkan peran kita semua. NOTE Paragraph 00:00:28.680 --> 00:00:31.260 Saya ingin menggunakan teknologi terbaru, 00:00:31.284 --> 00:00:34.577 bekerja sama dengan tim paling beragam dan paling terbuka di dunia 00:00:34.601 --> 00:00:36.668 untuk meningkatkan persediaan pangan petani. 00:00:37.545 --> 00:00:39.426 Saya adalah ahli biologi komputasi. 00:00:39.450 --> 00:00:42.854 Saya mempelajari bencana kelaparan dan cara mengatasinya. 00:00:42.878 --> 00:00:46.124 Pada dasarnya, saya menyukai ilmu komputer dan biologi 00:00:46.148 --> 00:00:48.592 dan menggabungkan kedua bidang itu sebagai pekerjaan NOTE Paragraph 00:00:48.616 --> 00:00:49.699 (Tertawa) NOTE Paragraph 00:00:49.723 --> 00:00:51.243 Saya tidak pernah bercita-cita 00:00:51.267 --> 00:00:54.553 menjadi seorang ahli biologi waktu berusia muda. 00:00:54.577 --> 00:00:58.283 Pada saat itu, saya senang bermain bola basket di kampus. 00:00:58.583 --> 00:01:03.726 Untuk mencukupi paket bantuan keuangan, saya harus bekerja paruh waktu. 00:01:04.300 --> 00:01:05.840 Jadi pada suatu hari, 00:01:05.864 --> 00:01:09.061 saya berkeliling ke gedung yang terdekat dengan asrama 00:01:09.085 --> 00:01:11.765 dan secara kebetulan saya sampai di gedung biologi. 00:01:12.347 --> 00:01:14.933 Saya masuk ke dalam dan melihat papan lowongan kerja. 00:01:15.493 --> 00:01:17.657 Ya, waktu itu adalah zaman pra-internet. 00:01:18.430 --> 00:01:20.437 Saya melihat papan berukuran 3 x 5 00:01:20.461 --> 00:01:23.826 yang mengiklankan sebuah lowongan kerja di laboratorium herbarium. 00:01:24.601 --> 00:01:26.602 Saya segera mencatat lowongan itu, 00:01:26.626 --> 00:01:28.331 karena jam kerjanya yang fleksibel, 00:01:28.355 --> 00:01:31.612 dan bisa saya lakukan di sela-sela jadwal bola basket. 00:01:32.204 --> 00:01:36.791 Saya berlari ke perpustakaan untuk mencari informasi tentang herbarium. NOTE Paragraph 00:01:36.815 --> 00:01:39.022 (Tertawa) NOTE Paragraph 00:01:39.046 --> 00:01:40.355 Ternyata 00:01:40.379 --> 00:01:44.458 herbarium adalah tempat menyimpan tanaman yang kering dan mati. 00:01:45.379 --> 00:01:47.093 Saya berhasil mendapat pekerjaan itu. 00:01:47.117 --> 00:01:50.323 Jadi pekerjaan ilmiah pertama saya 00:01:50.347 --> 00:01:55.682 adalah mengelem tanaman mati di atas kertas sepanjang hari. NOTE Paragraph 00:01:55.706 --> 00:01:58.984 (Tertawa) NOTE Paragraph 00:01:59.008 --> 00:02:00.158 Ini sungguh menarik. 00:02:00.182 --> 00:02:03.931 Inilah cerita awal saya menjadi seorang ahli biologi komputasi. 00:02:04.323 --> 00:02:05.506 Pada waktu itu, 00:02:05.530 --> 00:02:08.252 genom dan komputasi sudah dikenal luas. 00:02:08.276 --> 00:02:10.680 Lalu saya melanjutkan ke jenjang pascasarjana, 00:02:10.704 --> 00:02:13.799 menggabungkan ilmu biologi dan komputer. NOTE Paragraph 00:02:13.823 --> 00:02:14.882 Pada saat itu, 00:02:14.902 --> 00:02:16.811 saya bekerja di Lab Nasional Los Alamos, 00:02:16.841 --> 00:02:19.756 di kelompok teori biologi dan biofisika 00:02:19.776 --> 00:02:23.506 dan di sanalah saya pertama kali mengenal superkomputer, 00:02:23.530 --> 00:02:25.204 yang membuat saya kagum. 00:02:25.840 --> 00:02:27.879 Dengan kecepatan hitung superkomputer, 00:02:27.903 --> 00:02:32.126 yang intinya adalah ribuan komputer pribadi yang tersambung dengan steroid, 00:02:32.150 --> 00:02:37.623 kami berhasil menemukan kerumitan penyakit flu dan hepatitis C. 00:02:38.134 --> 00:02:40.465 Saat itu saya melihat keunggulan 00:02:40.489 --> 00:02:44.609 penggunaan kombinasi komputer dan biologi untuk kemanusiaan 00:02:44.633 --> 00:02:47.005 dan memilih bidang ini sebagai jalan karier saya. 00:02:48.030 --> 00:02:49.807 Jadi, sejak tahun 1999, 00:02:49.807 --> 00:02:52.505 saya menghabiskan sebagian besar waktu sebagai ilmuwan 00:02:52.553 --> 00:02:54.482 di laboratorium berteknologi mutakhir, 00:02:54.506 --> 00:02:57.239 yang dilengkapi dengan alat-alat sangat mahal. NOTE Paragraph 00:02:57.712 --> 00:02:59.355 Banyak orang ingin mengetahui 00:02:59.379 --> 00:03:03.246 cara dan alasan saya bekerja untuk para petani di Afrika. 00:03:03.804 --> 00:03:06.106 Jadi, karena keahlian komputer yang saya miliki, 00:03:06.130 --> 00:03:10.669 pada tahun 2013, tim peneliti Afrika Timur 00:03:10.693 --> 00:03:14.782 meminta saya bergabung di dalam tim untuk menyelamatkan tanaman singkong. 00:03:15.406 --> 00:03:20.569 Daun dan umbi singkong dimakan oleh 800 juta orang di seluruh dunia 00:03:20.619 --> 00:03:23.822 [800 juta orang bergantung pada singkong untuk kalori harian mereka] 00:03:23.952 --> 00:03:26.676 dan 500 juta orang di Afrika Timur. 00:03:26.994 --> 00:03:29.001 Jadi, hampir 1 juta manusia 00:03:29.025 --> 00:03:32.253 bergantung pada tanaman ini untuk memenuhi kalori sehari-hari. 00:03:32.581 --> 00:03:36.426 Jika keluarga petani skala kecil memiliki cukup banyak tanaman singkong, 00:03:36.450 --> 00:03:38.594 mereka dapat memberi makan keluarga 00:03:38.618 --> 00:03:42.664 dan menjualnya ke pasar untuk membayar pos penting seperti biaya sekolah, 00:03:42.688 --> 00:03:44.823 biaya kesehatan dan tabungan. NOTE Paragraph 00:03:45.752 --> 00:03:49.283 Namun, tanaman singkong di Afrika terserang hama. 00:03:49.665 --> 00:03:54.101 Kutu putih (kebul) dan virus menyerang tanaman singkong. 00:03:54.593 --> 00:03:56.589 Kutu putih adalah serangga kecil 00:03:56.823 --> 00:03:59.601 yang memakan daun lebih dari 600 jenis tanaman. 00:03:59.625 --> 00:04:01.466 Keberadaan mereka adalah berita buruk. 00:04:01.490 --> 00:04:02.649 Memiliki banyak spesies; 00:04:02.673 --> 00:04:04.942 kutu putih resistan terhadap pestisida; 00:04:04.966 --> 00:04:08.440 dan menularkan ratusan virus tanaman 00:04:09.254 --> 00:04:11.768 yang mengakibatkan penyakit bercak coklat 00:04:11.792 --> 00:04:14.022 dan penyakit mozaik pada tanaman singkong. 00:04:14.085 --> 00:04:16.969 Penyakit ini benar-benar mematikan. 00:04:17.038 --> 00:04:18.855 Jika tidak ada singkong, 00:04:18.879 --> 00:04:22.878 tidak akan ada makanan dan penghasilan untuk jutaan manusia. NOTE Paragraph 00:04:24.001 --> 00:04:26.557 Saya melakukan perjalanan ke Tanzania 00:04:26.581 --> 00:04:29.379 karena saya sadar para wanita di sana memerlukan bantuan. 00:04:29.403 --> 00:04:33.316 Keluarga para petani skala kecil yang tangguh dan luar biasa ini, 00:04:33.350 --> 00:04:34.948 mayoritas petani perempuan, 00:04:34.972 --> 00:04:36.509 menjalani hidup dengan tangguh. 00:04:36.744 --> 00:04:39.180 Mereka tidak bisa memenuhi kebutuhan pangan keluarga 00:04:39.204 --> 00:04:40.792 dan ini adalah krisis nyata. 00:04:41.530 --> 00:04:43.029 Kenyataan yang terjadi adalah 00:04:43.053 --> 00:04:46.045 mereka pergi ke lahan dan menanam singkong di musim hujan. 00:04:46.069 --> 00:04:47.729 Sembilan bulan kemudian, 00:04:47.759 --> 00:04:50.879 tidak ada yang dapat dipanen, karena serangan hama dan patogen. 00:04:50.903 --> 00:04:53.061 Saya berpikir, 00:04:53.085 --> 00:04:55.853 mengapa petani bisa menderita kelaparan? NOTE Paragraph 00:04:55.885 --> 00:04:59.135 Jadi saya putuskan untuk menghabiskan waktu di lapangan 00:04:59.159 --> 00:05:00.839 bersama para petani dan peneliti 00:05:00.863 --> 00:05:04.236 untuk membantu mereka dengan keahlian yang saya miliki. 00:05:04.427 --> 00:05:07.283 Situasi di lapangan sungguh mengejutkan. 00:05:07.307 --> 00:05:11.577 Kutu putih merusak bagian daun yang mengandung protein, 00:05:11.601 --> 00:05:15.183 dan virus merusak bagian umbi yang mengandung pati singkong. 00:05:15.592 --> 00:05:18.037 Ketika musim tanam berakhir, 00:05:18.061 --> 00:05:22.171 para petani kehilangan pendapatan dan makanan sepanjang tahun, 00:05:22.195 --> 00:05:25.393 dan keluarga akan menderita bencana kelaparan yang panjang. 00:05:25.942 --> 00:05:28.022 Hal ini sesungguhnya dapat dicegah. 00:05:28.046 --> 00:05:29.370 Jika petani mengetahui 00:05:29.394 --> 00:05:32.458 varietas singkong yang cocok ditanam di lahan, 00:05:32.482 --> 00:05:35.427 yang tahan terhadap serangan virus dan patogen tersebut, 00:05:35.521 --> 00:05:38.736 mereka akan memiliki lebih banyak cadangan makanan. NOTE Paragraph 00:05:38.760 --> 00:05:41.595 Kita mempunyai semua teknologi yang dibutuhkan, 00:05:41.619 --> 00:05:44.823 tetapi pengetahuan dan sumber daya 00:05:44.847 --> 00:05:47.982 belum tersebar secara merata ke seluruh dunia. 00:05:48.712 --> 00:05:51.274 Jadi maksud saya adalah 00:05:51.298 --> 00:05:53.150 teknologi genom terdahulu 00:05:53.174 --> 00:05:56.037 yang dibutuhkan untuk meneliti kerumitan 00:05:56.061 --> 00:05:59.123 hama dan patogen ini 00:05:59.147 --> 00:06:02.145 tidak cocok untuk Afrika sub-Sahara. 00:06:03.058 --> 00:06:04.909 Teknologi itu berharga jutaan dollar; 00:06:04.973 --> 00:06:07.311 membutuhkan tenaga listrik yang stabil 00:06:07.335 --> 00:06:09.135 dan sumber daya manusia yang cakap. 00:06:09.970 --> 00:06:12.831 Mesin ini masih sangat langka, 00:06:12.855 --> 00:06:17.476 sehingga banyak ilmuwan harus bertarung di garis terdepan tanpa pilihan, 00:06:17.500 --> 00:06:19.499 hanya mengirimkan sampel ke luar negeri. 00:06:19.523 --> 00:06:21.483 Ketika sampel dikirim ke luar negeri, 00:06:21.507 --> 00:06:24.133 sampel akan rusak sehingga menimbulkan banyak biaya. 00:06:24.157 --> 00:06:27.324 Pengembalian data menggunakan jaringan internet yang lambat 00:06:27.348 --> 00:06:28.748 tidak mungkin dilakukan. 00:06:28.782 --> 00:06:32.665 Terkadang diperlukan waktu 6 bulan untuk mengirimkan hasil ke petani. 00:06:32.665 --> 00:06:35.219 Ketika itu terjadi, semua sudah terlambat. 00:06:35.243 --> 00:06:36.830 Tanaman singkong telah mati, 00:06:36.854 --> 00:06:40.020 akibatnya kemiskinan dan kelaparan semakin memburuk. NOTE Paragraph 00:06:41.306 --> 00:06:43.464 Kami yakin bisa mengatasi hal ini. 00:06:43.989 --> 00:06:45.393 Di tahun 2017, 00:06:45.417 --> 00:06:50.203 kami mendengar tentang peranti genggam portabel pengurut (sekuens) DNA 00:06:50.227 --> 00:06:52.736 yaitu "Oxford Nanopore MinION". 00:06:52.760 --> 00:06:56.913 Peranti ini sudah digunakan di Afrika Barat untuk memerangi Ebola. 00:06:56.937 --> 00:06:58.434 Kami berpikir: 00:06:58.458 --> 00:07:01.744 Mengapa tidak menggunakannya untuk petani di Afrika Timur? 00:07:01.768 --> 00:07:06.101 Jadi, kami memutuskan untuk menggunakan peranti itu. 00:07:06.609 --> 00:07:09.301 Pada waktu itu, teknologi tersebut masih baru 00:07:09.301 --> 00:07:12.873 dan banyak yang meragukan kemampuan kami menggunakan peranti ini di lahan. 00:07:12.879 --> 00:07:14.196 Ketika memulai proyek ini, 00:07:14.220 --> 00:07:17.661 salah satu peneliti dari Inggris 00:07:18.075 --> 00:07:21.752 meragukan kemampuan kami mengatasi masalah di Afrika Timur dengan peranti ini 00:07:21.776 --> 00:07:23.242 apalagi di lahan pertanian. 00:07:23.863 --> 00:07:25.632 Kami menerima tantangan ini. 00:07:25.934 --> 00:07:32.387 Peneliti tersebut bahkan bertaruh dengan kami, dengan dua botol sampanye terbaik, 00:07:32.411 --> 00:07:35.369 bahwa kami tidak akan berhasil. 00:07:36.871 --> 00:07:38.450 Dua kata: 00:07:38.474 --> 00:07:39.625 terbayar lunas. NOTE Paragraph 00:07:39.649 --> 00:07:41.823 (Tertawa) NOTE Paragraph 00:07:41.847 --> 00:07:45.999 (Tepuk Tangan) NOTE Paragraph 00:07:46.023 --> 00:07:48.720 Terbayar lunas, karena kami berhasil. 00:07:48.720 --> 00:07:52.245 Kami menyediakan laboratorium molekuler portabel dengan teknologi mutakhir 00:07:52.269 --> 00:07:55.918 untuk para petani di Tanzania, Kenya dan Uganda, 00:07:55.942 --> 00:07:58.874 yang kami beri nama "Tree Lab". 00:07:58.942 --> 00:08:00.133 Apa yang kami lakukan? 00:08:00.157 --> 00:08:02.336 Pertama, kami memberi nama tim - 00:08:02.390 --> 00:08:04.934 yaitu "Cassava Virus Action Project". 00:08:04.958 --> 00:08:06.315 Kami membuat situs web, 00:08:06.339 --> 00:08:09.950 mencari dukungan dari komunitas genom dan komputasi, 00:08:09.974 --> 00:08:12.225 dan mulai mendatangi para petani. 00:08:12.411 --> 00:08:15.220 Segala sesuatu yang kami butuhkan untuk "Tree Lab" 00:08:15.244 --> 00:08:17.653 dibawa oleh tim. 00:08:17.677 --> 00:08:21.724 Semua kebutuhan molekuler dan komputasi yang diperlukan 00:08:21.748 --> 00:08:25.049 untuk mendiagnosa tanaman sakit juga dibawa oleh mereka. 00:08:25.431 --> 00:08:28.259 Semuanya ada di dalam laboratorium portabel ini. NOTE Paragraph 00:08:29.161 --> 00:08:32.748 Jika kami bisa mengambil data langsung dari lokasi tempat terjadinya masalah 00:08:32.772 --> 00:08:34.390 dan lebih dekat dengan petani, 00:08:34.414 --> 00:08:37.770 semakin cepat kami menemukan masalah yang terjadi pada tanaman mereka. NOTE Paragraph 00:08:38.169 --> 00:08:40.026 Kami bukan hanya memberitahukan masalah 00:08:40.026 --> 00:08:41.458 tetapi juga memberikan solusi. 00:08:41.482 --> 00:08:42.807 Solusinya adalah, 00:08:42.831 --> 00:08:45.454 membakar lahan dan menanam varietas 00:08:45.478 --> 00:08:48.982 yang tahan terhadap serangan hama dan patogen yang ada di lahan. 00:08:49.482 --> 00:08:54.146 Jadi langkah pertama adalah melakukan ekstraksi DNA, 00:08:54.170 --> 00:08:56.709 menggunakan mesin yang tampak di layar. 00:08:57.050 --> 00:09:00.249 Mesin ini disebut PDQeX, 00:09:00.273 --> 00:09:04.164 kepanjangan dari "Pretty Damn Quick Extraction (Ekstraksi Super Kilat)." NOTE Paragraph 00:09:04.188 --> 00:09:06.236 (Tertawa) NOTE Paragraph 00:09:06.260 --> 00:09:07.410 Menarik bukan? 00:09:07.768 --> 00:09:10.262 Teman saya, Joe, memang luar biasa. 00:09:11.394 --> 00:09:14.754 Salah satu tantangan terbesar dalam melakukan ekstraksi DNA 00:09:14.778 --> 00:09:18.093 adalah kebutuhan peralatan yang sangat mahal 00:09:18.117 --> 00:09:19.521 dan perlu waktu berjam-jam. 00:09:19.545 --> 00:09:21.037 Tetapi dengan mesin ini, NOTE Paragraph 00:09:21.061 --> 00:09:23.815 kami hanya butuh waktu 20 menit, 00:09:23.839 --> 00:09:25.085 dengan biaya yang rendah 00:09:25.109 --> 00:09:27.997 dan mesin ini hanya menggunakan aki motor. NOTE Paragraph 00:09:28.764 --> 00:09:34.041 Kemudian, kami mengambil ekstraksi DNA, menyiapkan pustaka genomik, 00:09:34.041 --> 00:09:36.110 menyiapkan ekstraksi untuk dimasukkan 00:09:36.134 --> 00:09:40.426 ke dalam peranti genggam portabel pengurut (sekuens) genom, 00:09:40.450 --> 00:09:41.601 seperti tampak di sini, 00:09:41.625 --> 00:09:45.363 kemudian kita sambung dengan sebuah superkomputer mini, 00:09:45.387 --> 00:09:47.209 yang disebut "MinIT". 00:09:47.728 --> 00:09:51.830 Kedua alat dihubungkan dengan perangkat pengisi daya portabel, 00:09:52.569 --> 00:09:54.442 sehingga kami berhasil mengurangi 00:09:54.466 --> 00:09:56.871 kebutuhan listrik utama dan internet, 00:09:56.895 --> 00:10:00.823 yang merupakan 2 faktor penghambat di lahan petani skala kecil. 00:10:01.807 --> 00:10:04.678 Menganalisis data secara cepat juga sulit dilakukan. 00:10:05.033 --> 00:10:08.939 Namun, kasus ini menunjukkan pentingnya seorang ahli biologi komputasi. 00:10:09.382 --> 00:10:11.612 Semua kegiatan penempelan tanaman mati 00:10:11.636 --> 00:10:13.196 dan pengukuran, 00:10:13.220 --> 00:10:15.212 serta keahlian komputasi 00:10:15.236 --> 00:10:19.387 pada akhirnya bermanfaat di dunia nyata dan waktu nyata. 00:10:19.411 --> 00:10:22.464 Saya berhasil membuat pangkalan data tersuai 00:10:22.488 --> 00:10:26.577 dan memberikan hasilnya ke petani hanya dalam waktu 3 jam, 00:10:26.587 --> 00:10:29.661 tidak sampai 6 bulan. NOTE Paragraph 00:10:29.694 --> 00:10:36.662 (Tepuk tangan ) NOTE Paragraph 00:10:38.085 --> 00:10:40.719 Para petani sangat gembira. 00:10:40.749 --> 00:10:43.915 Apakah kontribusi yang kami berikan benar-benar membantu? 00:10:43.915 --> 00:10:46.469 Sembilan bulan setelah kegiatan di "Tree Lab", 00:10:46.473 --> 00:10:50.197 petani bernama Asha berhasil meningkatkan hasil panen dari 0 ton per hektar 00:10:50.197 --> 00:10:51.905 menjadi 40 ton per hektar. 00:10:51.929 --> 00:10:53.728 Dia mampu memberi makan keluarganya 00:10:53.752 --> 00:10:56.442 dan berhasil menjual hasil panen ke pasar. 00:10:56.466 --> 00:10:59.201 Saat ini, dia sedang membangun rumah bagi keluarganya. 00:11:00.212 --> 00:11:01.371 Ya, sungguh luar biasa. NOTE Paragraph 00:11:01.395 --> 00:11:05.343 (Tepuk tangan) NOTE Paragraph 00:11:05.433 --> 00:11:07.889 Bagaimana kami mengukur keberhasilan "Tree Lab"? 00:11:07.940 --> 00:11:09.320 Tolok ukurnya adalah, 00:11:09.344 --> 00:11:11.447 para petani di Afrika. 00:11:11.451 --> 00:11:13.580 Para wanita ini bekerja dalam kelompok tani. 00:11:13.580 --> 00:11:17.510 Menolong Asha berarti membantu 3000 orang di desanya, 00:11:17.534 --> 00:11:21.186 karena dia membagikan hasil panen beserta cara mengatasi masalah. NOTE Paragraph 00:11:21.673 --> 00:11:25.864 Saya masih ingat setiap petani yang pernah saya temui. 00:11:26.665 --> 00:11:30.228 Kesedihan dan kegembiraan mereka 00:11:30.252 --> 00:11:32.052 terukir dalam ingatan saya. 00:11:32.958 --> 00:11:35.163 Ilmu pengetahuan kami berguna untuk mereka. 00:11:35.711 --> 00:11:40.758 "Tree Lab" adalah usaha terbaik kami untuk memenuhi ketahanan pangan petani. 00:11:41.180 --> 00:11:42.880 Saya tidak pernah bermimpi 00:11:42.880 --> 00:11:46.024 berhasil memberikan kontribusi ilmu pengetahuan terbaik 00:11:46.024 --> 00:11:49.351 di wilayah Afrika Timur, 00:11:49.351 --> 00:11:52.207 didukung oleh peranti genom dengan teknologi termutakhir. 00:11:52.312 --> 00:11:54.764 Namun, tim kami bermimpi 00:11:54.788 --> 00:11:58.942 dapat memberikan solusi bagi petani hanya dalam waktu 3 jam, bukan 6 bulan, 00:11:58.942 --> 00:12:00.518 dan kami berhasil melakukannya. 00:12:00.542 --> 00:12:04.650 Itulah manfaat keberagaman dan keterbukaan dalam ilmu pengetahuan. NOTE Paragraph 00:12:05.156 --> 00:12:06.307 Terima kasih. NOTE Paragraph 00:12:06.331 --> 00:12:09.482 (Tepuk tangan) NOTE Paragraph 00:12:09.506 --> 00:12:13.589 (Tepuk tangan)